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猕猴桃BBX基因家族成员鉴定与转录特征分析

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生物技术通报 2024年第2期40卷 172-182页

作者：路喻丹刘晓驰冯新陈桂信陈义挺福建农林大学园艺学院福州350002 福建省农业科学院果树研究所福州350013 福建省落叶果树工程技术研究中心福州350013

【目的】BBX(B-Box)作为锌指转录因子亚家族之一,广泛参与植物的生长发育过程。本研究旨在揭示猕猴桃BBX家族的基因特征和潜在功能。【方法】从全基因组水平对猕猴桃BBX基因家族进行鉴定,分析其蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统发育特... 详细信息

【目的】BBX(B-Box)作为锌指转录因子亚家族之一,广泛参与植物的生长发育过程。本研究旨在揭示猕猴桃BBX家族的基因特征和潜在功能。【方法】从全基因组水平对猕猴桃BBX基因家族进行鉴定,分析其蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统发育特征、蛋白质保守结构域以及同源特性等,同时研究它们在不同组织部位和果实贮藏过程的表达模式。【结果】48个AcBBX不均匀地分布于22条染色体上,编码的氨基酸长度126-515 aa,蛋白分子量14172.09-57905.84 Da,预测有4种亚细胞定位;家族成员有0-4个内含子;启动子含有光反应、植物激素调控、逆境胁迫调控、生长发育调控等多种顺式作用元件。结合进化树及保守结构域被聚为5个组,基因串联重复和片段复制是家族成员扩张的主要原因。AcBBXs在猕猴桃不同器官中的表达量有差异,7个成员在成熟果中表达量较其他部位高,3个成员在幼果中表达较高,7个成员在叶中表达量较高,3个成员在花中表达量较高;果实采后贮藏过程中,3个成员受果实外源激素调控影响表达上调且高于其他处理组,6个成员在果实室温贮藏一周后表达上调且高于其他处理组。在果实4℃低温贮藏过程中,10个成员的表达随时间增加而上调,5个成员的表达随时间增加而下调。【结论】揭示了BBX家族不同成员在猕猴桃生长发育和果实采后贮藏期间的转录特征,为后续猕猴桃BBX基因功能验证奠定基础。

关键词：猕猴桃 BBX转录因子全基因组鉴定不同组织部位果实贮藏转录分析

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印度梨形孢对香蕉抗旱性的影响

应用与环境生物学报 2024年第1期30卷 118-125页

作者：陈春玲李金曼罗杰陈义挺程春振赖钟雄黄玉吉福建农林大学园艺植物生物工程研究所福州350002 福建省农业科学院果树研究所福州350002 山西农业大学园艺学院太古030801

为了解印度梨形孢(Serendipita indica)对香蕉干旱胁迫下生长的影响以及提高香蕉抗旱性的生理生化机制,对正常浇水和干旱胁迫下的幼苗进行不加***和加***处理,比较香蕉苗表型、各项生长指标及相关生理生化指标的差异.结果显示,当土壤含... 详细信息

为了解印度梨形孢(Serendipita indica)对香蕉干旱胁迫下生长的影响以及提高香蕉抗旱性的生理生化机制,对正常浇水和干旱胁迫下的幼苗进行不加***和加***处理,比较香蕉苗表型、各项生长指标及相关生理生化指标的差异.结果显示,当土壤含水量适宜香蕉幼苗生长时,接种***的香蕉苗仅叶片数和茎粗显著高于CK组,其他各项生长指标与CK组无显著差异;干旱胁迫时,接种***的各项生长指标均优于未接种***组,其中接种***的根数量显著多于未接种***,约为2.19倍(P<0.01),接种***的干旱症状比未接种的香蕉苗轻,出现干旱症状的时间滞缓,接种***的根中过氧化氢酶(CAT)活性为未接种***组的1.58倍,叶片中过氧化物酶(POD)活性、丙二醛(MDA)含量、脯氨酸(Pro)含量、可溶性糖(SS)含量、脱落酸(ABA)、叶绿素含量分别为未接种***的1.78倍、50.23%、1.61倍、1.83倍、1.39倍和1.15倍,均达到极显著水平(P<0.01).本研究表明干旱胁迫时,印度梨形孢主要通过提高香蕉叶片中POD活性和根系中CAT活性来降解、清除干旱胁迫产生的有害物质,减少香蕉叶片和根系中MDA的积累,促进香蕉叶片中Pro、SS合成及积累,减缓叶绿素的分解,加速ABA的合成与积累,进而提高香蕉抗旱性.

关键词：干旱胁迫印度梨形孢生长生理生化抗旱

基于SLAF-Seq技术的橄榄种质资源SNP标记开发与遗传关系鉴定

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福建农业学报 2024年第5期39卷 557-562页

作者：沈朝贵赖瑞联陈瑾冯新陈义挺韦晓霞吴如健福建省农业科学院果树研究所福建福州350013

【目的】开发橄榄SNP标记并分析其种质资源遗传多样性,为橄榄种质资源保护和利用提供依据。【方法】基于SLAF-Seq技术进行橄榄SNP标记开发,同时采用系统进化分析、群体聚类分析和主成分分析等研究了橄榄种质资源遗传结构和遗传多样性。... 详细信息

【目的】开发橄榄SNP标记并分析其种质资源遗传多样性,为橄榄种质资源保护和利用提供依据。【方法】基于SLAF-Seq技术进行橄榄SNP标记开发,同时采用系统进化分析、群体聚类分析和主成分分析等研究了橄榄种质资源遗传结构和遗传多样性。【结果】基于SLAF-Seq技术共挖掘到506 701个SLAF标签,其中多态性SLAF标签27 108个,开发获得361 386个群体SNP标记;基于SNP标记,利用系统进化树和群体聚类分析可分别将橄榄种质资源分为3和6个类群,整体Nei多样性指数和Shanon-Wiener指数分别为0.321和0.472。两种分类方法分析结果均发现,不同地区之间的橄榄种质资源并未严格按照地域分布归类。【结论】橄榄种质资源遗传多样性相对丰富,且不同地域间存在种质资源交流,而采用SNP标记可有效鉴定橄榄种质资源。

关键词：橄榄种质资源 SNP标记遗传结构遗传多样性

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猕猴桃AdCCS1基因的克隆及其表达调控

园艺学报 2018年第12期45卷 2371-2382页

作者：陈义挺冯新赖瑞联高敏霞陈文光吴如健福建省农业科学院果树研究所福州350013

采用RT-PCR法从‘米良1号’猕猴桃中分离到1 066 bp的铜锌超氧化物歧化酶分子伴侣蛋白基因AdCCS1,登录号为KY471361。AdCCS1的开放阅读框为984bp,编码327个氨基酸,包含3个典型结构域(N端结构域、中间结构域和C端结构域)和2个保守的金属... 详细信息

采用RT-PCR法从‘米良1号’猕猴桃中分离到1 066 bp的铜锌超氧化物歧化酶分子伴侣蛋白基因AdCCS1,登录号为KY471361。AdCCS1的开放阅读框为984bp,编码327个氨基酸,包含3个典型结构域(N端结构域、中间结构域和C端结构域)和2个保守的金属结合位点(MXCXXC和CXC)。基因结构分析显示AdCCS1由6个外显子和5个内含子组成。系统进化分析表明AdCCS1聚在双子叶植物分支中,与茶树CsCCS的亲缘关系最近。此外,AdCCS1的5′端调控区存在多种光响应、胁迫响应和激素响应应答元件。定量PCR分析显示,AdCCS1在猕猴桃叶片中的表达量最高,其次是成熟果、花、幼果和茎,在根中的表达量最低。猕猴桃果实中AdCCS1在4℃低温贮藏过程中的表达量均比25℃贮藏中同期的低,说明低温抑制AdCCS1的表达。脱落酸和赤霉素处理后AdCCS1的表达下调,但二者的应答模式不同。

关键词：猕猴桃 AdCCS1 贮藏温度 ABA GA3 表达分析

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楷杷种质资源的RAPD分析

楷杷种质资源的RAPD分析

作者：陈义挺福建农林大学

学位级别：硕士

本研究以枇杷种质资源为材料,摸索出适合枇杷叶片基因组DNA的提取方法;建立和优化了枇杷RAPD反应体系;采用RAPD标记,结合聚类分析,分别进行了枇杷种质资源(包括11个枇杷属主要种类资源、65份枇杷种质资源、12个不同地方来源的解放钟... 详细信息

本研究以枇杷种质资源为材料,摸索出适合枇杷叶片基因组DNA的提取方法;建立和优化了枇杷RAPD反应体系;采用RAPD标记,结合聚类分析,分别进行了枇杷种质资源(包括11个枇杷属主要种类资源、65份枇杷种质资源、12个不同地方来源的解放钟品种材料)的遗传多样性与亲缘关系研究,并且证明了早钟6号是解放钟与森尾早生的杂种后代。主要研究结果如下: 一、枇杷叶片DNA提取方法的建立。针对枇杷叶片富含多糖、多酚类、色素等物质的特点,采用改良的SDS法,以新鲜幼嫩的枇杷叶片为材料,并在提取液中加入3%PVP,有效地克服消除了酚类物质的干扰。在DNA提取过程中。在第一次 25000g高速离心后,重复加入500μ120%SDS和1500μ15M KAc的步骤,让SDS 与多余多糖再次结合变成不溶性的十二烷基磺酸钾复合物,有效地、较彻底地消除了糖类物质的干扰。从枇杷叶片中提取了较高纯度和产量的DNA,适宜作为枇杷 RAPD分析。二、枇杷RAPD-PCR反应体系的优化。经过反复试验,确定适宜的PCR扩增程序为:94℃,预变性4min:94℃变性1min,38℃退火1.5min,72℃延迟2min,45个循环:最好一次延伸温度72℃,10min。优化的枇杷RAPD反应体系为:在扩增反应总体积25 μl中,包含0.6 mmol·L1Mg+、500 μ mol·L1dNTP、300 nmol·L1 引物、50ng模板DNA、1.25U Taq DNA聚合酶。三、枇杷属11个主要种类的RAPD分析。应用14个10聚体随机引物对解放钟、森尾早生、早钟6号、贵州野生、台湾枇杷、栎叶枇杷、乌脐、白梨、洛阳青、俨糖枇杷、湖北六二等11个枇杷种类或品种的基因组DNA进行RAPD扩增,共得到130条扩增带,其中3条为非多态性条带,多态性程度为97.69%。聚类分析表明,以D1=0.599进行划分时,可将枇杷的11个遗传资源分成栽培和非栽培两个类群。四、65份枇杷种质资源RAPD分析。利用RAPD技术对65份有代表性的枇杷种质资源进行了遗传亲缘关系及分类研究。从所筛选的Sangon引物中选取16个10

关键词：枇杷 RAPD 聚类分析品种鉴别遗传多样性亲缘关系

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无公害高优早熟枇杷基地建立及配套技术

中国南方果树 2005年第1期34卷 37-38页

作者：陈义挺赖钟雄福建省农业科学院果树研究所福州350013 福建农林大学亚热带果树研究所

枇杷是我国南方特有的珍稀常绿果树,秋萌冬花,春实夏熟,在百果中独具先天四时之气,被誉为独冠时新的佳果珍味.现在,果品在国际市场的竞争更加激烈,'绿色壁垒'等限制对国内农产品的品质要求显著提高,要想在这个大市场中占有一定份额,就... 详细信息

枇杷是我国南方特有的珍稀常绿果树,秋萌冬花,春实夏熟,在百果中独具先天四时之气,被誉为独冠时新的佳果珍味.现在,果品在国际市场的竞争更加激烈,'绿色壁垒'等限制对国内农产品的品质要求显著提高,要想在这个大市场中占有一定份额,就必须在枇杷品质和栽培环境上同时符合相应的要求.

关键词：枇杷基地建设栽培技术云霄县漳江实业有限公司建园

福州3个鲜食橄榄品种(系)的果实品质特征与香气组分分析

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食品科学 2020年第6期41卷 231-238页

作者：赖瑞联冯新陈瑾陈义挺吴如健福建省农业科学院果树研究所福建福州350013

研究鲜食橄榄的果实品质特征和香气组分,为橄榄鲜食品质性状育种提供理论基础。以福建福州主栽的鲜食橄榄品种(系)‘灵峰’、‘闽清2号’和‘清榄1号’为材料,对其果实品质指标和香气组分进行研究和综合评价。结果发现,鲜食橄榄品种(系... 详细信息

研究鲜食橄榄的果实品质特征和香气组分,为橄榄鲜食品质性状育种提供理论基础。以福建福州主栽的鲜食橄榄品种(系)‘灵峰’、‘闽清2号’和‘清榄1号’为材料,对其果实品质指标和香气组分进行研究和综合评价。结果发现,鲜食橄榄品种(系)间的果实总酸、总糖、总多酚、粗多糖、可溶性固形物等12项品质指标存在显著差异,基于固酸比和糖酸比评价其品质优劣排序依次为‘灵峰’>‘闽清2号’>‘清榄1号’;基于品质指标利用主成分分析法共提取2个主成分,建立的鲜食橄榄果实品质特征评价模型为f品质=0.686f1+0.314f2,品质特征综合排名由高到低依次为‘灵峰’>‘清榄1号’>‘闽清2号’。基于香气组分分析从鲜食橄榄果实中检测出35种香气物质,以烯烃类为主,还有少量醇类、酚类、酯类和其他化合物,且所有品种(系)均包含较高含量的石竹烯;其香气物质可归为2类主成分,综合评价模型为F香气=0.597F1+0.403F2,香气风味优劣综合排序为‘清榄1号’>‘闽清2号’>‘灵峰’。根据系统聚类结果,‘灵峰’与‘清榄1号’的品质特征较为一致,而‘闽清2号’与‘清榄1号’的香气物质组分相似度更高。研究结果表明,鲜食橄榄品种(系)间的果实品质特征和香气组分差异较大,其鲜食品质的准确评价需充分结合模型评估和感官评定;此外,烯烃类化合物是构成橄榄香气组分骨架的主要物质,其中石竹烯可能是鲜食橄榄特征香气的重要成分之一。研究结果为鲜食橄榄产业的发展提供科学参考。

关键词：橄榄福州鲜食品种(系) 品质特征香气组分

橄榄查尔酮异构酶基因CHI的密码子偏好模式

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应用与环境生物学报 2017年第5期23卷 945-951页

作者：赖瑞联冯新陈瑾韦晓霞陈义挺吴如健福建省农业科学院果树研究所福州350013

黄酮类化合物是橄榄[Canarium album(Lour.)Raeusch]的重要活性成分,而查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)是黄酮合成的关键酶类之一,了解橄榄查尔酮异构酶基因CHI的密码子偏好模式可为其功能和分子进化研究提供科学依据.采用Codon W... 详细信息

黄酮类化合物是橄榄[Canarium album(Lour.)Raeusch]的重要活性成分,而查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)是黄酮合成的关键酶类之一,了解橄榄查尔酮异构酶基因CHI的密码子偏好模式可为其功能和分子进化研究提供科学依据.采用Codon W和EMBOSS分析橄榄CHI的密码子偏好性参数,并通过有效密码子数(Effective number of codon,ENc)绘图、中性绘图和偏倚分析探讨单双子叶植物CHI密码子偏好性形成的可能因素,同时分别采用SPSS19.0和MEGA5.2基于密码子偏好性和序列相似性进行聚类分析.结果显示:橄榄CHI ENc值、G和C的含量(GC)以及密码子第3位上G和C含量(GC3s)分别为50.89、0.451和0.465,表明其密码子偏好性较弱,但倾向使用富含A和U,并以A或U结尾的密码子;单子叶植物CHI的密码子偏好性普遍高于双子叶植物,基于密码子偏好性和核酸序列相似性均能将单双子叶植物进行较准确的归类;密码子碱基成分和相关性分析发现,物种间CHI密码子偏好性受编码区长度的影响较小,而与碱基的组成密切相关;此外,橄榄CHI与模式生物拟南芥、烟草、大肠杆菌和酵母菌基因组均存在较大的密码子偏好性差异.本研究表明突变压力是单双子叶植物间CHI严格的密码子偏好规律形成的主要作用力,而橄榄CHI外源表达和遗传转化时需要根据宿主基因组偏好模式进行密码子优化和改造.

关键词：橄榄黄酮类化合物查尔酮异构酶密码子偏好模式

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荔枝大小年结果成因及对策浅议

福建果树 1998年第2期 52-54页

作者：陈义挺福建省农业科学院果树研究所 350013

荔枝大小年、隔年、甚至隔数年结果现象十分普遍，究其原因：一是某些品种开花期短，雌雄花不同期，导致结果不稳定；二是温度、水分、光照三个气象要素不适宜花芽分化要求，出现“冲消”或花芽受冻等，以致出现少花或无花现象；三是管... 详细信息

荔枝大小年、隔年、甚至隔数年结果现象十分普遍，究其原因：一是某些品种开花期短，雌雄花不同期，导致结果不稳定；二是温度、水分、光照三个气象要素不适宜花芽分化要求，出现“冲消”或花芽受冻等，以致出现少花或无花现象；三是管理粗放，肥水不足，引起营养生长与生殖生长不平衡。克服拉措施关键在于实施集约化、标准化栽培，包括培养及时萌发而又健壮的结果母校；严格控制冬梢生长；大年流花流果和小年壮花保果；实行配方优化施肥以及适时防治病虫害等，努力提高荔枝园整体管理水平。

关键词：荔枝大小年结果成因对策