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杜撒×大长撒 VRTN 基因多态及其与生产性状的关联研究

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浙江农业学报 2024年第7期36卷 1502-1510页

作者：马黎兰艺谢冰心周春露罗舒元许文坤董新星严达伟云南农业职业技术学院畜牧兽医学院云南昆明650212 云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南省畜牧总站云南昆明650224 云南省动物营养与饲料重点实验室云南昆明650201

为研究杜撒×大长撒VRTN基因多态及其对育肥、胴体、肉质的影响。采用PCR直接测序法对杜撒×大长撒、杜洛克、长白、大白VRTN基因启动子区和4个外显子区进行单核苷酸多态性检测,计算VRTN基因多态位点基因型频率及基因频率,测定杜撒×大... 详细信息

为研究杜撒×大长撒VRTN基因多态及其对育肥、胴体、肉质的影响。采用PCR直接测序法对杜撒×大长撒、杜洛克、长白、大白VRTN基因启动子区和4个外显子区进行单核苷酸多态性检测,计算VRTN基因多态位点基因型频率及基因频率,测定杜撒×大长撒猪群的育肥、胴体和肌肉品质,采用最小二乘模型分析VRTN基因与育肥、胴体、肉质的关联。结果显示:在4个猪群中共检测到VRTN g.97615896_97615897ins291和VRTN g.97622607G>A 2个突变位点具有多态性,其中,g.97615896_97615897ins291在4个猪群中均存在Q/Q、Q/Wt、Wt/Wt 3种基因型,4个群体均属于中度多态,均处于Hardy-Weinberg平衡状态;杜撒×大长撒g.97615896_97615897ins291位点Q/Q基因型活体背膘厚比Wt/Wt基因型少0.36 mm(PA位点在杜撒×大长撒属于低度多态(PIC=0.0799),处于Hardy-Weinberg平衡状态;杜撒×大长撒VRTN g.97622607G>A位点GG基因型30~100 kg日增重比GA基因型多61.43 g·d^(-1)(PA位点GG基因型可提高杜撒×大长撒猪群的日增重和瘦肉率。本研究结果为利用VRTN基因进行分子标记辅助选择提高撒坝猪的生产性能提供依据。

关键词：杜撒×大长撒 VRTN基因生产性能遗传多样性关联分析

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Wnt信号通路在骨骼肌发育中的调控研究进展

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农业生物技术学报 2022年第1期30卷 164-172页

作者：付玉董新星严达伟张浩张博中国农业大学畜禽育种国家工程实验室/高原畜禽遗传资源研究中心云南农业大学动物科技学院

Wnt是一种分泌型糖蛋白,能通过旁分泌或自分泌的形式与受体结合,激活胞内信号途径,调控靶基因转录,进而参与胚胎发育、以及细胞增殖等多种细胞学过程的调控,尤其在骨骼肌发育过程中发挥重要作用。本文综述了Wnt蛋白的受体、Wnt信号通路... 详细信息

Wnt是一种分泌型糖蛋白,能通过旁分泌或自分泌的形式与受体结合,激活胞内信号途径,调控靶基因转录,进而参与胚胎发育、以及细胞增殖等多种细胞学过程的调控,尤其在骨骼肌发育过程中发挥重要作用。本文综述了Wnt蛋白的受体、Wnt信号通路,并分别从配体、调控因子以及与其他通路的作用关系的角度阐述了Wnt通路在骨骼肌发育及再生中的调控作用,为骨骼肌生长和发育的调控机制研究提供思路,同时为畜牧业生产提供理论基础。

关键词： Wnt信号通路骨骼肌发育调控

大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异基因及其调控通路分析

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中国农业大学学报 2022年第6期27卷 132-144页

作者：聂靖茹张博马黎张浩李国美严达伟董新星云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 中国农业大学动物科学技术学院北京100193 云南农业职业技术学院畜牧兽医学院昆明650212

为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异的关键基因并分析其调控途径,以40、80和120kg的大型迪庆藏猪为对象,基于RNA-seq技术对背最长肌组织进行转录组测序,对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析,筛选与肌肉生长相关的... 详细信息

为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异的关键基因并分析其调控途径,以40、80和120kg的大型迪庆藏猪为对象,基于RNA-seq技术对背最长肌组织进行转录组测序,对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析,筛选与肌肉生长相关的差异基因进行STEM趋势分析、功能分析并构建差异基因互作网络。结果表明:1)10~40kg阶段与40~80kg阶段、40~80kg阶段与80~120kg阶段比较共检测到730个、981个基因显著差异表达;2)差异表达基因STEM趋势分析显示,共有4个差异显著模块,模块11和14的差异基因先上调表达后轻微下调;模块9和10的差异基因先上调后下调表达;3)差异基因互作网络显示,10~40kg vs 40~80kg,FOS基因位于调控网络核心,与EGRs、CCL2和NOR-1等基因有互作关系,NOR-1基因上调导致肌肉生长速度加快,FOS基因下调抑制肌源性分化,EGRs基因下调导致胶原纤维束减少,CCL2基因下调导致肌肉再生受损;40~80kg vs 80~120kg,FOXO1、PDK4和PPARD等基因位于网络中心,SFRPs基因上调阻止成肌细胞终末分化,FZD7基因下调减缓肌纤维肥大速度,FOXO1下调导致肌生长抑制素mRNA下降减缓肌肉萎缩进程,PPARD与FOXO1均降低PDK4含量从而使肌肉丙酮酸脱氢酶复合物活性增强,对碳水化合物氧化和葡萄糖摄取增加,肌纤维变粗,与大型迪庆藏猪40至80kg生长速度显著快于10至40kg阶段,而80kg之后缓慢下降的规律吻合;4)挑选了12个差异基因进行qPCR验证,EGR1、SFRP1和FOXO1等12个基因定量验证结果与转录组测序结果一致。综上,本研究利用RNA-seq技术筛选出12个影响大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长的差异基因,可为解析地方猪肌肉生长的遗传调控机制、应用分子标记辅助选择提高迪庆藏猪瘦肉产量提供参考。

关键词：大型迪庆藏猪 RNA-seq 肌肉生长差异表达基因调控途径

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马关无角山羊肉质特性

甘肃畜牧兽医 1998年第4期28卷 3-5页

作者：陈韬严达伟云南农业大学食品科学部云南农业大学动科院

试验测定了马关无角山羊的肉质指标并和临沧长毛山羊进行了比较。结果显示，肉中干物质、蛋白质和氨基酸含量差异不显著（Ｐ＞０．０５）。马关无角山羊肉蛋白质中赖氨酸和组氨酸含量高于理想蛋白质中的含量。肉的嫩度、熟肉率和肌纤维... 详细信息

试验测定了马关无角山羊的肉质指标并和临沧长毛山羊进行了比较。结果显示，肉中干物质、蛋白质和氨基酸含量差异不显著（Ｐ＞０．０５）。马关无角山羊肉蛋白质中赖氨酸和组氨酸含量高于理想蛋白质中的含量。肉的嫩度、熟肉率和肌纤维直径（背最长肌和股二头肌）两个品种之间差异显著（Ｐ＜０．０５）。马关无角山羊和监沧长毛山羊肉的ＰＨ２４值较高，分别为５．８４和５．９４。

关键词：马关无角山羊肉质肌纤维直径氨基酸

大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢差异基因及调控网络分析

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畜牧兽医学报 2023年第2期54卷 520-533页

作者：王琳马黎张博邓俊张浩欧阳晓芳严达伟董新星云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业职业技术学院昆明650212 中国农业大学动物科学技术学院北京100193 云南省畜牧总站昆明650224

旨在筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段、不同部位脂质代谢差异的关键基因。本研究选择胎次相同、出生日期相近、体重10 kg左右的大型迪庆藏猪36头,随机分为3组,相同条件育肥,分别在平均体重达40、80和120 kg时屠宰,测定胴体性能,每组采集3... 详细信息

旨在筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段、不同部位脂质代谢差异的关键基因。本研究选择胎次相同、出生日期相近、体重10 kg左右的大型迪庆藏猪36头,随机分为3组,相同条件育肥,分别在平均体重达40、80和120 kg时屠宰,测定胴体性能,每组采集3头猪的背脂和腹脂进行高通量转录组测序,测序数据经拼接、比对,筛选与脂质代谢相关的显著差异基因并进行GO、KEGG分析、基因互作网络分析。结果表明,40、80和120 kg大型迪庆藏猪腹脂vs.背脂分别筛到486、765和339个差异表达显著基因,随机挑选的EGR2、SOD3等5个差异表达显著基因的qPCR结果与转录组测序结果一致,差异表达显著基因主要富集在肌肉收缩、细胞黏附、间充质细胞增殖正调节等GO条目,心肌收缩、PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路等KEGG通路;40 kg组EGR2、RARRES2、TMOD4和SFRP2基因位于网络核心,EGR2、RARRES2、SFRP2在腹脂上调,TMOD4下调;80 kg组THBS1、PPARA、NRIP1和LPL基因位于网络核心,4个核心基因均在腹脂上调;120 kg组HTRA1、TSHR、LRRK2、STC2、SHOX2和SOD3基因位于网络核心,LRRK2、TSHR在腹脂上调,SHOX2、SOD3、STC2、HTRA1下调。结果提示,EGR2、THBS1、TSHR等14个基因作为核心基因精细调控大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢,10~40 kg,EGR2等4个基因位于核心,促进脂肪细胞分化、增殖的基因在腹脂上调,脂肪合成的开关基因下调;40~80 kg,THBS1等4个基因位于核心,促进甘油三酯合成、胆固醇形成、脂质积累的基因在腹脂上调;80~120 kg,LRRK2等6个基因位于核心,促进甘油三酯积累、脂肪酸氧化的基因在腹脂上调,抑制脂肪分解、脂滴形成的基因下调。本试验结果可为解析地方猪不同部位脂质差异性沉积的调控机制提供基础数据,为迪庆藏猪的靶向选育提供参考。

关键词：迪庆藏猪脂肪差异沉积功能基因基因互作网络

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藏鸡胚胎的低氧适应特征及其血红蛋白突变效应

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中国科学（C辑） 2005年第4期35卷 333-339页

作者：苟潇李宁连林生严达伟张浩吴常信中国农业大学动物科技学院北京100094 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100094 云南农业大学动物科技学院昆明650201

藏鸡能在4200 m以上海拔正常繁衍生息, 但低地鸡在模拟4200 m海拔(12.0%O2)条件下孵化却只有3.0%的孵化率.在两品种全期低氧和阶段低氧模拟孵化实验中, 4200 m全期低氧揭示4～11天是隐性白与藏鸡阶段存活率相差最悬殊的阶段, 12～21天... 详细信息

藏鸡能在4200 m以上海拔正常繁衍生息, 但低地鸡在模拟4200 m海拔(12.0%O2)条件下孵化却只有3.0%的孵化率.在两品种全期低氧和阶段低氧模拟孵化实验中, 4200 m全期低氧揭示4～11天是隐性白与藏鸡阶段存活率相差最悬殊的阶段, 12～21天相差极显著, 1～3天相差不显著.但4200 m阶段低氧只能造成两品种孵化率显著差异, 而并不足以造成低氧阶段间阶段死亡率显著差异, 结果显示藏鸡具有优越的克服低氧损害后期不良影响的能力.对藏鸡和隐性白鸡血红蛋白7条链全部编码序列进行多态分析, 筛选到?D链编码基因的一个低氧功能突变位点(Met- 2D(B13)-Leu).该突变基因为藏鸡独有, 其频率随着海拔升高而升高, 而且该突变基因频率越高的群体, 孵化率越高.以鸡的HbD晶体为模板, 对突变血红蛋白结构和功能进行了同源预测, 结果表明Leu替代Met提供了一个更疏水环境, 有利于血红素的稳定, 从而提高了血红蛋白的血氧亲和力.突变(Met-32D(B13)-Leu)发生的时间和地点与藏鸡家养化时间和地点密切相关.

关键词：藏鸡模拟孵化血红蛋白同源预测低氧适应突变效应鸡胚胎特征基因频率孵化率

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中国马遗传多样性与起源分化研究进展

黑龙江畜牧兽医 2017年第8期 55-58页

作者：袁珂蒙严达伟云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南省动物营养与饲料重点实验室昆明650201

动植物驯化是现代社会的创新,因此研究种群起源对理解文明变迁有着重要意义。马在交通和战争领域中的突出作用在很多情况改变着社会环境。根据考古资料和毛色资料表明,马最早可能在5 000年前欧亚大陆被驯化,同时也有线粒体DNA数据说明... 详细信息

动植物驯化是现代社会的创新,因此研究种群起源对理解文明变迁有着重要意义。马在交通和战争领域中的突出作用在很多情况改变着社会环境。根据考古资料和毛色资料表明,马最早可能在5 000年前欧亚大陆被驯化,同时也有线粒体DNA数据说明马有多个母系起源。马的驯化事件并不是一个单一的离散事件,这不能排除马在中国驯化的可能性。中国马起源问题现在有两种解释:可能是在欧亚大陆被驯化后蔓延到我国北方的邻国;以及中国本土的野马被驯化,中国可能是马起源地之一。但是,关于马的驯化问题目前还没有准确解释。为了弄清楚中国马的起源,还需要进一步研究中国马和外国马之间的关系。

关键词：马起源驯化遗传多样性线粒体DNA

杜撒♂×大长撒♀F_(1)代猪ARHGEF37基因多态性及其对生长性状的影响

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南方农业学报 2022年第4期53卷 918-925页

作者：朱怡轩闵鹏聪陈强王孝义鲁绍雄严达伟李明丽云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201

【目的】揭示ARHGEF37基因多态性及其对猪生长性状的影响,为利用该基因标记推进滇撒猪配套系的进一步选育及开发利用提供参考依据。【方法】以274头杜撒♂×大长撒♀F;代猪为试验材料,采用PCR扩增产物直接测序法检测ARHGEF37基因外显子... 详细信息

【目的】揭示ARHGEF37基因多态性及其对猪生长性状的影响,为利用该基因标记推进滇撒猪配套系的进一步选育及开发利用提供参考依据。【方法】以274头杜撒♂×大长撒♀F;代猪为试验材料,采用PCR扩增产物直接测序法检测ARHGEF37基因外显子8多态性,采用最小二乘模型分析各SNP位点基因型及单倍型组合对5个生长性状的影响。【结果】在杜撒♂×大长撒♀F;代猪ARHGEF37基因外显子8上检测出C1262G、T1293C、G1395A和C1398T 4个SNPs位点,分别以CC、TT、GA、CC基因型、等位基因C、T、G、C及单倍型CTGC的频率最高;除T1293C位点外,其余各位点的杂合度在0.4552~0.4940,遗传多样性较丰富。C1262G位点GG基因型个体达100 kg体重日龄(258.93±2.95 d)显著高于CG基因型个体(249.87±2.68 d)(P<0.05,下同),CG基因型个体30~60 kg日增重(462.44±15.44 g)显著高于CC基因型个体(409.29±14.30 g);T1293C位点TT基因型个体30~60 kg日增重(445.04±9.70 g)极显著高于TC基因型个体(329.33±42.26 g)(P<0.01),TT基因型个体30~100 kg日增重(516.96±6.44 g)显著高于TC基因型和CC基因型个体(470.92±28.08 g和480.64±16.94 g)。此外,达60 kg体重日龄和达100 kg体重日龄均以CTGC/GTGC组合最短(161.84±5.07 d和241.00±5.11 d),CTGC/CCGC组合最长(188.80±11.33 d和272.60±11.42 d);30~60 kg日增重和30~100 kg日增重分别以CTGC/GTAT组合和CTGC/GTGC组合最高(479.56±20.66 g和545.42±19.76 g),均以CTAC/CCGC组合最低(275.00±84.33 g和437.00±55.88 g)。【结论】ARHGEF37基因的G1395A和C1398T位点的遗传多样性较丰富;C1262G位点的CG基因型、T1293C位点的TT基因型及CTGC/GTGC单倍型组合对杜撒♂×大长撒♀F;代生长性状的影响较大,携带有CTGC单倍型个体的各生长性状均处于较高水平。

关键词：杜撒♂×大长撒♀F_(1) 代猪 ARHGEF37基因外显子8 单核苷酸多态性生长性状

宣和猪PID1基因外显子3的SNP检测及其与肉质性状的关联分析

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西南农业学报 2022年第7期35卷 1707-1714页

作者：刘梅朱怡轩王孝义陈强董新星严达伟李明丽云南农业大学动物科学技术学院昆明650201

【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料,对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测,选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的... 详细信息

【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料,对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测,选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的差异分析。【结果】在宣和猪PID1基因外显子3区域共检测出4个SNP位点,分别为253 643 bp处的T→C(T253643C)、253 675 bp处的G→C(G253675C)、253 734 bp处的A→G(A253734G)和253 827 bp处的G→A(G253827A)。4个SNP位点均检测出3种基因型,分别以等位基因T、G、G、A及基因型TT、GC、AG、AA的频率最高。4个SNP位点共有9种单倍型和24种单倍型组合,其中单倍型CGGA和单倍型组合CGGA/TCAA的频率最高。各位点杂合度在0.4490~0.4997,都属于中度多态且都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),遗传多样性比较丰富。G253675C位点与大理石纹评分存在显著关联,其中GC基因型可显著提高大理石纹评分(P<0.05),并且该基因型失水率、熟肉率以及滴水损失均表现最佳;A253734G位点与失水率和IMF含量存在显著关联,其中AG基因型可显著降低失水率(P<0.05),GG基因型可显著提高IMF含量(P<0.05);G253827A位点与失水率存在显著关联,其中GG基因型可显著降低失水率(P<0.05),并且该基因型大理石纹和熟肉率均表现最佳;单倍型组合中,TCAA/TCAA组合的失水率最高,大理石纹评分、熟肉率和IMF含量最低;CGGA单倍型具有提高大理石纹评分、熟肉率和IMF,降低失水率的效应。【结论】研究结果进一步丰富了PID1基因的SNP标记,初步证实了PID1基因对宣和猪的肉质性状有一定影响,可为实际生产中利用PID1基因标记改良宣和猪肉质性状提供了科学依据。

关键词：宣和猪磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)基因单核苷酸多态性肉质性状关联分析