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溶剂效应的TLSER描述及其在几类异构化反应中的应用

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有机化学 2000年第4期20卷 537-541页

作者：邹建卫商志才易平贵俞庆森林瑞森浙江大学化学系杭州310027

建立了适合于描述溶剂效应的理论线性溶剂化能相关(TLSER)模型。并用该模型对四类异构化反应在不同溶剂下的反应自由能或活化自由能与溶剂的分子结构之间的关系进行了研究,确证了模型的合理性。

关键词：理论线性溶剂化能相关溶剂效应 AM1 异构化反应

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丙氨酸自由基的推拉效应

物理化学学报 1994年第8期10卷 765-768页

作者：俞庆森蔡国强吴念慈李卫星浙江大学化学系!杭州310027 浙江工学院化学系!杭州310014 杭州大学化学系!杭州310028

本文用ab initio量子化学方法对丙氨酸自由基的稳定性及推拉效应进行了研究。计算结果, 丙氨酸自由基稳定化能为***~-~1, 而它的额外稳定化能为***~-~1, 这表明自由基具有中等的推拉效应。图2表3参9

关键词：推拉效应丙氨酸自由基 Abinitio计算

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污油泥调剖剂的研究与性能评价

浙江大学学报（理学版） 2005年第6期32卷 658-662页

作者：范振中俞庆森浙江大学化学系浙江杭州310027

通过分析油田产出含油污泥组分和粒径,确定以含油污泥为主要原材料,添加适当化学药剂和固相颗粒得到一种新型含油污泥调剖剂.合理配方(质量分数)为:污油泥50%+悬浮剂0.2%～0.3%+乳化剂0.3%～0.4%+膨润土8%+水,固含量大于15.65%,调剖剂... 详细信息

通过分析油田产出含油污泥组分和粒径,确定以含油污泥为主要原材料,添加适当化学药剂和固相颗粒得到一种新型含油污泥调剖剂.合理配方(质量分数)为:污油泥50%+悬浮剂0.2%～0.3%+乳化剂0.3%～0.4%+膨润土8%+水,固含量大于15.65%,调剖剂体系稳定,不产生分层现象.岩心实验表明,当孔喉与颗粒粒径之比在9.0～12.0时,调剖剂可以顺利进入岩心,实现稳态注入,当固相颗粒加入量大于8%时,岩心封堵率可达94%.该技术有助于解决含油污泥外排造成的环境污染问题,为油田综合治理、降低生产成本提供了一项新措施.

关键词：含油污泥调剖剂渗透率封堵率油田化学

新型手性N,N′-双支套索冠醚的合成及其应用

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有机化学 2005年第11期25卷 1473-1476页

作者：王成云汪大翚冷桃花俞庆森浙江大学环境工程研究所杭州310027 浙江大学化学系杭州310027

(S)-苯丙氨醇和原氯乙酸三乙酯作用得到的手性酰胺醇和手性噁唑啉分别与1,7-二氮-12-冠-4反应,得到了两种手性N,N′-双支套索冠醚N,N′-二[(S)-N-(1-羟甲基-2-苯基乙基)乙酰胺-2]-1,7-二氮-12-冠-4(1a)和N,N′-二[(S)-4-苄基-噁唑啉-2-... 详细信息

(S)-苯丙氨醇和原氯乙酸三乙酯作用得到的手性酰胺醇和手性噁唑啉分别与1,7-二氮-12-冠-4反应,得到了两种手性N,N′-双支套索冠醚N,N′-二[(S)-N-(1-羟甲基-2-苯基乙基)乙酰胺-2]-1,7-二氮-12-冠-4(1a)和N,N′-二[(S)-4-苄基-噁唑啉-2-亚甲基]-1,7-二氮-12-冠-4(1b).前者应用于D/L-肉碱的手性分离;后者的铜配合物用于重氮醋酸酯对烯烃的不对称环丙烷化反应.

关键词：手性N,N'-双支套索冠醚合成 D/L-肉碱手性分离不对称环丙烷化手性酰胺醇套索冠醚不对称环丙烷化反应应用 L-肉碱

SET区域Rubisco赖氨酸甲基化转移酶催化赖氨酸多重甲基化的量子力学研究

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化学学报 2009年第5期67卷 372-380页

作者：蒋彦可邹建卫卢运祥蒋勇军俞庆森浙江大学化学系杭州310027 浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室宁波315104

用从头计算和DFT方法计算S-腺苷甲锍氨酸多重甲基化赖氨酸的反应机理.气相中非催化反应的能垒比较低,反应势能剖面类似于SN2反应,而在电介质中,反应能垒很高.在B3LYP/6-31G*和ONIOM(MP2:B 3LYP)水平,研究了Rubisco大亚基甲基转移酶活性... 详细信息

用从头计算和DFT方法计算S-腺苷甲锍氨酸多重甲基化赖氨酸的反应机理.气相中非催化反应的能垒比较低,反应势能剖面类似于SN2反应,而在电介质中,反应能垒很高.在B3LYP/6-31G*和ONIOM(MP2:B 3LYP)水平,研究了Rubisco大亚基甲基转移酶活性位点的三个残基催化转移甲基到赖氨酸反应的过程.在ONIOM(MP2:B3LYP)水平,预测的反应能垒为82.8kJ/mol,与从实验得到的87.4kJ/mol接近.计算结果表明,酶对过渡态并没有特殊的稳定作用,主要通过为反应物提供一个没有溶剂的环境,用临近的残基把亲电和亲核的底物连接在一起,进而促使甲基化反应的进行.

关键词：赖氨酸甲基化甲基化转移酶 S-腺苷甲锍氨酸洋葱算法从头计算

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两类HPPD酶抑制剂的比较分子场分析研究

化学学报 2002年第9期60卷 1556-1563页

作者：黄美兰商志才邹建卫杨定亚俞庆森浙江大学化学系杭州310027 台湾东海大学化学系台中40704

用比较分子场分析法 (CoMFA)研究了环己二酮类及 3 烷基酸 2 环己烯酯类化合物的结构与活性的关系 .本研究从蛋白酶与底物动力学模拟的复合物结构出发构建两类抑制剂化合物分子的构象 ,并进行了全空间搜索 ,CoMFA分析得到了较好的模型 ... 详细信息

用比较分子场分析法 (CoMFA)研究了环己二酮类及 3 烷基酸 2 环己烯酯类化合物的结构与活性的关系 .本研究从蛋白酶与底物动力学模拟的复合物结构出发构建两类抑制剂化合物分子的构象 ,并进行了全空间搜索 ,CoMFA分析得到了较好的模型 (交叉验证回归系数q2 =0 .779,模型的线性回归系数r2 =0 .989) .该方程不仅可以帮助推测抑制剂与受体的结合方式 ,还可定量地预测结构相近的类似物活性 ,为设计合成新的HPPD酶抑制剂提供了理论依据 .

关键词： HPPD酶抑制剂比较分子力场分析法 HPPD酶动力学模拟 3-烷基酸-2-环乙烯酯除草剂结构活性 4-羟苯基丙酮酸双氧化酶环己酮

考虑极性基团相互作用影响的疏水常数计算方法

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Chinese Journal of Chemical Physics 2000年第4期13卷 468-472页

作者：李新华朱龙观俞庆森浙江大学玉泉校区化学系杭州310027

通过对点价的修正，将分子连接性指数转变成为一种量子拓扑指数。由于改进后的量子拓朴指数能够很好地表达分子的体积和电性等结构信息，因此该指数与疏水常数计算中的极性基团相互作用有很好的相关性。实际计算表明，对于含有极性基... 详细信息

通过对点价的修正，将分子连接性指数转变成为一种量子拓扑指数。由于改进后的量子拓朴指数能够很好地表达分子的体积和电性等结构信息，因此该指数与疏水常数计算中的极性基团相互作用有很好的相关性。实际计算表明，对于含有极性基团的分子，用该指数计算的结果更加精确。

关键词：极性基团相互作用疏水常数量子拓扑指数

甘氨酸自由基推拉效应的ab initio计算

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科学通报 1991年第11期36卷 827-829页

作者：李卫星周洵钧蔡国强俞庆森杭州大学化学系杭州310028 浙江大学化学系杭州310027

推拉效应指的是当自由基中心碳原子同时连有推电子基与吸电子基时,该自由基特别稳定的一种现象。反应中如涉及这种自由基,反应的速度、选择性,产率及机理等皆会有变化。因此近年来,人们对此呈现很大的兴趣。最早从理论上研究多取代自... 详细信息

推拉效应指的是当自由基中心碳原子同时连有推电子基与吸电子基时,该自由基特别稳定的一种现象。反应中如涉及这种自由基,反应的速度、选择性,产率及机理等皆会有变化。因此近年来,人们对此呈现很大的兴趣。最早从理论上研究多取代自由基稳定性的是Dewar。

关键词：甘氨酸自由基推拉效应氨基酸

药物水溶解度的QSAR研究和VolSurf参数

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Chinese Journal of Structural Chemistry 2004年第4期23卷 452-458页

作者：金海晓胡桂香吴天星商志才邹建卫俞庆森浙江大学理学院化学系浙江杭州310027 浙江大学宁波理工学院浙江宁波315104

药物的水溶解度与其吸收密切相关。本文利用一种新的计算方法,VolSurf,预测药物的水溶解度并测定有利于药物水溶解度的主要分子特征。被测化合物包括26个结构不同的药物,通过偏最小二乘分析法,对药物水溶解度实验值与分子特征进行相关,... 详细信息

药物的水溶解度与其吸收密切相关。本文利用一种新的计算方法,VolSurf,预测药物的水溶解度并测定有利于药物水溶解度的主要分子特征。被测化合物包括26个结构不同的药物,通过偏最小二乘分析法,对药物水溶解度实验值与分子特征进行相关,得到较好的模型(r2=0.90,q2=0.77)。将化合物分为训练集和预测集进行相关分析,结果表明以18个化合物所建立的训练集模型对其余8个化合物有较好的预测能力,预测的标准偏差(SDEP)为0.59。参数分析表明分子与水相互作用的3个局部能量最小值越小,且它们之间的距离越大,对其水溶解度越有利;亲水性占主导因素的分子有高的水溶解度;分子的疏水性越强,在水中的溶解性越弱;大分子的溶解度较小分子溶解度低。

关键词：药物水溶解度吸收 QSAR VolSurf参数主成分分析偏最小二乘分析定量构效关系三维结构