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石仙桃中4种转录因子鉴定及其组织表达的研究

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生物技术通报 2024年第5期40卷 141-152页

作者：刘保财张武君赵云青黄颖桢陈菁瑛福建省农业科学院作物研究所福州250013 福建省农业科学院药用植物研究中心福州250013

【目的】石仙桃Pholidota chinensis Lindl为珍稀濒危的附生兰,附生较地生而言进化出了许多特殊的形态结构和生理生化特性,而转录因子对调控植物的生长发育具有作用,旨在探讨和发掘石仙桃中调控其生长发育的转录因子。【方法】利用PacBi... 详细信息

【目的】石仙桃Pholidota chinensis Lindl为珍稀濒危的附生兰,附生较地生而言进化出了许多特殊的形态结构和生理生化特性,而转录因子对调控植物的生长发育具有作用,旨在探讨和发掘石仙桃中调控其生长发育的转录因子。【方法】利用PacBio和Illumina测序技术获得石仙桃的全长转录组数据以及在根、根状茎、假鳞茎和叶片中的基因表达量,通过进一步生信分析,探讨石仙桃4种转录因子家族成员、理化特性及其组织表达特异性,并用氯化钠(NaCl)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导逆境胁迫,用RT-qPCR分析了C2H2家族和bHLH家族的表达量。【结果】石仙桃中鉴定的4种转录因子及其家族成员转录本为:C2H2家族21个、bHLH家族27个、WRKY家族30个、bZIP家族19个,这4个家族及其成员主要为亲水的不稳定性蛋白,亚细胞定位主要位于细胞核内,bHLH家族的部分成员位于细胞质、叶绿体等细胞器中,各基因家族均具有典型的保守结构域特征,在石仙桃的根、根状茎、假鳞茎和叶片呈现出明显的组织特异性。21个C2H2家族和27个bHLH家族中所有基因表达均受NaCl和MeJA影响,但家族成员受到促进或抑制表达及其表达量存在差异。【结论】鉴定了石仙桃中4个转录因子家族成员的数量,各家族成员主要是位于细胞核内的亲水不稳定性蛋白,并具有保守结构域特征和组织表达特异性。

关键词：石仙桃 C2H2 bHLH WRKY bZIP 理化特性组织表达

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福建省山药种质资源品质比较与综合评价

食品研究与开发 2024年第9期45卷 75-85页

作者：张武君刘保财陈菁瑛黄颖桢赵云青福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350013

该研究较为全面地收集福建省6个地市45份山药主栽种质资源,测定块茎的9个品质指标,利用隶属函数法、主成分分析和聚类分析对山药的营养品质、加工品质和综合品质进行评价。结果表明,测定的9个指标中,淀粉含量和可食率的变异系数低于8%,... 详细信息

该研究较为全面地收集福建省6个地市45份山药主栽种质资源,测定块茎的9个品质指标,利用隶属函数法、主成分分析和聚类分析对山药的营养品质、加工品质和综合品质进行评价。结果表明,测定的9个指标中,淀粉含量和可食率的变异系数低于8%,其余7个指标的变异系数大于20%,其中块茎鲜重的变异系数高达59.90%。筛选出可溶性糖含量、淀粉含量、可溶性蛋白含量、尿囊素含量、折干率、可食率、块茎鲜重7项指标,构建营养品质和加工品质相结合的品质综合评价体系。聚类分析将福建山药种质资源聚为4类,第Ⅰ类营养和加工品质较一般;第Ⅱ类适合加工;第Ⅲ类适合鲜食;第Ⅳ类鲜食销售和加工均有优势。

关键词：山药资源营养加工综合评价

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福建太子参紫纹羽病病原鉴定及其生物学特性

中国中药杂志 2023年第1期48卷 45-51页

作者：刘保财陈菁瑛张武君黄颖桢赵云青叶京福建省农业科学院农业生物资源研究所福建福州350003 福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350003

紫翁羽病为太子参的主要根部病害之一。为明确引起福建省太子参紫纹羽病的病原菌种类,2017—2021年持续从福建省太子参主产区采集具有太子参紫纹羽症状的块根及菌核,采用组织分离法分离病原菌,结合形态学特征和多基因分子鉴定对病原菌... 详细信息

紫翁羽病为太子参的主要根部病害之一。为明确引起福建省太子参紫纹羽病的病原菌种类,2017—2021年持续从福建省太子参主产区采集具有太子参紫纹羽症状的块根及菌核,采用组织分离法分离病原菌,结合形态学特征和多基因分子鉴定对病原菌进行鉴定,并进一步开展病原菌生物学特性和室内药剂筛选研究。结果表明,从采集的块根样本中共分离获得78株紫纹羽菌株,形态学初步鉴定属于1种类型;从病原菌中选取2株代表菌株进行多基因系统发育分析,均与桑卷担子菌Helicobasidium mompa聚在一起。该菌菌丝适宜培养基为OA、生长温度为25℃、pH 6、草酸铵作为氮源,菌丝的致死温度为50℃处理10 min;99.1%丙环唑和98.7%嘧菌脂抑菌效果最佳,抑菌率50%的质量浓度分别为16.85、12.24μg·mL^(-1)。可见,福建太子参紫纹羽病的病原菌为桑卷担子菌H.mompa。培养基种类、生长温度、pH、氮源等对菌丝生长均有显著影响。

关键词：太子参紫纹羽病病原鉴定桑卷担子菌生物学特性

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福建太子参紫纹羽病原鉴定及其生物学特性

中国中药杂志 2022年

作者：刘保财陈菁瑛张武君黄颖桢赵云青叶京福建省农业科学院农业生物资源研究所福建省农业科学院药用植物研究中心

紫翁羽病为太子参的主要根部病害之一。为明确引起福建省太子参紫纹羽病的病原菌种类，2017—2021年持续从福建省太子参主产区采集具有太子参紫纹羽症状的块根及菌核，采用组织分离法分离病原菌，结合形态学特征和多基因分子鉴定对病原...

紫翁羽病为太子参的主要根部病害之一。为明确引起福建省太子参紫纹羽病的病原菌种类，2017—2021年持续从福建省太子参主产区采集具有太子参紫纹羽症状的块根及菌核，采用组织分离法分离病原菌，结合形态学特征和多基因分子鉴定对病原菌进行鉴定，并进一步开展病原菌生物学特性和室内药剂筛选研究。结果表明，从采集的块根样本中共分离获得78株紫纹羽菌株，形态学初步鉴定属于1种类型；从病原菌中选取2株代表菌株进行多基因系统发育分析，均与桑卷担子菌Helicobasidium mompa聚在一起。该菌菌丝适宜培养基为OA、生长温度为25 ℃、pH 6、草酸铵作为氮源，菌丝的致死温度为50 ℃处理10 min；99.1%丙环唑和98.7%嘧菌脂抑菌效果最佳，抑菌率50%的浓度分别为16.85、12.24 μg·mL。可见，福建太子参紫纹羽的病原菌为桑卷担子菌H. mompa。培养基种类、生长温度、pH、氮源等对菌丝生长均有显著影响。

关键词：

福建太子参黑斑病病原菌鉴定及生物学特性研究

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中国中药杂志 2023年第10期48卷 2732-2738页

作者：张武君刘保财陈菁瑛黄颖桢赵云青蔡净蓉福建省农业科学院农业生物资源研究所福建福州350003 福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350003

福建省柘荣县太子参黑斑病常于每年4—6月份的多雨季节暴发,为太子参的主要叶部病害之一,对该药材的产量和质量造成严重影响。为明确太子参黑斑病的病原菌种类及其生物学特性,该研究依据柯赫法则对病原菌分离纯化,采用形态学特征观察及... 详细信息

福建省柘荣县太子参黑斑病常于每年4—6月份的多雨季节暴发,为太子参的主要叶部病害之一,对该药材的产量和质量造成严重影响。为明确太子参黑斑病的病原菌种类及其生物学特性,该研究依据柯赫法则对病原菌分离纯化,采用形态学特征观察及多基因序列分析进行鉴定,鉴定为链格孢属致病真菌并进行致病性测定及生物学特性测定。鉴定结果表明:引起该黑斑病的病原菌为梨黑斑链格孢Alternaria gaisen。其菌落形态、孢子特征以及产孢表型特征与梨黑斑链格孢A.gaisen类似,且由ITS、tef1、gapdh、endoPG、Alta1、OPA10-2和KOG1077这7个组成的串联序列在20个链格孢属真菌的系统发育树上与梨黑斑链格孢A.gaisen聚为一支,最大似然支持率为100%,贝叶斯后验概率1.00。生物学特性表明:梨黑斑链格孢A.gaisen的菌丝生长的最适温度为25℃,最适pH为5~8,最适培养方式为24 h暗培养,菌丝和孢子致死温度均为50℃处理10 min。由A.gaisen引起的太子参黑斑病为国内外首次报道,该研究结果可为太子参叶斑类病害的诊断及防控提供理论依据。

关键词：太子参黑斑病梨黑斑链格孢多基因序列分析生物学特性

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福建省山药初级核心种质的构建

福建农业学报 2023年第11期38卷 1267-1276页

作者：张武君陈菁瑛刘保财赵云青黄颖桢福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350013

【目的】构建福建省山药初级核心种质,为福建地方山药资源的保存、品种选育提供理论依据。【方法】以55份福建省地方主栽山药资源为材料,调查20个农艺性状,包括7个数量性状和13个描述型性状,采用离差平方和法进行聚类,根据聚类结果采用... 详细信息

【目的】构建福建省山药初级核心种质,为福建地方山药资源的保存、品种选育提供理论依据。【方法】以55份福建省地方主栽山药资源为材料,调查20个农艺性状,包括7个数量性状和13个描述型性状,采用离差平方和法进行聚类,根据聚类结果采用优先取样法构建初级核心种质,同时采用统计学方法及ISSR分子标记等对其代表性进行评价。【结果】构建的初级核心种质数量占原种质的43.6%,在降低冗余的同时保留了选育品种和有突出特点或地方特色的资源。初级核心种质和原种质各性状的均值、方差、变异系数、香农多样性指数无显著性差异。数量性状除茎粗外,核心种质保留了原种质变异范围的84.9%~100%。描述性指标除最弱的生长势外,核心种质保留了原种质的全部等级分布。初级核心种质和原种质的ISSR分子标记的等位基因数量、有效等位基因数量、香农多样性信息指数、Nei’s基因多样性指数无显著差异,且初级核心种质的多态位点保留率达到原种质的98.6%。基于农艺性状的主成分分析和基于ISSR分子标记的主坐标分析均确认了核心种质的代表性。【结论】构建的福建省山药初级核心种质能够较好地代表原种质的遗传多样性,有助于福建地方山药资源的保存和开发利用。

关键词：山药初级核心种质农艺性状 ISSR标记福建省

基于化学计量学的不同生境及生长期马蓝叶指纹图谱和化学特征研究

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沈阳药科大学学报 2022年第10期39卷 1226-1235页

作者：陈莹陈菁瑛张武君刘保财黄颖桢赵云青福建省农业科学院农业生物资源研究所福建福州350003 北京中医药大学中药学院北京102488 福建省农业科学院药用植物研究中心福建福州350003

目的探究不同生境下不同生长期马蓝叶指纹图谱和化学特征,为马蓝的栽培过程中光强管理和品质评价提供方法和参考。方法采集11批不同生境(桉树下、稻田半阳生、稻田全阴生、稻田全日照、枇杷树下)和不同生长期马蓝叶,采用HPLC法建立11... 详细信息

目的探究不同生境下不同生长期马蓝叶指纹图谱和化学特征,为马蓝的栽培过程中光强管理和品质评价提供方法和参考。方法采集11批不同生境(桉树下、稻田半阳生、稻田全阴生、稻田全日照、枇杷树下)和不同生长期马蓝叶,采用HPLC法建立11批马蓝叶指纹图谱,同时测定马蓝叶主要成分吲哚苷、色胺酮、靛蓝和靛玉红的含量,结合相似度评价、聚类分析和主成分分析的化学计量学方法对不同生境和生长期马蓝叶的指纹图谱和化学特征进行分析。结果建立11批马蓝叶的指纹图谱,共标定8个峰,指认4个峰,指纹图谱相似度在0.295~0.806,生长后期的马蓝叶非极性成分增加;聚类分析和主成分分析一致,分为4大类,稻田全日照马蓝叶与其他生境马蓝叶显著不同。含量分析结果表明马蓝叶中吲哚苷、靛蓝和靛玉红含量在生长后期增加,而色胺酮降低。光照对马蓝叶4种成分吲哚苷、色胺酮、靛蓝和靛玉红有一定影响,全日照和部分光照均有利于马蓝叶吲哚苷、靛蓝和靛玉红的积累,部分光照有利于马蓝叶色胺酮的积累。结论马蓝叶指纹图谱和化学成分受不同生境和不同生长期的影响,稻田和树荫下均适合马蓝的栽培,部分光照更有利于马蓝叶活性成分的积累。本研究所建立的指纹图谱、多指标定量结合化学计量学分析方法为马蓝的栽培光照强度管理和质量评价提供方法参考。

关键词：马蓝叶不同生境不同生长期指纹图谱活性成分化学计量学

沼水蛙皮肤分泌物抗菌肽的分离纯化、结构鉴定和cDNA克隆

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沼水蛙皮肤分泌物抗菌肽的分离纯化、结构鉴定和cDNA克隆

作者：黄颖桢福州大学

学位级别：硕士

从许多种类的两栖动物特别是蛙属(rana)动物中已经分离到一类线型,两性,带正电荷的抗菌肽。由于该类抗菌肽能够渗入并破坏细菌细胞膜,而且不易诱发细菌产生耐药性,所以其抗菌作用能力越来越引起人们的注意。沼水蛙(Hylarana guentheri)... 详细信息

从许多种类的两栖动物特别是蛙属(rana)动物中已经分离到一类线型,两性,带正电荷的抗菌肽。由于该类抗菌肽能够渗入并破坏细菌细胞膜,而且不易诱发细菌产生耐药性,所以其抗菌作用能力越来越引起人们的注意。沼水蛙(Hylarana guentheri)广泛分布于中国南部,在两栖动物种类和数量不断减少的同时,它通常仍是当地的优势物种。本文介绍了运用高效液相色谱和液质联用技术对沼水蛙皮肤分泌物中抗菌肽进行分离纯化,应用Edman降解法和串联质谱对多肽进行结构鉴定,经过互联网数据库的搜索和序列比对,结果证明分离到了5种新型抗菌肽AMP1 ( GFSSLFKAGAKYLLKSVGKAGAQQLACKAANNCA )、AMP2 (GVITDALKGAAKTVAAELLRKAHCKLTNSC)、AMP3 (VIDDLKKVAKKVRRELLCKKHHKKLN)、AMP4 (SIWEGIKNAGKGFLVSILDKVRCKVAGGCNP)和AMP5(FLPLLFGAISHLL-NH2),并且对其作了抗菌活性测定,发现它们对革兰氏阳性和阴性细菌具有一定的抗菌作用,对白色假丝酵母均无抗菌作用。AMP1对金黄色葡萄球菌FDA209P的MIC为14.9μg/mL;AMP2对金黄色葡萄球菌FDA209P的MIC为16.5μg/mL,对大肠杆菌O111的MIC为8.2μg/mL,对大肠杆菌ATCC25922的MIC为8.2μg/mL;AMP3对金黄色葡萄球菌FDA209P的MIC为35.5μg/mL;AMP4对金黄色葡萄球菌FDA209P的MIC为9.8μg/mL,对大肠杆菌O111的MIC为19.6μg/mL,对大肠杆菌ATCC25922的MIC为9.8μg/mL;AMP5对金黄色葡萄球菌FDA209P的MIC为44.3μg/mL。应用3’- and 5’- RACE策略对抗菌肽brevinin-2家族的新成员AMP2和AMP4进行了cDNA克隆。沼水蛙皮肤分泌物中抗菌肽的分离鉴定为首次报道。

关键词：沼水蛙皮肤分泌物抗菌肽结构鉴定 cDNA克隆

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福建省山药根腐线虫病病原分离及鉴定

分子植物育种 2023年

作者：刘保财代玉立杨秀娟陈菁瑛张武君黄颖桢赵云青福建省农业科学院药用植物研究中心福建省农业科学院植物保护研究所福建省农业科学院农业生物资源研究所

线虫病系福建山药常见病害之一，为分离及鉴定山药线虫病的种类及建立防治方法。采用块茎组织分离线虫，在光学显微镜下观察、测量线虫的形态特征，并扩增18S序列进行分子生物学鉴定。结果表明福建山药块茎中分离出的根腐线虫形态学特... 详细信息

线虫病系福建山药常见病害之一，为分离及鉴定山药线虫病的种类及建立防治方法。采用块茎组织分离线虫，在光学显微镜下观察、测量线虫的形态特征，并扩增18S序列进行分子生物学鉴定。结果表明福建山药块茎中分离出的根腐线虫形态学特征与斯克里布纳短体线虫(Pratylenchus scribneri Steiners)基本一致，并且其18S序列与P. scribneri相似性达97.21%～99.49%，经与近似物种共同构建进化树，均处于同一分支上。基于上述分析，福建省建阳和明溪地区山药根腐病病原为斯克里布纳短体线虫，为该地区山药线虫病的鉴别及防控提供了科学依据。

关键词：福建山药线虫病斯克里布纳短体线虫