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胶质母细胞瘤恶性进展中不同细胞亚群的动态轨迹和细胞通讯网络

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北京大学学报（医学版） 2024年第2期56卷 199-206页

作者：蔡祥王仁东王世佳任梓齐于秋红李冬果首都医科大学生物医学工程学院智能医学工程学学系北京100069 首都医科大学附属北京天坛医院高压氧科北京100070

目的:探索胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)恶性进展过程中细胞亚群的动态轨迹以及免疫细胞亚群之间的通讯网络,结合GBM患者的转录组数据和临床信息,挖掘GBM恶性进展过程中的关键风险标志物,以期为该疾病的治疗和预后提供科学依据。方法... 详细信息

目的:探索胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)恶性进展过程中细胞亚群的动态轨迹以及免疫细胞亚群之间的通讯网络,结合GBM患者的转录组数据和临床信息,挖掘GBM恶性进展过程中的关键风险标志物,以期为该疾病的治疗和预后提供科学依据。方法:基于单细胞测序数据分析方法,构建GBM恶性进展中的细胞亚群图谱,利用Monocle2技术构建GBM恶性进展中肿瘤细胞亚群的动态进展轨迹,基于基因富集分析,挖掘肿瘤细胞亚群随GBM恶性进展中显著变化的基因所富集的生物学过程,利用CellChat软件识别不同免疫细胞亚群间的复杂通讯网络,通过生存分析识别GBM恶性进展中影响患者预后的关键风险分子标记物。结果:单细胞测序数据分析识别出6种不同的细胞类型,包括淋巴细胞、周细胞、少突神经胶质细胞、巨噬细胞、胶质瘤细胞、小胶质细胞,单细胞数据集中了27151个细胞,其中包含3881个来源于低级别胶质瘤患者的细胞,10166个来源于新诊断GBM患者的细胞,13104个来源于复发性胶质瘤患者的细胞。胶质瘤细胞亚群逆时序分析提示,胶质瘤细胞亚群在恶性进展中存在着明显的细胞异质性;免疫细胞亚群的细胞相互作用分析揭示,GBM恶性进展中不同免疫细胞亚群之间的通讯网络共识别出22条具有生物学意义的配体-受体对,涉及12条通路;生存分析识别出8个与GBM患者预后密切相关的基因,其中SERPINE1、COL6A1、SPP1、LTF、C1S、AEBP1、SAA1L是GBM患者的高风险基因,ABCC8是GBM患者的低风险基因。结论:深入揭示了GBM恶性进展中胶质瘤细胞亚群的动态变化以及免疫细胞亚群之间的通讯模式,对于理解GBM的复杂生物学过程具有重要意义,为GBM的精准医疗和治疗决策提供了科学依据,也为GBM患者更准确的预后评估提供了新的线索。

关键词：胶质母细胞瘤单细胞测序拟时序分析细胞相互作用细胞间通讯

基于Nrf2/HO-1信号通路探讨四逆散对胆汁淤积性肝炎大鼠氧化应激反应的影响

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中国实验方剂学杂志 2024年第12期30卷 1-7页

作者：曹丹陈祺陈小橹陈林珍王海燕郝巨辉张威马志强北京中医药大学中药品质评价北京市重点实验室北京102488 北京同仁堂科技发展股份有限公司制药厂北京100079 大连市妇女儿童医疗中心(集团) 生殖与遗传医学中心辽宁大连116000 北京中医药大学中药学院北京102488 哈尔滨医科大学附属第一医院哈尔滨150001

目的:基于核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素氧合酶-1(HO-1)信号通路探讨四逆散对胆汁淤积性肝炎大鼠肝脏氧化应激损伤的影响及其作用机制。方法:30只6周雄性SD大鼠,随机分为正常组、模型组、四逆散低、高剂量组(2.5、5.0 g·kg^(-1))、... 详细信息

目的:基于核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素氧合酶-1(HO-1)信号通路探讨四逆散对胆汁淤积性肝炎大鼠肝脏氧化应激损伤的影响及其作用机制。方法:30只6周雄性SD大鼠,随机分为正常组、模型组、四逆散低、高剂量组(2.5、5.0 g·kg^(-1))、熊去氧胆酸(UDCA,63 mg·kg^(-1))组,每组6只。各组大鼠连续给药7 d,第5天除对照组给予10 m L·kg^(-1)橄榄油外,其余各组均给予80 mg·kg^(-1)的α-萘异硫氰酸酯(ANIT);采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测血清中胆汁淤积相关生化指标水平,以及肝组织中抗氧化因子的含量;通过苏木素-伊红(HE)染色观察肝组织病理变化;采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)检测肝组织中Nrf2、HO-1和醌氧化还原酶1(NQO1) mRNA与蛋白的相对表达量。结果:与正常组比较,模型组血清各胆汁淤积生化指标水平、肝组织中抗氧化应激因子含量均显著升高(P小叶间胆管破坏等病理学改变;模型组大鼠肝组织中Nrf2、HO-1和NQO1 mRNA与蛋白相对表达水平均明显下调(P逆散高剂量组的血清各胆汁淤积生化指标水平、肝组织中抗氧化应激因子含量均显著降低(P小,炎性细胞浸润显著减少,小叶间静脉有少量瘀血;肝组织中Nrf2、HO-1和NQO1 mRNA与蛋白相对表达水平均明显上调(P逆散能显著改善肝内胆汁淤积性肝炎大鼠肝损伤,其机制可能与Nrf2/HO-1信号通路介导的抑制氧化应激反应有关。

关键词：四逆散胆汁淤积性肝炎氧化应激核因子E2相关因子2(Nrf2) 血红素氧合酶-1(HO-1)

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鸡血藤在大鼠体内的排泄动力学研究

中国现代中药 2024年第1期26卷 49-67页

作者：杨秀伟刘晓艳徐嵬张鹏赵威龚云刘逆夫北京大学药学院天然药物学系/天然药物及仿生药物国家重点实验室北京100191 株洲千金药业股份有限公司湖南株洲412000

目的:研究大鼠灌胃鸡血藤水提取物的排泄动力学,为其临床应用提供科学依据。方法:给雄性SD大鼠灌胃鸡血藤水提取物(30 g·kg^(–1),以生药量计),分别在给药后的2、4、6、8、12、24、48 h收集每组的粪便和尿液。采用超快速液相色谱-质谱... 详细信息

目的:研究大鼠灌胃鸡血藤水提取物的排泄动力学,为其临床应用提供科学依据。方法:给雄性SD大鼠灌胃鸡血藤水提取物(30 g·kg^(–1),以生药量计),分别在给药后的2、4、6、8、12、24、48 h收集每组的粪便和尿液。采用超快速液相色谱-质谱法检测大鼠排泄物样品,通过与对照品比对后鉴定和定量鸡血藤水提取物中化合物。结果:在大鼠48 h排泄的尿液和粪便中可检测到20个原型化合物,即烟酸(1)、对羟基苯甲酸(2)、水杨酸(3)、6,9-二羟基大柱香波龙-4,7-二烯-3-酮(4)、大豆苷(5)、8,9-二羟基大柱香波龙-4,6-二烯-3-酮(6)、异落叶松脂素(7)、芒柄花素(8)、4′,8-二甲氧基-7-O-β-D-吡喃葡萄糖基异黄酮(9)、(+)-松脂酚(10)、(+)-表松脂酚(11)、8-甲雷杜辛(12)、芒柄花素钠(13)、3′-甲氧基大豆素(14)、鸡血藤黄醇A (15)、毛蕊异黄酮(16)、艳紫铆素A (17)、奥刀拉亭(18)、鹰嘴豆芽素A (19)和(6a R,11a R)-高丽槐素(20)。结论:鸡血藤中的一些原型化合物可通过大鼠尿液和粪便排出体外。

关键词：鸡血藤黄酮木脂素超快速液相色谱-质谱法

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水电工程施工工序的概算定额智能绑定方法

水力发电学报 2024年

作者：庞小荣刘全孟歆刘杰元李心睿武汉大学水资源工程与调度全国重点实验室中国电建集团成都勘测设计研究院有限公司

概算定额和机械定额是施工资源分析和工程概算编制的基础，传统的工序和定额人工绑定低效繁琐且容易出错。本文在建立定额范式数据库的基础上，采用信息检索与自然语言处理技术，提出施工工序的概算定额智能绑定方法。根据文本关键词语... 详细信息

概算定额和机械定额是施工资源分析和工程概算编制的基础，传统的工序和定额人工绑定低效繁琐且容易出错。本文在建立定额范式数据库的基础上，采用信息检索与自然语言处理技术，提出施工工序的概算定额智能绑定方法。根据文本关键词语素分解，结合Word2vec词义分析与逆文本频率权重，提出了面向概算定额的正负相关性模糊检索模型；针对概算定额的分级检索特征，提出了概算定额的先验级联检索方法。实验表明，检索模型召回概算定额与施工机械台时费定额精确度分别达到92.29%、97.28%，先验级联检索方法显著缩短设计工时。本方法的应用将为水电工程设计智能化提供有力支持。

关键词：设计概算定额绑定自然语言处理信息检索词义分析

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逆舟作品我们推车(组诗)

诗刊 2006年第15期 6-8页

作者：逆舟

秋茄KoWRKY43基因克隆、表达与生物信息学分析

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浙江农业学报 2024年第8期 1832-1843页

作者：蒋文骏舒红锁陈正满任典挺杨党田荣江杜照奎台州学院生命科学学院三门县自然资源和规划局台州循环经济发展有限公司台州学院浙江省植物进化生态学与保护重点实验室

转录因子WRKY在开花植物中广泛存在，参与并调节植物的生长发育与防御反应等。为探究红树植物秋茄WRKY基因在非生物胁迫过程中的作用，以秋茄幼苗为试验材料，提取叶片总RNA,通过反转录PCR（RT-PCR）技术克隆获得KoWRKY43基因（GenBank... 详细信息

转录因子WRKY在开花植物中广泛存在，参与并调节植物的生长发育与防御反应等。为探究红树植物秋茄WRKY基因在非生物胁迫过程中的作用，以秋茄幼苗为试验材料，提取叶片总RNA,通过反转录PCR（RT-PCR）技术克隆获得KoWRKY43基因（GenBank登录号OR789874）,采用生物信息学手段分析其基因序列和蛋白质结构特点，利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术研究其表达模式。结果表明，KoWRKY43基因开放阅读框（ORF）为942 bp,编码313个氨基酸，蛋白质分子式为C1484H2415N439O459S14,分子量为34.2 ku,理论等电点为9.74,无信号肽，无跨膜结构，定位于细胞核，与木薯、银白杨和簸箕柳亲缘关系相对较近。qPCR检测显示，KoWRKY43基因在秋茄根中表达量最大，显著高于茎、叶、花和果实；幼叶KoWRKY43的表达量受NaCl诱导持续上升，在24 h表达量最大；激素水杨酸和脱落酸的诱导使其表达量先升高后降低，在6 h达到峰值；茉莉酸甲酯在24 h内均未显著改变其表达水平。研究结果为后续开展KoWRKY43基因的功能研究和培育抗逆秋茄品种提供了理论基础。

关键词：秋茄 KoWRKY43基因生物信息学分析基因克隆激素

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基于DCNN和Bi-LSTM的弧齿锥齿轮箱故障诊断

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电子测量技术 2024年第10期47卷 48-55页

作者：荀小伟许昕潘宏侠中北大学机械工程学院太原030051 中北大学系统辨识与诊断技术研究所太原030051

针对传统卷积神经网络(CNN)对弧齿锥齿轮箱的故障识别准确率不高这一问题,提出一种基于深度分离卷积神经网络(DCNN)和双向长短时记忆网络(Bi-LSTM)的弧齿锥齿轮箱智能故障诊断方法。首先,对原始信号进行小波阈值降噪处理,将降噪后的信... 详细信息

针对传统卷积神经网络(CNN)对弧齿锥齿轮箱的故障识别准确率不高这一问题,提出一种基于深度分离卷积神经网络(DCNN)和双向长短时记忆网络(Bi-LSTM)的弧齿锥齿轮箱智能故障诊断方法。首先,对原始信号进行小波阈值降噪处理,将降噪后的信号利用经验模态分解(EMD)算法进行了分解;然后,对分解出的本征模态函数(IMF)的各个分量进行峭度计算,选取峭度值最高的IMF分量重构成新的振动信号输入模型进行训练;之后,将振动信号重叠采样获得大量信号样本,将这些样本通过深度分离卷积神经网络从一维原始振动信号中自适应的提取空间特征信息,提取的特征进一步输入到双向长短时记忆网络,同时提取正、逆时域的振动信号,以更好的提取故障特征;同时,在深度分离卷积中加入了残差网络对数据特征进行了复利用,并对卷积核进行了深度分离,解决了深度模型的网络退化问题;最后,将特征信息输入到已经训练好的DCNN-Bi-LSTM模型中,对弧齿锥齿轮箱故障诊断识别。结果表明,该方法可以准确的识别齿轮箱故障,最高诊断准确率可达100%。并且,该方法比传统的卷积神经网络的准确率更高,抗噪能力更强,网络收敛速度更快,诊断结果更稳定。

关键词：深度分离卷积双向长短时记忆网络残差网络智能故障诊断本征模态函数振动信号

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怪物女孩

阅读 2024年第28期 40-42页

作者：小飞蛾

剧情简介爱好发明的怪物女孩阿基和章鱼爸爸水泡生活在半岛上。阿基日复一日地练习,却始终没能掌握爸爸拥有的再生能力。贪婪的梅比博士大肆汲取太阳的能量,试图逆天改命。阿基实验失败,导致行踪暴露,爸爸被抓。梅比博士利用水泡的再生...

剧情简介爱好发明的怪物女孩阿基和章鱼爸爸水泡生活在半岛上。阿基日复一日地练习,却始终没能掌握爸爸拥有的再生能力。贪婪的梅比博士大肆汲取太阳的能量,试图逆天改命。阿基实验失败,导致行踪暴露,爸爸被抓。梅比博士利用水泡的再生能力为所欲为,无休止地破坏,让整个星球濒临毁灭。阿基在寻找爸爸的过程中,认识了邦尼布鲁和伊戈。大家齐心协力,阻止了梅比博士,拯救了星球。

关键词：

阿尔兹海默症和便秘:两样本双向孟德尔随机化研究

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临床医学进展 2024年第3期14卷 1582-1593页

作者：任招霞易星宇李蓉郭留学成都中医药大学临床医学院四川成都成都中医药大学附属医院四川成都

目的:采用双向两样本孟德尔随机化(MR)分析探讨阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease, AD)与便秘的因果关系,希望为临床防治提供理论依据。方法:使用公开的全基因组关联研究汇总数据集,运用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法、MR-Egger回... 详细信息

目的:采用双向两样本孟德尔随机化(MR)分析探讨阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease, AD)与便秘的因果关系,希望为临床防治提供理论依据。方法:使用公开的全基因组关联研究汇总数据集,运用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法、MR-Egger回归法、简单模式(simple mode法)和加权模式(weighted mode法)进行两样本MR分析,评估AD与便秘的因果关系。结果:MR分析结果表明:AD与便秘增加存在正向因果关系(IVW: OR = 1.174, 95% CI: 1.068~1.290, P = 0.001),便秘与AD风险增加不存在因果关系(IVW: OR = 1.008, 95% CI: 0.977~1.039, P = 0.629)。在便秘对AD及其反向MR分析中,敏感性分析结果表明因果关系稳健,亦未检测到潜在的水平多效性。结论:两样本MR分析结果显示:AD与便秘风险增加存在正向因果关系,但便秘与AD风险增加不存在因果关系。

关键词：阿尔茨海默病便秘因果关系双向孟德尔随机化研究