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基于混合特征的药物相互作用预测方法研究

基于混合特征的药物相互作用预测方法研究

作者：李储吉林大学

学位级别：硕士

药物相互作用预测有助于更好的理解药物,其对于安全用药与新药研发有至关重要的意义。经济成本高昂、实验周期长的缺陷使药物湿实验无法大规模开展。深度学习算法辅助药物湿实验研究有着成本低、时间快、范围广的优势。因此,研究精度更... 详细信息

药物相互作用预测有助于更好的理解药物,其对于安全用药与新药研发有至关重要的意义。经济成本高昂、实验周期长的缺陷使药物湿实验无法大规模开展。深度学习算法辅助药物湿实验研究有着成本低、时间快、范围广的优势。因此,研究精度更高的深度学习计算方法对预测药物相互作用具有重要意义。目前基于深度学习的药物相互作用模型主要集中于药物单一属性研究,如药物分子图、药物SMILES、酶、靶点、通路等,通常忽略药物混合特征中的多元语义信息和药物关系网络中潜在关系信息。然而这些信息对综合理解药物特征至关重要。针对上述问题,本文综合使用药物混合特征,提出基于线图子图生成策略的药物相互作用预测模型与基于图对比学习的药物相互作用事件类型预测模型,主要贡献如下:1.本文在使用药物混合特征的基础上,引入线图转换策略,提出一种基于线图子图生成策略的药物相互作用预测模型。模型框架由三部分构成,分别是药物关系图构建模块、线图子图生成模块、图级分类模块。药物关系图构建模块对混合药物SMILES、酶和靶点多元语义信息的药物特征进行特征增强,并将增强后的特征作为节点特征构建药物关系图。为充分捕捉药物关系图中的潜在关系信息,本文从药物关系的角度出发,在线图子图生成模块中,将药物关系图映射到线图空间,并提出线图子图生成策略,以提取目标节点周围的关键结构信息,生成融合关系信息与节点特征的线图子图。与药物关系图相比,线图子图表现出更聚合的节点特征与更简化的网络拓扑结构。最终通过Graphormer分类器与Graph SAGE分类器对线图子图进行分类以预测药物相互作用。实验结果表明本文所提出的模型较其他基线模型性能有明显提升。消融实验结果表明混合特征增强方法与线图子图生成模块对于提升模型预测能力具有重要作用。2.本文在使用药物混合特征基础上,引入图对比学习策略,提出一种基于图对比学习的药物相互作用事件类型预测模型。模型框架由两部分构成,分别是药物混合特征学习模块与药物关系图对比学习模块。通过药物混合特征学习模块对混合药物酶和靶点信息的药物分子图进行特征学习,将得到的药物特征作为药物关系图的初始节点特征。在药物关系图对比学习模块中,利用多头注意力机制计算图中节点特征的注意力权重,之后通过GNN-FILM进行消息传递与特征聚合,将药物关系图中潜在的关系信息聚合到节点特征上。该模块引入图对比学习策略,根据药物关系图生成扰乱节点特征与扰乱边标签的两种负视图,并与正视图共同训练模型参数,以捕捉与正视图的一致性以及与负视图的差异性。实验结果表明本文提出的模型预测效果优于其他基线模型,消融实验结果表明药物混合特征学习模块与药物关系图对比学习模块在提高模型性能方面起到了关键作用。

关键词：药物相互作用预测药物混合特征图神经网络注意力机制图对比学习

现代学徒制框架下聋校职业教育“多导师制”建设路径——以江苏省无锡市特殊教育学校为例

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现代特殊教育 2024年第16期 75-80页

作者：周嬿江苏省无锡市特殊教育学校江苏无锡214000

江苏省无锡市特殊教育学校针对聋校职业教育师资不足和校企协同育人难题,创新性地提出“多导师制”。该制度通过整合校内学科导师、德育导师以及校外企业导师和岗位师傅,构建了一支多元化、立体化的导师团队,有效缓解了师资短缺问题,为... 详细信息

江苏省无锡市特殊教育学校针对聋校职业教育师资不足和校企协同育人难题,创新性地提出“多导师制”。该制度通过整合校内学科导师、德育导师以及校外企业导师和岗位师傅,构建了一支多元化、立体化的导师团队,有效缓解了师资短缺问题,为听障学生提供了全面深入的职业教育支持。“多导师制”建设路径主要有设立标准以组建专业高效的导师团队、完善培养机制以促进团队成长、建立保障体系以确保团队稳定。实践证明,该制度对聋校职业教育的创新与发展具有显著的推动作用,更为现代学徒制在聋校的推广提供了宝贵经验。

关键词：聋校职业教育 “多导师制” 师资培养现代学徒制校企合作

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基于深度强化学习的停机位分配问题的研究

基于深度强化学习的停机位分配问题的研究

作者：储同中国民用航空飞行学院

学位级别：硕士

随着全球经济的稳步增长和航空运输业务的迅猛发展,民用航空业在综合交通体系中的地位急剧上升。因此对机场运营效率提出了高标准的要求,特别是在停机位分配上。本文针对停机位分配问题进行了系统的研究,为了实现远机位分配数量最小以... 详细信息

随着全球经济的稳步增长和航空运输业务的迅猛发展,民用航空业在综合交通体系中的地位急剧上升。因此对机场运营效率提出了高标准的要求,特别是在停机位分配上。本文针对停机位分配问题进行了系统的研究,为了实现远机位分配数量最小以及近机位空闲时间最小的分配目标,通过将深度强化学习技术与停机位分配问题相结合,并根据航班的实际到达时间进行实时的停机位分配。主要研究内容如下:首先,介绍了机场系统构成和停机位分配流程,明确了停机位分配的重要性和其面临的挑战。针对机场停机位分配的多目标、多约束特性,提出了一个以最小远机位分配数量和最小近机位空闲时间为目标的多目标的数学模型,该模型考虑到了航班实际进港和出港的时间、机型类别以及停机位间的相互关系等参数。通过对航班和机位之间的相关参数进行了详细定义,并提出了保障模型合理化和适用性的基本假设。同时使用遗传算法(GA)、粒子群算法(PSO)和遗传粒子群算法(GAPSO)进行仿真,验证了该模型的可行性。其次,本文深入研究了基于深度强化学习方法,特别是深度确定性策略梯度算法(Deep Deterministic Policy Gradient,DDPG)的应用,并对停机位分配过程进行优化。通过引入马尔可夫决策过程与停机位分配问题相结合,设计了状态空间、动作空间和奖励函数,从而构建了马尔科夫决策模型。通过设计当前Actor-Critic网络、目标Actor-Critic网络和经验回放机制,详细描述了DDPG算法的实现过程。仿真实验表明,深度强化学习中的DDPG算法相较于传统算法,可以更好的降低远机位分配数量和近机位空闲时间,为机位分配提供较优方案。最后,为了提高DDPG算法的寻优能力与算法性能,本文设计了改进后的DDPG算法,集成了优先级经验回放机制和多策略融合探索机制,以增强算法性能。将改进的算法应用于机位分配问题,并与其他算法进行了对比实验。结果显示,改进的DDPG算法在减少最小远机位分配数量和优化近机位空闲时间方面是相比于其他算法提升效果十分显著。同时对比改进的DDPG算法与未改进的DDPG算法,改进后的DDPG算法还展现出更快的收敛速度和更强的全局寻优能力,证实了改进后的DDPG算法的有效性。

关键词：停机位分配深度学习强化学习遗传粒子群算法 DDPG算法

基于无人机的矿区地表特征点云提取方法及变形监测研究

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基于无人机的矿区地表特征点云提取方法及变形监测研究

作者：储栋安徽理工大学

学位级别：硕士

农村红色展馆建设浅议——以海盐县彭家堰纪念馆为例

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浙江档案 2024年第7期 56-57页

作者：汤储良海盐县档案馆(县史志研究室)

近年来，农村的红色档案文献资料陆续走向开放、走向现代化、走向社会，这是历史的必然选择。农村蕴含了丰富红色资源的一个重要领域。发挥农村地区各类红色档案文献资料的价值，收集、整理、挖掘并且展示运用各类红色主题党史资料，因... 详细信息

近年来，农村的红色档案文献资料陆续走向开放、走向现代化、走向社会，这是历史的必然选择。农村蕴含了丰富红色资源的一个重要领域。发挥农村地区各类红色档案文献资料的价值，收集、整理、挖掘并且展示运用各类红色主题党史资料，因地制宜建设一些场馆进行展陈，对于教育党员干部和广大青少年不忘党的历史、传承红色基因、永远听党话跟党走具有不可替代的作用。

关键词：农村地区党史纪念馆红色档案文献资料展示实证研究

乌梅丸通过调控miR-146a对溃疡性结肠炎大鼠结肠细胞凋亡的影响及机制研究

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中国免疫学杂志 2024年第3期40卷 551-555页

作者：杨雪储琳泰州市中医院药学部泰州225300 泰州市中医院脾胃病科泰州225300

目的:探讨乌梅丸通过调控miR-146a对溃疡性结肠炎(UC)大鼠结肠细胞凋亡的影响及机制。方法:选取50只SD大鼠,每组10只,分为正常对照组、模型组、乌梅丸低、中、高剂量组,转染anti-miR-NC、anti-miR-146a、miR-NC、miR-146a,作为anti-miR... 详细信息

目的:探讨乌梅丸通过调控miR-146a对溃疡性结肠炎(UC)大鼠结肠细胞凋亡的影响及机制。方法:选取50只SD大鼠,每组10只,分为正常对照组、模型组、乌梅丸低、中、高剂量组,转染anti-miR-NC、anti-miR-146a、miR-NC、miR-146a,作为anti-miR-NC组、anti-miR-146a组、乌梅丸+miR-NC组、乌梅丸+miR-146a组。CCK-8检测细胞增殖;流式细胞术检测细胞凋亡;RT-qPCR检测细胞miR-146a表达;ELISA检测细胞IL-1β、IL-13含量;Western blot检测细胞B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、Bax蛋白表达。结果:与正常对照组比较,模型组细胞存活率、Bcl-2蛋白表达降低,细胞凋亡率、Bax蛋白表达、IL-1β、IL-13含量、miR-146a表达升高(P<0.05);与模型组比较,乌梅丸显著升高细胞存活率、Bcl-2蛋白表达,降低细胞凋亡率、Bax蛋白表达、IL-1β、IL-13含量、miR-146a表达(P<0.05)。抑制miR-146a可提高细胞存活率、Bcl-2蛋白表达,降低细胞凋亡率、IL-1β、IL-13含量、Bax蛋白表达(P<0.05)。过表达miR-146a表达逆转乌梅丸对UC大鼠结肠细胞增殖和凋亡的影响。结论:乌梅丸通过上调miR-146a表达降低UC大鼠结肠细胞凋亡。

关键词：乌梅丸 miR-146a 溃疡性结肠炎结肠细胞增殖凋亡

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婺源两地入选首批陆生野生动物重要栖息地名录

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婺源两地入选首批陆生野生动物重要栖息地名录

突发公共卫生事件下多周期防护物资生产设施选址与订单分配研究

上饶日报

作者：吴嬿

婺源讯近日，国家林业和草原局发布了首批陆生野生动物重要栖息地名录，婺源森林鸟类国家级自然保护区和婺源饶河源国家湿地公园入选。婺源森林鸟类国家级自然保护区是全国唯一以森林鸟类命名的国家级自然保护区，位于江西、浙江、安徽... 详细信息

婺源讯近日，国家林业和草原局发布了首批陆生野生动物重要栖息地名录，婺源森林鸟类国家级自然保护区和婺源饶河源国家湿地公园入选。婺源森林鸟类国家级自然保护区是全国唯一以森林鸟类命名的国家级自然保护区，位于江西、浙江、安徽3省交界处。婺源县境内的黄山、天目山......

关键词：陆生野生动物栖息地

来源： cnki报纸评论

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系统科学与数学 2024年

作者：吴鹏谢华鑫储诚斌福州大学经济与管理学院

在公共卫生事件如COVID-19发生时,防护物资产能不足会极大增加疫情蔓延的风险,合理生产和分配防护物资是应对突发公共卫生事件的关键.公共卫生事件根据感染人数、蔓延速度等显著特征可划分为出现、爆发、波峰及衰减四个阶段,本研究针对... 详细信息

在公共卫生事件如COVID-19发生时,防护物资产能不足会极大增加疫情蔓延的风险,合理生产和分配防护物资是应对突发公共卫生事件的关键.公共卫生事件根据感染人数、蔓延速度等显著特征可划分为出现、爆发、波峰及衰减四个阶段,本研究针对一类突发公共卫生事件下多周期防护物资生产设施选址与订单分配问题,以最大化防护物资生产综合效益为目标,优化工厂的产能迁移、生产计划以及分配中心的库存与交付决策.首先将上述问题建立为一个混合整数非线性规划模型;其次通过挖掘问题特性开发了一种混合自适应大邻域搜索算法,设计了融合问题特性的固定分解优化策略和基于问题特征的四种成对算子以提升算法寻优能力.大量数值实验结果表明:1)所提出的算法在求解小规模算例时,能在9秒内获得距离最优解平均差距为3.25%的满意解;求解大规模算例时,所提出算法能够在平均求解时间缩短82.1%的情况下获得距离最优解平均差距为5.44%的满意解;2)在公共卫生事件发生时,产能迁移策略可以为疫情严重区域提供更为有效的物资保障,同时在后疫情时代缓解供应链的产能过剩现象.

关键词：多周期动态设施选址产能迁移订单分配延期交付大邻域搜索算法

基于YOLOv5和改进DeeplabV3+的青藏高原植被提取算法

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草业学报 2024年

作者：闫储淇黄建强青海大学计算机技术与应用学院青海省智能计算与应用实验室

青藏高原的植被覆盖度是生态研究和环境监测的重要指标。传统的植被覆盖度检测方法在地形简单且植被分布集中的区域效果较好，但在复杂地形下由于成本高、调查范围受限、耗时长等问题，导致植被提取精度受限。近年来，计算机视觉和深度... 详细信息

青藏高原的植被覆盖度是生态研究和环境监测的重要指标。传统的植被覆盖度检测方法在地形简单且植被分布集中的区域效果较好，但在复杂地形下由于成本高、调查范围受限、耗时长等问题，导致植被提取精度受限。近年来，计算机视觉和深度学习技术的飞速发展为青藏高原复杂地形下的植被精准提取开辟了新的可能性。本研究提出一种结合YOLOv5和改进DeeplabV3+的双阶段植被提取算法。算法引入基于YOLOv5的植被目标检测模型，以减少背景对第二阶段植被分割任务的干扰；设计新型的DeeplabV3+语义分割模型，以实现精准的植被分割提取。改进的模型引入了轻量级主干网络MobileNetV2、优化了ASPP模块膨胀卷积参数，并集成EMA和CloAttention注意力机制。在青藏高原无人机航拍数据集上的实验结果显示，本算法在交并比（IoU）和像素准确率（PA）上分别达到了90.40%和96.32%，显著超过现有技术，且大幅降低了模型参数。本算法在多种环境条件下均展示了高精度的植被提取能力，可以为青藏高原植被覆盖度的快速、精准测定提供有效的技术支持。

关键词：青藏高原植被提取深度学习 YOLOv5 DeeplabV3+