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水稻AP2/EREBP转录因子响应非生物胁迫的表达谱分析

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中国农业科学 2009年第11期42卷 3765-3773页

作者：靳鹏黄立钰王迪吴慧敏朱苓华傅彬英中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源和遗传改良国家重大科学工程

【目的】了解AP2/EREBP家族基因参与逆境反应分子机理,为水稻抗逆相关基因的克隆及揭示水稻抗逆分子调控机理奠定基础。【方法】采用基因芯片技术分析AP2/EREBP家族基因在水稻幼苗受PEG、低温、高盐、ABA、GA等处理下的表达谱变化,并通... 详细信息

【目的】了解AP2/EREBP家族基因参与逆境反应分子机理,为水稻抗逆相关基因的克隆及揭示水稻抗逆分子调控机理奠定基础。【方法】采用基因芯片技术分析AP2/EREBP家族基因在水稻幼苗受PEG、低温、高盐、ABA、GA等处理下的表达谱变化,并通过实时定量PCR技术对部分具有明显表达特点基因的胁迫表达谱进行验证。【结果】点制了水稻AP2/EREBP转录因子家族的基因芯片,检测到42个胁迫差异表达的AP2/EREBP基因。实时定量PCR所得结果与基因芯片结果基本吻合,说明芯片结果可靠。两个AP2/EREBP基因对所有胁迫反应相同,其它差异表达的AP2/EREBP基因对不同胁迫反应各不相同。【结论】研究发现两个AP2/EREBP基因在水稻应对外界胁迫反应中起核心分子调控作用;不同差异表达AP2/EREBP基因在水稻响应不同胁迫反应过程中具有相同或者不同的分子应答机理。

关键词：水稻 AP2/EREBP 基因芯片非生物胁迫

水稻转录因子bHLH家族基因响应环境胁迫表达谱分析

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分子植物育种 2008年第3期6卷 425-431页

作者：张子佳王迪傅彬英中国农业科学院作物科学研究所北京100081

植物转录因子在植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的作用。bHLH转录因子是植物转录因子最大的家族之一。本研究以水稻日本晴为材料,在苗期进行PEG模拟干旱胁迫和ABA(abscisicacid)处理,采用荧光定量PCR方法,比较分析干旱胁... 详细信息

植物转录因子在植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的作用。bHLH转录因子是植物转录因子最大的家族之一。本研究以水稻日本晴为材料,在苗期进行PEG模拟干旱胁迫和ABA(abscisicacid)处理,采用荧光定量PCR方法,比较分析干旱胁迫差异表达的22个候选bHLH家族基因在PEG和ABA处理下的不同时间梯度的表达谱。结果表明大部分候选基因的PEG胁迫表达谱与干旱胁迫表达谱一致,验证了芯片结果的可靠性;而在ABA处理下的大部分bHLH基因表现为抑制表达,部分基因的表达谱与干旱或PEG胁迫表达谱明显不同,推测这些bHLH基因参与PEG和ABA胁迫应答的具有相同或不同的分子路径或模式。研究结果对进一步克隆这些基因及分析其在植物生长发育过程中的分子调控模式打下了基础。

关键词：水稻转录因子 ABA 表达谱

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水稻蛋白质组学研究进展

生物技术通报 2005年第6期21卷 1-6,11页

作者：魏敏李阳生傅彬英中国农业科学院作物科学研究所北京100081 武汉大学生命科学学院武汉430072

蛋白质组是一个基因组所表达蛋白质的总称,研究内容包括蛋白质基本氨基酸序列的鉴定到相关性状、修饰、功能及不同类型蛋白分子相互作用等等。本文简要介绍了蛋白质组学的产生背景,以及主要研究技术包括双向电泳(2D-PAGE)质谱、蛋白质... 详细信息

蛋白质组是一个基因组所表达蛋白质的总称,研究内容包括蛋白质基本氨基酸序列的鉴定到相关性状、修饰、功能及不同类型蛋白分子相互作用等等。本文简要介绍了蛋白质组学的产生背景,以及主要研究技术包括双向电泳(2D-PAGE)质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交,并重点介绍了近期水稻蛋白质组学应用研究进展。

关键词：水稻蛋白质组学双向电泳质谱

DNA甲基化在植物抗逆反应中的研究进展及其育种应用

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中国农业科技导报 2013年第6期15卷 83-91页

作者：黄菲李雪梅王文生傅彬英沈阳师范大学化学与生命科学学院沈阳110034 中国农业科学院作物科学研究所农作物基因资源和遗传改良国家重大科学工程北京100081

DNA甲基化指通过对基因组DNA上的胞嘧啶的共价修饰,从而对生物遗传信息进行表观遗传水平上的调控,其在植物应对外界环境胁迫、调控基因的表达、稳定基因组等方面发挥重要作用。综述了DNA甲基化在植物抗逆反应中功能研究的最新进展及DNA... 详细信息

DNA甲基化指通过对基因组DNA上的胞嘧啶的共价修饰,从而对生物遗传信息进行表观遗传水平上的调控,其在植物应对外界环境胁迫、调控基因的表达、稳定基因组等方面发挥重要作用。综述了DNA甲基化在植物抗逆反应中功能研究的最新进展及DNA甲基化的隔代遗传以及其在植物育种中的潜在应用,为从表观遗传水平上研究植物抗逆性的机理以及DNA甲基化在育种上的应用提供理论参考。

关键词：植物 DNA甲基化抗逆反应育种

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植物表观遗传变化与环境压力研究进展

分子植物育种 2008年第3期6卷 569-573页

作者：王迪傅彬英张立军沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

表观遗传学研究的是生物可遗传的染色质修饰。目前,其主要研究内容包括DNA甲基化、翻译后组蛋白修饰、组蛋白组成变化。小分子RNA在调控生物表观遗传的变化中起到了重要作用。在环境压力下,植物发生了复杂的表观遗传变化。在基因组水平... 详细信息

表观遗传学研究的是生物可遗传的染色质修饰。目前,其主要研究内容包括DNA甲基化、翻译后组蛋白修饰、组蛋白组成变化。小分子RNA在调控生物表观遗传的变化中起到了重要作用。在环境压力下,植物发生了复杂的表观遗传变化。在基因组水平上发生脱甲基化反应,以启动压力相关基因表达。同时,翻译后组蛋白修饰和组蛋白组成也发生变化。而且,甲基化与翻译后组蛋白修饰之间有紧密的联系。部分表观遗传修饰在压力去除后可以发生可逆性回复,还有一部分表观遗传修饰是可以遗传的。本文介绍了植物表观遗传变化与环境压力的关系。

关键词：植物表观遗传学环境压力

应用Gateway技术构建水稻OsDAD1基因的RNA干涉载体

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分子植物育种 2007年第1期5卷 133-136页

作者：徐化学熊建华傅彬英中国农业科学院作物科学所北京100081

近年来,RNA干涉广泛应用于植物基因功能研究。Gateway技术是通过采用多重载体高效构建目标基因及任何DNA片段克隆和表达载体的研究平台,该技术以λ噬菌体的位点特异性重组体系为基础,两端具有重组位点的DNA片段或目标基因可以非常容易... 详细信息

近年来,RNA干涉广泛应用于植物基因功能研究。Gateway技术是通过采用多重载体高效构建目标基因及任何DNA片段克隆和表达载体的研究平台,该技术以λ噬菌体的位点特异性重组体系为基础,两端具有重组位点的DNA片段或目标基因可以非常容易地被重组克隆到含同源重组位点的载体上。这种以重组为基础的克隆体系目前已被广泛应用于分子生物学中来分析基因的功能。本文应用Gateway技术体系替代传统载体构建方法,构建了水稻基因OsDAD1的RNA干涉载体,从而证明了Gateway技术的可行性。

关键词： RNA干涉载体 Gateway,OsDAD1基因

半定量RT-PCR方法研究microRNA393在旱处理后的孕穗期水稻叶片和穗部的表达情况

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分子植物育种 2008年第2期6卷 355-357页

作者：王迪傅彬英张立军沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

microRNAs是新近发现的一类具有重要功能的小分子RNA。研究表明,一些mi RNAs与植物抗逆反应相关。本文使用半定量RT-PCR的方法,研究了mi R393在旱处理后的孕穗期水稻叶片和穗部的表达情况。结果发现,mi R393在胁迫后的叶片和穗部表达上... 详细信息

microRNAs是新近发现的一类具有重要功能的小分子RNA。研究表明,一些mi RNAs与植物抗逆反应相关。本文使用半定量RT-PCR的方法,研究了mi R393在旱处理后的孕穗期水稻叶片和穗部的表达情况。结果发现,mi R393在胁迫后的叶片和穗部表达上调。同时也发现,mi R393在胁迫前后穗部的表达略高于其在叶片中的表达。实验结果也表明,半定量RT-PCR适用于分析mi RNAs的表达。

关键词：半定量RT-PCR miR393 水稻旱胁迫

水稻干旱胁迫诱导DNA甲基化时空变化特征分析

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中国农业科学 2009年第9期42卷 3009-3018页

作者：潘雅姣傅彬英王迪朱苓华黎志康中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源和遗传改良重大科学工程 International Rice Research Institute

【目的】研究水稻抗旱导入系DK106和旱敏感轮回亲本IR64苗期和分蘖期干旱胁迫前后DNA甲基化的变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化特征,探讨DNA甲基化在水稻干旱胁迫反应中的作用。【方法】用甲基化敏感扩增多态性技术(methylat... 详细信息

【目的】研究水稻抗旱导入系DK106和旱敏感轮回亲本IR64苗期和分蘖期干旱胁迫前后DNA甲基化的变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化特征,探讨DNA甲基化在水稻干旱胁迫反应中的作用。【方法】用甲基化敏感扩增多态性技术(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)和高效液相层析(high performance liquid chromatography,HPLC)方法分析DNA甲基化变化情况;从聚丙烯酰胺凝胶回收甲基化多态性片段并克隆测序及序列比对。【结果】MSAP分析结果显示,水稻基因组中约有20%的CCGG位点发生了胞嘧啶甲基化;水分胁迫导致DNA甲基化平均水平明显增加,其中根部增加幅度尤为明显;DNA甲基化水平及状态变化在品种间存在差异,同时具有时期及组织特异性。对干旱胁迫特异诱导DNA甲基化片段序列分析结果表明,基因编码区和非编码区发生DNA甲基化的频率基本相同。【结论】干旱胁迫反应过程中DNA甲基化表现出一定时空特异性和品种特异性,且与品种抗旱性差异相关。

关键词： DNA甲基化干旱胁迫甲基化敏感扩增多态性高效液相层析

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水稻MYB转录因子冷胁迫表达谱分析

分子植物育种 2014年第1期12卷 9-16页

作者：刘晓月张婷黄立钰王文生傅彬英中国农业科学院作物科学研究所农作物基因资源和遗传改良国家重大科学工程北京100081 杂交水稻国家重点实验室武汉大学生命科学院武汉430072

本论文以耐冷粳稻品种丽江新团黑谷及冷敏感籼稻品种IR29为研究材料,在4℃低温条件下进行处理,采用荧光定量PCR技术分析MYB转录因子候选基因的表达模式。研究发现低温胁迫条件下,45个MYB基因在两个品种中的表达谱存在较大差异,鉴定了部... 详细信息

本论文以耐冷粳稻品种丽江新团黑谷及冷敏感籼稻品种IR29为研究材料,在4℃低温条件下进行处理,采用荧光定量PCR技术分析MYB转录因子候选基因的表达模式。研究发现低温胁迫条件下,45个MYB基因在两个品种中的表达谱存在较大差异,鉴定了部分耐冷品种特异冷胁迫差异表达MYB基因;另外有小部分MYB基因在两个品种表达方式一致,但表达量存在较大差异。结果表明MYB基因低温胁迫下的不同表达方式或差异表达量可能与两个品种的不同耐冷性相关,研究为进一步分析耐冷候选MYB基因功能打下了基础。

关键词：水稻低温胁迫 MYB转录因子定量PCR