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石耳科地衣的分子系统学研究

石耳科地衣的分子系统学研究

作者：付少彬河北大学

学位级别：硕士

石耳科(Umbilicariaceae)地衣是真菌界(Kingdom fungi)、双核菌亚界(Dikarya)、子囊菌门(Ascomycota)、茶渍纲(Lecanoromycetes)、石耳目(Umbilicariales)一个独特的类群,其生长类型为脐叶型地衣,可能与真菌进化连锁上的某缺失环节有关。此外,石耳科地衣在人类活动中,尤其是在免疫调节方面具有很大潜力。本论文的研究主要是通过核糖体核酸基因大亚基(LSU rDNA)全序列的比对分析,探求真菌界、子囊菌门、茶渍菌纲、石耳目、石耳科等各类群的特有基因序列,为真菌有关类群的共同起源提供分子证据;通过多基因综合分析所形成的系统树,探求石耳科在真菌进化中的地位。本论文通过石耳科16种地衣体共测得它们的核糖体RNA基因大亚基(LSUrDNA)全序列(见附表4-1),其中石耳属(Umbilicaria)15种,疱脐衣属(Lasallia)1种,以及盾叶科(Rhizoplacopsidaceae)的一个种蔚青盾衣(Rhizoplacopsis weichingii J. ***& ***),通过地衣共生菌测得非石耳科地衣LSU rDNA全序列的为13个种(见表3-2),总共测得30种地衣型真菌核糖体RNA基因大亚基全序列。通过对真菌界以及动物界和植物界共计34种生物的LSU rDNA全序列的比对分析,从C3、C5、C7、C9和C11五个保守区中鉴定出8条高度保守的核苷酸序列,其中4条为真菌界所共有,1条为子囊菌门所共有,1条为担子菌门所共有,2条为接合菌共有。这些数据为达尔文进化论的共同祖先学说提供了分子证据。虽然通过LSUrDNA及ITS区(包括ITS1、5.8S、ITS2)均不能找到石耳目及石耳科地衣的特有序列。但随着基因组序列的不断增多可能会为解决上述问题提供一条新的途径。通过SSU+ITS区基因全序列的联合、LSU rDNA全序列基因以及蛋白质RPB1+RPB2氨基酸序列的联合,综合分析了石耳科地衣在子囊菌门中的系统地位,结果表明：由石耳属及疱脐衣属组成的石耳科系一单系类群,与茶渍目不属于同一单系,因而支持石耳目的建立。此外,分子数据也支持单型的盾叶科与石耳目形成同一单系类群。至于石耳科内的疱脐衣属与石耳属内的系统关系有待进一步的分析和研究。

关键词：石耳科 LSU rDNA全序列分子系统学真菌起源

菌株Streptomyces griseus *** CGMCC4.18对熊果酸的微生物转化

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中国药学杂志 2013年第23期48卷 1994-1997页

作者：付少彬杨峻山孙迪安中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 遵义医学院药学院贵州遵义563003

目的熊果酸是存在于多种天然植物中的一种三萜类化合物,因具有广泛的生物活性而备受关注。笔者拟通过对其进行结构修饰,以增加熊果酸的结构多样性,为筛选活性更好的化合物奠定基础。方法本研究首次利用链霉菌Streptomyces griseus *** C... 详细信息

目的熊果酸是存在于多种天然植物中的一种三萜类化合物,因具有广泛的生物活性而备受关注。笔者拟通过对其进行结构修饰,以增加熊果酸的结构多样性,为筛选活性更好的化合物奠定基础。方法本研究首次利用链霉菌Streptomyces griseus *** CGMCC 4.18,通过微生物转化的方式对熊果酸进行结构修饰与改造。结果得到化学方法难以得到且微生物转化中稀有的2位羟基化产物corosolic acid(2α,3β-dihydroxy-urs-12-en-28-oic acid)以及A环C-C单键打开的产物3,4-seco-ursan-4-hydroxy-12-en-3,28-dioic acid,更为可贵的是2位羟基的立体结构是α构型,这在微生物转化中是非常少见的。转化产物的结构通过波谱数据以及报道文献得知。结论通过链霉菌Streptomyces griseus *** CGMCC 4.18对熊果酸进行结构改造,可以有效地增加熊果酸结构的多样性,这也充分体现了微生物转化具有区域选择性强、立体选择性高的特点。

关键词：生物转化熊果酸 Streptomyces griseus subsp griseus α-羟基化 A环开环

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一种新型科罗索酸衍生物的生物催化合成

有机化学 2016年第11期36卷 2743-2745页

作者：付少彬孟庆峰辛庆肖世基遵义医学院药学院遵义563000 遵义医学院公共卫生学院遵义563000

科罗索酸是一种五环三萜酸,因其显著的抗糖尿病活性而备受关注.通过生物催化的方法对其进行结构修饰和改造,增加科罗索酸结构多样性,为筛选结构新颖或活性更强衍生物奠定基础.使用一株植物内生真菌Umbelopsis isabellina催化合成一个新... 详细信息

科罗索酸是一种五环三萜酸,因其显著的抗糖尿病活性而备受关注.通过生物催化的方法对其进行结构修饰和改造,增加科罗索酸结构多样性,为筛选结构新颖或活性更强衍生物奠定基础.使用一株植物内生真菌Umbelopsis isabellina催化合成一个新的科罗索酸衍生物,命名为2α,3β,7β-三羟基-乌苏-11-烯-28,13-内酯(2).其结构通过高分辨质谱、核磁共振等波谱技术确定.

关键词：科罗索酸生物催化羟基化 2α,3β,7β-三羟基-乌苏-11-烯-28,13-内酯

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真菌共祖起源的分子证据

菌物学报 2008年第2期27卷 217-223页

作者：付少彬魏江春河北大学生命科学学院保定071002

以真菌界、动物界和植物界中的19种各类生物作为代表,从具有进化速率不同区段结构的核糖体核酸基因大亚基全序列的C3、C9及C11三个高度保守区段中鉴定出了4条真菌所共有的核苷酸序列,亦即真菌界所特有的核苷酸序列。从其保守区段C5中鉴... 详细信息

以真菌界、动物界和植物界中的19种各类生物作为代表,从具有进化速率不同区段结构的核糖体核酸基因大亚基全序列的C3、C9及C11三个高度保守区段中鉴定出了4条真菌所共有的核苷酸序列,亦即真菌界所特有的核苷酸序列。从其保守区段C5中鉴定出了1条子囊菌门所特有的保守序列;从保守区段C7中鉴定出了1条担子菌门所特有的保守序列。研究结果为各类真菌起源于一个共同祖先提供了分子证据。用于研究的美味石耳的核糖体核酸基因大亚基全序列是由本实验室所提供;其他18种核糖体核酸基因大亚基全序列来自GenBank。

关键词：美味石耳子囊菌门担子菌门核糖体核酸基因特有序列

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药用植物内生菌对乌苏酸的微生物转化筛选

中国药学杂志 2011年第16期46卷 1225-1228页

作者：付少彬杨峻山崔晋龙孙迪安中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

目的从药用植物蛇足石杉分离纯化内生菌,并筛选可以转化乌苏酸的菌株,以期探究利用药用植物内生菌对乌苏酸进行结构修饰和改造的可行性。方法通过组织块法分离内生菌;用薄层色谱检测转化反应的发生;用CTAB法提取转化菌株的基因组DNA,PC... 详细信息

目的从药用植物蛇足石杉分离纯化内生菌,并筛选可以转化乌苏酸的菌株,以期探究利用药用植物内生菌对乌苏酸进行结构修饰和改造的可行性。方法通过组织块法分离内生菌;用薄层色谱检测转化反应的发生;用CTAB法提取转化菌株的基因组DNA,PCR技术对其ITS rDNA进行扩增,再经Blast比对鉴定菌株。结果从药用植物蛇足石杉的茎和叶中分离得到内生菌52株,用30株对乌苏酸进行转化筛选。有4株内生菌具有转化乌苏酸的能力,经表观形态及分子生物学的方法鉴定转化菌株,分别是Pestalotiopsis microspora,Colletotrichum gloeosporioides,Fusarium chlamydosporum,***。结论从转化产物的结构可以得出结论,利用药用植物内生菌对天然活性成分乌苏酸进行微生物转化,可以丰富乌苏酸的结构类型,为获得活性更好的衍生物提供技术和方法基础。

关键词：药用植物蛇足石杉内生菌微生物转化乌苏酸筛选

曝气生物滤池沿程脱氮性能及其微生物特性研究

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工业水处理 2014年第11期34卷 51-54页

作者：付少彬黄瑞敏俞舒迈华南理工大学环境与能源学院广东广州510006

通过曝气生物滤池中试系统处理模拟废水,研究沿程含氮化合物转化规律与微生物量、细菌群落丰富度、细菌种群相似程度的关系。结果表明,曝气生物滤池沿程的生物量逐渐减少,进水口附近微生物生长密集,反应器整体微生物种群丰富度都很高,... 详细信息

通过曝气生物滤池中试系统处理模拟废水,研究沿程含氮化合物转化规律与微生物量、细菌群落丰富度、细菌种群相似程度的关系。结果表明,曝气生物滤池沿程的生物量逐渐减少,进水口附近微生物生长密集,反应器整体微生物种群丰富度都很高,但沿程菌群种类变化不大,曝气生物滤池脱除氨氮和总氮的良好性能,是沿程营养物质变化引发各细菌种群数量在空间上有序变化有机合作的结果。

关键词：曝气生物滤池脱氮生物量细菌群落

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白苞裸蒴中两个新的含氮类化合物

有机化学 2016年第10期36卷 2496-2498页

作者：肖世基徐德林付少彬张茂生丁立生周燕遵义医学院药学院遵义563003 中国科学院成都生物研究所成都610041

通过硅胶和MCI柱色谱以及制备液相色谱等分离方法从白苞裸蒴中分离纯化得到6个含氮类化合物,经质谱和核磁共振等波谱技术将其结构分别鉴定为2-(1-羟基-6-甲氧基-4-氧亚基环己-2-烯-1-基)乙腈(1)、10-甲氧基-1-氧杂-3-氮杂螺[4.5]癸-2,6... 详细信息

通过硅胶和MCI柱色谱以及制备液相色谱等分离方法从白苞裸蒴中分离纯化得到6个含氮类化合物,经质谱和核磁共振等波谱技术将其结构分别鉴定为2-(1-羟基-6-甲氧基-4-氧亚基环己-2-烯-1-基)乙腈(1)、10-甲氧基-1-氧杂-3-氮杂螺[4.5]癸-2,6-二烯-8-酮(2)、2-(1-羟基-4-氧亚基环己-2,5-二烯-1-基)乙腈(3)、1-氧杂-3-氮杂螺[4.5]癸-2-烯-8-酮(4)、1-氧杂-3-氮杂螺[4.5]癸-2,6-二烯-8-酮(5)、对羟基苯乙腈(6).化合物1和2为新的含氮类化合物,化合物3为新的天然产物,其余化合物均为首次从该植物中分离得到.

关键词：白苞裸蒴三白草科含氮类化合物化学成分

红景天苷生物、化学和生物催化合成的分子理论及应用

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天然产物研究与开发 2013年第6期25卷 851-855,840页

作者：崔晋龙付少彬王梦亮山西大学应用化学研究所太原030006 遵义医学院药学院遵义563003

红景天苷是红景天属植物的主要活性成分之一,研究红景天苷的高效合成具有重要的科研和应用价值。本文全面概述近年来合成红景天苷的研究状况,主要包括生物合成途径、化学合成途径、生物催化合成途径。对生物合成途径中红景天苷的代谢合... 详细信息

红景天苷是红景天属植物的主要活性成分之一,研究红景天苷的高效合成具有重要的科研和应用价值。本文全面概述近年来合成红景天苷的研究状况,主要包括生物合成途径、化学合成途径、生物催化合成途径。对生物合成途径中红景天苷的代谢合成途径、关键酶及基因、实践现状进行了分析;总结了以Koenigs-Knorr法为理论基础的化学合成的研究进展;对具有广泛发展前景的体外生物催化合成状况进行了理论与实践的概述。通过对这些合成方法的展望,为人们了解合成红景天苷的研究现状、进一步深入研究提供参考。

关键词：红景天苷生物合成途径酶催化化学合成红景天

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微量DNA高效提取方法

安徽农业科学 2011年第15期39卷 8868-8869页

作者：付少彬王海英孟庆峰孙迪安中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 河北大学生命科学学院河北保定071002 山东师范大学山东济南250014 莱芜一中山东莱芜271100

[目的]探究一种高效的提取微量地衣体及地衣共生菌DNA的方法。[方法]在CTAB法的基础上,对溶液成分、比例及应用硅基质吸附柱对微量DNA提取进行优化。[结果]对于叶状、枝状和壳状地衣,采用该方法可得到质量较高的DNA。[结论]所用方法既... 详细信息

[目的]探究一种高效的提取微量地衣体及地衣共生菌DNA的方法。[方法]在CTAB法的基础上,对溶液成分、比例及应用硅基质吸附柱对微量DNA提取进行优化。[结果]对于叶状、枝状和壳状地衣,采用该方法可得到质量较高的DNA。[结论]所用方法既节约样品,简便易行,费用低,稳定性好,效率高,而且不局限于新鲜材料。

关键词：地衣共生菌微量DNA 提取方法

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