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广东省2013-2017年3种基因型诺如病毒感染暴发疫情的流行特征

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中华流行病学杂志 2018年第9期39卷 1210-1215页

作者：张萌龙遗芳郭莉敏吴崧霖方苓杨芬李晖黄琼孙立梅广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广州511430 广东省疾病预防控制中心广东省现场流行病学培训项目广州511430 广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所广州511430 广东省疾病预防控制中心公共卫生应急部广州511430 清远市清城区疾病预防控制中心 511515 深圳市坪山新区疾病预防控制中心 518118

目的分析2013-2017年广东省115起由GⅡ.2、GⅡ.17和GⅡ．4／sydneV3种基因型引起的诺如病毒感染暴发的流行特征，为诺如病毒感染疫情的防控提供科学依据。方法通过“突发公共卫生事件报告管理信息系统”收集2013年1月1日至2017年11月30... 详细信息

目的分析2013-2017年广东省115起由GⅡ.2、GⅡ.17和GⅡ．4／sydneV3种基因型引起的诺如病毒感染暴发的流行特征，为诺如病毒感染疫情的防控提供科学依据。方法通过“突发公共卫生事件报告管理信息系统”收集2013年1月1日至2017年11月30日广东省报告的诺如病毒感染暴发疫情，采用RT-PCR方法对每起疫情的病例标本进行诺如病毒核酸检测，经基闵测序后确定病毒基凶型，对GⅡ.2、GH．17和GⅡ．4／svdnev3种基因型暴发疫情特点进行分析，采用直接标准化法计算病例呕吐和腹泻的比例。结果广东省2013年1月1日至2017年11月30日共报告诺如病毒感染暴发疫情167起，GⅡ.2、GⅡ．17和GⅡ．4／sydney3种基冈型引起115起。暴发场所中，GⅡ．2型为小学占39．68％（25／63）、托幼机构占28．57％（18／63）、中学占25．40％（16／63）、大学占6-35％（4／63）；Gn．17型为中学占41．03％（16／39）、其他社会单位占20．51％（8／39）、小学占15．38％（6／39）、大学占12．82％（5／39）、社区和托幼机构各占5．13％（2／39）；GⅡ．4／sydney型为大学占53．85％（7／13）、托幼机构和其他社会单位各占15．38％（2／13）、小学和中学各占7．69％（1／13）。传播途径中，GⅡ．2型为接触传播占77．78％（49／63）、食源性传播占17．46％（11／63）；GⅡ．17型为食源性传播占53．85％（21／39）、接触传播占15．38％（6／39）、水源性传播占12．82％（5／39）；GⅡ．4／sydney型为食源性传播占53．85％（7／13）、接触传播占38．46％（5／13）。临床表现中，GⅡ．2型的标准化呕吐比例为73．76％、腹泻比例为42．85％；GⅡ．17型的标准化呕吐比例为76．37％、腹泻比例为51．40％；GⅡ．4／sydney型的标准化呕吐比例为54．10％、腹泻比例为55．95％。结论GⅡ．2型主要涉及小学、托幼机构和中学，以接触传播为主；GⅡ．17型主要涉及中学和其他社会单位，以食源性传播为主；GⅡ．4／sydney型主要涉及大学．食源性传播比例最高，接触传播也有较高比例。

关键词：诺如病毒暴发基因型流行病学特征

广东省EV71疫苗接种水平与手足口病流行分析

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中国公共卫生 2020年第3期36卷 351-354页

作者：杨芬梁文佳孙立梅龙遗芳张萌李晖曾汉日郑焕英郑慧贞朱琦广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广州511430

目的了解广东省2016-2017年肠道病毒71型(EV71)灭活疫苗接种水平及接种期间手足口病的流行情况。方法从"中国免疫规划信息管理系统"提取EV71灭活疫苗接种情况报表资料;从"中国疾病预防控制信息系统"收集手足口病普通病例疫情数据、重症... 详细信息

目的了解广东省2016-2017年肠道病毒71型(EV71)灭活疫苗接种水平及接种期间手足口病的流行情况。方法从"中国免疫规划信息管理系统"提取EV71灭活疫苗接种情况报表资料;从"中国疾病预防控制信息系统"收集手足口病普通病例疫情数据、重症及死亡病例疫情数据;在广东省8家哨点医院开展手足口病普通病例EV71感染病原学监测,结合EV71哨点监测结果和网络直报疫情数据来估算EV71感染手足口病发病情况。结果2016年9月-2017年12月,广东省共报告接种EV71灭活疫苗2304456剂次,其中2017年5-9月为接种高峰,月平均接种量为198315剂次。全省平均估算接种率2016年为3.82%、2017年为10.07%。21个地市中深圳估算接种率最高,2016年为6.05%、2017年为19.76%;汕头估算接种率最低,2016年0.78%、2017年1.39%。2017年广东省EV71感染手足口病发病率比2016年下降39.97%,EV71感染手足口病重症及死亡数下降53.33%。结论广东省2016年启动EV71灭活疫苗接种项目以来,疫苗接种水平逐渐增加,但仍处于较低水平;2017年EV71感染手足口病发病率、重症与死亡数比2016年有所下降。

关键词：肠道病毒71型(EV71) 疫苗接种手足口病流行病学

基孔肯雅病毒全基因组的多序列比对及遗传进化分析

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中华疾病控制杂志 2015年第5期19卷 492-495,499页

作者：龙遗芳柯昌文郭中敏陆家海中山大学公共卫生学院热带病防治研究教育部重点实验室广东广州510080 广东省重大传染病预防和控制技术研究中心广东广州510080 广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所广东广州511430 中山大学医学院动物实验中心广东广州510080

目的了解基孔肯雅病毒（Chikungunya virus,CHIKV）毒株的时间、地区及基因型的分布情况,不同时间和地区分离毒株的相似性,核苷酸位点的变异情况以及病毒的遗传进化趋势,为基孔肯雅热的预防和控制奠定基础。方法对美国国立生物技术信... 详细信息

目的了解基孔肯雅病毒（Chikungunya virus,CHIKV）毒株的时间、地区及基因型的分布情况,不同时间和地区分离毒株的相似性,核苷酸位点的变异情况以及病毒的遗传进化趋势,为基孔肯雅热的预防和控制奠定基础。方法对美国国立生物技术信息中心（NCBI）中收录的CHIKV毒株全基因组序列共133条用DNAStar7.1软件进行核苷酸和氨基酸相似性比较及变异分析,用Mega6.06进行遗传进化分析。结果 CHIKV组内核苷酸序列相似性在97.7%～100.0%之间,CHIKV组内氨基酸序列相似性在80.3%～100.0%之间,组内相似性较高,变异率较低;CHIKV碱基间的转换较为常见占碱基突变的81.02%;分离时间、地区相近的毒株遗传距离较近,不同谱系的东/中/南非型毒株已蔓延至欧亚各地区。结论 CHIKV毒株存在一定的变异,但具有较高的遗传稳定性。

关键词：基孔肯雅病毒基因频率变异(遗传学)

广东省医疗机构门诊儿童就诊环境肠道病毒污染风险分析

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中国公共卫生 2019年第4期35卷 427-431页

作者：谭小华孙立梅李晖曾汉日杨芬黄国锋龙遗芳杨宇威广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广东广州511430

目的调查广东省手足口病高发地区医疗机构在手足口病不同流行阶段儿童门诊环境肠道病毒污染现况。方法在2016年手足口病流行前(1—3月)、流行高峰(5—7月)及流行后(10—12月),选取手足口病高发的广州和惠州2个地市4个县(区)不同等级医... 详细信息

目的调查广东省手足口病高发地区医疗机构在手足口病不同流行阶段儿童门诊环境肠道病毒污染现况。方法在2016年手足口病流行前(1—3月)、流行高峰(5—7月)及流行后(10—12月),选取手足口病高发的广州和惠州2个地市4个县(区)不同等级医疗机构作为调查对象,采集儿童门诊各类物体表面涂抹拭子进行手足口病病原核酸检测;同时收集2个地市采样相应月份的手足口病月均发病率。结果采集广州和惠州16家医疗机构的儿童门诊环境涂抹拭子共1 568份,肠道病毒核酸通用引物检测阳性率为4.21%。手足口病流行高峰的阳性率(7.34%)高于流行前(3.92%)与流行后(1.33%),差异有统计学意义(χ~2=23.90,P=0.000)。儿童门诊环境阳性率与人群手足口病月均发病率存在正相关关系(r=0.50,P=0.67)。二甲医院阳性率(5.87%)高于未分级医疗机构(5.71%)和三甲医院(2.84%),三者差异有统计学意义(χ~2=8.46,P=0.015);在流行高峰,二甲医院阳性率(11.43%)高于未分级医疗机构(9.17%)和三甲医院(4.61%),三者差异有统计学意义(χ~2=7.07,P=0.029),但在流行前和流行后,三者阳性率差异均无统计学意义(均P> 0.05)。在二甲和三甲医院,9:00时采样阳性率(5.22%)高于16:00时(3.71%)和11:00时(2.45%),但差异无统计学意义(P> 0.05)。健康儿童门诊阳性率(4.29%)高于患病儿童门诊(3.85%),差异无统计学意义(P> 0.05)。在患病儿童门诊,阳性率居前3位的有治疗台(6.14%)、输液椅(5.73%)和候诊椅(4.76%);健康儿童门诊仅疫苗接种台(28.13%)与婴幼儿发育测量设施(7.14%)表面检出肠道病毒;疫苗接种台在不同流行期内阳性率均保持较高水平(18.18%～45.45%)。结论广东省手足口病高发地区医疗机构儿童门诊肠道病毒污染普遍存在,以手足口病流行高峰、门诊开诊日上午9:00时、门诊中疫苗接种台、治疗台、输液椅和候诊椅等物体表面污染较为严重,应有针对地制定院感防控措施。

关键词：肠道病毒环境污染医疗机构儿童门诊

病毒样颗粒技术——现代生物医学应用的新平台

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中国病毒病杂志 2013年第4期3卷 304-309页

作者：龙遗芳郭中敏陆家海中山大学公共卫生学院热带病防治研究教育部重点实验室广东省重大传染病预防和控制技术研究中心广东广州510080 中山大学实验动物中心广东广州510080

病毒样颗粒（virus-like particles,VLPs）是由病毒的一种或几种结构蛋白组成的空心颗粒,不含病毒的核酸,不能自主复制,没有感染性,其在形态上与真正病毒颗粒相同或相似。VLPs的制备原理是在体外高效表达某种病毒的一种（或几种）结构蛋... 详细信息

病毒样颗粒（virus-like particles,VLPs）是由病毒的一种或几种结构蛋白组成的空心颗粒,不含病毒的核酸,不能自主复制,没有感染性,其在形态上与真正病毒颗粒相同或相似。VLPs的制备原理是在体外高效表达某种病毒的一种（或几种）结构蛋白,使其自动装配成在形态上类似于天然病毒的空心颗粒。其方法主要是将病毒结构蛋白基因克隆到表达载体中,再将这些载体转入原核或真核细胞中进行表达。

关键词：病毒样颗粒生物医学技术免疫测定疫苗载体

广东省2008-2015年诺如病毒感染暴发的危险因素分析

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中华流行病学杂志 2017年第7期38卷 906-910页

作者：杨芬孙立梅李晖郭丽丽方苓谭小华龙遗芳柯昌文何剑峰广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广州511430 广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所广州511430 广东省疾病预防控制中心中心办公室广州511430

目的研究2008-2015年广东省诺如病毒感染暴发疫情的危险因素，为诺如病毒感染的预防控制工作提供参考依据。方法通过“突发公共卫生事件报告管理信息系统”收集2008年1月1日至2015年12月31日广东省报告的诺如病毒感染暴发疫情资料，并... 详细信息

目的研究2008-2015年广东省诺如病毒感染暴发疫情的危险因素，为诺如病毒感染的预防控制工作提供参考依据。方法通过“突发公共卫生事件报告管理信息系统”收集2008年1月1日至2015年12月31日广东省报告的诺如病毒感染暴发疫情资料，并进行流行病学分析。采用RT-PCR方法对2012--2015年73起诺如病毒感染暴发疫情的372份阳性标本进行基因测序亚型分析。结果2008--2015年广东省共报告96起诺如病毒感染暴发疫情，其中2013—2015年共报告80起（占83．3％，80／96）。暴发地点在学校的占全部疫情的85．4％（82／96）；传播途径为食源性传播占40．6％（39／96），接触传播占24．0％（23／96），水源性传播占7．3％（8／96）。基因测序亚型分析显示，2012—2013年的暴发主要由GⅡ．4／Sydney2012型诺如病毒感染引起（占30．0％，6／20），2014—2015年的暴发主要由GⅡ．17型诺如病毒感染引起（占62．3％，33／53）。结论食源性和接触传播及新出现的2种诺如病毒变异株GⅡ．4／Sydney2012变异株和GⅡ．17是引起广东省诺如病毒感染暴发的主要原因。

关键词：诺如病毒暴发流行病学基因分型

珠三角地区学校诺如病毒感染性腹泻疫情经济负担评估

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中国学校卫生 2020年第3期41卷 405-408页

作者：张萌许玉成陈建千李静华杨芬龙遗芳黄琼张永慧中山大学公共卫生学院广东广州510080 广东省疾病预防控制中心广东省现场流行病学培训项目深圳市福田区疾病预防控制中心佛山市三水区疾病预防控制中心清远市清新区疾病预防控制中心

目的对珠三角地区学校诺如病毒感染性腹泻疫情的疾病经济负担进行评估,为政府部门制定疾病管理策略和控制措施提供科学依据。方法使用统一问卷进行调查,评估珠三角地区2017年10月至2018年4月发生诺如病毒感染性腹泻疫情的学校和涉病班... 详细信息

目的对珠三角地区学校诺如病毒感染性腹泻疫情的疾病经济负担进行评估,为政府部门制定疾病管理策略和控制措施提供科学依据。方法使用统一问卷进行调查,评估珠三角地区2017年10月至2018年4月发生诺如病毒感染性腹泻疫情的学校和涉病班级全体学生家庭的疾病经济负担。结果患病学生经济负担人均720.41(95%UI=640.45~804.63)元,其中门诊就医人均费用213. 70 (95%UI=191. 83~236. 33)元,住院人均费用1 712. 75 (95%UI=328. 50~3 400.00)元,自行购药人均费用58.97(95%UI=43.00~77.69)元,交通费人均53.63(95%UI=43.98~63.58)元,补习费人均558.49(95%UI=381.40~774.01)元,误工费人均695.62(95%UI=630.25~767.29)元。班级停课导致健康学生经济损失人均382.62(95%UI=343.29~424.45)元,学校经济损失平均每起疫情49 264.53(95%UI=22 363.38~79 976.25)元。疫情总经济负担随疫情级别升高而增加,疫情级别越大,患病学生经济负担所占比例逐步下降,2~9例组、10~19例组和≥20例组分别为56.58%,23.27%和10.93%。结论珠三角地区诺如病毒感染性腹泻疫情疾病经济负担高,相关部门要重视加强预防控制及宣传教育工作,开展有针对性的防控,减少疾病经济负担。

关键词：腹泻肠道病毒感染疾病暴发流行费用,医疗学生

广东省2017年肠道病毒71型灭活疫苗接种现况分析

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华南预防医学 2018年第4期44卷 349-351页

作者：龙遗芳李胜峰谢莘朱琦张萌杨芬芦瑞鹏徐勇郑慧贞广东省疾病预防控制中心广东广州511430

目的了解广东省2017年肠道病毒71型(EV 71)疫苗接种现况,为评估EV 71疫苗接种策略提供参考依据。方法通过广东省儿童预防接种信息报告管理系统导出广东省2017年EV 71疫苗接种的个案数据,采用描述流行病学方法进行接种率分析。结果 2017... 详细信息

目的了解广东省2017年肠道病毒71型(EV 71)疫苗接种现况,为评估EV 71疫苗接种策略提供参考依据。方法通过广东省儿童预防接种信息报告管理系统导出广东省2017年EV 71疫苗接种的个案数据,采用描述流行病学方法进行接种率分析。结果 2017年全省应种人数为10 162 712人,接种1剂次EV 71疫苗1 050 706人,接种率为10.34%;接种2剂次806 491人,2剂次基础免疫完成率平均为76.76%。接种人群主要为1~3岁儿童,占接种总数的84.33%(886 126/1 050 706);其中1岁组接种人数最多为349 801人(占33.29%),0岁组接种人数最少为7 724人(占0.74%);2岁和3岁年龄组2剂次基础免疫完成率较高,分别为84.05%和84.68%;最低为0岁组,仅为7.16%。接种率排在前3位的分别为深圳市(21.26%)、中山市(15.72%)和东莞市(13.39%)。结论 2017年广东省0岁组低龄儿童EV 71疫苗接种率偏低,建议加大对EV 71疫苗接种的宣传,提高家长的认知水平及接种意愿。

关键词：肠道病毒71型疫苗接种

河源市一起由桶装水污染引起的学校诺如病毒感染性腹泻暴发疫情调查

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华南预防医学 2019年第3期45卷 249-252,293页

作者：高淑萍龙遗芳张萌林颖瑜朱海城吴曼菊王海河源市疾病预防控制中心广东河源517000 广东省疾病预防控制中心江门市新会区疾病预防控制中心

目的对发生在河源市的1起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情进行现场调查,查明疫情波及范围及危险因素,以采取有效控制措施。方法制定病例定义,通过医疗机构调查、现场访谈等方式开展流行病学调查,摸清疫情波及范围;采集病例粪便、从业人员肛... 详细信息

目的对发生在河源市的1起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情进行现场调查,查明疫情波及范围及危险因素,以采取有效控制措施。方法制定病例定义,通过医疗机构调查、现场访谈等方式开展流行病学调查,摸清疫情波及范围;采集病例粪便、从业人员肛拭子和桶装水等样本开展实验室检测;采用病例对照研究分析危险因素;调查桶装水生产厂家,了解桶装水的生产过程及供水范围。结果累计报告诺如病毒感染性腹泻病例51例,其中确诊病例11例、临床诊断病例40例,罹患率为3.00%(51/1 698)。发病时间集中在2月15-19日,疫情历时5 d,发病高峰为16、17日,共报告35例,占病例总数的68.63%。共采集20份现症病例肛拭子、7份学校食堂及校外餐饮店从业人员肛拭子、1份学校宿舍保洁员肛拭子样本进行检测,结果显示11份现症病例肛拭子、1份学校宿舍保洁员肛拭子样本检出诺如病毒核酸阳性;采集发病班级已开封桶装水、未开封桶装水、水厂源头水、成品水各1份进行检测,结果显示2份桶装水和1份成品水检出诺如病毒核酸阳性。病例对照研究结果显示,饮用某牌子桶装水增加诺如病毒感染性腹泻发病风险(OR=5.34)。结论该起疫情为1起桶装水受诺如病毒污染导致的感染性腹泻暴发疫情,应加强对桶装水的生产、储藏、运输、销售等环节的监管。

关键词：诺如病毒感染性腹泻疾病暴发流行流行病学