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绿脓杆菌特有的Tsi2三维结构——一种全新卷曲螺旋构象的类抗毒素蛋白

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生物化学与生物物理进展 2012年第7期39卷 640-646页

作者：王维丁璟珒王大成中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室北京100101 中国科学院研究生院北京100039

绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)利用六型分泌系统(T6SS)向其他竞争性细菌分泌毒素效应分子Tse2,这是一种新发现的绿脓杆菌获得生存优势的分子机制.为了避免同类间的误杀,绿脓杆菌合成一种特异结合Tse2的抑制蛋白Tsi2来保护自己.序列... 详细信息

绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)利用六型分泌系统(T6SS)向其他竞争性细菌分泌毒素效应分子Tse2,这是一种新发现的绿脓杆菌获得生存优势的分子机制.为了避免同类间的误杀,绿脓杆菌合成一种特异结合Tse2的抑制蛋白Tsi2来保护自己.序列分析显示,Tsi2是绿脓杆菌特有的一种新型类抗毒素蛋白.我们利用SAD方法成功地解析了Tsi2 1.8魡分辨率的晶体结构.Tsi2的三维结构采用一种规则的卷曲螺旋的结构特征,这是抗毒素分子中的一种全新的折叠方式,不同于经典的抗毒素分子在没有结合毒素分子状态下采用无规则构象的结构特征;二聚体是Tsi2的功能单位,二聚体内两个Tsi2单体通过广阔的疏水相互作用紧密结合,形成"夹子"状独特的二聚体组装方式;位于二聚体界面上的两个凹槽分别结合对称分子的两段螺旋,提供了Tsi2与Tse2结合可能的分子部位.该研究工作结果对于认识Tsi2抗毒素蛋白的分子本质,揭示其发挥抗毒素活性的结构基础,并为进一步开展Tse2-Tsi2复合物的结构与功能研究奠定了坚实的基础.

关键词：绿脓杆菌六型分泌系统 Tsi2-Tse2 抗毒素卷曲螺旋

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黄精凝集素PCL及底物复合物的晶体结构——PCL功能活性调控的结构机理

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细胞程序化死亡因子10（PDCD10）的表达、纯化和初步结晶

中国晶体学会第四届全国会员代表大会暨学术会议

作者：丁璟珒张英王大成中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室

＜正＞黄精凝集素（PCL）是我国科学家从传统中药囊丝黄精的根状茎中分离纯化的一种凝集素,体外实验发现PCL能显著抑制HIV感染宿主细胞,生物化学和分子生物学实验证实PCL属于单子叶甘露糖结合凝集素An et al.。本文报道了PCL 2.0 A分辨...

＜正＞黄精凝集素（PCL）是我国科学家从传统中药囊丝黄精的根状茎中分离纯化的一种凝集素,体外实验发现PCL能显著抑制HIV感染宿主细胞,生物化学和分子生物学实验证实PCL属于单子叶甘露糖结合凝集素An et al.。本文报道了PCL 2.0 A分辨率晶体结构和PCL甘露糖复合物2.2 A分辨率晶体结构的测定,并对PCL进行了深入的结构与功能关系的研究。PCL在溶液状态下以二聚体形式存在,晶体结构中以二聚体为基本单位,两个二聚体再通过非晶体学二重对称相关联,形成一个晶体学不对称单位。PCL单亚基采用的是B三棱镜（β-prism）折叠模式,由三组反平行的β片构成三个亚结构域,再通过近似的三重对称关系构成类似三棱镜的

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细胞程序化死亡因子10（PDCD10）的表达、纯化和初步结晶

天麻抗真菌蛋白（GAFP）寡聚组装机理的初步分子生物学研究

第十次中国生物物理学术大会

作者：丁璟珒李德峰张英王大成中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所

＜正＞PDCD10最早是在TF-1前骨髓瘤细胞的凋亡诱导实验中表达水平显著上调而被鉴别到的,实验表明,PDCD10在肝脏和其它组织中均有显著的表达。近来在诱导纤维原细胞凋亡以鉴别特异的凋亡相关基因的研究中也发现该基因的表达水平显著上调...

＜正＞PDCD10最早是在TF-1前骨髓瘤细胞的凋亡诱导实验中表达水平显著上调而被鉴别到的,实验表明,PDCD10在肝脏和其它组织中均有显著的表达。近来在诱导纤维原细胞凋亡以鉴别特异的凋亡相关基因的研究中也发现该基因的表达水平显著上调。这些初始的研究表明PDCD10这个从线虫到人高度保守的基因在细胞凋亡的途径中发挥着作用,

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天麻抗真菌蛋白（GAFP）寡聚组装机理的初步分子生物学研究

脑海绵状血管瘤因子2(CCM2)与丝裂原活化蛋白激酶MEKK3分子识别的结构基础

第十次中国生物物理学术大会

作者：浮广森丁璟珒杨娜王大成中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所

＜正＞天麻抗真菌蛋白（GAFP）是存在于寄生性植物天麻的球茎中的一种单子叶甘露糖凝集素（MBL）。MBL家族中首先被报道的是雪花莲凝集素（GNA）,被认为具有抗逆转录病毒HIV的活性。GAFP是第一个被发现具有明确抗真菌活性的MBL,家族成...

＜正＞天麻抗真菌蛋白（GAFP）是存在于寄生性植物天麻的球茎中的一种单子叶甘露糖凝集素（MBL）。MBL家族中首先被报道的是雪花莲凝集素（GNA）,被认为具有抗逆转录病毒HIV的活性。GAFP是第一个被发现具有明确抗真菌活性的MBL,家族成员。目前已发现的MBL,家族成员绝大多数是多亚基蛋白,只有包括GAFP在内的三种凝集素具有单体结构。对天然的GAFP和GNA结构之间的对比分析发现单体蛋白和多亚基蛋白主要是由于其C末端一级结构残基不一致造成的寡聚组装的差异。一系列研究表明 MBL的复杂功能与其寡聚组装密切相关,因此了解MBL寡聚组装机理对于解释其结构与功能的关系是非常重要的。

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科学新闻 2016年第1期 139-139页

作者： Xiaoyan Wang Yanjie Hou Kai Deng Ying Zhang 王大成丁璟珒中国科学院中国科学院生物物理研究所

文章简介衔接蛋白是细胞信号转导的重要组成部分,通过独特的蛋白质相互作用结构域在时空上精确地调控细胞信号传递,实现正常的生理功能。早期研究发现,CCM2是细胞激活MEKK3调控细胞骨架应对高渗透环境的重要衔接蛋白,编码CCM2蛋白的基... 详细信息

文章简介衔接蛋白是细胞信号转导的重要组成部分,通过独特的蛋白质相互作用结构域在时空上精确地调控细胞信号传递,实现正常的生理功能。早期研究发现,CCM2是细胞激活MEKK3调控细胞骨架应对高渗透环境的重要衔接蛋白,编码CCM2蛋白的基因突变会引起脑海绵状血管瘤(CCM)。最新研究表明,胚胎发育中内皮细胞表达的CCM2负调控MEKK3激酶活性对于心血管正常发育至关重要,但CCM2调控MEKK3的分子机理至今不明。

关键词： CCM2 细胞复合物脑海绵状血管瘤 MEKK3 分子机理

细菌效应蛋白揭示V-ATPase-ATG16L1通路介导异源自噬的研究

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科学新闻 2020年第2期 37-37页

作者：邵峰刘小云丁璟珒许悦周平程森陆秋鹤史旭焱周志伟 Kathrin Nowak Ann-Katrin Hopp Lin Li Wenqing Gao Da Li Huabin He Michael O.Hottiger 中国科学院北京生命科学研究所北京大学中科院生物物理所中国农业大学苏黎世大学

文章简介真核细胞通过选择性自噬的方式识别胞内病原体的过程称为异源自噬(xenophagy)。异源自噬在宿主天然免疫防御中发挥重要作用,但其触发机制仍不清楚。本研究通过对鼠伤寒沙门氏菌进行全基因组转座子突变筛选,鉴定出一个可强力阻... 详细信息

文章简介真核细胞通过选择性自噬的方式识别胞内病原体的过程称为异源自噬(xenophagy)。异源自噬在宿主天然免疫防御中发挥重要作用,但其触发机制仍不清楚。本研究通过对鼠伤寒沙门氏菌进行全基因组转座子突变筛选,鉴定出一个可强力阻断异源自噬的沙门氏菌III型分泌系统效应蛋白Sop F。更重要的是,Sop F可以抑制各种细菌感染引起的异源自噬,但不影响经典自噬通路。

关键词： ATPase V-ATPase-ATG16L1 效应蛋白 ATG