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狭刀豆叶绿体基因组的组装与序列分析

分子植物育种 2024年

作者：韦海忠潘丽芹汤紫依何海叶田盛野朱晏张慧娟蒋明台州科技职业学院农业与生物工程学院台州学院生命科学学院

狭刀豆(Canavalia lineata)为多年生豆科植物，分布于海岛或海岸地区，是一种重要的抗逆种质资源。本研究以狭刀豆的叶片作为试验材料，经过DNA的提取，并通过高通量的测序、组装以及序列分析，得出狭刀豆叶绿体基因组的特征，以及其系... 详细信息

狭刀豆(Canavalia lineata)为多年生豆科植物，分布于海岛或海岸地区，是一种重要的抗逆种质资源。本研究以狭刀豆的叶片作为试验材料，经过DNA的提取，并通过高通量的测序、组装以及序列分析，得出狭刀豆叶绿体基因组的特征，以及其系统发育关系。研究结果表明，狭刀豆的叶绿体基因组全长为158 291 bp，具有一个保守的四分体结构，大单拷贝区、小单拷贝区及反向重复区的大小分别为78 025、18 978和30 644 bp；狭刀豆叶绿体基因组共有135个基因，其中蛋白质编码基因、tRNA基因、rRNA基因的数量分别为90、37和8；序列比对结果表明，狭刀豆叶绿体基因组与同属的小刀豆相似性最高，达99.7%，与毛刀豆的相似性较低，为99.2%；在4种刀豆属植物中检测到7个高变异区；系统发育分析结果表明，16种豆科植物在发育树上可分为5组，与分类学结果一致，狭刀豆先与小刀豆聚于一个分支，再与刀豆和毛刀豆聚为一组。通过对狭刀豆叶绿体基因组的组装，以及基因组的序列分析，为开展遗传结构和遗传多样性的后续研究奠定了基础，并提供了相应的科学依据。

关键词：狭刀豆叶绿体基因组组装序列分析

基于SCoT分子标记的圆叶小石积遗传多样性分析

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分子植物育种 2024年

作者：汤紫依方宇洁何海叶黄翰慧张珍语王顺莉张慧娟蒋明台州学院生命科学学院

圆叶小石积(Osteomeles subrotunda)是浙江省极小种群野生植物和省重点保护野生植物，分布区域十分狭窄，植株数量稀少，该植物亟待保护。本研究在叶片样品采集、DNA提取、PCR反应体系优化和引物筛选的基础上，利用SCoT分子标记研究圆... 详细信息

圆叶小石积(Osteomeles subrotunda)是浙江省极小种群野生植物和省重点保护野生植物，分布区域十分狭窄，植株数量稀少，该植物亟待保护。本研究在叶片样品采集、DNA提取、PCR反应体系优化和引物筛选的基础上，利用SCoT分子标记研究圆叶小石积的遗传多样性。结果表明，从36条引物中筛选到8条重复性高、多态性好、条带清晰的SCoT引物，共扩增出220个条带，其中多态性条带219个；物种水平上，多态性比率(PPB)为99.55%，观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农信息指数(I)的均值分别为1.995 5、1.473 1、0.284 7和0.437 3，具有较高的遗传多样性水平；居群水平上，PPB、遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为37.57%、0.591 7和0.345 0，表明居群间的基因交流较少，大部分变异发生在居群内；UPGMA聚类结果表明，6个居群可分为6组，蛤蜊湾(GLW)样品与其余样地的关系最远，与主成分分析结果一致。圆叶小石积遗传多样性研究，为后续开展该物种的保护和应用打下了基础。

关键词：圆叶小石积极小种群野生植物 SCoT分子标记遗传多样性

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基于SRAP分子标记的华顶杜鹃遗传多样性

浙江农业学报 2024年第1期36卷 127-133页

作者：吴倩汤紫依田盛野何海叶潘伟伟王军峰鲍洪华张慧娟蒋明台州学院生命科学学院浙江台州318000 华东药用植物园科研管理中心浙江丽水323000 台州市生态环境保护局路桥分局浙江台州318050

华顶杜鹃是浙江特有的珍稀濒危野生植物,分布区域十分狭窄,植株数量稀少,该植物亟待保护。以不同居群华顶杜鹃的叶片为材料,采用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术进行遗传多样性研究。结... 详细信息

华顶杜鹃是浙江特有的珍稀濒危野生植物,分布区域十分狭窄,植株数量稀少,该植物亟待保护。以不同居群华顶杜鹃的叶片为材料,采用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术进行遗传多样性研究。结果表明,从140个组合中筛选出8对扩增多态性高、条带清晰、重复性好的SRAP引物,利用这些引物对50份华顶杜鹃基因组DNA进行PCR扩增,共得到263个条带,其中多态性位点261个,多态性比率(PPB)为99.24%;在物种水平上,观测等位基因数(N_(a))为1.992 4,有效等位基因数(N_(e))为1.340 1,Nei’s基因多样性指数(H)为0.221 5,Shannon?s信息指数(I)为0.357 9,表明华顶杜鹃在物种水平上有较高的遗传多样性;在居群水平上,5个自然群体的遗传分化系数(G_(st))为0.459 6,基因流(N_(m))为0.587 8,表明居群间存在一定的基因分化和基因交流,而大部分遗传变异出现在居群内;UPGMA聚类结果表明,5个居群的样品可分为5组,与主成分分析结果一致。研究结果为后续开展该珍稀物种的保护和利用奠定了基础。

关键词：华顶杜鹃遗传多样性亲缘关系

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锈毛钝果寄生叶绿体基因组的序列特征和系统发育分析

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中草药 2023年第10期54卷 3273-3280页

作者：蒋明王军峰吴丹朱晏汤紫依何海叶张慧娟台州学院生命科学学院浙江椒江318000 华东药用植物园科研管理中心浙江丽水323000 台州恩泽医疗中心(集团)路桥医院浙江路桥318050

目的以药用植物锈毛钝果寄生Taxilluslevinei为材料,在高通量测序、组装的基础上,明确叶绿体因组的结构、序列特征和系统发育关系。方法利用SDS法提取基因组DNA,采用Illumina HiSeq X Ten进行高通量测序,用Novo Plasty组装叶绿体基因... 详细信息

目的以药用植物锈毛钝果寄生Taxilluslevinei为材料,在高通量测序、组装的基础上,明确叶绿体因组的结构、序列特征和系统发育关系。方法利用SDS法提取基因组DNA,采用Illumina HiSeq X Ten进行高通量测序,用Novo Plasty组装叶绿体基因组,借助PhyML生成系统发育树。结果锈毛钝果寄生的叶绿体基因组全长为122 208 bp,GC值为37.3%,大单拷贝区(large single copy region,LSC)、小单拷贝区(small single copy region,SSC)和反向重复区(inverted repeat region,IR)的长度分别为70 522、6084和22 801 bp;锈毛钝果寄生的叶绿体基因组共有基因108个,其中的编码蛋白基因、t RNA与r RNA分别为66、29和8个,另有5个假基因;inf A基因、所有的ndh基因及6个t RNA发生丢失。序列比对结果表明,锈毛钝果寄生与桑寄生T. sutchuenensis (Lecomte) Danser叶绿体基因组之间的相似性最高,达96.7%。系统发育分析结果表明,7种植物在发育树上分成5组,其中,锈毛钝果寄生与桑寄生和广寄生聚于一组。结论锈毛钝果寄生叶绿体基因组的组装、序列分析和系统发育分析,为后续开展遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础,并为桑寄生科植物的进化和系统发育研究提供了依据。

关键词：锈毛钝果寄生桑寄生广寄生叶绿体基因组序列特征系统发育分析

单叶铁线莲叶绿体基因组的序列特征与系统发育分析

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中草药 2022年第12期53卷 3766-3773页

作者：韦海忠潘丽芹田盛野汤紫依何海叶张慧娟蒋明台州科技职业学院浙江黄岩318020 台州学院生命科学学院浙江椒江318000

目的以药用植物单叶铁线莲Clematishenryi叶片为材料,在高通量测序、组装和序列分析的基础上,明确叶绿体因组的序列特征和系统发育关系。方法利用CTAB法提取叶片基因组DNA,通过NovaSeq6000平台测序,再用NovoPlasty组装叶绿体基因组,借... 详细信息

目的以药用植物单叶铁线莲Clematishenryi叶片为材料,在高通量测序、组装和序列分析的基础上,明确叶绿体因组的序列特征和系统发育关系。方法利用CTAB法提取叶片基因组DNA,通过NovaSeq6000平台测序,再用NovoPlasty组装叶绿体基因组,借助PhyML生成系统发育树。结果单叶铁线莲的叶绿体基因组全长159707bp,GC值为38.0%,大单拷贝区、小单拷贝区和反向重复序列的长度分别为79 449、18 100、31 079 bp;单叶铁线莲的叶绿体基因组总共有基因137个,其中蛋白质编码基因、tRNA、rRNA的数量分别为91、36、8,另有2个假基因,分别为Ψycf1和ΨinfA。序列比对结果表明,单叶铁线莲与牯牛铁线莲叶绿体基因组的相似性最高,达99.6%;共检测到41个SSR,其中40个为单核苷酸重复,1个为三核苷酸重复。系统发育分析结果表明,单叶铁线莲与牯牛铁线莲和大叶铁线莲聚于一组,支持率达100%。结论单叶铁线莲叶绿体基因组的组装、序列分析和系统发育分析,为该药用植物的遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础。

关键词：单叶铁线莲牯牛铁线莲大叶铁线莲叶绿体基因组序列特征系统发育分析

安土重迁:农民工返乡建宅的现实表征、类型考察及其行动逻辑

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社会发展研究 2024年第2期11卷 130-148,M0005,M0006页

作者：何海清华东理工大学社会与公共管理学院

以往对农民工返乡行为的研究较少关注返乡建宅行为,忽视了该行为蕴含的社会文化、制度要素及其与农民工返乡行为的关联性。本文以重庆市蜡烛村为例,探析了农民工返乡后的建宅行为。本研究发现:第一,在农民工的返乡建宅行为中,返乡人的... 详细信息

以往对农民工返乡行为的研究较少关注返乡建宅行为,忽视了该行为蕴含的社会文化、制度要素及其与农民工返乡行为的关联性。本文以重庆市蜡烛村为例,探析了农民工返乡后的建宅行为。本研究发现:第一,在农民工的返乡建宅行为中,返乡人的回归机制非常多样化,住宅的形态被改造,人地关系呈现出游离式状态;第二,从建宅行为的主导要素来看,可依据文化与制度的双重驱动划分为自然建宅、占地盘式建宅和情怀式建宅三种实践类型;第三,农民工返乡建宅是在既定政策背景下所做出的理性经济选择。以建宅行为为切入点理解农民工返乡,有助于我们进一步把握现代城乡流动中农村人、地、资源的联动关系,探索未来建设宜居宜业、和美乡村的有效途径。

关键词：农民工返乡农村自建房住宅重建人地关系

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行政权利论

中国法学 2024年第3期 224-244页

作者：何海波清华大学法学院

在过去40多年中,公民、法人和其他组织在行政法上的权利(简称“行政权利”)蓬勃兴起。然而,行政权利体系仍有待完善,继续伸张并更好保护行政权利是这个时代的重大课题。无论作为法学研究范畴还是法律规范对象,行政权利是行政权力、宪法... 详细信息

在过去40多年中,公民、法人和其他组织在行政法上的权利(简称“行政权利”)蓬勃兴起。然而,行政权利体系仍有待完善,继续伸张并更好保护行政权利是这个时代的重大课题。无论作为法学研究范畴还是法律规范对象,行政权利是行政权力、宪法权利、民事权利所无法取代的。尽管权利渊源多种多样,权利发展需多方协同,立法应当在其中发挥主导作用。通过专门立法系统规定行政权利,可以更好地宣示民主法治理念、塑造行政法规则、防止行政权力的滥用。未来的通用行政法典宜专辟一章,列举重要的行政权利;列举的权利从类型上应当覆盖人身权、财产权、参与权、行政受益权、程序保障权、获得救济权等。

关键词：行政权利行政法权利行政法学体系通用行政法典

一类Hénon型Choquard方程组在R空间中的Liouville定理

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数学学报(中文版) 2024年

作者：何海洋李肖湖南师范大学数学与统计学院

本文中,我们研究一类如下Hénon型Choquard方程组■正解的不存在性,其中00.我们将证明在R3空间中,当p,q>2且满足■时,方程（0.1）没有正经典解.

关键词： Choquard方程 Hénon型 Liouville定理 Pohozaev恒等式

走出行政诉讼的“卡夫丁峡谷”——行政争议实质性解决纵论

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中国法律评论 2024年第3期 53-69页

作者：何海波清华大学法学院

程序空转,即实质上同一个纠纷需要多种诉讼、多次诉讼、多个审级才能解决甚至未能解决,这是当前行政诉讼制度面临的严峻问题。为使争议得到实质性解决,需要改进立案工作,注重通过依法判决来定分止争。法院在积极大胆受案、切实保护诉权... 详细信息

程序空转,即实质上同一个纠纷需要多种诉讼、多次诉讼、多个审级才能解决甚至未能解决,这是当前行政诉讼制度面临的严峻问题。为使争议得到实质性解决,需要改进立案工作,注重通过依法判决来定分止争。法院在积极大胆受案、切实保护诉权的同时,宜厘清民行关系,分流诉讼渠道,规制过度诉讼,排除诉讼泡沫,改进立案方式,合并同类诉讼。在坚持全面审查的基础上,法院判决应当根据诉讼类型,回应诉讼请求,明确判决内容,避免判不对题、空泛无当。二审、再审需加强监督,最高人民法院需更好择案而审。实质性解决争议要求进一步树立司法权威,修改不适宜的司法解释,探索引入“‘案/件’比”评估方法。

关键词：行政纠纷行政争议行政诉讼争议解决实质性解决