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生物信息学和机器学习筛选银屑病中医证型特征基因

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四川大学学报（医学版） 2024年第2期55卷 337-345页

作者：刘学伟贾皇超王丽云王子雯许孟月李云飞王茸慧河南中医药大学郑州450046 河南中医药大学第一附属医院郑州450003 新疆医科大学乌鲁木齐830054

目的通过生物信息学和机器学习筛选寻常型银屑病(psoriasis vulgaris, PV)血热证(blood-heat syndrome,BHS)、血瘀证(blood stasis syndrome, BSS)及血燥证(blood-dryness syndrome, BDS)的重要特征基因,为不同中医证型PV的临床诊疗提供科学依据。方法从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)下载GSE192867数据集,利用limma包筛选患者与健康人群的PV、BHS、BSS及BDS差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),并进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。将PV、BHS、BSS及BDS筛选出的DEGs分别取交集,获取不同的特征基因。利用支持向量机(support vector machine, SVM)和随机森林(random forest, RF)两种算法中效能最优的方法对特征基因进行分析,将排序前5的基因作为重要特征基因,并利用pROC包绘制重要特征基因的受试者工作特征(receiver operating characteristic curve, ROC)曲线,计算曲线下面积(area under the curve, AUC),评价其诊断效能。结果筛选出与PV、BHS、BSS以及BDS相关的DEGs数量分别为7 699个、7 291个、7 654个和6 578个。KEGG富集分析主要集中在Janus激酶(Janus kinase,JAK)/信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription, STAT)、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate, cAMP)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK),以及细胞凋亡等通路。通过机器学习共筛选出13个重要特征基因,其中凝集素(malectin, MLEC)、TUB样蛋白3(TUB like protein 3, TULP3)、含SET域9(SET domain containing 9, SETD9)、核膜整合膜蛋白2(nuclear envelope integral membrane protein 2, NEMP2)和BTG抗增殖因子3(BTG anti-proliferation factor 3, BTG3)是BHS的重要特征基因,双特异性磷酸酶15(dual specificity phosphatase 15, DUSP15)、C1q与肿瘤坏死因子相关蛋白7(C1q and tumor necrosis factor related protein7, C1QTNF7)、溶质载体家族12成员5(solute carrier family 12 member 5, SLC12A5)、含三联基元63(tripartite motif containing 63, TRIM63)和泛素相关蛋白样因子1(ubiquitin associated protein 1 like, UBAP1L)是BSS的重要特征基因,重组小鼠蛋白(recombinant mouse protein, RRNAD1)、GTP酶激活蛋白ASAP3蛋白(ASAP3 protein, ASAP3)和人肌间蛋白2(human myomesin 2, MYOM2)是BDS的重要特征基因,且PV不同证型的特征基因ROC曲线均表现出较高诊断效能。结论 PV不同证型的特征基因存在显著差异,其可能成为潜在的诊断PV中医证型的生物标志物。

关键词：银屑病中医证型生物信息学机器学习生物标志物

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基于“三因制宜”探讨银屑病的中医药防治

中华中医药杂志 2024年第6期39卷 2812-2815页

作者：刘学伟贾皇超王丽云王子雯李云飞王茸慧河南中医药大学郑州450046 河南中医药大学第一附属医院郑州450003

银屑病病程长、易复发,与遗传、体质、情志、季节、外感、地域等均有一定关系。“三因制宜”即因时、因地、因人制宜,彰显中医个体化诊疗,体现中医实践个体化特点,是中医基础理论的重要组成部分。笔者根据“三因制宜”理论,从“时令论... 详细信息

银屑病病程长、易复发,与遗传、体质、情志、季节、外感、地域等均有一定关系。“三因制宜”即因时、因地、因人制宜,彰显中医个体化诊疗,体现中医实践个体化特点,是中医基础理论的重要组成部分。笔者根据“三因制宜”理论,从“时令论”“地域论”“体质论”3个角度开展研究,分析银屑病中医药防治的理论根据,为临床诊治提供思路。

关键词：银屑病三因制宜时令论地域论体质论

经典名方生脉散的古籍文献考证与现代临床应用

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中国实验方剂学杂志 2024年

作者：吕承启牛蔚露刘学伟贾皇超王丽云杨孟洁孙玉杰石成玉乔敬康河南中医药大学第一附属医院河南中医药大学第一临床医学院

生脉散被誉为“补气之圣药”，又有生脉汤、《千金》生脉散、《医录》生脉散、人参生脉散、生脉饮、生脉散《辨惑论》、参麦五味饮、参麦散等8个别名。最早出自金代医家张元素的《医学启源》，由人参、麦冬、五味子3味药物组成，具有益... 详细信息

生脉散被誉为“补气之圣药”，又有生脉汤、《千金》生脉散、《医录》生脉散、人参生脉散、生脉饮、生脉散《辨惑论》、参麦五味饮、参麦散等8个别名。最早出自金代医家张元素的《医学启源》，由人参、麦冬、五味子3味药物组成，具有益气生津、润肺止渴的功效，善治气阴两虚之证。该研究运用文献计量学的方法，从方名及出处、处方组成衍变及方义、剂量衍变、药物基原与炮制、煎服方法、临床应用等方面对生脉散进行系统的考证。关于药物的基原，3味组成药物的基原均与2020版《中华人民共和国药典》一致。《医学启源》中未记载药物剂量及煎服方法，所考证的剂量与煎服方法均出自与之成书时间最近的《丹溪心法附余》，经古今剂量换算后确定各药剂量如下：人参3.73 g，麦冬7.46 g，五味子2.98 g。煎服方法：将药物锉成粒径为2～4.75 mm的颗粒，加水200 mL，煎至140 mL，于饭前空腹服用，亦或不拘时服，每日2次。现代研究涉及心血管系统、呼吸系统、内分泌系统等科室为主的200余种疾病，多以气阴两虚等为辨证要点。通过对生脉散的古籍文献考证，以期能为其更深入地研究和开发提供文献学依据。

关键词：生脉散生脉汤生脉饮人参生脉散文献考证基原剂量炮制煎服法临床应用

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论艾滋病咳嗽

中华中医药杂志 2022年第6期37卷 3087-3091页

作者：贾皇超姜琦李鹏宇许前磊郭会军闫永彬河南中医药大学郑州450046 河南中医药大学第一附属医院郑州450000 河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室郑州450008

艾滋病咳嗽是艾滋病患者最常见的机会性感染之一,具有反复发作、病程较长、迁延难愈的特点,严重影响着患者的生活质量。前期临床实践显示,中医药在艾滋病咳嗽的防治方面有着较大的应用前景。文章通过对艾滋病咳嗽的特点及发病机制进行分... 详细信息

艾滋病咳嗽是艾滋病患者最常见的机会性感染之一,具有反复发作、病程较长、迁延难愈的特点,严重影响着患者的生活质量。前期临床实践显示,中医药在艾滋病咳嗽的防治方面有着较大的应用前景。文章通过对艾滋病咳嗽的特点及发病机制进行分析,结合课题组前期的研究基础,验证了参苏饮加减治疗艾滋病咳嗽风寒袭肺证和千金苇茎汤合麻杏石甘汤加减治疗艾滋病咳嗽痰热壅肺证的临床有效性,为中医药对艾滋病咳嗽的防治提供参考。

关键词：艾滋病咳嗽风寒袭肺证痰热壅肺证中医药

中老年人类免疫缺陷病毒和获得性免疫缺陷综合征患者血脂异常的相关危险因素分析

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中华老年心脑血管病杂志 2022年第5期24卷 456-459页

作者：贾皇超姜琦金艳涛许前磊李鹏宇郭会军河南中医药大学郑州450046 河南中医药大学第一附属医院艾研中心科

目的探究中老年人类免疫缺陷病毒(HIV)/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者血脂异常及其影响因素,为制定合理的干预措施提供科学依据。方法选择2020年6~7月河南省某地区中老年HIV/AIDS患者239例,进行问卷调查,收集患者信息资料,包括一般... 详细信息

目的探究中老年人类免疫缺陷病毒(HIV)/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者血脂异常及其影响因素,为制定合理的干预措施提供科学依据。方法选择2020年6~7月河南省某地区中老年HIV/AIDS患者239例,进行问卷调查,收集患者信息资料,包括一般人口学特征、HIV/AIDS体格检查相关特征及实验室检查指标。采用多因素logistic回归分析血脂异常的危险因素。结果中老年HIV/AIDS患者中,血脂异常130例(54.4%)。其中高TC血症、高TG血症、高LDL-C血症、低HDL-C血症和混合型高脂血症患病率分别为10.5%、44.8%、5.4%、28.5%、28.0%。多因素logistic回归分析显示,抗病毒二线治疗方案、高尿酸血症、CD4/CD8≥1及超重或肥胖是中老年HIV/AIDS患者血脂异常的危险因素(OR=4.999,95%CI:2.688~9.294,P=0.001;OR=3.458,95%CI:1.140~10.487,P=0.028;OR=2.715,95%CI:1.355~5.443,P=0.005;OR=7.372,95%CI:1.404~38.713,P=0.018)。结论中老年HIV/AIDS患者血脂异常发病率较高,抗病毒二线治疗方案、高尿酸血症、CD4/CD8、体质量指数是影响中老年HIV/AIDS患者血脂异常的主要影响因素。

关键词： HIV 获得性免疫缺陷综合征血脂异常高尿酸血症肥胖症

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艾滋病咳嗽中医诊疗方案的临床验证

中国中医基础医学杂志 2022年第5期28卷 752-756,761页

作者：贾皇超许前磊金艳涛李鹏宇姜琦郭会军河南中医药大学郑州450006 河南中医药大学第一附属医院郑州450008

目的:对艾滋病咳嗽风寒袭肺证和痰热壅肺证的中医诊疗方案进行临床验证。方法:采用随机、对照、双盲的前瞻性随机对照试验,选取风寒袭肺证和痰热壅肺证各128例。风寒袭肺证治疗组选用参苏饮加减颗粒剂,痰热壅肺证治疗组选用苇茎汤合麻... 详细信息

目的:对艾滋病咳嗽风寒袭肺证和痰热壅肺证的中医诊疗方案进行临床验证。方法:采用随机、对照、双盲的前瞻性随机对照试验,选取风寒袭肺证和痰热壅肺证各128例。风寒袭肺证治疗组选用参苏饮加减颗粒剂,痰热壅肺证治疗组选用苇茎汤合麻杏石甘汤加减颗粒剂,对照组使用安慰剂疗程2周,观察其治疗前后症状、体征、中医证候改善、24 h咳嗽症状计分、莱塞斯特咳嗽生命质量问卷、胸部X线等疗效指标及血常规、尿常规、肝肾功等安全性指标。结果:风寒袭肺证和痰热壅肺证2组在24 h咳嗽积分方面、中医证候方面及莱赛斯特咳嗽生命质量问卷方面治疗组疗效均优于对照组,差异有统计学意义(P0.05)。结论:艾滋病咳嗽中医诊疗方案安全有效,值得临床推广。

关键词：艾滋病咳嗽临床验证麻杏石甘汤参苏饮

基于“火郁发之”浅析防风通圣散在皮肤病治疗中的应用

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中医学报 2024年

作者：李萌月刘学伟贾皇超耿菁珂王顺喜河南中医药大学河南中医药大学第一附属医院

防风通圣散是刘完素基于“火郁”学说所创立的方剂，被称为“表里、气血、三焦通治之剂”，可治疗火郁证之皮肤病。本文基于“火郁发之”的理论，浅析皮肤病病因病机与“火郁”的关系及防风通圣散治疗皮肤病火郁证的证治机理，结合古籍... 详细信息

防风通圣散是刘完素基于“火郁”学说所创立的方剂，被称为“表里、气血、三焦通治之剂”，可治疗火郁证之皮肤病。本文基于“火郁发之”的理论，浅析皮肤病病因病机与“火郁”的关系及防风通圣散治疗皮肤病火郁证的证治机理，结合古籍文献记载及现代医家临床经验，分别论述防风通圣散在变态反应性皮肤病、细菌性皮肤病、红斑鳞屑性皮肤病、真菌性皮肤病、皮肤附属器疾病等皮肤病中的具体应用，以期为防风通圣散在皮肤病的临床应用中提供更多思路。

关键词：防风通圣散火郁发之皮肤病

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艾滋病咳嗽的中医药研究进展

中医研究 2019年第1期32卷 70-74页

作者：贾皇超李鹏宇武悦姜琦朱柯颖郭会军河南中医药大学第一附属医院河南郑州450000

咳嗽是艾滋病患者主要临床表现之一,发病率很高。中医学认为咳嗽的主要病变在肺,与肝、心、脾、肾也有很大的关系;病理因素有风邪、燥邪、湿邪、瘀等多种,病机错综复杂。艾滋病咳嗽病因病机较单纯的艾滋病和单纯的咳嗽都更为复杂。虽然... 详细信息

咳嗽是艾滋病患者主要临床表现之一,发病率很高。中医学认为咳嗽的主要病变在肺,与肝、心、脾、肾也有很大的关系;病理因素有风邪、燥邪、湿邪、瘀等多种,病机错综复杂。艾滋病咳嗽病因病机较单纯的艾滋病和单纯的咳嗽都更为复杂。虽然目前没有统一的认识,但多数医家都认同艾滋病咳嗽是患者在被艾滋病疫毒侵入机体损伤元气的同时又受到咳嗽病因的影响,使得艾滋病咳嗽病程较长,难以治愈。中医药在扶正祛邪方面拥有独特的优势,对于艾滋病本身及其咳嗽的治疗都有着显著的效果,且安全性好,尤其是在早期防治方面有着不可替代的作用。

关键词：咳嗽,艾滋病/病因病机咳嗽,艾滋病/中医药疗法综述发展趋势

多种倾向性评分匹配方法评价中医药对艾滋病患者CD4^(+)T细胞的长期影响

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中国中西医结合杂志 2024年第5期44卷 548-553页

作者：金艳涛王东利贾皇超袁君马秀霞许前磊郭会军河南中医药大学第一附属医院艾滋病临床研究中心郑州450000 河南中医药大学第一临床医学院郑州450000

目的探讨在观察性临床研究中最佳的控制研究对象基线信息均衡性的倾向性评分(PS)匹配(PSM)方法,并运用最佳方法评价中医药治疗对艾滋病患者CD4^(+)T细胞的长期影响。方法以既往艾滋病治疗数据为信息来源,收集河南省2006年参与“中医... 详细信息

目的探讨在观察性临床研究中最佳的控制研究对象基线信息均衡性的倾向性评分(PS)匹配(PSM)方法,并运用最佳方法评价中医药治疗对艾滋病患者CD4^(+)T细胞的长期影响。方法以既往艾滋病治疗数据为信息来源,收集河南省2006年参与“中医药治疗艾滋病试点项目”(中医项目)地区的艾滋病患者信息,对其CD4^(+)T细胞计数进行12年的随访。按是否参与中医项目分为中医组和非中医组。分别采用一般线性模型(Logistic回归)法、一般化加速建模(GBM)和神经网络模型(NNET)估计PS值;采用“最邻近匹配”(NNM)并设定“卡钳值”。“卡钳值”分别设定为0.01、0.2倍的两组PS值logit合并方差(σ),和0.1倍σ及“最优匹配”(OM),共12种PSM方法进行1:1无放回匹配。使用两组协变量的均值标准化差异评价PSM后两组患者基线信息的均衡性,并绘制匹配后中医组与非中医组CD4^(+)T细胞计数变化趋势。所有分析均采用R 4.1.1软件包。结果共纳入2 783例艾滋病患者,其中中医组544例,非中医组2 239例。Log 0.01 NNM,Log 0.2σNNM模型匹配效果最好。使用Log 0.01 NNM模型数据分析中医治疗对艾滋病患者CD4^(+)T细胞影响的结果显示:在治疗初期两组艾滋病患者CD4^(+)T细胞均逐年升高,第6年CD4^(+)T细胞计数达到400个/μL左右时,增势消失。第1年中医组CD4^(+)T细胞计数均值高于非中医组(P0.05)。结论使用Logistic回归计算PS值并用NNM匹配可以更好的控制观察性临床研究中的研究对象基线信息的均衡性;中医药在艾滋病患者CD4^(+)T细胞<350个/μL时,可以快速提升CD4^(+)T细胞计数。

关键词：艾滋病中医学倾向性评分匹配 CD4~+T细胞计数队列研究