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β-酪蛋白不同基因型荷斯坦奶牛瘤胃微生物群落特征和功能分析

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动物营养学报 2024年第1期36卷 537-550页

作者：赵金燕王川川禹保军马若霜胡佳欢张娟顾亚玲宁夏大学动物科技学院银川750021 宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室银川750021

β-酪蛋白是乳汁中最重要的蛋白质之一,在荷斯坦奶牛中存在A1和A2这2种主要基因型。为探究β-酪蛋白不同基因型荷斯坦奶牛瘤胃微生物群落的差异,试验选取体况良好、第1胎次的A1A1、A1A2和A2A2基因型荷斯坦奶牛各15头(各基因型奶牛乳脂... 详细信息

β-酪蛋白是乳汁中最重要的蛋白质之一,在荷斯坦奶牛中存在A1和A2这2种主要基因型。为探究β-酪蛋白不同基因型荷斯坦奶牛瘤胃微生物群落的差异,试验选取体况良好、第1胎次的A1A1、A1A2和A2A2基因型荷斯坦奶牛各15头(各基因型奶牛乳脂率和乳蛋白率相近),采集瘤胃液后通过Illumina HiSeq 2000平台进行宏基因组测序,并利用Diamond 0.9.7软件进行分类和功能注释,分析3种基因型奶牛瘤胃微生物群落的组成和功能。结果表明:1)A1A1基因型奶牛瘤胃中特征微生物有Intestinibaculum、戴阿利斯特杆菌属(Dialister)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)和不动杆菌属(Acinetobacter)等;A1A2基因型奶牛瘤胃中特征微生物有普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)的帕拉普雷沃氏菌属(Paraprevotella)和Paraprevotella xylaniphila;A2A2基因型奶牛瘤胃中特征微生物包括醋杆菌属(Acetobacter)和黄单胞菌属(Xanthomonas)等。2)A1A2和A2A2基因型奶牛瘤胃中富含与木质纤维素和纤维素降解相关的酶;A1A2基因型奶牛瘤胃参与淀粉和蔗糖代谢、脂肪酸生物合成、蛋白质消化与吸收、精氨酸和脯氨酸代谢以及RNA降解通路的基因数量更多;A2A2基因型奶牛瘤胃参与炎症介质调节通路的基因数量更多。由此可知,A1A1基因型荷斯坦奶牛的瘤胃标志物微生物是Intestinibaculum和戴阿利斯特杆菌属,可能与减少甲烷排放和A1型β-酪蛋白以及部分疾病存在潜在关联;A1A2基因型奶牛的瘤胃标志微生物是普雷沃氏菌科,可能对饲粮消化有促进作用;A2A2基因型奶牛的瘤胃标志微生物是醋杆菌属,其相对丰度对乳脂含量有调节作用。

关键词：荷斯坦奶牛 β-酪蛋白 A2奶瘤胃微生物宏基因组学

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权贵之家内幕

权贵之家内幕

基于转录组测序挖掘奶牛乳脂代谢关键候选基因

丛书名：苏联文艺丛书

1981年

作者：（苏）罗佐夫（В.С.Розов）顾亚玲查意楞译

本书采用追溯的手法，通过债主的要挟，海尔茂收到揭发信，交代剧情发展的关键事件娜拉伪造签名，然后集中刻画他们冲突、决裂的过程。

ISBN: (纸本)10215·4

本书采用追溯的手法，通过债主的要挟，海尔茂收到揭发信，交代剧情发展的关键事件娜拉伪造签名，然后集中刻画他们冲突、决裂的过程。

关键词：戏剧剧本近代苏联

来源：汇雅图书（南通市图书馆... 评论

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汇雅图书（南通市图书馆）

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畜牧兽医学报 2022年第10期53卷 3421-3433页

作者：王川川母童冯小芳禹保军张娟顾亚玲宁夏大学农学院银川750021

旨在对高、低乳脂率奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)转录组测序的mRNA表达谱数据进行深入分析,挖掘影响奶牛乳脂代谢的关键候选基因。本研究采用IlluminaPE150方法对乳脂率具有极端差异的荷斯坦奶牛(高、低乳脂组各4头)的BMECs进行转录组测序,... 详细信息

旨在对高、低乳脂率奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)转录组测序的mRNA表达谱数据进行深入分析,挖掘影响奶牛乳脂代谢的关键候选基因。本研究采用IlluminaPE150方法对乳脂率具有极端差异的荷斯坦奶牛(高、低乳脂组各4头)的BMECs进行转录组测序,以P<0.05和|log_(2)FoldChange|≥1.5为阈值筛选差异表达基因,并利用KOBAS在线网址进行功能富集分析,最后通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析测序结果的准确性及乳脂代谢相关差异表达基因的组织表达谱。结果表明,在高、低乳脂组之间共发现578个差异表达基因,包括332个上调差异表达基因,246个下调差异表达基因。功能富集分析共确定了包含生物学过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)的366个显著富集的GO条目(P<0.05),其中与脂代谢密切相关的GO条目有长链脂肪酸的运输、脂肪细胞分化的正向调节、乳腺肺泡发育、花生四烯酸的结合等。差异表达基因显著富集到47条KEGG通路(P<0.05),参与脂代谢的通路有15条,分别为脂肪细胞内脂解的调节、磷脂酶D信号通路、河马信号通路等,其中ID2、PRKKA2、FABP4和ADCY5为可能调控乳脂代谢的关键候选基因。组织表达谱分析发现,FABP4在乳腺组织中的表达水平相对最高,ID2、PRKKA2和ADCY5相对于其它组织在乳腺中的表达也均处于较高水平。本研究筛选得到了4个影响奶牛乳脂代谢的重要候选基因,为今后奶牛乳脂代谢的分子调控机制研究提供了重要的理论依据。

关键词：荷斯坦奶牛转录组差异表达基因乳脂组织表达谱

中国荷斯坦奶牛乳脂中miR-2285f生物信息学分析及靶基因验证

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中国农业大学学报 2023年第7期28卷 108-121页

作者：张迪刘佳敏禹保军李德生顾亚玲温万张娟宁夏大学农学院银川750021 宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室银川750021 宁夏畜牧工作站银川750002

旨为探索bta-miR-2285f和宿主基因TANK结合激酶1(TANK binding kinase 1,TBK1)的生物学功能,以及bta-miR-2285f与靶基因互作调节奶牛乳脂代谢的潜在机制,本研究通过生物信息学方法分析bta-miR-2285f在不同物种间的保守性,并通过上游序列... 详细信息

旨为探索bta-miR-2285f和宿主基因TANK结合激酶1(TANK binding kinase 1,TBK1)的生物学功能,以及bta-miR-2285f与靶基因互作调节奶牛乳脂代谢的潜在机制,本研究通过生物信息学方法分析bta-miR-2285f在不同物种间的保守性,并通过上游序列CPG岛分析、启动子预测、进一步进行组织表达谱分析,预测靶基因并进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用双荧光素酶报告试验验证bta-miR-2285f调控的下游靶基因钙结合蛋白39(Calcium binding protein 39,CAB39),并在乳腺上皮细胞水平探究bta-miR-2285f的功能作用。结果表明:(1)bta-miR-2285f是牛特异性miRNA,属于内含子miRNA;(2)bta-miR-2285f与宿主基因TBK1上游序列2 kb处均不含有CPG岛。bta-miR-2285f在上游586 bp处为转录起始位点。宿主基因TBK1在上游105 bp处为转录起始位点;(3)TargetScan和miRWalk预测miR-2285f有172个交集靶基因,主要参与新陈代谢、遗传信息传递、信号分析和细胞的相互作用,并且显著富集到mTOR信号通路、PI3K-AKT信号通路、ErbB信号通路、Hippo信号通路以及甘油酯代谢等乳脂代谢相关的信号通路并在STRING数据库中构建bta-miR-2285f靶基因之间的互作网络图;(4)bta-miR-2285f在奶牛乳腺组织中的表达水平最高,与其他组织存在显著差异(P<0.05);(5)双荧光素酶报告基因试验证明bta-miR-2285f与基因CAB39的3’非翻译区(UTR)种子序列具有直接的靶向关系并且bta-miR-2285f mimic显著上调乳脂标志基因ELOVL6、SLC27A6、PPARG和FASN的表达,bta-miR-2285f inhibitor则具有相反的作用。综上,bta-miR-2285f-1可能通过反馈调节宿主基因TBK1从而参与乳脂代谢过程,并且bta-miR-2285f通过靶向基因CAB39进而参与奶牛乳脂代谢过程,为进一步探究bta-miR-2285f在中国荷斯坦奶牛乳脂代谢中的潜在机制提供基础。

关键词：中国荷斯坦奶牛 miR-2285f 生物信息学 miRNA-mRNA互作乳脂

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荷斯坦牛高、低乳脂率牛乳代谢组分析

畜牧兽医学报 2022年第5期53卷 1396-1408页

作者：王影文亮母童冯小芳刘佳敏张娟温万顾亚玲宁夏大学农学院银川750021 宁夏农垦贺兰山奶业有限公司银川750000 宁夏畜牧工作站银川750001

旨在筛选牛乳不同乳脂水平潜在标志性差异代谢物。本研究中乳样采自宁夏农垦贺兰山奶业茂盛牧场,采集体重与月龄相近且健康的头胎次荷斯坦牛泌乳中后期(180~210 d)的早、中、晚班次新鲜乳样(4∶3∶3混合)245份。DHI测定后筛选体细胞数低... 详细信息

旨在筛选牛乳不同乳脂水平潜在标志性差异代谢物。本研究中乳样采自宁夏农垦贺兰山奶业茂盛牧场,采集体重与月龄相近且健康的头胎次荷斯坦牛泌乳中后期(180~210 d)的早、中、晚班次新鲜乳样(4∶3∶3混合)245份。DHI测定后筛选体细胞数低于20万个·mL^(-1),乳脂率具有极端差异的样品26份,其中乳脂率大于4.4%为高乳脂率组(HF组,13份),乳脂率小于3.0%为低乳脂率组(LF组,13份)。之后采用超高效液相色谱-质谱法(UHPLC-MS)对样品进行代谢组学分析。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)结果显示,相对于LF组,HF组代谢轮廓发生了变化,在HF与LF两组中共鉴定出343种代谢产物,根据VIP值(VIP>1)和单变量统计分析(P2.0及P0.85,发现有18种差异代谢物对两组牛乳具有显著区别能力,即:N-油酰甘氨酸、皮质醇、δ-生育酚、PC(14∶0e/9∶0)。结果发现,不同乳脂水平显著差异代谢物有60种,且代谢物N-油酰甘氨酸、皮质醇、δ-生育酚、PC(14∶0e/9∶0)可作为高乳脂率牛乳潜在标志性差异代谢物。本研究结果为奶牛乳脂合成提供了有价值的理论依据,同时也为研究奶牛的泌乳过程提供了资料。

关键词：荷斯坦奶牛乳脂率代谢组学标志代谢物

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荷斯坦奶牛FABP4基因结构与功能分析

华北农学报 2023年第3期38卷 204-212页

作者：王川川母童李德生张迪李蕾蕾张娟顾亚玲宁夏大学农学院宁夏银川750021

旨在深入了解荷斯坦奶牛脂肪酸结合蛋白4(FABP4)的分子功能,及其在不同组织中的表达规律。以荷斯坦奶牛的乳腺组织为cDNA模板,通过PCR扩增荷斯坦奶牛FABP4基因的编码区序列(Coding sequence, CDS),并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技... 详细信息

旨在深入了解荷斯坦奶牛脂肪酸结合蛋白4(FABP4)的分子功能,及其在不同组织中的表达规律。以荷斯坦奶牛的乳腺组织为cDNA模板,通过PCR扩增荷斯坦奶牛FABP4基因的编码区序列(Coding sequence, CDS),并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技术检测了FABP4基因在小肠、肝脏、乳腺、心脏、子宫、肾脏及卵巢组织中的mRNA相对表达水平。结果表明,荷斯坦奶牛FABP4基因编码区序列长399 bp,编码133个氨基酸,蛋白质二级结构以β-折叠为主。FABP4蛋白为稳定亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽剪切位点。通过氨基酸同源性分析发现,牛FABP4与绵羊和山羊之间的亲缘关系最近;核质定位表明,FABP4基因可能在细胞质中发挥重要功能。利用STRING对FABP4进行蛋白互作分析发现,与FABP3、PPARG、LIPE等脂质相关蛋白密切相关。qRT-PCR结果显示,FABP4在泌乳中期奶牛的各组织中均有表达,但在奶牛乳腺组织中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05)。本研究为后续深入研究荷斯坦奶牛中FABP4的生物学功能及乳脂调控机制提供了重要的理论依据。

关键词：荷斯坦奶牛 FABP4 克隆生物信息学组织表达谱

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综合选择指数在奶牛生产中的应用

中国奶牛 2002年第6期 30-31页

作者：顾亚玲宁夏大学农学院动物科学系 750105

选择指数是把所要选择的各方面的性状,按照遗传特点和经济效果综合成为一个指数,然后按指数高低进行选留。利用宁夏地区某牛场20头荷斯坦奶牛产奶量、乳脂率及外貌鉴定得分进行统计测定,对其选择指数进行了计算,并根据选择指数大小对牛... 详细信息

选择指数是把所要选择的各方面的性状,按照遗传特点和经济效果综合成为一个指数,然后按指数高低进行选留。利用宁夏地区某牛场20头荷斯坦奶牛产奶量、乳脂率及外貌鉴定得分进行统计测定,对其选择指数进行了计算,并根据选择指数大小对牛进行了排序。结果表明,1号、2号牛选择指数最高,3号、8号、18号选择指数最低,其它居中。20头奶牛选择指数的排序与它们在实际生产中表现优劣情况相比较,所得结果两者基本一致。表明选择指数在奶牛选种选配方面能提供重要依据,在奶牛育种生产中有重要意义。

关键词：综合选择指数奶牛生产应用遗传力

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中草药添加剂对肉鸡增重的饲养试验

甘肃畜牧兽医 1995年第2期25卷 12-13页

作者：顾亚玲杨库宁夏农学院牧医系宁夏农学院实验农场

中草药添加剂对肉鸡增重的饲养试验顾亚玲，杨库（宁夏农学院牧医系）（宁夏农学院实验农场）随着养鸡业的发展，添加剂的应用已引起人们极大重视，中草药作为添加剂，安全、不产生抗药性、无毒无残留。为了探讨肉鸡饲料中添加苦参、蒲... 详细信息

中草药添加剂对肉鸡增重的饲养试验顾亚玲，杨库（宁夏农学院牧医系）（宁夏农学院实验农场）随着养鸡业的发展，添加剂的应用已引起人们极大重视，中草药作为添加剂，安全、不产生抗药性、无毒无残留。为了探讨肉鸡饲料中添加苦参、蒲公英中草药以及硒、铁、锌、锰、铜等...

关键词：肉用鸡中草药添加剂增重饲养

非遗传因素对安格斯牛初生体重、体尺性状的影响及遗传参数估计

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中国畜牧杂志 2023年第1期59卷 126-130页

作者：陈亚飞冯小芳蒋秋斐李蕾蕾姚婷婷顾亚玲张娟宁夏大学农学院宁夏银川756200 宁夏畜牧工作站宁夏银川756200

为探讨非遗传因素对安格斯牛初生体重及体尺性状的影响和遗传参数估计,本研究利用SAS 8.1软件中的GLM程序分析了场、年度、季节、性别对安格斯牛初生体重及体尺性状的影响,并用DMU 9.2软件中的DMUAI模块对初生体重及体尺性状进行遗传参... 详细信息

为探讨非遗传因素对安格斯牛初生体重及体尺性状的影响和遗传参数估计,本研究利用SAS 8.1软件中的GLM程序分析了场、年度、季节、性别对安格斯牛初生体重及体尺性状的影响,并用DMU 9.2软件中的DMUAI模块对初生体重及体尺性状进行遗传参数估计。结果表明:除了季节对初生体重无显著影响外,场、年度、性别对初生体重及体尺性状均有极显著影响;体重、体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围、管围的遗传力分别为0.52、0.70、0.71、0.75、0.70、0.69、0.43,均属于高遗传力性状;各性状间遗传相关系数范围为-0.26~0.95,体高和十字部高的遗传相关最高,相关系数为0.95,表型相关系数范围为0.12~0.80,胸围和腹围的表型相关最高,相关系数为0.80。上述研究结果为今后安格斯牛的遗传评定和遗传参数估计统计模型的建立提供了参考依据。

关键词：非遗传因素安格斯牛遗传参数估计体重体尺性状