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不同地理种群克氏原螯虾形态差异及相关分子标记研究

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江苏农业科学 2024年第16期52卷 203-213页

作者：高杨田灿姜京京杨楠唐永凯张成锋陈焕根李冰陈铭卢泽宇苏胜彦朱健南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部稻鱼综合种养生态重点实验室江苏无锡214081 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 江苏省渔业技术推广中心江苏南京210036

为了解我国克氏原螯虾不同地理群体的种属差异,加快克氏原螯虾的育种进程,筛选与目标性状紧密相关位点的基因型进行分子辅助选育,选取安徽巢湖、江西鄱阳湖、山东微山湖、湖南洞庭湖、湖北洪湖、江苏洪泽湖6个地区的克氏原螯虾样品,对... 详细信息

为了解我国克氏原螯虾不同地理群体的种属差异,加快克氏原螯虾的育种进程,筛选与目标性状紧密相关位点的基因型进行分子辅助选育,选取安徽巢湖、江西鄱阳湖、山东微山湖、湖南洞庭湖、湖北洪湖、江苏洪泽湖6个地区的克氏原螯虾样品,对全长、体长、体重、头胸甲长、头胸甲宽、腹部长、腹部宽、尾扇长8个形态学指标进行测量,以2个形态参数比进行多元分析;并根据标记位点鉴定出的个体基因型,与测量到的形态指标的差异进行生长性状的关联分析,分析出克氏原螯虾重要的经济性状肌肉重、腹部宽、头胸甲宽等和与之相关的标记位点。聚类分析表明,6个地区的克氏原螯虾分为2个分支,第1分支为巢湖群体和洪湖群体;鄱阳湖群体、微山湖群体、洞庭湖群体和洪泽湖群体构成第2分支。主成分分析结果显示,雌虾的4个主成分累计贡献率达85.10%,其中,第1和第2主成分分别是腹长因子和腹宽因子;雄虾的4个主成分累计贡献率达86.31%,第1和第2主成分分别为头胸甲和腹部因子。判别分析中,雌性综合判别率为82.16%,雄虾为83.28%,判别率较高。关联分析表明,14对分子标记的连锁不平衡共有105对SSR位点组合,满足P<0.01的条件,14对SSR引物在168份克氏原螯虾材料中存在连锁不平衡,可与生长性状进行关联分析。采用一般线性模型对克氏原螯虾种质的6个表型性状和2个质量性状同SSR位点进行关联分析,在P<0.01的阈值条件下,存在1组引物关联多个性状的情况,共检测到30组引物对6个表型性状和2个质量性状呈极显著关联状态。由此可以丰富克氏原螯虾群体关联位点的筛选,并在一定程度上为克氏原螯虾种质资源的保护和亲本选育工作提供支持。

关键词：克氏原螯虾形态差异微卫星标记关联分析

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4个线粒体基因在鲤所属国家种质鉴定中的应用及效果评价

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2017年第1期38卷 45-51页

作者：苏胜彦董在杰朱文彬中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

近年来,mtDNA条形码技术已广泛应用于鱼类种质鉴定研究。为探讨该技术在鲤种质鉴定方面应用的可行性及如何有效应用于地域种群等鉴定分析,从NCBI网站(http://***/)搜集鲤COⅠ、COⅡ、Cytb和D-loop4个mtDNA序列,并尝试基于DNA条形码技术... 详细信息

近年来,mtDNA条形码技术已广泛应用于鱼类种质鉴定研究。为探讨该技术在鲤种质鉴定方面应用的可行性及如何有效应用于地域种群等鉴定分析,从NCBI网站(http://***/)搜集鲤COⅠ、COⅡ、Cytb和D-loop4个mtDNA序列,并尝试基于DNA条形码技术来进行鲤所属国家的鉴定分析。结果表明:Cytb相对其他3个线粒体序列存在较大的DNA条形码间隙,COⅡ基因最佳匹配的准确率最高(准确率82.97%),基于4个mtDNA序列的聚类分析表明鲤所属国家按照临近区域聚类。综合条形码间隙及假阳性率和假阴性率的评价,研究认为,相比其他3个mtDNA序列,Cytb基因用于鉴定鲤所属国家更具优势,但其鉴定效率仍不理想。综上所述,mtDNA序列用于鉴定鲤不同地域的技术依然需要改进,以降低这一技术的假阳性率和假阴性率。

关键词：鲤亚种 mtDNA序列鲤所属国家 DNA条形码间隙

富集优势基因型的后备亲本筛选以及相关分子标记的遗传效应分析

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水生生物学报 2017年第1期41卷 79-85页

作者：张成锋苏胜彦朱健石连玉中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室无锡214081 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室哈尔滨150070

选取黄河鲤新品系亲本和子代共450尾,5对微卫星引物和4个基因区段扩增引物开展基因型检测,并检测它们与体重的关联性以及分析相应的遗传效应。结果显示:Koi42和4个SNPs位点对体重有显著的影响,获得具有超过富集2个优势基因型的候选亲本... 详细信息

选取黄河鲤新品系亲本和子代共450尾,5对微卫星引物和4个基因区段扩增引物开展基因型检测,并检测它们与体重的关联性以及分析相应的遗传效应。结果显示:Koi42和4个SNPs位点对体重有显著的影响,获得具有超过富集2个优势基因型的候选亲本共13尾,富集优势分子标记基因型的候选亲本生长性能优势明显。通过多元逐步回归分析,利用AIC最佳模型筛选到COⅠ626、D-Loop253和Koi42共3个位点,发现Koi42贡献率较大,经Fisher精确性检验,发现其与性别存在关联,其加性效应接近显著水平(P<0.05)。检测的多个上位效应组分中,仅有D-Loop253和Koi42的加性效应间的互作达到显著水平。对遗传方差组分进行剖分发现,加性方差占11.4%,两个位点的加性效应构成的上位效应占到77.5%,因此这3个分子标记对体重的影响主要以上位效应为主,而且是两两加性效应的占比较大,可以推断出D-Loop 253和Koi42两个分子标记的上位效应起主要作用。综上所述结果提示Koi42及与其有互作的D-Loop253可用于黄河鲤新品系的标记辅助选择,可以开展多个分子标记的富集选择。

关键词：黄河鲤新品系基因型体重关联分析上位效应

鲤改良品系与体质量、体长性状相关的TRAP标记筛选

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中国水产科学 2011年第4期18卷 801-808页

作者：董在杰曲疆奇袁新华苏胜彦谢庄南京农业大学动物科技学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室南京农业大学无锡渔业学院

应用TRAP标记对一个鲤(Cyprinus carpio)改良品系72个个体进行扩增,采用其中25个多态性较好引物组合用于该群体遗传多样性分析。运用卡方检验分析25对引物在体质量差异显著的2组鱼中频率差异显著的位点,初步筛选出与体质量和体长性状相... 详细信息

应用TRAP标记对一个鲤(Cyprinus carpio)改良品系72个个体进行扩增,采用其中25个多态性较好引物组合用于该群体遗传多样性分析。运用卡方检验分析25对引物在体质量差异显著的2组鱼中频率差异显著的位点,初步筛选出与体质量和体长性状相关的TRAP标记。将初步筛选的TRAP标记用于随机群体132个个体进行位点性状间的关联分析。结果表明,25个TRAP分子标记共扩增出353个位点,其中多态性位点230个,平均多态性比率65%,平均多态性信息含量为0.28,Nei’s遗传多样性指数平均值为0.219,Shannon信息指数平均值为0.329,表明该群体遗传多样性较为丰富。在初步筛选出的3个TRAP位点(gh1Trap04–140、4rTrap04–308、igf4Ga5–135)中,4rTrap04–308与体质量、体长呈极显著相关(P<0.01)。本研究利用TRAP这一新型分子标记对1个鲤改良群体进行遗传分析,并寻找出1个可能与鲤体质量,体长性状相关的功能基因位点,旨在为鲤体质量、体长性状的QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础。

关键词：鲤 TRAP标记遗传多样性体质量体长关联分析

鲤IGF2a基因内含子3的单核苷酸多态性与福瑞鲤生长性状的相关性

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2014年第5期40卷 489-494页

作者：苏胜彦董在杰朱文彬袁新华中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 南京农业大学动物科技学院南京210095

为了解鲤IGF2a基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与福瑞鲤(FFRC strain carp)生长性状的相关性,以福瑞鲤为实验材料,设计用于分析IGF2a基因内含子3的SNP引物,分析其SNP,再结合福瑞鲤的生长性状,探讨两者之间的相... 详细信息

为了解鲤IGF2a基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与福瑞鲤(FFRC strain carp)生长性状的相关性,以福瑞鲤为实验材料,设计用于分析IGF2a基因内含子3的SNP引物,分析其SNP,再结合福瑞鲤的生长性状,探讨两者之间的相关性.研究发现:杂合子A/G基因型使福瑞鲤体质量、体长2个生长指标减小,体质量的降低幅度高于体长,但是两者差异均无统计学意义(P>0.05);而杂合子A/G基因型和纯合子G/G基因型的体长与体质量的比值差异有统计学意义(P<0.05).这表明IGF2a基因可影响福瑞鲤的体质量、体长,且其SNP可能与福瑞鲤内脏质量增加有关.同时,研究发现这个多态位点与性别在对鲤的生长性能的影响上存在互作.这些结果将为基于内含子3的IGF2a基因分子辅助育种奠定基础.

关键词：福瑞鲤类胰岛素生长因子 2a基因多态性生长性状相关性

不同放养规格和放养密度下吉富罗非鱼体长生长模型研究

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江苏农业科学 2017年第22期45卷 170-175页

作者：陈倩苏胜彦刘思辰叶伟朱伟凡袁新华南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

为研究不同放养规格和养殖密度下吉富罗非鱼的体长生长规律,采用von Bertalanffy、Gompertz、Logistic、Brody 4种生长模型对吉富罗非鱼体长的生长进行拟合,使用R-Studio软件自行编程求出模型中各生长参数,以AIC统计量作为确定吉富罗非... 详细信息

为研究不同放养规格和养殖密度下吉富罗非鱼的体长生长规律,采用von Bertalanffy、Gompertz、Logistic、Brody 4种生长模型对吉富罗非鱼体长的生长进行拟合,使用R-Studio软件自行编程求出模型中各生长参数,以AIC统计量作为确定吉富罗非鱼体长最优生长模型的准则。结果表明,4种模型均能很好地模拟吉富罗非鱼生长曲线,其中平均体长为0.8 cm(SL1)的试验组以Gompertz模型为最佳,平均体长为(2.8±0.14)cm(SL2)的试验组以Logistic模型为最佳。体长生长瞬时生长速度曲线均呈先上升再下降的趋势,SL2试验组比SL1试验组更具养殖优势,养殖密度为15尾/m^2(D1)的个体生长状况优于养殖密度为30尾/m^2(D2)和60尾/m^2(D3)的个体生长状况。研究结果可为吉富罗非鱼的育种研究、规模化养殖及养殖管理模式优化提供理论依据。

关键词：吉富品系尼罗罗非鱼生长模型 AIC准则体长规格密度

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福瑞鲤选育家系不同养殖阶段的生长差异分析

南方水产科学 2017年第1期13卷 43-49页

作者：王兰梅朱文彬董在杰苏胜彦傅建军阎明信刘念中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214128 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

为了进一步观察最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction,BLUP)家系选育方法在福瑞鲤(Cyprinus carpio)继代选育中的潜力,该研究测量了继续选育第2代家系群体不同养殖阶段的体质量和形态性状。结果表明,生长快速家系群福瑞鲤... 详细信息

为了进一步观察最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction,BLUP)家系选育方法在福瑞鲤(Cyprinus carpio)继代选育中的潜力,该研究测量了继续选育第2代家系群体不同养殖阶段的体质量和形态性状。结果表明,生长快速家系群福瑞鲤早期(4月龄)生长速度较慢,到后期则生长加快,其体质量增长表现出明显的优势。在体型方面,随着养殖时间的延长,福瑞鲤各选育家系群的体厚/体长增加,体高/体长降低,逐渐呈现其体型修长的特征;同时2个越冬期的成活率均达到了94%以上。结果表明通过BLUP家系选育对福瑞鲤长期选育是可行的。在此基础上,通过主成分分析发现,福瑞鲤生长性状第一主成分是体质量;对不同生长时期的体质量进行相关性分析,发现9月龄、14月龄、21月龄鱼的体质量与24月龄的相关系数均达到极显著水平(P<0.01),分别为0.851、0.897和0.957。因此,在福瑞鲤继续选育过程中,进行早期个体选择值得尝试。

关键词：福瑞鲤家系选育最佳线性无偏预测生长体型越冬

IGF2b基因注射鲤鱼越冬后补偿生长特点分析

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2015年第3期36卷 26-30页

作者：张亚楠苏胜彦袁新华南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

为了解注射含IGF2b基因的慢病毒载体的鲤鱼越冬后补偿生长的特点,通过建立补偿指数假设、YN效应假设和补偿水平设置3个假设,探讨每条注射10、20、40μL IGF2b基因慢病毒载体的鲤鱼越冬后是否存在补偿生长、补偿生长程度大小以及补偿生... 详细信息

为了解注射含IGF2b基因的慢病毒载体的鲤鱼越冬后补偿生长的特点,通过建立补偿指数假设、YN效应假设和补偿水平设置3个假设,探讨每条注射10、20、40μL IGF2b基因慢病毒载体的鲤鱼越冬后是否存在补偿生长、补偿生长程度大小以及补偿生长对体重的影响。结果表明:在特定水平下,补偿的有无对收获体重和增重影响明显,且从最高补偿水平的角度发现,随着补偿程度的提高,收获体重和增重明显增加,20μL注射组从标记到收获期间增重最明显,在体长、体厚、体高3个性状上均表现出补偿性。试验为研究鲤鱼补偿生长的生理学特性及应用提供了依据。

关键词：鲤鱼 IGF2b基因慢病毒载体补偿指数假设 YN效应假设补偿水平

配合饲料和冰鱼对单体养殖中华绒螯蟹生长、性腺发育及其肌肉品质的影响

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水产学报 2021年第5期45卷 748-759页

作者：冯伟李辉唐永凯苏胜彦王美垚李建林俞菊华南京农业大学无锡渔业学院上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

为研究配合饲料和冰鱼对中华绒螯蟹的养殖性能和营养状况的影响,本实验通过连续采样分析了单体养殖中华绒螯蟹的生长性能、性腺发育和肌肉的营养成分,并进一步比较了终末体质量、增重率、特定增长率、成活率和蜕壳间隔。结果显示:(1)配... 详细信息

为研究配合饲料和冰鱼对中华绒螯蟹的养殖性能和营养状况的影响,本实验通过连续采样分析了单体养殖中华绒螯蟹的生长性能、性腺发育和肌肉的营养成分,并进一步比较了终末体质量、增重率、特定增长率、成活率和蜕壳间隔。结果显示:(1)配合饲料组的成活率极显著高于冰鱼组,而终末体质量、增重率、特定增长率和蜕壳间隔二组无显著差异;在不同蜕壳阶段,在体质量指标上,配合饲料组小于冰鱼组,其中第3次蜕壳后二组间差异显著;增重率在雌、雄蟹体间存在差异,其中雌蟹在第2次蜕壳后配合饲料组的增重率极显著小于冰鱼组,而雄蟹在第1次和第4次蜕壳后2个阶段配合饲料组的增重率极显著大于冰鱼组。(2)在配合饲料和冰鱼2组投喂下肝胰腺指数分别为3.59%和4.45%,性腺指数二者分别为3.20%和2.25%,肝胰腺指数和性腺指数在二组投喂下无显著差异。(3)在肌肉氨基酸含量方面,氨基酸总量(∑TAA)、必需氨基酸总量(∑TEAA)和呈味氨基酸总量(∑FAA)配合饲料组显著小于冰鱼组;从单个氨基酸含量看,赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)含量配合饲料组显著小于冰鱼组,而脯氨酸(Pro)含量则是配合饲料组显著大于冰鱼组。(4)在肌肉脂肪酸含量方面,高度不饱和脂肪酸(∑HUFA)和DHA+EPA含量配合饲料组显著高于冰鱼组;从单个脂肪酸看,单不饱和脂肪酸(∑MUFA)中C16:1和C18:1n-9含量配合饲料组显著小于冰鱼组,而多不饱和脂肪酸(∑PUFA)中的ARA和DHA配合饲料组却显著高于冰鱼组。研究表明,在该单体养殖条件下,配合饲料组在中华绒螯蟹生长性能和肌肉品质上接近冰鱼组,而在性腺发育和成活率上则优于冰鱼组,配合饲料对中华绒螯蟹养殖业更具有发展优势。

关键词：中华绒螯蟹生长性能性腺发育肌肉品质单体养殖