检索结果-南通市图书馆

作者：乔还澳北京化工大学

学位级别：硕士

新冠病毒对儿童、老人及患有基础疾病的人群的生命健康造成了极大的威胁。SARS-CoV-2木瓜样蛋白酶（PLpro）和RNA聚合酶（RdRp）在病毒复制、增殖过程中具有重要的生物学功能,是开发广谱抗冠状病毒药物的热门靶标。本论文则从基于配体... 详细信息

新冠病毒对儿童、老人及患有基础疾病的人群的生命健康造成了极大的威胁。SARS-CoV-2木瓜样蛋白酶（PLpro）和RNA聚合酶（RdRp）在病毒复制、增殖过程中具有重要的生物学功能,是开发广谱抗冠状病毒药物的热门靶标。本论文则从基于配体角度出发,利用化学信息学工具与多种机器学习算法,构建了PLpro与RdRp抑制剂的定性分类模型,并深入分析了它们的构效关系,为PLpro与RdRp抑制剂设计与优化提供参考。（1）运用多种机器学习算法进行PLpro抑制剂分类研究。通过对从Sci Finder文献数据库和Ch EMBL在线数据库中下载的49篇文献进行查阅与总结,获得610个化合物及其对应的半抑制浓度(IC50)用于构建模型。以10μM为阈值进行高低活性划分,采用三次随机划分方式将数据集划分为训练集和测试集。采用MACCS指纹描述符、CORINA描述符、MOE描述符与RDKit描述符,基于支持向量机（SVM）、深度神经网络（DNN）、随机森林（RF）三种算法构建54个PLpro抑制剂分类模型。最优模型为基于CORINA描述符和RF算法构建的Model1K,在测试集上准确率（Q）为0.82,马修斯相关系数（MCC）为0.64,具有良好的预测性能。此外,利用将四舍五入法（CLASS-LAG）与标准偏差（STD）结合的新型可靠性度量方式(d STD-PRO)计算模型的应用域,Model 2A测试集覆盖度最高,有91%化合物在应用域内且被准确预测。（2）SARS-CoV-2 PLpro抑制剂构效关系研究。对Model 1K建模过程中使用的描述符进行分析,发现辛醇/水分配系数、平均分子极化率、分子中化合键的总数等10种对PLpro抑制剂的活性影响较大的物理化学性质。基于子节点划分路径对决策树模型进行分析,得到5-[（氮杂环丁烷-3-基）氨基]-N-乙基-2-甲基苯甲酰胺、3-氨基-N-乙基苯甲酰胺、2-（3-乙基苯基）噻吩等14个高活性骨架以及苯嗪酸等7个低活性骨架。采用K-均值（K-Means）聚类算法将610个小分子抑制剂聚为12类,其中高活性子集1和4中的骨架特征包含在上述14个高活性骨架之中。（3）基于多种机器学习算法构建SARS-CoV-2 RdRp抑制剂分类模型。从Sci Finder文献数据库中共下载得到19篇文献,构建含有111个化合物及其对应的IC50的RdRp抑制剂数据库,以5μM为阈值进行化合物高低活性的划分,利用三次随机划分和SOM划分对数据集划分,使用CORINA、RDKit、MACCS三种分子描述符,基于SVM、RF、极致梯度提升（XGBoost）、自组织神经网络（SOM）算法建立39个RdRp抑制剂高低活性分类模型,从中选取6个最优模型,分别是Model 2B（SVM）、Model 2C（SVM）、Model 3E（RF）、Model3H（XGBoost）、Model 6A（SVM）、Model 6B（RF）,它们在测试集上准确率Q均大于0.83,MCC均大于0.66,均具有良好的预测性能。采用欧几里得距离法对最优模型应用域进行分析,Model 2B测试集覆盖度最高,95.65%化合物在应用域内且被准确预测。（4）RdRp抑制剂的构效关系分析。对最优模型Model 2C与Model 3H所用到的描述符进行分析,总结出原子价连通性指数、范德华表面积和油水分配系数log P（o/w）等6个RDKit描述符和MACCS＿151、MACCS＿142、MACCS＿155等10个MACCS指纹描述符对抑制剂高低活性影响较大。对RdRp抑制剂决策树模型和K-Means聚类结果分析,得到核苷酸类似物、7-氯-N-（2-丙基）-4-氨基喹啉等6个高活性骨架和1,3-苯并噻唑等4个低活性骨架,且上市及临床药物结构中也包含有上述的一些高活性骨架。本研究进行了SARS-CoV-2 PLpro与RdRp抑制剂的构效关系研究,利用多种机器学习算法构建了抑制剂生物活性的分类模型;通过分析重要描述符、聚类结果归纳总结出一系列高低活性抑制剂的骨架特征,对SARS-CoV-2 PLpro与RdRp抑制剂的进一步开发具有重要意义。

关键词：新冠病毒木瓜样蛋白酶(PLpro) 新冠病毒RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp) 构效关系(SAR) 机器学习(ML) 应用域(AD)

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甲状腺乳头状癌合并桥本甲状腺炎的临床病理特点

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武汉大学学报(医学版) 2024年第9期45卷 1071-1075页

作者：王子澳吴瑞乔武汉科技大学附属天佑医院普通外科

目的：探讨甲状腺乳头状癌（PTC）伴桥本甲状腺炎（HT）患者的临床病理特点、治疗及预后。方法：纳入2012年12月—2022年12月期间由武汉科技大学附属天佑医院收治经病理诊断为PTC伴有HT的患者共45例，将其作为合并组，同期随机选取60例... 详细信息

目的：探讨甲状腺乳头状癌（PTC）伴桥本甲状腺炎（HT）患者的临床病理特点、治疗及预后。方法：纳入2012年12月—2022年12月期间由武汉科技大学附属天佑医院收治经病理诊断为PTC伴有HT的患者共45例，将其作为合并组，同期随机选取60例单纯PTC的患者作为对照组，对两组的临床病理特点及预后进行比较。结果：合并组中女性占比64.44%，高于对照组（女性占比33.33%）；术前促甲状腺激素（TSH）水平（1.96±0.33）μIU/mL高于对照组（1.53±0.35）μIU/mL，游离三碘甲状腺原氨酸（FT3）、游离甲状腺素（FT4）水平低于对照组，血清甲状腺球蛋白抗体（Tg-Ab）与血清甲状腺过氧化物酶抗体（TPO-Ab）升高率、术前彩超微小钙化灶检出率均高于对照组（P0.05）。多因素分析发现，患者合并HT并非导致PTC中央区淋巴结转移的独立危险因素（P>0.05）。结论：PTC合并HT更好发于女性，通常伴随甲状腺机能减退症，合并HT并不会使患者的术前、术中诊断难度增加，对此类患者采用常规手术进行治疗不会增加术后并发症和癌症复发风险。

关键词：甲状腺乳头状癌桥本甲状腺炎临床特点预后

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矿井安全监控系统融合网关的设计

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现代信息科技 2024年第5期8卷 190-193,198页

作者：何澳王金恒乔李阳刘一兵谭宇博中国矿业大学(北京)人工智能学院北京100083

矿井安全监控系统包含众多子系统,这些子系统使用独立且不同的网关。煤矿井下环境恶劣,数据传输的实时性和可靠性对于安全生产具有重要意义,传统网关数据处理能力差,难以实时处理和传输海量数据。为此,设计一款矿井安全监控系统融合网关... 详细信息

矿井安全监控系统包含众多子系统,这些子系统使用独立且不同的网关。煤矿井下环境恶劣,数据传输的实时性和可靠性对于安全生产具有重要意义,传统网关数据处理能力差,难以实时处理和传输海量数据。为此,设计一款矿井安全监控系统融合网关,该网关以RK3568核心板为主控,搭载无线通信、有线通信和扩展模块,负责接收来自各个子系统的数据,在网关内进行数据处理,通过工业以太网上传数据,实现各个子系统的数据融合与转发。

关键词：安全监控融合网关 RK3568 工业以太网

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