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基于高斯混合模型的针对自噬相关蛋白靶标预测与配体比对的研究

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基于高斯混合模型的针对自噬相关蛋白靶标预测与配体比对的研究

作者：刘珂伶四川大学

学位级别：硕士

近年来,自噬在多种疾病的发病机制和治疗中的作用引起了广泛关注,与自噬相关的药物设计成为其重要研究方向。自噬相关数据库的构建和化合物相似性比对是自噬药物设计和发现的重要步骤,虚拟筛选数据集是化合物相似性比对的重要评估工具,... 详细信息

近年来,自噬在多种疾病的发病机制和治疗中的作用引起了广泛关注,与自噬相关的药物设计成为其重要研究方向。自噬相关数据库的构建和化合物相似性比对是自噬药物设计和发现的重要步骤,虚拟筛选数据集是化合物相似性比对的重要评估工具,因此,深入研究自噬相关数据库和探索化合物相似性比对具有重要意义。本文通过对当前国内外研究现状的调查,提出以下三个科学问题:(1)如何构建无偏的虚拟筛选基准数据集,提高化合物虚拟筛选的富集?(2)如何在进行数据库查询时,提高化合物相似性比对工具的速度和精度?(3)如何搭建一个综合全面、定时更新并具备蛋白质靶标查询功能的自噬数据库可视化平台?针对这三个问题,本文开展以下主要工作:(1)虚拟筛选基准数据集构建:首先,在DUD-E数据集和Pub Chem Bio Assay数据库基础上下载蛋白质以及对应的活性和非活性化合物。然后,采用非对称验证的方式对数据进行无偏处理。接下来,使用ECFP4(Extended connectivity fingerprints)和Py MOL工具计算靶标与活性和非活性化合物之间的相似性。最后,使用EF方法验证数据集的富集度。(2)构建化合物相似性比对工具:首先,对数据集进行中心化、归一化和PCA降维等预处理。然后,使用化合物相似性比对算法二维部分对降维后的数据集进行扫描得到预筛选数据集。最后,使用相似性比对算法三维部分对预筛选数据集进行精确的化合物相似性比对。(3)搭建自噬数据库和可视化与分析平台:首先,从公开论文和数据库中收集自噬相关数据,并进行清洗和去重等处理,得到自噬相关数据集。然后,搭建可视化Web平台,并集成自噬数据库和相关查询以及研究工具。

关键词：虚拟筛选基准数据集化合物比对高斯混合模型自噬数据库

天津市北辰区西堤头镇政府公务员管理完善对策研究

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天津市北辰区西堤头镇政府公务员管理完善对策研究

作者：刘珂伶天津大学

学位级别：硕士

1998年底，我国按照从低到高建设了乡镇、县、地市、省和中央五个级别的政府机关。在这当中，县、乡镇级公务员身处最末端，与群众距离最短，是保持基层社会稳定的维系者。然而现代社会的迅猛发展，也倒逼政府必须推进人力资源管理地发... 详细信息

1998年底，我国按照从低到高建设了乡镇、县、地市、省和中央五个级别的政府机关。在这当中，县、乡镇级公务员身处最末端，与群众距离最短，是保持基层社会稳定的维系者。然而现代社会的迅猛发展，也倒逼政府必须推进人力资源管理地发展。正是基于这样的现状，笔者选择其工作所在地---天津市北辰区西堤头镇人民政府为研究个案，系统地阐述西堤头镇公务员队伍中人力资源管理实践中展现的缺陷，并对造成缘由进行剖析，在分析与总结之后,提出针对性对策,便于完善管理,便于领导决策。本文将通过笔者实际从事的人事工作所掌握的大量一手资料出发，通过数据图表法、社会调查法等等一系列的科学方法阐明研究思路、找好理论依据、摆出存在问题、研究解决对策、提出合理建议。本文共分为六个部分：首先是绪论。该部分叙述了笔者选题的背景和价值,论文的研探思路、内容与方法以及国内外有关研究。其次是政府人力资源管理相关概念与理论。该部分主要归纳了政府人力资源管理的关联概念，大致梳理了国外政府人力资源管理制度的发展历程。其次是我国政府人力资源管理的现状。这一部分主要从政府，四个方面系统的演化，建立了取得的成果和存在的问题，结合当前我国政府人力资源管理的现状。其次是西堤头镇政府公务员管理现状的实证分析。该部分描述了西堤头镇政府公务员基本情况和公务员管理现状，比对人力资源管理的科学过程分析了西堤头镇政府公务员管理实践中的主要问题及形成原因。其次是改善西堤头镇政府公务员管理的专题性策略探索。该部分结合科学的人力资源管理方法对西堤头镇政府公务员管理实证分析中发现的问题逐一提出了针对性的对策建议。结束语部分回顾了文章的主要脉络，概括了西堤头镇政府公务员管理的完善对策，并对研究存在的不足及进一步研究的方向做了概括和规划。

关键词：乡镇公务员人力资源管理政府人力资源管理

“双一流”背景下以《仪器分析》课程为载体的大学生“双创”培养新模式初探

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创新教育研究 2019年第3期7卷 264-269页

作者：范雨刘珂伶唐攀余蓉木本荣成都中医药大学四川成都

“新时代”和“双一流”是目前高校学生培养需要考虑的两个重要背景。针对目前社会对创新人才需求迫切与高校“双创”能力培养缺少科学系统机制的矛盾,结合成都中医药大学双一流建设对一流本科建设的要求,我们探索了以教研室为单位,核... 详细信息

“新时代”和“双一流”是目前高校学生培养需要考虑的两个重要背景。针对目前社会对创新人才需求迫切与高校“双创”能力培养缺少科学系统机制的矛盾,结合成都中医药大学双一流建设对一流本科建设的要求,我们探索了以教研室为单位,核心课程《仪器分析》为中心,分析测试方法为手段,进行上游原料的开发利用、和下游产品设计制作的“双创”培养模式。该模式初步实现了学生的创新意识、创新思维和创新技能在教学中相互融合的培养模式,提升学生“创新创业”能力和大学生就业质量,初步探索出一条易于推广的“双创”人才培养之路,为其他相关课程的“双创”能力培养提供了可参考的依据,对大学生课程的创新实践具有一定的借鉴意义。

关键词：创新创业双一流《仪器分析》

新型城镇化进程中城郊治理协同创新机制研究——以圳美新村为例

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湖北农机化 2021年第10期 47-49页

作者：谢紫欣刘珂伶成力西华大学土木建筑与环境学院四川成都610039

边缘治理现象在我国城郊村普遍存在,严重阻碍我国新型城镇化进程。深圳市通过进行社会整合,将社区居民自制与原有城郊制度相结合,在行政组织上加强管控与引导,刺激个体经济的治理能力与责任,探索出一种“协同共治”的城郊社区管理模式,... 详细信息

边缘治理现象在我国城郊村普遍存在,严重阻碍我国新型城镇化进程。深圳市通过进行社会整合,将社区居民自制与原有城郊制度相结合,在行政组织上加强管控与引导,刺激个体经济的治理能力与责任,探索出一种“协同共治”的城郊社区管理模式,为城郊社区转型治理提供了制度保障,为新型城镇化建设提供了新方向。

关键词：城郊村转型社会治理协同共治

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高校中医专业全培养周期式学风建设融合模式的构建

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2022年第1期 14-17页

作者：罗文萍蒲玥衡朱俊龙刘珂伶成都中医药大学附属医院·临床医学院四川成都611137

本研究以提升中医专业学生专业能力培养为核心,以强化医学生全周期式学风建设工作为抓手,结合强化临床实践、跟师传承的中医专业培养模式特点,从医学生的全培养周期视角来构建了涵盖“日常学生管理、日常教师教学、学术科研培养、临床... 详细信息

本研究以提升中医专业学生专业能力培养为核心,以强化医学生全周期式学风建设工作为抓手,结合强化临床实践、跟师传承的中医专业培养模式特点,从医学生的全培养周期视角来构建了涵盖“日常学生管理、日常教师教学、学术科研培养、临床医疗实践、名师指路点睛”五大学风建设板块体系,以及三维度立体实施和监督反馈的闭环模式,总体形成“管、教、研、医、师”五位一体,覆盖医学本科生全培养周期的学风建设融合模式。以期作为中医专业学生专业能力提升的补充教育。

关键词：医学高等教育中医专业学风建设

医学生“全周期”式职业心理素养培育路径探新——基于医学生岗位胜任力

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中国科技经济新闻数据库教育 2022年第5期 152-155页

作者：罗文萍刘珂伶张海莉杨秀云白耀琳成都中医药大学临床医学院·附属医院四川成都610000

当前医学生岗位胜任力亟待加强,而医学生职业心理素养水平成为影响其临床岗位胜任力的重要因素。本文基于前期研究构建的医学生“3+2”职业心理素养核心体系,结合医学生整个培养教育周期的要求和规范,进一步探索构建了医学生职业心理素... 详细信息

当前医学生岗位胜任力亟待加强,而医学生职业心理素养水平成为影响其临床岗位胜任力的重要因素。本文基于前期研究构建的医学生“3+2”职业心理素养核心体系,结合医学生整个培养教育周期的要求和规范,进一步探索构建了医学生职业心理素养提升培养的路径和方法,以期创建一套完整的关于医学生职业心理素养培育体系,有效助力医学生职业化发展、提升临床岗位胜任力和临床诊疗能力水平。

关键词：医学生职业心理素养路径探新

人工神经网络法优化醋莪术的挥发油提取与包合工艺研究

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人工神经网络法优化醋莪术的挥发油提取与包合工艺研究

动力离心试验研究宽级配饱和珊瑚土场地剪应力-剪应变非线性响应

“好医生杯”中药制剂创新与发展论坛

作者：聂英军傅超美李莹胡慧玲廖婉严鑫甘彦雄刘珂伶刘哿依成都中医药大学药学院中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地

目的优化醋莪术挥发油提取及包合工艺。方法采用水蒸气蒸馏法提取醋莪术挥发油,浸泡时间、加水量、提取时间为主要影响因素,以挥发油得率为评价指标,进行正交试验设计,对挥发油提取工艺进行筛选;然后采用饱和水溶液法对挥发油进行包合,... 详细信息

目的优化醋莪术挥发油提取及包合工艺。方法采用水蒸气蒸馏法提取醋莪术挥发油,浸泡时间、加水量、提取时间为主要影响因素,以挥发油得率为评价指标,进行正交试验设计,对挥发油提取工艺进行筛选;然后采用饱和水溶液法对挥发油进行包合,以β-环糊精与挥发油的加入比例、包合时间及包合温度为主要影响因素,以醋莪术挥发油包合率和包合物得率为评价指标,进行正交实验设计,对挥发油包合工艺进行筛选。采用人工神经网络法,对提取与包合的试验参数进一步进行优化。结果经正交试验与人工神经网络法优化的提取与包合工艺条件分别为:取醋莪术饮片100g,加入8倍量水,浸泡1h,水蒸汽蒸馏提取6h,即得挥发油:取挥发油1 ml,β-环糊精与挥发油加入比为8:1,包合温度50℃,包合1h,即得挥发油包合物。结论优化提取与包合工艺能显著提高原药材中挥发油利用率,该工艺稳定可行,重复性较好。

关键词：醋莪术配方颗粒挥发油 β-环糊精包合人工网络神经分析法

来源： cnki会议评论

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岩土工程学报 2025年

作者：王体强王永志屈盅伶梁小丛陈平山中国地震局工程力学研究所地震工程与工程振动重点实验室地震灾害防治应急管理部重点实验室中交四航工程研究院有限公司南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)

珊瑚土作为热带和亚热带地区港口工程及军事、民事设施建设场地的重要土体，其在接近真实场地条件和地震自下而上传递下的循环剪应力、剪应变行为尚缺乏认知。基于动力离心试验可较真实模拟场地应力分布、排水条件、地震传递等优势，开... 详细信息

珊瑚土作为热带和亚热带地区港口工程及军事、民事设施建设场地的重要土体，其在接近真实场地条件和地震自下而上传递下的循环剪应力、剪应变行为尚缺乏认知。基于动力离心试验可较真实模拟场地应力分布、排水条件、地震传递等优势，开展了典型水平饱和珊瑚土场地模型试验，探讨了珊瑚土场地的循环剪应力、剪应变时空分布特征与演化规律，比较了循环剪应力、剪应变与超静孔压比发展的关联性，并求解分析了不同埋深珊瑚土动剪切模量、阻尼比随剪应变的变化关系和发展模式。结果表明：反演获得剪应力-剪应变滞回圈具有良好的光滑性、连续性和规律性，随着循环次数增加，滞回圈逐步向水平倾斜且面积逐步扩大，呈明显的强度软化特征；同一荷载下，剪应力随埋深增加而增大，剪应变随埋深增加而先增加后减小，并随荷载强度的增大而增大，基岩峰值加速度0.05g～0.3g正弦荷载下，剪应变主要集中于0.01%～2%范围内。荷载强度逐渐提高条件下，剪应力与超静孔压比随埋深变化的关联性不明显，但超静孔压比增加对剪应力随埋深的增长表现出一定约束作用；而剪应变与超静孔压比随埋深的分布具有显著的一致性，当孔压比超过0.6时，土层剪应变将显著增加。求解的动剪切模量随埋深增大而增大、随剪应变增大而减小，具有良好的规律性；而阻尼比随埋深增大而减小，相对离散性偏大，与计算方法和液化强非线性相关；最大剪切模量明显低于单元试验结果，且典型水平饱和场地的珊瑚土动剪切模量比更符合Martin-Davidenkov模型。

关键词：动力离心试验珊瑚土反演分析剪应力剪应变演化特性

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高龄女性卵子颗粒细胞转录组的数据分析

中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4069-4075页

作者：秦立峰王加强朱伶东北农业大学生命科学学院黑龙江省哈尔滨市150030 重庆市妇幼保健院人类胚胎工程重庆市重点实验室重庆市400013

背景:颗粒细胞的状态很大程度上影响卵母细胞的质量。随着高龄女性在辅助生殖中占比不断增多,为了能更好地评估卵母细胞的质量,此研究在转录水平对不同年龄段患者来源的颗粒细胞进行了检测。目的:探究低龄和高龄患者颗粒细胞mRNA及长链... 详细信息

背景:颗粒细胞的状态很大程度上影响卵母细胞的质量。随着高龄女性在辅助生殖中占比不断增多,为了能更好地评估卵母细胞的质量,此研究在转录水平对不同年龄段患者来源的颗粒细胞进行了检测。目的:探究低龄和高龄患者颗粒细胞mRNA及长链非编码RNA表达变化。方法:在辅助生殖治疗周期中收集患者取卵时获得的废弃卵丘颗粒细胞,其中低龄组患者年龄为25-35周岁,高龄组患者年龄为38-45周岁。对低龄和高龄女性颗粒细胞进行RNA-seq分析,每组3个重复。结果与结论:①RNA-seq分析结果显示,样本平均测序量超过14 G,质控后的数据质量Q30超过93%,数据平均比对率为98.4%,表明数据质量较好;②主成分分析及相关性分析结果显示高龄组和低龄组样本间基因表达水平具有明显差异;③差异分析结果显示,相对于低龄组,高龄组颗粒细胞中共有410个差异表达的mRNA,其中上调基因167个,下调基因243个,GO分析结果显示下调基因主要富集到胞吐作用调节、激素代谢过程等,GSEA分析结果显示高龄组颗粒细胞中与分泌相关的通路表达下调;④相对于低龄组,高龄组共检测到662个差异表达的长链非编码RNA,这部分长链非编码RNA直接调控的蛋白质编码基因为1772个,其中与差异表达基因交集59个。结果表明:高龄组颗粒细胞中与分泌相关的基因及通路表达下调,从而影响卵母细胞质量,同时这些表达下调的基因受到长链非编码RNA调控,因此长链非编码RNA的表达可能与年龄有关。

关键词：年龄颗粒细胞卵母细胞全转录组差异基因长链非编码基因

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