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GSTO1、LAMA5和ITGA6在EOC组织中的表达与患者临床病理预后及免疫细胞浸润的关系

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GSTO1、LAMA5和ITGA6在EOC组织中的表达与患者临床病理预后及免疫...

作者：侯纪帅石河子大学

学位级别：硕士

目的:探讨上皮性卵巢癌(Epithelial Ovarian Cancer,EOC)患者肿瘤组织中谷胱甘肽S-转移酶1(Glutathione-S-transferaseΩ-1,GSTO1)、层粘连蛋白亚基α5(Lamininα5,LAMA5)、整合素α6(Integrinα6,ITGA6)表达水平与患者临床病理特征、预后和免疫细胞浸润的关系。方法:1、卵巢癌(Ovarian Cancer,OC)高转移细胞和亲本细胞N-糖基化定量分析:课题组将OC高转移性细胞和亲本细胞各三对(由华中科技大学同济医学院附属协和医院王泽华教授团队馈赠)送至华大基因进行蛋白质N-糖基化检测分析(检测序号:F19FTSNWWLJ7959＿J200109064),结果显示,在肿瘤通路中GSTO1、LAMA5、ITGA6存在N-糖基化修饰的显著差异,课题组基于此,对GSTO1、LAMA5、ITGA6三个蛋白进行了深入研究。2、生物信息学方法探究GSTO1、LAMA5、ITGA6在OC中的表达以及与患者临床病理特征、预后和免疫细胞的浸润的关系:(1)c Bioprotal数据库探究GSTO1、LAMA5、ITGA6基因在OC中的基因突变情况。(2)GEPIA2和GEO数据库分析GSTO1、LAMA5、ITGA6在OC组织及对照组中的表达。(3)TCGA数据库分析GSTO1、LAMA5和ITGA6基因表达与患者临床病理特征的相关性。(4)Kaplan-Meier plotter数据库分析GSTO1、LAMA5和ITGA6基因表达与患者预后的关系。(5)STRING数据库分析GSTO1、LAMA5、ITGA6三个蛋白间的相互作用。(6)GSEA功能富集分析GSTO1、LAMA5、ITGA6基因在OC中发挥作用可能的机制。(7)GEPIA2数据库分析GSTO1、LAMA5、ITGA6表达与PD-1、PD-L1、CTLA4的相关性;TIMER数据库和Cibersort算法分析三个基因表达与免疫细胞浸润的关系;Kaplan-Meier plotter数据库分析不同免疫细胞浸润状态下三个基因表达与患者预后的关系。3、选取2010年01月至2022年05月石河子大学医学院第一附属医院收治的110例EOC患者的肿瘤组织为实验组,获得病理蜡块并制作组织芯片,选取30例正常输卵管伞端上皮组织作为对照。4、免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)染色检测GSTO1、LAMA5、ITGA6在110例EOC组织和30例正常对照中的表达,根据IHC染色结果划分为高表达组和低表达组,≥4分定义为高表达,0.05);GEO数据集分析显示LAMA5与ITGA6在OC中的表达较正常对照组高,差异具有统计学意义(P均<0.001)。(3)TCGA数据库显示GSTO1、ITGA6在OC中表达水平与患者FIGO分期有相关性,LAM A5表达水平与肿瘤分化程度有相关性,(P均<0.05)。(4)检索Kaplan-Meier plotter数据库结果提示,GSTO1、LAMA5基因高表达与患者较短的O S相关(P均<0.05),

关键词： EOC GSTO1 LAMA5 ITGA6 临床病理特征及预后免疫

石河子地区1080例TCT和HPV双筛异常阴道镜活检患者宫颈病变特点

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中国医师杂志 2022年第1期24卷 29-34页

作者：阮阳阳韦艳侯纪帅白瑞徐晓涵杨萍石河子大学医学院第一附属医院妇科石河子832008

目的探讨近两年新疆石河子地区女性患者宫颈病变特点,为临床工作和当地宫颈癌筛查提供指导。方法回顾性分析2017年5月至2019年3月在石河子大学医学院第一附属医院妇科门诊行人乳头瘤病毒(HPV)和子宫颈脱落细胞检查(TCT)双筛异常,行阴道... 详细信息

目的探讨近两年新疆石河子地区女性患者宫颈病变特点,为临床工作和当地宫颈癌筛查提供指导。方法回顾性分析2017年5月至2019年3月在石河子大学医学院第一附属医院妇科门诊行人乳头瘤病毒(HPV)和子宫颈脱落细胞检查(TCT)双筛异常,行阴道镜子宫颈组织活检的1080例患者的临床病理资料及其特点,logistic回归分析宫颈病变的影响因素。结果(1)未接受过学校教育(OR=2.267),有阴道不规则出血(OR=3.275)和性伴侣个数≥3个(OR=3.052)是发生宫颈病变的独立危险因素。(2)上皮内瘤变(CIN)在30~39岁组检出率最高(57.54%),子宫颈癌在≥60岁组检出率最高(14.15%),其次是40~49岁年龄组(2.20%)。(3)40~49岁年龄组HPV阳性构成比和高危HPV16/18阳性率均最高,分别是33.18%和39.38%。不同年龄组间HPV病毒载量差异无统计学意义(均P>0.05)。(4)HPV16/18阳性组CIN3和子宫颈癌的检出率均高于HPV其他亚型且TCT≥不典型鳞状上皮细胞(ASC-US)组(18.34%vs 11.33%,4.30%vs 1.82%,均P<0.05)。高载量组≥CIN2的检出率(28.44%)高于中载量组(25.32%)和低载量组(15.79%),三组间比较差异有统计学意义(P<0.05)。(5)TCT为ASC-US且HPV阳性人群中,HPV16/18阳性组CIN3的检出率显著高于HPV其他亚型阳性组(21.43%vs 8.33%,P<0.05)。结论石河子地区宫颈癌筛查时应对老年女性、未接受过学校教育人群提高宣传力度,加强健康知识宣教。石河子地区CIN和宫颈癌变者与高危型HPV感染密切相关,尤其是HPV16/18感染。HPV阳性年龄主要集中在40~49岁年龄组,CIN和宫颈癌分别在30~39岁和≥60岁年龄组检出率最高。HPV16/18分型和高病毒载量人群≥CIN2检出率高于HPV其他亚型阳性和中低载量人群。如何有效分流HPV阳性且TCT≥ASC-US人群,有待于进一步研究。

关键词：阴道镜检查人乳头状瘤病毒DNA检测子宫颈脱落细胞检查宫颈上皮内瘤样病变宫颈肿瘤

STT3A和STT3B在上皮性卵巢癌中的表达及与预后的关系

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实用医学杂志 2023年第16期39卷 2062-2070页

作者：孙崇凤杨萍侯纪帅赵邹宇于盼盼石河子大学第一附属医院妇科新疆石河子832008 国家卫生健康委中亚高发病防治重点实验室新疆石河子832008

目的探究上皮性卵巢癌(EOC)组织中STT3A和STT3B的表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法选择接受手术治疗的88例EOC患者癌组织为实验组,22例非EOC患者(子宫或卵巢良性肿瘤)的正常输卵管上皮及其正常卵巢组织为对照组。收集患者... 详细信息

目的探究上皮性卵巢癌(EOC)组织中STT3A和STT3B的表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法选择接受手术治疗的88例EOC患者癌组织为实验组,22例非EOC患者(子宫或卵巢良性肿瘤)的正常输卵管上皮及其正常卵巢组织为对照组。收集患者的临床资料并进行随访。采用免疫组织化学染色方法检测STT3A和STT3B的表达,分析其表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。结果STT3A和STT3B在EOC组织中的表达水平显著高于对照组(P<0.05),且STT3A表达水平与肿瘤分化程度、淋巴结转移密切相关(P<0.05)。STT3B的表达水平与FIGO分期、血清CA125水平、淋巴脉管间隙浸润、肿瘤分化程度、淋巴结转移具有显著的相关性(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析表明,STT3A和STT3B高表达与EOC患者的不良预后相关(P<0.05)。多因素Cox回归分析发现,STT3A和STT3B高表达是EOC患者预后的独立危险因素(P<0.05)。Western blot结果显示STT3A和STT3B在卵巢癌细胞系中高表达(P<0.05)。结论STT3A和STT3B在EOC癌组织中高表达,且其表达水平与患者不良预后有关,可能是判断EOC患者预后的潜在标志物。

关键词：上皮性卵巢癌 STT3A STT3B 临床病理特征预后

CFL-1在头颈部鳞癌中的表达与患者预后的关系

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上海口腔医学 2024年第2期33卷 148-155页

作者：赵开张宇宁纪帅旗刘颖姜涵苏州大学附属第四医院口腔科苏州市独墅湖医院苏州大学医学中心江苏苏州215000 福建医科大学口腔医院预防牙科福建省口腔疾病重点实验室福建医科大学口腔医学院福建福州350000

目的:探索Cofilin 1蛋白(Cofilin 1 protein,CFL-1)在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)中的表达、预后价值和免疫相关性。方法:在癌症基因组图谱数据库(cancer genome map database,TCGA)和基因表达总数据库(gene expression total databases,GEO)中,分析CFL-1在HNSCC中的表达及预后价值,通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GESA)、cibersoft明确CFL-1在HNSCC组织中的分子通路。采用SPSS 26.0软件包对数据进行统计学分析。结果:CFL-1在HNSCC组织中显著上调。CFL-1高表达组与较低的总生存率显著相关。多因素Cox生存分析表明,CFL-1表达是HNSCC预后不良的独立预测因素。GESA、cibersoft分析表明,CFL-1表达失调影响多条信号通路,并影响免疫细胞的局部浸润。结论:CFL-1在HNSCC中高表达,并与不良预后显著相关,是HNSCC的潜在标志物。

关键词： CFL-1 头颈部鳞癌免疫浸润预后标志物

豆酱源枯草芽孢杆菌S1-2产细菌素分离鉴定及其稳定性研究

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食品工业科技 2024年第8期45卷 158-164页

作者：张淘崴乌日娜纪帅奇娄梦雪马颖武俊瑞沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁省食品发酵技术工程研究中心辽宁沈阳110161 沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室辽宁沈阳110866

本研究首先从东北传统豆酱中分离筛选出一株具有良好抑菌作用的菌株,结合16S rDNA与持家基因gyrA测序分析等方法对菌株鉴定。其次,利用乙酸乙酯萃取法对其所产细菌素进行粗提,使用葡聚糖凝胶Sephadex-G50和高效液相色谱(HPLC)技术进一... 详细信息

本研究首先从东北传统豆酱中分离筛选出一株具有良好抑菌作用的菌株,结合16S rDNA与持家基因gyrA测序分析等方法对菌株鉴定。其次,利用乙酸乙酯萃取法对其所产细菌素进行粗提,使用葡聚糖凝胶Sephadex-G50和高效液相色谱(HPLC)技术进一步纯化,结合SDS-PAGE和液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术进行鉴定。最后通过最小浓度实验与生长抑制曲线分析了细菌素对金黄色葡萄球菌的抑制效果,并探究了细菌素对热、酸碱和蛋白酶的稳定性。结果表明,枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)菌株S1-2对金黄色葡萄球菌和单增李斯特氏菌抑菌效果最好,该菌株产生的细菌素经分离纯化鉴定为subtilosin A,分子量约为3 kDa,对金黄色葡萄球菌和单增李斯特氏菌有明显的抑制效果,对金黄色葡萄球菌的最小抑制浓度为0.625 mg/mL。该细菌素在20~80℃抑菌活性稳定,且在100~120℃仍表现出抑菌活性;对酸碱耐受性较高,经过pH为1、10的强酸强碱处理后仍表现出抑菌活性,在pH6.0~8.0的范围内表现出最高的抑菌活性;能够被蛋白酶K、胃蛋白酶、胰蛋白酶水解。综上,枯草芽孢杆菌S1-2与其产生的细菌素subtilosin A在食品生物防腐中具有较强的研究和应用潜力。

关键词：枯草芽孢杆菌细菌素分离纯化抑菌

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农业知识图谱技术研究现状与展望

农业机械学报 2024年第6期55卷 1-17页

作者：侯琛牛培宇中国农业大学信息与电气工程学院北京100083 北京大学大数据分析与应用技术国家工程实验室北京100871

在当前农业信息化的发展进程中,多数农业子领域面临着数据资源分散、信息整合难度大、知识利用效率低等问题。作为近年来新兴的一种知识表示技术,知识图谱已在部分农业特定领域展现出了强大的语义推理和数据整合能力,同时帮助一些农业... 详细信息

在当前农业信息化的发展进程中,多数农业子领域面临着数据资源分散、信息整合难度大、知识利用效率低等问题。作为近年来新兴的一种知识表示技术,知识图谱已在部分农业特定领域展现出了强大的语义推理和数据整合能力,同时帮助一些农业上层应用提高了性能。为系统总结近年来农业知识图谱构建与应用方面的研究成果,本文首先阐述了知识图谱基础和农业知识图谱的构建流程,并从本体建模、信息抽取、知识融合以及知识加工4方面总结了构建农业知识图谱所涉及的关键技术。将当前农业知识图谱的应用分为信息检索、问答系统、推荐系统、专家诊断系统和作物预测5方面,并对这些应用工作进行了梳理。最后,对当前农业知识图谱的研究现状进行了总结,并认为未来农业知识图谱可以从多模态知识推理、强时效性知识更新、多语言知识查询、跨领域数据融合以及子领域知识图谱构建等方面加以研究。

关键词：知识图谱农业领域信息检索问答系统推荐系统专家诊断系统作物预测

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高产抗菌脂肽芽孢杆菌的分离鉴定筛选及发酵工艺优化

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食品工业科技 2024年第4期45卷 101-108页

作者：纪帅奇乌日娜张淘崴娄梦雪贺凯茹张妍武俊瑞沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁省食品发酵技术工程研究中心辽宁沈阳110866 沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室辽宁沈阳110866

为了筛选出高产抗菌脂肽的芽孢杆菌并确定其最佳发酵工艺条件,研究从传统发酵豆酱中分离和鉴定产抗菌脂肽芽孢杆菌菌株,通过正交试验研究了发酵接种量、发酵填液量、发酵时间、发酵温度等发酵条件对芽孢杆菌脂肽产量的影响。结果表明,从... 详细信息

为了筛选出高产抗菌脂肽的芽孢杆菌并确定其最佳发酵工艺条件,研究从传统发酵豆酱中分离和鉴定产抗菌脂肽芽孢杆菌菌株,通过正交试验研究了发酵接种量、发酵填液量、发酵时间、发酵温度等发酵条件对芽孢杆菌脂肽产量的影响。结果表明,从9份东北传统发酵豆酱中分离筛选得到27株芽孢杆菌,经16S rDNA鉴定,其中6株芽孢杆菌具有合成脂肽的基因sfp、fenB和ituA。通过单位菌体脂肽产量和抑菌效果测定发现,贝莱斯芽孢杆菌SN-20和解淀粉芽孢杆菌SN-46表现优异,单位菌体脂肽产量达106和72 mg,且对革兰氏阳性和阴性指示菌均有较强的抑菌效果。正交试验发现贝莱斯芽孢杆菌SN-20最佳发酵工艺为:接种量3%,发酵填液量20%,发酵时间36 h,发酵温度32℃;枯草芽孢杆菌SN-46最佳发酵工艺为:接种量2%,发酵填液量40%,发酵时间24 h,发酵温度32℃。在此条件下发酵的两株芽孢杆菌单位菌体脂肽产量优化前为106.11和76.23 mg/g,优化后分别提高了21.85%和23.84%。研究结果有效地增加了芽孢杆菌抗菌脂肽的产量。

关键词：抗菌脂肽芽孢杆菌筛选鉴定发酵工艺优化

枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序及其抑菌物质预测分析

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食品科学 2024年第2期45卷 57-63页

作者：纪帅奇乌日娜张淘崴娄梦雪丁瑞雪马颖武俊瑞沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁省食品发酵技术工程研究中心辽宁沈阳110866 沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室辽宁沈阳110866

为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能注释及... 详细信息

为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能注释及分类、系统发育进化和次级代谢产物等关键信息。结果表明:SNBS-3的基因组为一条环状闭合DNA,大小为4076387 bp,共有4000个蛋白质编码基因,在直系同源集、基因本体论、京都基因与基因组百科全书、碳水化合物活性酶、抗生素耐药性数据库和致病毒力因子数据库分别注释到3209、2824、2560、147、12个和4个功能基因。应用在线软件AntiSMASH和Bagel4发现其除具有合成Surfactin、Mycosubtilin、Plipastatin、Bacilysin和Bacillaene等多种抑菌物质的相关基因外,还具有一条完整的细菌素Subtilosin A合成基因簇,结合抑菌实验和蛋白酶K实验结果推测枯草芽孢杆菌SNBS-3具有合成细菌素SubtilosinA的能力。综上,枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序结果表明其本身可产生多种抑菌物质,是1株具有生防潜力的微生物,相关分析结果可为包括细菌素SubtilosinA在内的多种抑菌物质的进一步开发应用提供理论基础。

关键词：枯草芽孢杆菌全基因组细菌素合成基因簇

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压铸模具钢热机械疲劳损伤机制研究

现代制造技术与装备 2024年第6期60卷 88-90页

作者：纪帅张红岩平顶山职业技术学院机电工程系平顶山467000

热机械疲劳(Thermal Mechanical Fatigue,TMF)是压铸模具钢在高温和机械应力下的重要损伤形式。通过分析TMF加载条件下的疲劳断口特征,揭示其与传统低周疲劳不同的疲劳断口特征。研究发现:TMF的疲劳断口具有疲劳源区、裂纹扩展区和断裂... 详细信息

热机械疲劳(Thermal Mechanical Fatigue,TMF)是压铸模具钢在高温和机械应力下的重要损伤形式。通过分析TMF加载条件下的疲劳断口特征,揭示其与传统低周疲劳不同的疲劳断口特征。研究发现:TMF的疲劳断口具有疲劳源区、裂纹扩展区和断裂区3个明显区域,其中裂纹扩展区面积最大;在不同加载条件下,断裂区的特征存在一定变化趋势。此外,在TMF过程中观察到断口表面的氧化现象在不同相位下呈现不同特征,这与加载条件及材料性质有关。研究还发现,在TMF过程中存在预缩现象,尤其在外部压力-热机械疲劳(External Pressure-Thermal Mechanical Fatigue,EP-TMF)条件下更为显著,这与低温半周塑性变形有关。

关键词：压铸模具钢材热机械疲劳(TMF) 损伤机制