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临床肿瘤学杂志 2010年第11期15卷 961-965页

作者：宗飒张绪超苏健谢至陈世良黄迎陈志红陈剑光杨学宁唐红艳严红虹吴一龙广东省人民医院医学研究中心广东省肺癌研究所广东省医学科学院广州510080

目的检测早期非小细胞肺癌（NSCLC）患者癌组织与癌旁组织hsa-mir-34b（mir-34b）基因启动子甲基化水平的差异.方法采用重亚硫酸盐还原技术、降落巢式PCR扩增27例Ⅰ期NSCLC患者癌组织和癌旁组织配对样本中mir-34b基因启动子区DNA,克... 详细信息

目的检测早期非小细胞肺癌（NSCLC）患者癌组织与癌旁组织hsa-mir-34b（mir-34b）基因启动子甲基化水平的差异.方法采用重亚硫酸盐还原技术、降落巢式PCR扩增27例Ⅰ期NSCLC患者癌组织和癌旁组织配对样本中mir-34b基因启动子区DNA,克隆测序法分析甲基化谱变异,并与临床病理特征进行关联分析.结果癌组织mir-34b基因启动子CpG岛整体甲基化水平为9.7%（6.8%～22.3%）,而癌旁组织为8.5%（5.3%～11.0%）,癌组织甲基化水平高于癌旁组织（Z=2.355, P=0.019）.当前吸烟患者mir-34b基因启动子甲基化发生率高于以往吸烟及不吸烟者.癌组织mir-34b基因启动子甲基化水平与患者性别、年龄、PS评分无关.结论早期NSCLC患者癌组织mir-34b基因启动子甲基化水平升高,吸烟可能与mir-34b基因启动子甲基化的发生有关.mir-34b基因甲基化与早期肿瘤发生相关的机制值得进一步研究.

关键词： Mir-34b DNA甲基化肺癌

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高分辨熔解曲线法检测非小细胞肺癌p53基因的突变

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中国肺癌杂志 2011年第10期14卷 767-773页

作者：陈志红安社娟谢至严红虹陈剑光苏健张绪超牛飞玉郭伟浜吴一龙广东省人民医院医学研究中心广东省医学科学院广东省肺癌研究所广州510080

背景与目的 p53基因与人类多种肿瘤相关,突变型具有致癌作用,主要分布在外显子5-8。本研究旨在建立高分辨熔解曲线(high resolution melting,HRM)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者p53基因突变的方法,探讨p53基... 详细信息

背景与目的 p53基因与人类多种肿瘤相关,突变型具有致癌作用,主要分布在外显子5-8。本研究旨在建立高分辨熔解曲线(high resolution melting,HRM)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者p53基因突变的方法,探讨p53基因突变的特点及其在NSCLC发生发展中的演变规律。方法采用HRM法检测264例NSCLC患者肿瘤组织和54例癌旁肺组织p53基因外显子5-8的突变,突变样品进一步使用PCR产物直接测序法分析确定突变类型;HRM法检测阳性而PCR产物直接测序法检测阴性的样品,进一步进行亚克隆测序证实。结果 54例对照未发现突变。264例肿瘤组织中,HRM法检出p53基因突变104例,102例得到PCR产物直接测序法证实,突变率为39.4%;95例为点突变,7例为碱基插入和缺失导致的移码突变。p53外显子5-8的突变率分别为11.7%、8%、12.5%和10.6%,差异无统计学意义(P=0.35)。p53基因突变与性别有关,与其它临床病理特征无关。结论 HRM法筛选p53基因突变样品,具有操作简便、快速、敏感、单管避免污染等优点,值得推广。p53基因的突变特点提示,p53基因突变是自发性突变,可能是DNA合成和修复过程中的随机错误所致。

关键词： p53基因突变测序

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非小细胞肺癌基因突变谱检测

非小细胞肺癌基因突变谱检测

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第13届全国肺癌学术大会

作者：苏健张绪超钟文昭安社娟黄迎陈世良严红虹陈志红郭伟浜谢至黄小穗吴一龙广东省肺癌研究所广东省人民医院医学研究中心广东省医学科学院

＜正＞目的:建立SNapshot平台检测非小细胞肺癌基因突变。方法:将2011年11月11日至2011年12月31日在广东省人医院住院的肺癌患者手术标本或穿刺活检标本110例,其中手术标本48（42.5%）例、穿刺（纤支镜）标本62（54.9%）例、细胞标本3（... 详细信息

＜正＞目的:建立SNapshot平台检测非小细胞肺癌基因突变。方法:将2011年11月11日至2011年12月31日在广东省人医院住院的肺癌患者手术标本或穿刺活检标本110例,其中手术标本48（42.5%）例、穿刺（纤支镜）标本62（54.9%）例、细胞标本3（2.7%）例。用SNaPshot技术检测患者标本及不同浓度的细胞系DNA样本中EGFR、KRAS、PIK3CA、NRAS、BRAF、MEK1、PTEN、HER2基因的突变状态,同时,用直接测序法检测患者样本中EGFR、KRAS及NRAS的突变状态。SNaPshot平台可同时检测上述基因36个热点突变及3个框内缺失/插入突变。【结果】SNapshot平台灵敏度为100%,特异度为98.4%,阳性预测值为97.9%,阴性预测值为100%。用细胞系作DNA作上样量测试,发现DNA上样量低至2ng/ul仍能用SNapshot平台检测突变。SNapshot平台与直接测序法在手术标本、穿

关键词：非小细胞肺癌病理机制基因突变直接测序法

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