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嗜水气单胞菌噬菌体（Yyong）的分离与基因组分析

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中国生物工程杂志 2024年

作者：陈慧珏刘文才钱敏桦潘灵婷徐锦鹏李登峰童贻刚 1.宁波大学海洋学院 2.北京化工大学生命科学学院宁波大学海洋学院北京化工大学生命科学学院

目的：嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）的致病范围十分广泛，耐药现象日益普遍，危害鱼类、家畜和人类健康。本研究目的在于分离、鉴定烈性A. hydrophila噬菌体。方法：以A. hydrophila Ah2为指示菌，用双层平板法从污水中分离获... 详细信息

目的：嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）的致病范围十分广泛，耐药现象日益普遍，危害鱼类、家畜和人类健康。本研究目的在于分离、鉴定烈性A. hydrophila噬菌体。方法：以A. hydrophila Ah2为指示菌，用双层平板法从污水中分离获得烈性噬菌体Yyong。对其进行了电镜观察、宿主范围检测、一步生长试验、全基因组测序、基因注释和系统进化分析。结果：Yyong呈肌尾病毒样，头部直径为（83±2）nm，尾部长度为（115±5）nm。基因组全长165 663 bp，G+C含量为40.90%，含有16 个tRNA基因和242 个开放阅读框（ORF），含有诸多为辅助代谢基因（AMGs），主要涉及DNA合成和抗氧化应激。有两个ORF分别被预测为编码TA（Toxin-Antitoxin）防御系统的毒素（PAAR重复蛋白）和抗毒素DarG，这有利于Yyong在细菌细胞内生存。有三个ORF分别被预测为编码σ因子、抗σ70蛋白和σ70诱饵，这些因子可能修饰RNA聚合酶使之优先识别噬菌体基因的启动子区域。在系统进化树中，与Yyong进化距离最小的病毒是Tulanevirus属的气单胞菌噬菌体。Yyong与它们间分享的最高ANI值和isDDH值分别是94.51%和53.30%，均小于定义一个种的边界值，与它们间分享的最大PASC值和VIRIDIC值，分别是90.51%和90.20%，均大于属的边界值；Tulanevirus属和Straboviridae科的另一个属Biquartavirus聚成一簇（clade），它们共享的核心基因（core genes）占比为68.53%，符合ICTV关于建立一个亚科的标准（27%～79%）。结论：Yyong是一个新种，属于Tulanevirus属。我们建议在Straboviridae科下建立一个新的亚科以包含Tulanevirus属和Biquartavirus属。Yyong携带的数量和种类多样的AMGs和tRNA基因，使其有效地控制宿主细菌，高效合成噬菌体自身核酸和蛋白。一些AMGs具有良好的开发潜力。本研究丰富了噬菌体基因数据库与噬菌体分类系统，为噬菌体的功能基因研究和噬菌体研发奠定了基础。

关键词：分离基因组噬菌体嗜水气单胞菌辅助代谢基因新亚科

不同污染压力对青岛董家口邻近海域大型底栖动物群落的影响

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生态学报 2024年

作者：蒋文贤张明伟刘晓收 1.中国海洋大学海洋生命学院 2.中国海洋大学海洋生物多样性与进化教育部重点实验室中国海洋大学海洋生命学院中国海洋大学海洋生物多样性与进化教育部重点实验室

本文利用2021年11月在青岛董家口邻近海域的14个站位采集的大型底栖动物数据，分析了不同污染压力对大型底栖动物群落的影响。本研究共鉴定出大型底栖动物66个分类单元，主要类群为多毛类、节肢动物、环节动物、软体动物等。研究区域的... 详细信息

本文利用2021年11月在青岛董家口邻近海域的14个站位采集的大型底栖动物数据，分析了不同污染压力对大型底栖动物群落的影响。本研究共鉴定出大型底栖动物66个分类单元，主要类群为多毛类、节肢动物、环节动物、软体动物等。研究区域的平均丰度为343.33个/m2，平均湿重生物量为8.26g/m2。研究区域的海域底质类型包括砂、粘土质粉砂、砂质粉砂、砂-粉砂-粘土四种类型。海域内的重金属污染较轻，铬、锌、铅、砷、铜、镉处于清洁水平，砷在部分站位存在轻度污染。通过BIOENV分析得出，影响大型底栖动物群落的决定因素包括化学需氧量、沉积物叶绿素a含量、锌、铅、镉含量，相关系数为0.460。对大型底栖动物群落结构的主要压力来源于重金属。在港区继续长期使用后，重金属的污染压力可能会增大。

关键词：大型底栖动物群落结构环境因子污染压力重金属

黄河源实际蒸发和径流变化多时间尺度归因分析

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水土保持研究 2024年

作者：曹振江姬广兴杨瑞婷王雨欣李凡张亚丽陈伟强黄珺嫦 1.河南农业大学资源与环境学院 2.中国地质大学(武汉)公共管理学院河南农业大学资源与环境学院中国地质大学(武汉)公共管理学院

[目的]全面分析黄河源区变化环境下水文要素(实际蒸发和径流)变化的主要影响因素,为黄河源区水文循环机理研究和生态环境保护提供参考依据。[方法]基于黄河源区1967—2020年的水文气象数据,使用Mann-Kendall趋势检验法在年、季和月时间... 详细信息

[目的]全面分析黄河源区变化环境下水文要素(实际蒸发和径流)变化的主要影响因素,为黄河源区水文循环机理研究和生态环境保护提供参考依据。[方法]基于黄河源区1967—2020年的水文气象数据,使用Mann-Kendall趋势检验法在年、季和月时间尺度上分析黄河源区实际蒸发和径流的变化特征,采用ABCD水文模型和月尺度Budyko模型在多时间尺度上定量分离出人类活动和气候变化对黄河源区实际蒸发和径流变化的贡献率。[结果](1) 1967—2020年黄河源区实际蒸发量在年、季和月时间尺度上都表现为显著增加的趋势;径流在年尺度、旱季、8月、9月表现为不显著减少趋势,在雨季和7月表现为不显著增加趋势。(2)在年尺度、旱季、8月和9月,气候变化对流域实际蒸发的影响较大,其对实际蒸发量变化的贡献率分别为59.61%,108.43%,50.71%,58.17%;在雨季和7月,人类活动对流域实际蒸发的影响较大,其贡献率为62.38%和53.34%。(3)无论是在年尺度、季尺度还是7月、8月、9月,都表现为气候变化对流域径流变化的贡献率较大,贡献率分别为55.58%,56.23%,59.92%,68.70%,51.51%和87.03%。[结论]黄河源区不同时间尺度实际蒸发和径流变化多受气候变化影响较大,但是气候因素和人类活动对它们的贡献率相差较小,未来仍应注重人类活动影响的加剧。

关键词：黄河源区实际蒸发径流多时间尺度趋势分析 ABCD水文模型月尺度Budyko模型

探究2023年2月6日土耳其7.8级双震的成因

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地震 2024年

作者：郭贵娟孙凤霞杜建国 1.地震出版社 2.中国地震局地震预测研究所 3.中国地质大学(北京)地球科学与资源学院地震出版社中国地震局地震预测研究所中国地质大学(北京)地球科学与资源学院

为了促进地震预测和揭示地震成因奥秘,依据地壳结构、地震地质、地球物理、地热流体地球化学资料和地震序列发生的时空特征,综合研究了2023年2月6日土耳其南部7.8级双震的成因。2023年2月6—17日土耳其南部发生7.8级双震,伴随了几十次M... 详细信息

为了促进地震预测和揭示地震成因奥秘,依据地壳结构、地震地质、地球物理、地热流体地球化学资料和地震序列发生的时空特征,综合研究了2023年2月6日土耳其南部7.8级双震的成因。2023年2月6—17日土耳其南部发生7.8级双震,伴随了几十次M≥5.0强余震和数千次M<5.0的余震。地震震源深度分布范围为5～22 km,在大约500 km×300 km的范围内震中分布形成一条NE向、宽约40 km、长约300 km和另一条近EW向、宽约50 km、长约240 km的震中分布密集带。研究区下存在地壳内的低速高导层,大地热流密度高值异常,布格重力负异常、航磁异常以及深大断裂带,表明该区岩石圈内存在地幔流体聚集、形成超高压流体的条件。地幔流体局部聚集形成超高压流体的过程可视为孕震过程。2023年2月617日不同时段的地震震源空间分布的阶段性集中和深度变化表明,地幔高能密流体的持续供给或者供给量增大形成了孕震体。当孕震体内流体压力大于围岩束缚强度(围岩抗压强度+静水压力)时发生流体隐爆,产生地震。流体通过运移—聚集—爆炸运移—聚集—爆炸……的循环方式运移,同时产生7.8级双震及其余震。这从能量来源和产生地震波的角度较合理地解释了在有限的范围内非连续、非弹性地体中连续产生7.8级双震和M≥4.0余震的现象。

关键词： 7.8级双震隐爆作用地幔流体地热流体孕震地震成因土耳其

江苏安徽早三叠世裂齿鱼科一新种:吴氏三叠鱼（英文）

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古脊椎动物学报(中英文） 2024年

作者：徐光辉袁志伟任艺廖浚伶赵丽君宋海军 1.中国科学院古脊椎动物与古人类研究所,中国科学院脊椎动物演化与人类起源重点实验室 2.中国地质大学地球科学学院,生物地质与环境地质国家重点实验室 3.中国科学院大学 4.兴义民族师范学院经济贸易学院 5.浙江自然博物院中国科学院古脊椎动物与古人类研究所中国科学院脊椎动物演化与人类起源重点实验室中国地质大学地球科学学院生物地质与环境地质国家重点实验室中国科学院大学兴义民族师范学院经济贸易学院浙江自然博物院

裂齿鱼科是新鳍鱼类干群的一支,只生活于三叠纪。根据江苏句容和安徽巢湖早三叠世奥伦尼克期晚史密斯亚期海相地层中发现的6块保存较好的化石,命名了裂齿鱼科一新种,吴氏三叠鱼(Teffichthys wui ***.)。它代表了三叠鱼属的第三个种,时... 详细信息

裂齿鱼科是新鳍鱼类干群的一支,只生活于三叠纪。根据江苏句容和安徽巢湖早三叠世奥伦尼克期晚史密斯亚期海相地层中发现的6块保存较好的化石,命名了裂齿鱼科一新种,吴氏三叠鱼(Teffichthys wui ***.)。它代表了三叠鱼属的第三个种,时代上略晚于非洲马达加斯加早史密斯亚期的马达加斯加三叠鱼和贵州印度期晚第纳尔亚期的优雅三叠鱼,是该属迄今已知最年轻的种。新种具有三叠鱼属的共近裔特征(一块喷水骨,38-41列侧线鳞,尾鳍轴上鳍条不超过3条),但同时它以一些自近裔特征与马达加斯加三叠鱼和优雅三叠鱼相区别,如主鳃盖骨和下鳃盖骨水平接触,鳞片光滑并且后缘无锯齿。根据新种与其他裂齿鱼科鱼类的详细比较,修订了三叠鱼属及裂齿鱼科的鉴定特征。在分支系统学研究的基础上,讨论了裂齿鱼科与其他新鳍鱼类干群的系统发育关系。研究结果为了解新鳍鱼类干群的系统发育和分类提供了新的信息。

关键词：江苏安徽早三叠世裂齿鱼目骨骼学系统发育

珠江口盆地陆丰凹陷西北洼原型盆地及迁移演化特征

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海洋地质与第四纪地质 2024年

作者：钟锴肖张波朱伟林黄鑫边利豪吴琼玲冯凯龙 1.同济大学海洋地质国家重点实验室 2.同济大学海洋资源研究中心 3.中海石油(中国)有限公司深圳分公司 4.中海石油深海开发公司 5.广东海洋大学船舶与海洋工程系同济大学海洋地质国家重点实验室同济大学海洋资源研究中心中海石油(中国)有限公司深圳分公司中海石油深海开发公司广东海洋大学船舶与海洋工程系

陆丰凹陷西北洼是发育在珠一坳陷惠陆低凸起上的古近系残留型洼陷，总体表现为古近系“北断南削”型箕状半地堑和新近系坳陷型洼陷的双层结构特征，具有较好的油气勘探潜力。基于对研究区高精度三维地震的精细解释、平衡剖面恢复、洼陷... 详细信息

陆丰凹陷西北洼是发育在珠一坳陷惠陆低凸起上的古近系残留型洼陷，总体表现为古近系“北断南削”型箕状半地堑和新近系坳陷型洼陷的双层结构特征，具有较好的油气勘探潜力。基于对研究区高精度三维地震的精细解释、平衡剖面恢复、洼陷结构和构造演化分析，揭示了研究区西段、中段和东段在原型盆地及其动力学机制、洼陷结构和构造演化、岩浆底侵期次及强度等方面存在显著的分段差异性，并表现出由东向西的迁移性演化特征。由东到西，洼陷变形机制由脆-韧性变形转变为脆性变形，洼陷伸展量、伸展率逐渐变大；岩浆底侵作用总体上东强西弱，强烈底侵期东早西晚；控洼断裂的滑脱作用东强西弱，滑脱时期东早西晚；早断陷期文下段沉积厚度总体上东厚西薄，晚断陷期恩下段西厚东薄；古近系地层翘倾、剥蚀作用总体上东强西弱，时间上东早西晚。结合研究区地温梯度及岩浆底侵作用的横向差异，提出了热机制是西北洼成盆机制及分段差异演化的主控因素，并导致了西北洼从东到西，由早到晚的迁移性演化特征。西北洼迁移性演化特征的新认识将对其石油地质条件分段差异性的深入研究及推动勘探进程提供科学指导。

关键词：残留型洼陷原型盆地洼陷演化岩浆底侵热机制陆丰凹陷西北洼

蒙阴金刚石的形态形貌特征及其对深部熔流体性质、活动的指示

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地球科学进展 2024年

作者：丁永康梁伟章丘志力邓小芹孙媛马瑛孙成阳陆太进 1.中山大学地球科学与工程学院 2.桂林理工大学材料科学与工程学院 3.广东省科学院 4.国检中心深圳珠宝检验实验室有限公司 5.中国地质大学(北京)珠宝学院 6.自然资源部珠宝玉石首饰管理中心北京研究所中山大学地球科学与工程学院桂林理工大学材料科学与工程学院广东省科学院国检中心深圳珠宝检验实验室有限公司中国地质大学(北京)珠宝学院自然资源部珠宝玉石首饰管理中心北京研究所

金刚石在金伯利岩浆捕虏前的地幔环境及后续岩浆运移过程中熔流体的共同熔/溶蚀作用下，会产生复杂的晶体形态和表面形貌，这些形态形貌学的表观特征一定程度上反映了地幔及金伯利岩浆运移过程中熔流体的不同性质。尝试通过对蒙阴金刚... 详细信息

金刚石在金伯利岩浆捕虏前的地幔环境及后续岩浆运移过程中熔流体的共同熔/溶蚀作用下，会产生复杂的晶体形态和表面形貌，这些形态形貌学的表观特征一定程度上反映了地幔及金伯利岩浆运移过程中熔流体的不同性质。尝试通过对蒙阴金刚石的形态及其形貌学特征进行分析，结合国际大量模拟地幔及金伯利岩温压和化学环境条件下天然金刚石的熔/溶蚀实验的相关成果，对蒙阴金刚石所体现的地幔及金伯利岩熔流体活动的性质和特点进行了讨论，得到以下几点认识：(1)蒙阴金刚石的地幔熔体熔蚀形态及形貌特征以低程度熔蚀的“八面体+三角/锯齿状薄层+联合凹坑/深蚀坑”的组合为主，严重熔蚀的“十二面体+深蚀坑”组合次之，结合统计分析，这一定程度上暗示了华北克拉通古老岩石圈地幔所经历的小规模、低程度的橄榄岩—熔体反应，熔体性质为相对富CO2贫H2O的含碳酸盐熔体；(2)蒙阴3个金伯利岩矿带的金刚石溶蚀形态比例指示了其岩浆流体活动性具有一定差异，具有高比例溶蚀形态金刚石的常马庄矿带岩浆流体活动相对坡里和西裕矿带更强；(3)蒙阴金刚石岩浆流体溶蚀的形态及形貌以“四六面体+浅凹陷+溶蚀凹雕”组合为主，且大多数样品都表现出岩浆流体低程度溶蚀的叠加形貌，另外，所有浅的、独立的三角凹坑均为平底和具有截角的倒三角凹坑，未见特殊类型，以上特征均与浅成金伯利岩释放的富H2O贫CO2流体相关。上述结果表明，即使在比较有限的区域内，金刚石所记录的地幔及金伯利岩浆熔流体活动过程也存在不均一性，其形态及形貌特征可以作为研究地幔熔体及金伯利岩浆流体活动的一个重要参考，也从某些角度揭示出很多金刚石矿区不同岩体、矿带产出的金刚石的品质和品位存在明显差异的内在原因。

关键词：金刚石金伯利岩形态及形貌学金刚石成矿

词根频率和语义透明度对英语二语后缀派生词加工模型影响的实证研究

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外语学刊 2024年

作者：陈士法秦越顾晓岚彭玉乐中国海洋大学外国语学院中国海洋大学外国语学院

本研究采用词汇判断任务，探究词根频率、语义透明度及其交互效应对英语二语后缀派生词加工模型的影响。实验发现：（1）在反应时上词根频率主效应显著，高频词根派生词的平均反应时低于低频词根派生词；（2）在反应时上语义透明度主效... 详细信息

本研究采用词汇判断任务，探究词根频率、语义透明度及其交互效应对英语二语后缀派生词加工模型的影响。实验发现：（1）在反应时上词根频率主效应显著，高频词根派生词的平均反应时低于低频词根派生词；（2）在反应时上语义透明度主效应显著，语义透明派生词的平均反应时低于语义晦涩派生词；（3）在正确率上二者交互效应显著，语义透明度对低频词根派生词正确率的影响更大，词根频率对语义晦涩派生词正确率的影响更大。据此，我们构建中国学习者英语二语后缀派生词分解加工模型：分为词素分解和词素整合两个阶段，词根频率和语义透明度均影响派生词加工的时间进程，二者交互影响派生词的加工质量。

关键词：英语后缀派生词词根频率语义透明度分解加工模型

青藏高原伦坡拉盆地丁青湖组二段黑色页岩正构烷烃特征及古环境重建

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沉积与特提斯地质 2024年

作者：白鑫陈云陈晓冬伍坤宇李雅楠何洋李莎陈露洁伊海生 1.成都理工大学地球科学学院 2.中国地质科学院 3.中国石油青海油田公司 4.成都理工大学沉积地质研究院成都理工大学地球科学学院中国地质科学院中国石油青海油田公司成都理工大学沉积地质研究院

伦坡拉盆地自新生代沉积了一套连续的湖相暗色岩系，记录了该时期气候环境变化，这套湖相黑色页岩沉积为研究高原内部气候环境变化特征提供了良好的素材。本研究在对蒋日阿错地区渐新统丁青湖组二段沉积剖面地质调查的基础上，对黑色页... 详细信息

伦坡拉盆地自新生代沉积了一套连续的湖相暗色岩系，记录了该时期气候环境变化，这套湖相黑色页岩沉积为研究高原内部气候环境变化特征提供了良好的素材。本研究在对蒋日阿错地区渐新统丁青湖组二段沉积剖面地质调查的基础上，对黑色页岩中的正构烷烃进行抽提和色谱分析，研究CPI、ACL、Paq以及链长等指标的纵向变化情况，探讨并恢复古湖盆水深变化及植物群落演化特征，重建青藏高原中部渐新世的区域气候变化情况。结果表明：（1）伦坡拉盆地丁青湖组二段沉积有机质主要来源从陆源高等植物向水生沉水植物转变。（2）伦坡拉盆地蒋日阿错地区渐新世气候背景由湿转干，使古湖盆水体形成盐度分层，为有机质保存及黑色页岩的形成提供良好沉积环境。（3）利用Paq指标重建伦坡拉盆地蒋日阿错地区丁青湖组二段古湖盆水生植物演替变化，依据不同水深环境下生长的植物类型，推断古湖水位在研究阶段为下降趋势，当水位下降到适宜沉水植物生长的深度时使其大量生长，成为沉积物中主要的有机质来源。

关键词：伦坡拉盆地环境演化黑色页岩正构烷烃色谱分析