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胰腺癌细胞的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定:基于CEACAM5、LGALS1和CENPF基因表达

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南方医科大学学报 2023年第9期43卷 1567-1576页

作者：孙敬杰卢鹏管莎莎刘淞淞中国人民解放军总医院海南医院肿瘤内科海南三亚572013 中国人民解放军总医院海南医院肝胆外科海南三亚572013

目的探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法,鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因。方法分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据,初步聚类后,根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞,再聚类、分群后鉴定特征基... 详细信息

目的探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法,鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因。方法分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据,初步聚类后,根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞,再聚类、分群后鉴定特征基因,进行通路GO和KEGG通路富集分析,并进行拟时序分析。提取癌症基因组图谱179例胰腺癌患者和正常胰腺组织基因表达库中171例正常人基因表达数据、临床信息及预后情况,结合人类蛋白表达图谱蛋白表达情况对各亚型关键基因进行验证。最后通过细胞功能实验验证CEACAM5、LGALS1、CENPF对胰腺癌细胞的增殖、侵袭与迁移等功能的影响。结果对16例胰腺癌样本48570个细胞进行分析后发现,细胞总共被聚类为22群,其中包含5群胰腺癌细胞。这些胰腺癌细胞被分为3群:亚型1、亚型2和亚型3,分别具有完全不同的基因表达模式和功能。亚型1胰腺癌细胞的特征基因主要富集于蛋白代谢过程的负调节、铁死亡和抗原提呈相关通路;亚型2胰腺癌细胞的特征基因主要于肽合成过程、翻译和核糖体相关通路;亚型3胰腺癌细胞的特征基因主要富集于ATP代谢过程、糖酵解/葡萄糖生成和细胞周期相关通路。亚型2和亚型3可能是由亚型1发展而来,亚型3可能是胰腺癌细胞发育的最终状态。各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达情况也在发育轨迹中展现了不同状态。基因和蛋白表达层面均显示各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF在胰腺癌中高表达,且与患者的不良预后相关,当下调CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达后,胰腺癌细胞的增殖(P<0.05)、迁移(P<0.05)和侵袭(P<0.05)能力均被抑制。结论胰腺癌细胞有较强的异质性,基于CEACAM5、LGALS1、CENPF基因表达可鉴定肿瘤细胞发展过程中的不同分子亚型,且影响胰腺癌细胞的增殖、侵袭和转移。

关键词：胰腺癌分子亚型异质性单细胞测序

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胆管癌光动力治疗的基础与临床研究新进展

临床外科杂志 2022年第11期30卷 1094-1097页

作者：刘淞淞谭一舟卢鹏中国人民解放军总医院海南医院肝胆外科 572022 中国人民解放军总医院激光医学中心 572022

胆管癌起病隐匿且恶性程度极高,大多数病人初诊时已是晚期,失去了根治性手术的机会,不可切除的胆管癌病人生存期极短且生存质量较低。目前对于不可切除的胆管癌的常见治疗方法有胆道支架、放化疗、射频消融、靶向和免疫治疗等,但由于胆... 详细信息

胆管癌起病隐匿且恶性程度极高,大多数病人初诊时已是晚期,失去了根治性手术的机会,不可切除的胆管癌病人生存期极短且生存质量较低。目前对于不可切除的胆管癌的常见治疗方法有胆道支架、放化疗、射频消融、靶向和免疫治疗等,但由于胆道肿瘤恶性程度高,放化疗不敏感且易发生耐药,现有治疗手段对病人生存时间和生存质量的提升亦有限。因此,临床医生亟需探索新的治疗策略以突破当下的困境。光动力疗法作为一种治疗胆管癌的新手段,以其优异的局部抗肿瘤效果引起广泛关注。本文主要针对近年来光敏剂的研制和发展、光动力治疗(PDT)的分子作用机制、PDT的临床应用等相关情况进行归纳总结,结合我们团队开展的相应临床工作,阐述PDT研究的热点和潜力,为临床及科研提供参考。

关键词：胆管癌光动力治疗光敏剂

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长链非编码RNA在胰腺癌转移中的研究进展

临床外科杂志 2019年第12期27卷 1099-1101页

作者：刘淞淞王槐志陆军军医大学第一附属医院肝胆外科研究所重庆400038 中国科学院大学重庆医院肝胆胰外科研究所

胰腺癌侵袭程度高,初诊即有局部淋巴结和远处转移。长链非编码RNA(IncRNA)最初被认为是基因转录组的"噪音"而未受到重视。但随着研究的深入,学者们发现lncRNA在人类基因组普遍被转录且起着重要的调控作用,与肿瘤的发生发展及转移密切相... 详细信息

胰腺癌侵袭程度高,初诊即有局部淋巴结和远处转移。长链非编码RNA(IncRNA)最初被认为是基因转录组的"噪音"而未受到重视。但随着研究的深入,学者们发现lncRNA在人类基因组普遍被转录且起着重要的调控作用,与肿瘤的发生发展及转移密切相关。胰腺癌中有大量的lncRNA表达失调,其根据自身的亚细胞定位和结构不同,在胰腺癌转移中参与不同的生物学调控,涉及到上皮-间质转化(EMT),自噬,肿瘤代谢,关键驱动基因等多方面。研究lncRNA在肿瘤转移中的作用及其分子机制,有望为胰腺癌提供新的防治策略和新的治疗靶点。

关键词：胰腺癌长链非编码RNA

考虑消费者参考效应的双渠道乳制品供应链协调机制设计

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控制与决策 2022年第6期37卷 1609-1620页

作者：杨建华刘淞北京科技大学经济管理学院北京100083 北京企业低碳运营战略研究基地北京100083

将消费者对乳制品新鲜度的参考效应引入第三方物流(third party logistics,TPL)服务商参与的双渠道乳制品供应链中,考虑到乳制品新鲜度受到制造商加工水平和TPL服务商物流服务水平的共同影响,构建分散式、集中式以及引入基于二部定价的... 详细信息

将消费者对乳制品新鲜度的参考效应引入第三方物流(third party logistics,TPL)服务商参与的双渠道乳制品供应链中,考虑到乳制品新鲜度受到制造商加工水平和TPL服务商物流服务水平的共同影响,构建分散式、集中式以及引入基于二部定价的成本共担契约下的微分博弈模型,求解并比较3种情形下供应链成员的最优均衡策略.研究表明:一定条件下,基于二部定价的成本共担契约能够使制造商加工水平、TPL服务商物流服务水平以及供应链整体收益均达到集中式决策下的情形,而且制造商、零售商和TPL服务商的收益相较于分散式决策都能得到帕累托改善,供应链能够实现完美协调;线上或线下渠道乳制品的零售价与该渠道所占的市场份额及渠道间的价格替代系数正相关;消费者的参考效应能够激励制造商和TPL服务商提高各自的努力水平,使供应链收益增加.

关键词： TPL服务商乳制品新鲜度参考效应微分博弈双渠道供应链协调契约

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微创外科技术在胰腺外科中的应用与发展

中国普外基础与临床杂志 2021年第1期28卷 1-3页

作者：王槐志谢阜明符稳刘淞淞中国科学院大学重庆医院肝胆胰外科研究所重庆400013 陆军军医大学第一附属医院肝胆外科研究所重庆400038

微创外科,作为一个外科革新与信息科技交互产生的重要医疗领域,它以患者最小创伤完成不亚于开放手术的预后为发展目标[1]。医疗技术飞速发展的同时,大众对于医治水平、手术创伤、外表美容等方面也有了更多需求[2]。多学科融合大力促进... 详细信息

微创外科,作为一个外科革新与信息科技交互产生的重要医疗领域,它以患者最小创伤完成不亚于开放手术的预后为发展目标[1]。医疗技术飞速发展的同时,大众对于医治水平、手术创伤、外表美容等方面也有了更多需求[2]。多学科融合大力促进了临床医学的发展,特别是当内镜、介入、腔镜、外科手术机器人等新技术的发明与应用,真正引领微创外科进入了飞速发展的时代[3]。腹腔镜手术作为微创外科的一项重要技术,其应用和发展尤为迅速,从最初的胆囊切除术延伸到包括胃肠道、减重代谢、甲状腺、腹壁与疝、肝胆、胰腺外科等领域,手术量和手术程度日益提升。

关键词：胰腺外科腹腔镜手术微创外科开放手术多学科融合胆囊切除术医疗领域手术创伤

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改进集合经验模态分解理论及其应用的研究

改进集合经验模态分解理论及其应用的研究

作者：刘淞华云南大学

学位级别：硕士

多数实际工程中的信号具备非平稳、非线性等过程特征,使用传统短时傅里叶变换(Short-Time FT,STFT)、小波变换、Wigner-Ville分布(Wigner-Ville distribution,WVD)等方法并不能有效提取特征信息。而经验模态分解(Empirical Mode Decompo... 详细信息

多数实际工程中的信号具备非平稳、非线性等过程特征,使用传统短时傅里叶变换(Short-Time FT,STFT)、小波变换、Wigner-Ville分布(Wigner-Ville distribution,WVD)等方法并不能有效提取特征信息。而经验模态分解(Empirical Mode Decomposition,EMD)方法自提出以来,已验证处理非平稳、非线性过程信号的有效性,因此该方法在实际工程中被广泛应用,被认为是自傅里叶变换以来信号处理领域的重大突破。但EMD存在分解局限性、模态混叠、模态分裂等问题,使分解得到的固有模态函数(Intrinsic mode functions,IMFs)失去实际物理意义。集合经验模态分解EEMD(Ensemble EMD,EEMD)通过向待分解信号中添加高斯白噪声,以填充信号中的高频间歇,从而有效抑制了EMD的模态混叠问题。然而,EEMD无法抑制模态分裂问题,且性能受辅助噪声幅值的影响,使得该方法的综合分解性能、自适应性较差。鉴于此,本文对EMD系列方法进行系统研究,重点针对EEMD存在的问题进行优化,以提升噪声辅助EMD系列方法的综合分解性能。取得的主要研究成果为:(1)提出中值互补集合经验模态分解(Median complementary EEMD,MCEEMD)算法。该算法借鉴互补集合经验模态分解(Complementary EEMD,CEEMD)抑制残留噪声幅值的思想,即通过添加互补噪声以提高方法的分解完备性。并且在算法集合过程中,MCEEMD将中值算子与平均算子巧妙结合,利用两种算子各自优势,使方法具备抑制模态分裂、模态混叠能力的同时,兼备良好的分解完备性,从而达到提升方法综合性能目的。为验证方法的有效性,本文使用概率理论设计了一套模态分裂量化模型,在有效量化方法模态分裂现象的同时,量化了中值算子在CEEMD中抑制模态分裂、模态混叠的有效性,为MCEEMD方法提供理论支撑。该量化模型在一定程度上丰富了EMD系列方法的理论基础,并且本文使用概率理论证明了所提模型的合理性。最后,本文使用三种类型仿真信号验证了所提方法的普遍性、鲁棒性,并且使用实际机械故障振动信号、人体颈动脉血流信号进行处理分析,进一步验证了所提方法良好的分解性能,说明所提方法具备一定的实际应用价值和可推广性。(2)针对EEMD的辅助噪声参数整定问题,提出一种新的自适应整定方法。本文首次综述现有EEMD的辅助噪声自适应整定方法,并依据方法的技术路线将它们分为三大类:基于概率理论的方法、基于评价指标的方法以及基于优化算法的方法。基于对现有方法的研究,本文提出一种自适应噪声整定方法,该方法核心是设计了一套量化模态分裂与模态混叠的评价指标,通过遍历辅助噪声幅值计算评价指标,选择最小的评价指标所对应的辅助噪声幅值作为最优值。该方法整定的噪声幅值可使EEMD有效抑制模态混叠问题,增强了算法的自适应性;最后通过大量仿真实验与实际案例验证了所提方法的有效性。基于此,本文建议将该算法作为EEMD的标准形式。本文旨在弥补EMD方法的理论基础,提升EMD系列方法综合分解性能,所提MCEEMD与EEMD辅助噪声自适应整定算法或将为诸多信号处理相关领域带来新的启示与分析工具。

关键词：经验模态分解集合经验模态分解模态混叠模态分裂自适应整定辅助噪声幅值

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考虑转化效率的竞争企业产能共享策略研究

中国管理科学 2024年

作者：王军进许淞俊刘家国大连海事大学航运经济与管理学院

市场竞争可能会导致供需不匹配。产能共享是将过度产能与过度需求相结合的一种常见做法。考虑共享产能的不完全替代性问题，构建由两个对称竞争企业组成的产能共享非合作博弈模型，探究市场细分、产能容量及替代性对企业产能共享策略和... 详细信息

市场竞争可能会导致供需不匹配。产能共享是将过度产能与过度需求相结合的一种常见做法。考虑共享产能的不完全替代性问题，构建由两个对称竞争企业组成的产能共享非合作博弈模型，探究市场细分、产能容量及替代性对企业产能共享策略和盈利能力的影响。研究结果表明产能共享可以软化企业的价格竞争，但承诺过高的产能共享价格不一定会提高企业利润。企业利润受到价格敏感者非单调影响，而产能容量与替代性对其的影响取决于企业间产能转化效率，同时产能共享盈利性存在一个沉没成本阈值效应，更多的价格敏感者、更大的企业产能容量及更低的产能转化效率会抑制该阈值效应，从而降低企业达成产能共享的可能性。

关键词：转化效率产能共享供需匹配价格竞争

基于WGCNA和ssGSEA的胰腺癌预后模型构建

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中国临床新医学 2020年第11期13卷 1084-1090页

作者：张峻烽刘淞淞王槐志中国科学院大学重庆医院•重庆市人民医院肝胆胰腺外科重庆401120 陆军军医大学(第三军医大学)附属第一医院肝胆外科重庆400038

目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单样本基因富集分析(ssGSEA)构建胰腺癌预后模型。方法获取胰腺癌组织转录组测序数据和患者预后信息,ssGSEA对各肿瘤组织17810条通路进行评分,利用WGCNA、单因素分析和Lasso回归筛选各通路参数... 详细信息

目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单样本基因富集分析(ssGSEA)构建胰腺癌预后模型。方法获取胰腺癌组织转录组测序数据和患者预后信息,ssGSEA对各肿瘤组织17810条通路进行评分,利用WGCNA、单因素分析和Lasso回归筛选各通路参数,构建多因素Cox比例风险回归模型对胰腺癌患者的预后情况进行预测,并对模型进行评价。结果经ssGSEA发现,不同胰腺癌组织各通路评分不同,如GO RECEPTOR REGULATOR ACTIVITY、GO MONOSACCHARIDE BINDING等通路,提示不同患者各通路活性有差异,这可能是引起肿瘤向不同结局发展的重要原因。经WGCNA分析采用动态剪切树法合并表达相似的通路模块,最终得到7个通路模块。其中,Blue模块中包含的通路最多,含3098条通路。Red模块与胰腺癌患者生存状态有较高的正相关性(r=0.33,P<0.001),Black模块也与其生存有显著的相关性(r=0.11,P=0.03)。同时,Red模块(r=0.30,P<0.001)和Blue模块(r=0.24,P=0.002)与胰腺癌组织学分期有显著的正相关性;Blue模块(r=0.27,P<0.001)、Yellow模块(r=-0.17,P=0.03)、Black模块(r=0.30,P<0.001)和Magenta模块(r=0.15,P=0.03)与胰腺癌肿瘤分期有明显的相关性。使用单因素分析、Lasso回归筛选Red模块中与生存预后相关的通路,共得到11条与胰腺癌患者生存预后相关的通路。进一步利用多因素Cox回归建立多通路预后预测模型,最终得到由5条通路构成的胰腺癌预后预测模型,C指数为0.7,赤池信息准则(AIC)为776.49,且该模型具有良好的预测效能(AUC=0.742)。结论WGCNA和ssGSEA技术在胰腺癌预后模型的构建中有重要作用。

关键词：胰腺癌加权基因共表达网络分析单样本基因富集分析

面对不确定性供应中断风险的制造商采购策略研究

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中国管理科学 2024年

作者：王军进许淞俊刘家国大连海事大学航运经济与管理学院上海交通大学安泰经济与管理学院

越来越多的供应商面临不确定性中断，他们不知道中断是否以及何时会发生，低估或高估供应的可靠性可能会导致采购过剩或不足。针对具有不确定性供应中断风险的制造商采购问题，构建了一种供应可靠性信号博弈模型，制造商可以从初始不确... 详细信息

越来越多的供应商面临不确定性中断，他们不知道中断是否以及何时会发生，低估或高估供应的可靠性可能会导致采购过剩或不足。针对具有不确定性供应中断风险的制造商采购问题，构建了一种供应可靠性信号博弈模型，制造商可以从初始不确定型供应商处单源采购，或额外从高成本供应可靠型供应商处双源采购，探究了不同信息条件下信号质量效应、不确定性效应及最优采购策略。研究结果表明，供应中断信息不对称下制造商需要向高可靠性供应商支付信息租金，防止高可靠性供应商模仿低可靠性供应商。提高信号质量或减少中断的不确定性并不一定对制造商有益，制造商可以通过调整采购策略减少信息不对称的负面影响。此外，当供应商成本差异中度时，较大的市场规模可以对冲信息差对采购策略转换造成的风险。

关键词：信息不对称不确定性中断风险采购策略