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基于生信分析探索IL4I1表达对卵巢癌的影响

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肿瘤预防与治疗 2024年第5期37卷 413-420页

作者：封露李俊杨张国楠王登凤黄建鸣西南医科大学附属医院肿瘤科四川泸州646000 四川省肿瘤临床医学研究中心四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心电子科技大学附属肿瘤医院妇瘤科成都610041 四川省肿瘤临床医学研究中心四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心电子科技大学附属肿瘤医院实验研究部成都610041

目的:探讨白细胞介素4诱导蛋白1(interleukin-4 induced 1 protein, IL4I1)在卵巢癌中的表达情况及临床意义。方法:基于TCGA、GTEx数据库,分析IL4I1基因在卵巢癌组织与正常卵巢组织中的表达差异,从HPA数据库获得免疫组化图像,采用RNA-se... 详细信息

目的:探讨白细胞介素4诱导蛋白1(interleukin-4 induced 1 protein, IL4I1)在卵巢癌中的表达情况及临床意义。方法:基于TCGA、GTEx数据库,分析IL4I1基因在卵巢癌组织与正常卵巢组织中的表达差异,从HPA数据库获得免疫组化图像,采用RNA-seq检测IL4I1在卵巢癌中的表达水平。使用Kaplan-Meier plotter绘制IL4I1的生存分析图以解读其对卵巢癌患者预后的作用。使用GSEA探索IL4I1相关的生物学功能和信号通路。利用TIMER数据库和CIBERSORT算法分析IL4I1的表达与免疫细胞浸润水平的相关性。结果:IL4I1在卵巢癌组织中表达增加(P<0.001),并与卵巢癌患者较差的无进展生存期相关(P<0.05);GSEA结果提示,IL4I1可能参与调节IL6-JAK-STAT3、PI3K-AKT-MTOR通路。TIMER分析结果提示,IL4I1表达水平与B细胞(r=0.190,P<0.05)、CD4~+T细胞(r=0.289,P<0.05)、中性粒细胞(r=0.373,P<0.05)、树突状细胞(r=0.322,P<0.05)浸润水平成正相关。结论:IL4I1在卵巢癌中高表达,它可能通过PI3K-AKT-MTOR、IL6-JAK-STAT3通路促进卵巢癌的发生和发展,并与卵巢癌肿瘤免疫具有一定关联,具有作为卵巢癌诊断和治疗靶点的潜力。

关键词：卵巢癌白细胞介素4诱导蛋白1 基因富集分析肿瘤免疫

丙泊酚改善缺氧诱导的宫颈癌细胞增殖、G2/M期阻滞和辐射抗性

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肿瘤预防与治疗 2024年第2期37卷 101-109页

作者：毛远舟郭巧姗黄建鸣邹江陈一丁张可贤舒进军四川省肿瘤临床医学研究中心四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心电子科技大学附属肿瘤医院麻醉科成都610041 四川省肿瘤临床医学研究中心四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心电子科技大学附属肿瘤医院实验研究部成都610041 四川省骨科医院麻醉科成都610041

目的:探讨丙泊酚对氯化钴环境下宫颈癌Hela细胞的增殖、G2/M期阻滞和抗辐射抵抗作用及其与HIF-1α和VEGF的关系。方法:CoCl_(2)诱导Hela细胞构建缺氧化学模型;结晶紫染色检测细胞增殖活性;流式细胞术检测细胞周期;克隆形成实验检测细胞... 详细信息

目的:探讨丙泊酚对氯化钴环境下宫颈癌Hela细胞的增殖、G2/M期阻滞和抗辐射抵抗作用及其与HIF-1α和VEGF的关系。方法:CoCl_(2)诱导Hela细胞构建缺氧化学模型;结晶紫染色检测细胞增殖活性;流式细胞术检测细胞周期;克隆形成实验检测细胞辐射敏感性;荧光定量PCR检测HIF-1α和VEGF转录水平表达;免疫印迹和酶联免疫吸附实验检测HIF-1α和VEGF蛋白水平表达。结果:CoCl_(2)处理条件下丙泊酚抑制Hela细胞增殖,且呈剂量依赖性;与对照组相比,CoCl_(2)处理诱导了G0/G1/S期细胞比例显著增加和G2/M期细胞比例显著减少(P<0.001),而丙泊酚处理后显著反转了此结果(P<0.001);在CoCl_(2)处理后的Hela细胞中,丙泊酚降低0、1、2、4 Gy剂量辐射后Dq、SF2和D0值;机制上,丙泊酚处理恢复了CoCl_(2)处理诱导的HIF-1α和VEGF转录和翻译表达水平的下调(P<0.001)。结论:丙泊酚可通过下调宫颈癌Hela细胞HIF-1α和VEGF的表达来逆转缺氧诱导的增殖、G2/M期阻滞和辐射抵抗。

关键词：宫颈癌丙泊酚氯化钴辐射抗性 HIF-1α VEGF

EB荧光分析法测定肿瘤细胞DNA交联及增殖活性

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生物化学与生物物理进展 1996年第1期23卷 70-73页

作者：黄建鸣董玉宁许峰文浩王瑾郎锦义四川省肿瘤研究所四川省肿瘤医院放疗科

应用ＥＢ荧光分析法测定体外培养人宫颈癌细胞株（ＨｅＬａ）、人白血病细胞株（ＨＬ－６０），增殖性和非增殖性人外周血淋巴细胞（ＰＢＬ）的ＤＮＡ含量及其交联度（ＤＮＡｃｒｏｓｓ－ｌｉｎｋ），并据此研究不同增殖状态细胞与其Ｄ... 详细信息

应用ＥＢ荧光分析法测定体外培养人宫颈癌细胞株（ＨｅＬａ）、人白血病细胞株（ＨＬ－６０），增殖性和非增殖性人外周血淋巴细胞（ＰＢＬ）的ＤＮＡ含量及其交联度（ＤＮＡｃｒｏｓｓ－ｌｉｎｋ），并据此研究不同增殖状态细胞与其ＤＮＡ百分交联度（ｃｔ％）的相互关系．结果显示，ＨｅＬａ细胞、ＨＬ－６０细胞、增殖性和非增殖性ＰＢＬ的ＤＮＡｃｔ％分别为３６．５、２２．５、２０．２和０，表明不同增殖速度或周期的细胞具有不同的ＤＮＡ交联反应，而非增殖性细胞或Ｇｏ期细胞不产生ＤＮＡ交联反应．

关键词：肿瘤肿瘤细胞 DNA交联反应 EB荧光分析法

对卵巢癌治疗中PARP抑制剂适应证从BRCA突变到HRD、铂敏感变迁的思考

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中国实用妇科与产科杂志 2019年第5期35卷 551-553页

作者：张国楠黄建鸣电子科技大学医学院附属肿瘤医院四川省肿瘤医院.研究所四川成都610041

人体细胞中的DNA每天都会遭受大量的内源性和外源性损伤,但这些细胞中的DNA损伤可以通过多种修复机制来保持基因组的保真性不仅正常细胞可以使用这些修复途径,癌细胞也能在不断增殖的细胞中修复损伤的DNA。

关键词：卵巢肿瘤 PARP抑制剂同源重组修复缺陷铂敏感复发

恶性肿瘤患者PHA活化T淋巴细胞的增殖反应与其介导的杀伤活性之相关性的初步分析

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中国免疫学杂志 1994年第4期10卷 214-217页

作者：黄建鸣谢之荣四川省肿瘤研究所四川省肿瘤医院生化室

检测了１０１例恶性肿瘤患者和３０例正常对照ＰＨＡ活化Ｔ淋巴细胞的增殖反应（ＴＬＰ）及其介导的杀伤活性，分析了肿瘤患者ＴＬＰ与其介导的杀伤活性的相关性。结果显示，肿瘤患者和正常对照的ＴＬＰ及其介导的杀伤活性的均值分别为... 详细信息

检测了１０１例恶性肿瘤患者和３０例正常对照ＰＨＡ活化Ｔ淋巴细胞的增殖反应（ＴＬＰ）及其介导的杀伤活性，分析了肿瘤患者ＴＬＰ与其介导的杀伤活性的相关性。结果显示，肿瘤患者和正常对照的ＴＬＰ及其介导的杀伤活性的均值分别为１．２９±０．３２，４２．４％±１９．５％和１．７２±０．２６，６７．４％±８．３７％，二者间均有非常显著的差异（Ｐ＜０．０１）；肿瘤患者的ＴＬＰ与其介导的杀伤活性呈显著正相关（ｒ＝０．４９２，Ｐ＜０．０１），表明肿瘤患者ＰＨＡ活化Ｔ淋巳细胞的增殖反应及其介导的杀伤活性均显著低下，二者间存在明显的平行关系。

关键词： T细胞增殖反应肿瘤癌

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卵巢上皮癌分子分型和化疗耐药的再认识

中国妇产科临床杂志 2017年第6期18卷 481-483页

作者：张国楠黄建鸣四川省肿瘤医院四川省癌症防治中心电子科技大学医学院附属肿瘤医院 610041

20世纪90年代以来,彻底的肿瘤细胞减灭术＋以铂类为基础的联合化疗方案使大多数卵巢上皮性癌（epithelial ovarian cancer,EOC）患者从中获益,达到临床完全缓解,但不尽如人意的是,近50%的晚期EOC患者因化疗耐药而发生复发和疾病进展,使... 详细信息

20世纪90年代以来,彻底的肿瘤细胞减灭术＋以铂类为基础的联合化疗方案使大多数卵巢上皮性癌（epithelial ovarian cancer,EOC）患者从中获益,达到临床完全缓解,但不尽如人意的是,近50%的晚期EOC患者因化疗耐药而发生复发和疾病进展,使其5年生存率一直徘徊在30%左右[1-2]。

关键词：化疗耐药卵巢上皮癌分子分型肿瘤细胞减灭术卵巢上皮性癌联合化疗方案 5年生存率完全缓解

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绝缘磁芯平面变压器的漏磁补偿

强激光与粒子束 2012年第7期24卷 1595-1598页

作者：康成刘永好黄建鸣李德明中国科学院上海应用物理研究所上海201800 中国科学院研究生院北京100049

针对绝缘磁芯平面变压器因绝缘膜而产生的漏磁问题,提出了在每层次级线圈的两端并联补偿电容的解决方法。通过理论分析给出了补偿电容大小的推导公式,利用CST和Protel对搭建的绝缘磁芯平面变压器的仿真计算发现,引入补偿电容后,变压器... 详细信息

针对绝缘磁芯平面变压器因绝缘膜而产生的漏磁问题,提出了在每层次级线圈的两端并联补偿电容的解决方法。通过理论分析给出了补偿电容大小的推导公式,利用CST和Protel对搭建的绝缘磁芯平面变压器的仿真计算发现,引入补偿电容后,变压器总的输出电压提高了约17.6%,同时各层次级线圈输出电压的大小基本相同。仿真结果与实验结果一致,从而验证了并联补偿电容方法的有效性。

关键词：绝缘磁芯平面变压器补偿电容漏磁

基于加权基因共表达网络分析筛选卵巢上皮性癌预后相关关键基因并建立基因预后模型

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中华妇产科杂志 2022年第7期57卷 534-539页

作者：向文妮黄建鸣张国楠电子科技大学医学院附属肿瘤医院四川省肿瘤医院妇瘤科成都610041

目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选卵巢上皮性癌(卵巢癌)预后相关关键基因,并建立基因预后模型。方法:(1)从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合(GEO)数据库下载基因表达谱数据集GSE26712,共有185份卵巢癌组织标本和1... 详细信息

目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选卵巢上皮性癌(卵巢癌)预后相关关键基因,并建立基因预后模型。方法:(1)从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合(GEO)数据库下载基因表达谱数据集GSE26712,共有185份卵巢癌组织标本和10份正常卵巢组织标本的数据,采用limma软件包筛选出卵巢癌的差异表达基因,与WGCNA筛选出的卵巢癌预后相关模块基因绘制韦恩(Venn)图,取其交集,得到交集基因;再结合基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行信号通路富集分析,构建交集基因相应蛋白之间的相互作用网络。(2)在交集基因中,采用单因素及多因素Cox回归模型分析筛选出与卵巢癌患者总生存时间显著相关的关键基因,据此构建基因预后模型,预后模型风险评分为各关键基因的表达水平乘以相应权重值后求和,以风险评分的中位数为界分为高风险组和低风险组。使用癌症基因组图谱(TCGA)数据库(共有379份卵巢癌组织标本)进行验证;并对TCGA数据库中的高风险组、低风险组采用基因集富集分析(GSEA)进行KEGG信号通路富集、基因突变分析和免疫特征分析。结果:(1)数据集GSE26712筛选出的1024个卵巢癌差异表达基因与WGCNA筛选出的523个卵巢癌预后相关模块基因绘制韦恩图,取其交集获得378个交集基因。(2)单因素及多因素Cox回归模型分析共筛选出6个与预后显著相关的关键基因,即BNC1、CERK、FOXO1、GALNT6、MRPL2、PRSS2基因,构建基因预后模型,风险评分=BNC1基因表达水平×0.06+CERK基因表达水平×0.24+FOXO1基因表达水平×0.14+GALNT6基因表达水平×(-0.22)+MRPL2基因表达水平×(-0.20)+PRSS2基因表达水平×(-0.07)。训练集(GSE26712数据集)和验证集(TCGA数据库)中低风险组总生存率均显著高于高风险组(P<0.001,P=0.003)。采用GSEA进行的KEGG信号通路富集发现,低风险组的基因在氧化磷酸化相关通路中富集,高风险组的基因在恶性肿瘤、钙离子等信号通路中富集;基因突变分析发现,TP53和TTN基因在高风险组(分别为82%、23%)和低风险组(分别为85%、24%)中的突变率均高于15%;免疫特征分析发现,低风险组浆细胞、滤泡辅助性T淋巴细胞、M1型巨噬细胞的浸润比例均显著高于高风险组(P均<0.05),而休眠记忆CD 4 T淋巴细胞的浸润比例显著低于高风险组(P<0.05)。结论:基于WGCNA筛选的卵巢癌关键基因建立的基因预后模型能有效预测卵巢癌患者的预后,基因预后模型中的6个关键基因为研究卵巢癌的发生、发展及治疗靶点提供了参考依据。

关键词：预后模型 FOXO1 卵巢上皮性癌正常卵巢组织总生存率氧化磷酸化 T淋巴细胞韦恩图

紫杉醇在上皮性卵巢癌化疗中的双刃剑效应与对策思考

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中国实用妇科与产科杂志 2017年第1期33卷 21-24页

作者：张国楠朱熠黄建鸣四川省肿瘤医院电子科技大学医学院附属肿瘤医院妇科肿瘤中心四川成都610041 四川省肿瘤医院电子科技大学医学院附属肿瘤医院超声医学中心四川成都610041 四川省肿瘤医院电子科技大学医学院附属肿瘤医院研究所四川成都610041

1紫杉醇对卵巢癌的双刃剑效应及问题提出的缘由在上皮性卵巢癌（epithelial ovarian cancer,简称卵巢癌）的综合治疗中,化疗占有重要地位,是延缓卵巢癌患者复发与赖以长期生存的主要措施。晚期患者的手术很难达到无肉眼残留病变的程度,... 详细信息

1紫杉醇对卵巢癌的双刃剑效应及问题提出的缘由在上皮性卵巢癌（epithelial ovarian cancer,简称卵巢癌）的综合治疗中,化疗占有重要地位,是延缓卵巢癌患者复发与赖以长期生存的主要措施。晚期患者的手术很难达到无肉眼残留病变的程度,对于残留的癌灶,有赖于术后化疗来杀灭。

关键词：卵巢肿瘤紫杉醇化疗