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广西马尾松三个优良种源的遗传多样性及生长性状变异分析

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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第6期43卷 67-72页

作者：冯源恒李火根杨章旗黄永利陈虎广西壮族自治区林业科学研究院用材林所国家林业局马尾松工程技术研究中心广西南宁530002 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 南宁市林业科学研究所广西南宁530107

【目的】以25年生马尾松种源、地点、林分3水平子代试验林为研究材料,从表型、遗传变异两方面开展研究,以期为马尾松遗传育种策略的制定提供有价值参考。【方法】采用SSR分子标记进行遗传结构分析,使用Arlequin 3.5软件依据线性模型估... 详细信息

【目的】以25年生马尾松种源、地点、林分3水平子代试验林为研究材料,从表型、遗传变异两方面开展研究,以期为马尾松遗传育种策略的制定提供有价值参考。【方法】采用SSR分子标记进行遗传结构分析,使用Arlequin 3.5软件依据线性模型估算各层次变异的相对分量。以SAS分析软件依据线性模型对林分生长量数据进行统计分析,以4因素嵌套模型估算各层次变异的相对分量。【结果】遗传多样性分析结果表明,种源间及种源内无明显的遗传分化。分子方差分析结果表明,种源间的遗传变异仅占总变异的2.56%,种源内不同地点间的变异占1.66%,地点内个体间的遗传变异则占总变异的95.78%。生长表型数据分析结果同样显示胸径与材积性状在种源间、种源内地点间、同一地点的优良林分与普通林分间均无显著差异。【结论】分子方差分析与生长性状表型数据方差分析的结果均表明,广西马尾松的主要遗传变异存在于林分内个体间。因此在优良种源中开展优良单株选择可以获得更好的改良效果。该结论对于马尾松遗传育种策略的制定具有重要的参考价值。

关键词：马尾松遗传变异 SSR 分子变异分析

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马尾松树高生长性状SSR标记关联验证

广西师范大学学报（自然科学版） 2023年第5期41卷 152-160页

作者：凌金燕冯源恒杨章旗陈虎谭健晖龚桂芳罗群凤付军翟章贵广西师范大学生命科学院广西桂林541006 广西壮族自治区林业科学研究院广西南宁530002 广西马尾松工程技术研究中心/国家林业和草原局中南速生材繁育重点实验室/广西优良用材林资源培育重点实验室/国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心(广西壮族自治区林业科学研究院) 广西南宁530002 广西国有派阳山林场广西宁明532500

分子标记辅助选择育种是获得控制目标性状基因的重要方法。本研究以马尾松二代全同胞家系为材料,选择4个课题组前期获得的与马尾松生长性状关联的SSR标记:PCZ002、PCZ023、PCZ142和PCZ187,每个标记选择4个杂交家系,分别有150、172、157... 详细信息

分子标记辅助选择育种是获得控制目标性状基因的重要方法。本研究以马尾松二代全同胞家系为材料,选择4个课题组前期获得的与马尾松生长性状关联的SSR标记:PCZ002、PCZ023、PCZ142和PCZ187,每个标记选择4个杂交家系,分别有150、172、157、163份单株材料,结合树高生长性状数据对马尾松二代全同胞群体进行关联分析。结果表明,标记PCZ142扩增出的PCZ142-AA和PCZ142-AB基因型与树高存在正相关性,且树高均显著高于PCZ142-BB基因型材料,而PCZ142-BB基因型与树高存在显著负相关(P<0.05);标记PCZ187扩增出的PCZ187-BB基因型与树高存在极显著正相关性(P<0.01),且树高显著高于PCZ187-AA和PCZ187-AB基因型材料;标记PCZ002和PCZ023的各基因型与树高无显著相关性。综上,标记PCZ142-BB和PCZ187-BB与马尾松树高生长性状存在显著相关性,PCZ142-BB为显著负相关,PCZ187-BB为极显著正相关,这2种基因型材料可成为马尾松树高生长性状重要的基因资源。本研究结果为定位控制群体中马尾松树高生长性状位点提供重要信息,并为马尾松分子标记辅助选择育种提供参考。

关键词：马尾松 SSR标记树高关联分析辅助育种

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黑格优树子代遗传评价及选择

广西林业科学 2022年第6期51卷 739-745页

作者：安琪杨章旗胡拉冯源恒黄永利颜燕广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室广西南宁530002 南宁市林业科学研究所广西武鸣530100

为探究黑格(Albizia odoratissima)不同优树子代幼林的生长状况,以黑格优树自由授粉子代为试验材料,对20个家系4年生幼林的生长表现差异进行分析。结果表明,黑格生长迅速,平均胸径10.16 cm,平均树高10.28 m,平均单株材积0.0560 m^(3)。... 详细信息

为探究黑格(Albizia odoratissima)不同优树子代幼林的生长状况,以黑格优树自由授粉子代为试验材料,对20个家系4年生幼林的生长表现差异进行分析。结果表明,黑格生长迅速,平均胸径10.16 cm,平均树高10.28 m,平均单株材积0.0560 m^(3)。不同产地和不同家系的4年生黑格幼林平均胸径、平均树高和平均单株材积均差异显著或极显著,不同性状的家系遗传力均处于中等以上水平,说明可开展黑格优良家系选择。以家系生长量、变异系数和保存率作为选择标准,筛选出1、3、6和10号家系为优良家系,入选率为20%,其平均胸径、平均树高和平均单株材积分别为11.47 cm、11.25 m和0.0696 m^(3),分别比总体均值高出12.89%、9.44%和24.29%。选出优良单株10株,入选率为1.33%,其平均胸径、平均树高和平均单株材积分别为15.50 cm、14.03 m和0.1380 m^(3),分别比总体均值高出52.56%、36.48%和146.36%。

关键词：家系选择优良单株黑格

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马尾松候选基因EST-SSR引物开发

分子植物育种 2020年第23期18卷 7840-7846页

作者：龚桂芳冯源恒安琪杨章旗广西师范大学生命科学学院桂林541006 广西壮族自治区林业科学研究院广西马尾松工程技术研究中心广西优良用材林资源培育重点实验室南宁530002

松脂产量是马尾松的重要经济性状,通过开展候选基因关联分析获得与产脂性状具有较强相关性的遗传标记,进行分子标记辅助选择,是加快马尾松产脂性状改良进程的一种可行方法。该研究通过对马尾松高产脂无性系与普通产脂无性系的针叶、顶... 详细信息

松脂产量是马尾松的重要经济性状,通过开展候选基因关联分析获得与产脂性状具有较强相关性的遗传标记,进行分子标记辅助选择,是加快马尾松产脂性状改良进程的一种可行方法。该研究通过对马尾松高产脂无性系与普通产脂无性系的针叶、顶芽和韧皮部3个组织进行转录组差异分析,并根据所得差异序列开发SSR引物,为马尾松产脂性状候选基因关联分析研究提供分子标记。经分析共在6个样本的124345条Unigene序列中发现14461个SSR位点。根据表达差异基因序列含有SSR的位点设计开发了259对EST-SSR引物,其中147对引物可扩增出清晰条带,引物的有效性为56.76%;有65对引物表现出多态性,多态率为25.10%,可用于进行马尾松产脂性状候选基因关联分析。本研究所开发的EST-SSR引物为今后马尾松的关联分析研究、分子标记辅助育种研究等提供可靠的标记,并为马尾松产脂性状关键基因的挖掘提供参考依据。

关键词：马尾松(Pinus massoniana) 转录组 SSR 关联分析引物开发

马尾松生长性状显著关联标记PCZ090所在基因的挖掘与生物信息学分析

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广西林业科学 2022年第2期51卷 184-189页

作者：罗群凤吴志铭冯源恒龚桂芳杨章旗广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室广西马尾松工程技术研究中心广西南宁530002

马尾松(Pinus massoniana)是我国南方重要的用材树种。基于马尾松生长性状候选基因组关联分析,得到显著关联的SSR标记位点PCZ090,通过生物信息学分析方法挖掘其所在基因的全长序列及生理功能。结果表明,基因全长1636 bp,包含1个795 bp... 详细信息

马尾松(Pinus massoniana)是我国南方重要的用材树种。基于马尾松生长性状候选基因组关联分析,得到显著关联的SSR标记位点PCZ090,通过生物信息学分析方法挖掘其所在基因的全长序列及生理功能。结果表明,基因全长1636 bp,包含1个795 bp的开放阅读框,编码264个氨基酸,蛋白质分子量为30.88 kDa,理论等电点为9.27;参与谷胱甘肽代谢过程,具有谷胱甘肽转移酶活性。通过NCBI CDD进一步确定PCZ090所在基因是谷胱甘肽S-转移酶家族蛋白成员,命名为PmGSTTCHQD1,根据同源基因的注释结果,推测该基因可能参与了催化氯代异源物质的代谢过程,在细胞解毒机制中具有重要作用。该研究结果对于解析细胞解毒能力对马尾松生长的影响具有重要的参考价值。

关键词：基因组关联分析 SSR 生长性状马尾松谷胱甘肽S-转移酶

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不同松树种间杂交类型的可育性分析

广西植物 2021年第8期41卷 1270-1279页

作者：孙明升冯源恒贾婕杨章旗广西大学林学院南宁530000 广西壮族自治区林业科学研究院南宁530002 广西马尾松工程技术研究中心南宁530002 国家林业和草原局中南速生材繁育实验室南宁530002

探究不同松树种间杂交可育性,为松树种间杂交育种亲本选配提供依据,进而为松树的杂种优势研究积累材料。该研究利用随机区组设计,通过92个松树种间杂交组合与20个半同胞对照,分析9种松树种间杂交类型子代的平均球果产种数、平均球果产... 详细信息

探究不同松树种间杂交可育性,为松树种间杂交育种亲本选配提供依据,进而为松树的杂种优势研究积累材料。该研究利用随机区组设计,通过92个松树种间杂交组合与20个半同胞对照,分析9种松树种间杂交类型子代的平均球果产种数、平均球果产种量、百粒重、发芽率与成苗率5项育性指标,综合球果期、种期与苗期3个阶段的表现,利用模糊数学隶属函数法对不同松树种间杂交类型进行可育性综合评价。结果表明:加勒比松×湿地松(C×E)、湿地松×加勒比松(E×C)与湿地松×火炬松(E×T)3种杂交类型育性表现优于或接近相应的半同胞对照,马尾松×湿地松(M×E)、马尾松×火炬松(M×T)、马尾松×加勒比松(M×C)、火炬松×加勒比松(T×C)、火炬松×马尾松(T×M)与火炬松×湿地松(T×E)杂交类型育性表现远低于半同胞对照,表现出低育性甚至不育。综合5项育性指标,亚组内杂交育性的整体表现明显优于亚组间杂交;湿地松与加勒比松为母本的3种杂交组合育性表现总体水平明显优于马尾松与火炬松为母本的另外6种杂交组合。9种杂交类型中除了火炬松×湿地松(T×E)外,均获得了具有生活力的杂交子代,尤其马尾松与3种国外松的杂交子代在相关研究中是首次获得,对松树种间杂交育种的研究具有重要意义。

关键词：杂交松种实表型性状可育性种间杂交综合评价

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鹅掌楸属种及杂种的SSR分子鉴定

林业科学 2010年第1期46卷 36-39页

作者：张红莲李火根胥猛冯源恒南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

以不同种源的鹅掌楸、北美鹅掌楸和不同组合的杂交鹅掌楸为试验材料,对176对SSR引物进行初筛、复筛,最后筛选出1对物种特异性SSR引物。该引物在鹅掌楸群体中特异性扩增出190bp的产物,在北美鹅掌楸群体中特异性扩增出180bp的产物,在杂交... 详细信息

以不同种源的鹅掌楸、北美鹅掌楸和不同组合的杂交鹅掌楸为试验材料,对176对SSR引物进行初筛、复筛,最后筛选出1对物种特异性SSR引物。该引物在鹅掌楸群体中特异性扩增出190bp的产物,在北美鹅掌楸群体中特异性扩增出180bp的产物,在杂交鹅掌楸群体中特异性扩增出180bp和190bp2种产物。该引物对鹅掌楸种间鉴别准确率达100%。

关键词：鹅掌楸北美鹅掌楸杂交鹅掌楸 SSR分子标记特异性鉴定

松属EST-SSR引物开发及马尾松-湿地松种间特异性鉴别引物筛选

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分子植物育种 2014年第5期12卷 963-968页

作者：贾婕冯源恒杨章旗黄永利广西壮族自治区林业科学研究院南宁530002 广西壮族自治区南宁市林科所南宁530107

为了开发松属SSR标记,本研究从NCBI的dbEST数据库中共下载889 964条松属EST序列,处理最新的280 000条,经过去冗余处理和SSR位点搜索,获得了248条备选EST序列并进行引物设计。通过检测发现有44对引物在马尾松中有扩增产物,其中13对具有... 详细信息

为了开发松属SSR标记,本研究从NCBI的dbEST数据库中共下载889 964条松属EST序列,处理最新的280 000条,经过去冗余处理和SSR位点搜索,获得了248条备选EST序列并进行引物设计。通过检测发现有44对引物在马尾松中有扩增产物,其中13对具有多态性;39对在湿地松中有扩增产物,9对具有多态性。经进一步筛选得到扩增产物稳定、清晰且种内高度一致、种间差异明显的引物15对,其中PJ164引物作为马尾松与湿地松种间鉴定较为合适。这批引物对于马尾松、湿地松分子育种研究及种间杂交子代鉴定具有较大的应用价值。

关键词：松属 EST-SSR 引物开发马尾松湿地松

26年生马尾松初级种子园半同胞子代变异及家系选择

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南京林业大学学报（自然科学版） 2017年第3期41卷 189-192页

作者：谭健晖冯源恒黄永利杨章旗广西壮族自治区林业科学研究院广西南宁530002 南宁市林业科学研究所广西武鸣530107

【目的】研究马尾松全轮伐期半同胞家系的遗传变异并进行选择评价,为马尾松高世代遗传改良提供可靠依据。【方法】对南宁市林业科学研究所26年生马尾松初级种子园169个半同胞家系子代测定林进行长期定位观测,分析了树高、胸径和材积3个... 详细信息

【目的】研究马尾松全轮伐期半同胞家系的遗传变异并进行选择评价,为马尾松高世代遗传改良提供可靠依据。【方法】对南宁市林业科学研究所26年生马尾松初级种子园169个半同胞家系子代测定林进行长期定位观测,分析了树高、胸径和材积3个性状的方差分析、遗传力分析和家系选择。【结果】家系间树高、胸径、材积存在极显著差异,表明马尾松初级无性系种子园的半同胞家系间存在丰富的变异,改良潜力较大;分别有2.96%和5.33%的家系材积生长量低于古蓬种源和武鸣种源,表明建园优树无性系具有较好的基因型;树高、胸径和材积的家系遗传力分别为0.555、0.466和0.423,属中等至高等遗传力;3个性状的单株遗传力分别为0.219、0.128和0.111,属低等遗传力;家系遗传力和单株遗传力均表现为树高>胸径>材积,即树高具有较强遗传力。【结论】以家系材积均值和材积变异系数作为选择指标进行马尾松优良家系选择,其中37、98、107、113和137号5个家系入选,可作为优良家系进行推广应用。

关键词：马尾松无性系种子园子代林家系选择