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基于psbA-trnH标记的红花龙胆野生居群遗传多样性研究

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时珍国医国药 2024年第3期35卷 648-651页

作者：任得强王仕梅李梅魏升华贵州中医药大学药学院贵州贵阳550025

目的对贵州、云南等18个产地111份红花龙胆分子样品进行检测,为红花龙胆的分类鉴别及遗传研究提供参考。方法研究采用叶绿体基因psbA-trnH序列进行扩增并测序,进行序列差异分析、单倍型分析及遗传多样性分析。结果 111条红花龙胆叶绿... 详细信息

目的对贵州、云南等18个产地111份红花龙胆分子样品进行检测,为红花龙胆的分类鉴别及遗传研究提供参考。方法研究采用叶绿体基因psbA-trnH序列进行扩增并测序,进行序列差异分析、单倍型分析及遗传多样性分析。结果 111条红花龙胆叶绿体基因psbA-trnH序列扩增成功率和测序成功率分别为100.00%和94.90%;psbA-trnH序列差异分析结果表明,保守位点337个,变异位点24个,简约信息位点24个,二倍简并位点87个,四倍简并位点26个;遗传距离分析结果表明,居群间遗传距离变化范围是0~0.032,平均遗传距离为0.017;18个红花龙胆居群的序列共产生多态(分离)位点数S为9,突变总数(Eta)为11,单倍型数(h)为7个,单倍型(基因)多样性(Hd)为0.667,核苷酸多样性(Pi)为0.012,单倍型多样性方差(Vh)值0.001、单倍型多样性标准差(Sh)值0.032,遗传分化系数为0.494,基因流为0.200;经聚类分析,psbA-trnH序列易于将红花龙胆与外类群区分,且将红花龙胆18个野生居群聚为两类。结论叶绿体基因psbA-trnH序列可应用于红花龙胆种质资源的遗传多样性研究中,不同产地红花龙胆遗传变异丰富,在进化上存在一定的地域性特征。

关键词：红花龙胆 psbA-trnH序列野生居群遗传多样性

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贵州栽培种铁皮石斛遗传多样性分析

时珍国医国药 2024年第4期35卷 992-995页

作者：任得强王廷璐李梅陈春伶贵州中医药大学药学院贵州1贵阳550025

目的研究贵州栽培种铁皮石斛的遗传多样性,可为种质资源利用及遗传改良提供参考。方法利用简单重复序列间区(Inter-simple sequence repeats,ISSR)、简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记技术,对贵州20份分别来自浙江、云... 详细信息

目的研究贵州栽培种铁皮石斛的遗传多样性,可为种质资源利用及遗传改良提供参考。方法利用简单重复序列间区(Inter-simple sequence repeats,ISSR)、简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记技术,对贵州20份分别来自浙江、云南的栽培种的铁皮石斛进行遗传多样性研究,使用NTsys、Popgen32等软件进行遗传分析。结果经筛选得到32对多态性引物,共扩增得到152条清晰的条带,平均每对引物扩增4.75条带,其中多态性条带145条,平均每对引物扩增4.53条多态性条带,其条带的多态率(PPL)为96.05%。经遗传分析,Nei’s基因多样性指数(H)平均值为0.3507,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.5219等位基因数(Ne)平均值为1.5992、观测等位基因数(Na)平均值为1.9605,这表明研究所用铁皮石斛具有丰富的遗传变异。聚类分析结果表明,根据来源可将20个贵州栽培种铁皮石斛聚为2类。结论ISSR及SSR分子标记可以有效应用于铁皮石斛遗传多样性分析中,贵州铁皮石斛遗传变异丰富,应加强不同来源的铁皮石斛在系统选育及遗传改良中的合理利用。

关键词：铁皮石斛 ISSR SSR 遗传多样性

贵州石漠化山区不同种植模式下的山豆根质量研究

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耕作与栽培 2024年第2期44卷 75-79页

作者：朱家红王小仲任得强龙菀成吴帆何艳利郭延红陈贇贵阳康养职业大学贵阳550081 关岭县中药材产业发展中心贵州关岭561300 贵州中医药大学贵阳550025

比较贵州石漠化山区不同种植模式下的山豆根药材质量,优选适宜的地区种植模式,对于产业发展及石漠化山区环境治理有较强现实意义。本研究设置仿野生、大田种植模式实验,以野生山豆根药材为对照,对山豆根苦参碱与氧化苦参碱含量、浸出物... 详细信息

比较贵州石漠化山区不同种植模式下的山豆根药材质量,优选适宜的地区种植模式,对于产业发展及石漠化山区环境治理有较强现实意义。本研究设置仿野生、大田种植模式实验,以野生山豆根药材为对照,对山豆根苦参碱与氧化苦参碱含量、浸出物含量、含水量、总灰分、重金属含量等性状测定和比较分析。结果表明,三种种植模式下,山豆根药材质量均符合《中华人民共和国药典》(2020年版)规定,其中仿野生种植模式下苦参碱和氧化苦参碱总含量为2.06%,浸出物含量22.77%,比大田种植模式、野生分别高14.75%、31.28%。仿野生栽培环境与大田栽培条件产量差异明显。研究表明,越南槐可采用仿野生种植模式在石漠化山区种植推广。

关键词：山豆根石漠化山区种植模式药材质量

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小麦类胡萝卜素含量与若干品质性状相关性及遗传分析

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小麦类胡萝卜素含量与若干品质性状相关性及遗传分析

作者：任得强安徽农业大学

学位级别：硕士

本文选用31个小麦品种(系)为试验材料,研究其类胡萝卜素含量及若干品质性状的相关性;用96个小麦品种(系),研究2012、2013年两年类胡萝卜素含量,探讨其不同来源、不同皮色小麦类胡萝卜素含量的分布,并进行聚类分析;选用“孟0318/宛抗18... 详细信息

本文选用31个小麦品种(系)为试验材料,研究其类胡萝卜素含量及若干品质性状的相关性;用96个小麦品种(系),研究2012、2013年两年类胡萝卜素含量,探讨其不同来源、不同皮色小麦类胡萝卜素含量的分布,并进行聚类分析;选用“孟0318/宛抗18”杂交组合F2代群体,测定类胡萝卜素含量,采用数量性状主-多基因混合遗传模型分析和遗传参数的估算。得出以下主要结果：1.供试的31个小麦品种(系)的类胡萝卜素含量分析表明,品种间差异显著;类胡萝卜素含量与水溶性戊聚糖、黄度呈极显著正相关,与高峰黏度、低谷黏度、稀懈值、最终黏度、容重、形成时间呈极显著负相关;与峰值时间、蛋白质含量、稳定时间呈显著负相关。本研究中,脂肪氧化酶与戊聚糖之间相关性不显著,总戊聚糖、水溶性戊聚糖、非水溶性戊聚糖与亮度呈显著负相关,总戊聚糖、水溶性戊聚糖、非水溶性戊聚糖与白度呈显著负相关,高峰黏度与低谷黏度、稀懈值、最终黏度、峰值时间呈极显著正相关,低谷黏度与稀懈值、最终黏度、峰值时间呈极显著正相关,稀懈值与最终黏度、峰值时间呈极显著正相关,最终黏度与反弹值、峰值时间呈极显著正相关;蛋白质与湿面筋、稳定时间、形成时间分别呈极显著正相关。2.供试的96个小麦品种(系)的类胡萝卜素含量变幅较大,两年的类胡萝卜素含量的总变异均显著,但年份间的品种类胡萝卜素含量高低顺序基本一致,相关达极显著(r=0.66,R2=0.436),说明类胡萝卜素含量品种间差异较大,类胡萝}、素含量主要是由基因型控制;方差分析和多重比较结果表明,类胡萝卜素含量在品种间差异显著,这与不同来源的小麦品种(系)的类胡萝卜素含量分析结果基本一致：但小麦白皮、花皮、红皮品种间的类胡萝卜素含量差异不显著。因此,认为通过检测和比较,筛选类胡萝卜素含量高、低的品种资源是可行的。3.“孟0318/宛抗18"杂交组合F2代群体中,供试的217个单穗,类胡萝卜素含量呈正向偏态分布,根据数量性状主-多基因混合遗传模型分析,推测小麦品种(系)籽粒中类胡萝卜素含量受主基因和微效基因共同作用控制;该组合的F2代群体类胡萝卜素含量的遗传符合一对主基因的模型,主基因表现为加性、部分显性或超显性;主基因的加性效应da=0.3118,显性效应ha=-0.0548,显性度ha/da=-0.1758,主基因加性和显性效应相反,表现为不完全显性,主基因遗传率hmg2=98.70%。本研究试图按5%的比例,从“孟0318/宛抗18"F2代217个单穗中,筛选取出高、低类胡萝卜素含量的单穗各11份。

关键词：小麦类胡萝卜素品质相关遗传分析

小麦品种(系)籽粒LOX活性与部分品质性状关系的研究

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安徽农业大学学报 2013年第4期40卷 564-569页

作者：吴萍陈瑞瑞任得强郑文寅张文明姚大年安徽农业大学农学院合肥230036

研究10个小麦品种(系)随机区组试验的LOX活性、蛋白质、湿面筋、沉降值、籽粒硬度、直链淀粉和RVA参数等13个品质性状及其相关性。结果表明,除糊化温度之外,其余12个品质性状的品种间均达到极显著;全麦粉LOX活性与面粉LOX活性呈极显著... 详细信息

研究10个小麦品种(系)随机区组试验的LOX活性、蛋白质、湿面筋、沉降值、籽粒硬度、直链淀粉和RVA参数等13个品质性状及其相关性。结果表明,除糊化温度之外,其余12个品质性状的品种间均达到极显著;全麦粉LOX活性与面粉LOX活性呈极显著正相关,与最后粘度、反弹值、峰值时间和直链淀粉含量呈极显著负相关,与低谷粘度呈显著负相关;面粉LOX活性与低谷粘度、最后粘度、反弹值和峰值时间呈极显著负相关,与高峰粘度和直链淀粉含量呈显著负相关。认为小麦品种(系)籽粒的LOX活性高对全麦粉和面粉的若干主要品质性状存负面的影响;就针对籽粒LOX活性的品质改良而言,认为在育种中应尽量筛选那些LOX活性较低的材料。讨论了脂肪氧化酶在小麦品质改良中的利用等问题。

关键词：小麦品种 LOX活性品质

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粗毛淫羊藿叶绿体基因组及其结构分析

种子 2022年第11期41卷 47-53页

作者：严福林任得强魏升华何顺志贵州中医药大学贵阳550025

本研究通过Illumina HiSeq X-Ten高通量测序平台对粗毛淫羊藿的叶绿体基因组进行测序,并应用生物信息学分析工具对其结构特征进行比较分析。结果表明,粗毛淫羊藿叶绿体基因组大小为156894 bp,具有被子植物典型的环状四分体结构,大单拷贝... 详细信息

本研究通过Illumina HiSeq X-Ten高通量测序平台对粗毛淫羊藿的叶绿体基因组进行测序,并应用生物信息学分析工具对其结构特征进行比较分析。结果表明,粗毛淫羊藿叶绿体基因组大小为156894 bp,具有被子植物典型的环状四分体结构,大单拷贝区(large single copy,LSC)长度为88496 bp,小单拷贝区(small single copy,SSC)长度为16685 bp,2个反向重复区(inverted repeat sequence,IRa/IRb)长度为25809 bp;粗毛淫羊藿叶绿体基因组有133个基因,其中包括85个蛋白编码基因、10个rRNA基因和38个tRNA基因,44个外显子,23个内含子。研究结果丰富了淫羊藿属物种的叶绿体基因组资料,可为淫羊藿属物种的分子标记开发、系统学研究与药材的混伪品鉴定提供参考。

关键词：粗毛淫羊藿叶绿体基因组高通量测序结构分析鉴定

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红花龙胆的生态适宜性研究

北方园艺 2022年第23期 120-125页

作者：任得强王仕梅严福林李梅吴之坤魏升华贵州中医药大学药学院贵州贵阳550025

以红花龙胆为试材,拟通过收集红花龙胆的分布信息,结合生态因子,应用最大熵模型MaxEnt研究影响红花龙胆适宜分布的主要生态因子,并预测红花龙胆在中国的潜在适生区,以期为红花龙胆种质资源的筛选、人工栽培和药材质量评价的进一步研究... 详细信息

以红花龙胆为试材,拟通过收集红花龙胆的分布信息,结合生态因子,应用最大熵模型MaxEnt研究影响红花龙胆适宜分布的主要生态因子,并预测红花龙胆在中国的潜在适生区,以期为红花龙胆种质资源的筛选、人工栽培和药材质量评价的进一步研究提供参考依据。结果表明:根据MaxEnt模型预测的AUC值均大于0.9,预测效果极好。生态因子在红花龙胆生长适宜度中所占权重表明,年均降雨量、最冷月最低温、海拔、最冷季度降水量的总贡献率为86.8%。单因子建模分析结果表明,红花龙胆最适宜生长在年均降雨量800~1300 mm、最冷月最低温-3~4℃、海拔1000~2800 m及最冷季度降水量60~95 mm的环境中。适宜区划研究表明,红花龙胆最适生长区为云南北部、四川西部、重庆南部、广西壮族自治区的西部以及贵州省大部分地区。

关键词：红花龙胆最大熵模型生态因子最适生长区

ITS2序列鉴定苗药八爪金龙药材及其近缘混伪品的研究

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中药材 2022年第4期45卷 830-835页

作者：文琴琴严福林陈丽君王志威任得强安江勇魏升华贵州中医药大学药学院贵州贵阳550025

目的:探讨ITS2序列在苗药八爪金龙药材及其混伪品中鉴定的可行性,为八爪金龙临床用药的安全、有效提供参考。方法:对收集的63份八爪金龙药材及其同属植物样品进行DNA提取,ITS2引物PCR扩增及其双向测序,使用DNASTAR 7.1进行序列拼接校对... 详细信息

目的:探讨ITS2序列在苗药八爪金龙药材及其混伪品中鉴定的可行性,为八爪金龙临床用药的安全、有效提供参考。方法:对收集的63份八爪金龙药材及其同属植物样品进行DNA提取,ITS2引物PCR扩增及其双向测序,使用DNASTAR 7.1进行序列拼接校对,经隐马尔可夫模型的HMMer注释,并预测其二级结构。候选序列在Geneious R11.0.2中应用MAFFT alignment进行比对,应用MEGA 7.0计算遗传距离,构建NJ进化树。结果:ITS2序列能较好地将八爪金龙与同属植物区分开,通过比较ITS2序列的二级结构螺旋区茎环大小、数目及茎环上碱基等特征可以鉴别八爪金龙及其混伪品。结论:DNA条形码ITS2序列能有效区分八爪金龙药材及其同属植物,为临床应用的安全有效提供了新的鉴别方法。

关键词： ITS2 八爪金龙混伪品药材鉴定

鲁麦22×扬麦9号早代LOX活性分布及遗传分析

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麦类作物学报 2013年第5期33卷 912-918页

作者：陈瑞瑞任得强郑文寅张文明姚大年安徽农业大学农学院安徽合肥230036

为了解脂肪氧化酶(LOX)活性基因的遗传规律,利用单个分离世代群体遗传分析方法对"鲁麦22×扬麦9号"的F2群体及F2∶3家系群体的LOX活性分布、相关性及遗传组成进行了分析。结果表明,F2与F2∶3家系的LOX活性分布相似,并极显著相关(R2=0.71... 详细信息

为了解脂肪氧化酶(LOX)活性基因的遗传规律,利用单个分离世代群体遗传分析方法对"鲁麦22×扬麦9号"的F2群体及F2∶3家系群体的LOX活性分布、相关性及遗传组成进行了分析。结果表明,F2与F2∶3家系的LOX活性分布相似,并极显著相关(R2=0.714);该组合的LOX活性主要受两对主基因控制,且主基因显示为加性-显性-上位性效应。对于F2群体,两对主基因遗传率为78.2%,第一对主基因的加性效应、显性效应和显性度分别为4.09、-2.1和-0.51;第二对主基因分别为2.1、-0.77和-0.37;对于F2∶3家系群体,主基因遗传率为81.2%,第一对主基因加性效应、显性效应和显性度分别为3.11、-0.49和-0.159;第二对主基因分别为1.828、-0.1、-0.056。在F2及F2∶3家系中,两对主基因均表现为负向显性效应,其加性×加性上位(互作)效应、加性×显性(显性×加性)效应和显性×显性互作效应都不为0,说明二者存在明显互作效应。

关键词：小麦 LOX活性遗传分析主多基因混合遗传模型