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IGF_(2)BP_(1)调控lncRNA NEAT1在类风湿关节炎中的作用

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临床与病理杂志 2024年第3期44卷 354-362页

作者：肖剑伟蔡旭黄新民洪易炜颜真波陈新鹏深圳市福田区风湿病专科医院风湿免疫科广东深圳518000

目的:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种常见的全身性自身免疫疾病,可能导致关节变形和功能障碍。本研究旨在探索胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF_(2)BP_(1))在RA中的表达水平,以及其对长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)核丰富转录本1(nuclear paraspeckle assembly transcript 1,NEAT1)稳定性的影响和在RA发病机制中的作用。方法:通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库获取RA数据集,并将其分为正常对照组和RA组,使用R软件分析获取N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)相关的甲基化酶的表达量并进行差异分析。分析差异表达的m^(6)A甲基化酶与lncRNA NEAT1的相关性。通过在线网站ENCORI预测与lncRNA NEAT1结合的蛋白质,并与lncRNA NEAT1表达相关的m^(6)A甲基化酶取交集,从而获取关键基因。通过RNA蛋白质相互作用分析实验(RNA pull-down)验证在RA滑膜细胞中NEAT1与关键基因结合的情况。通过蛋白质印迹法验证关键基因在正常滑膜细胞和RA滑膜细胞中的表达水平。在RA滑膜细胞中转染关键基因的小干扰RNA,通过real-time RT-PCR检测NEAT1在滑膜细胞中的表达水平。结果:差异分析结果显示:与正常对照组相比,共有8个m^(6)A甲基化基因在RA组中存在差异表达,其中IGF_(2)BP_(1)、甲基转移酶样蛋白14(methyltransferase 14,N^(6)-adenosine-methyltransferase subunit,MEEEL14)与lncRNA NEAT1存在相关性;ENCORI预测结果显示:共有23个蛋白质能够与lncRNA NEAT1结合,与NEAT1共表达m^(6)A甲基化酶取交集,获得NEAT1相关m^(6)A甲基化蛋白IGF_(2)BP_(1)。蛋白质印迹法显示:与正常对照组相比,RA组中IGF_(2)BP_(1)蛋白在RA滑膜细胞中表达升高(P<0.05);RNA pull-down结果显示IGF_(2)BP_(1)蛋白与NEAT1结合;real-time RT-PCR的结果表明:敲减IGF_(2)BP_(1)可显著降低NEAT1 mRNA表达水平(P<0.01)。结论:IGF_(2)BP_(1)可能通过稳定lncRNA NEAT1表达参与RA发病,调控IGF_(2)BP_(1)水平可能是一种新的治疗RA的方法。

关键词：类风湿关节炎 N6-甲基腺苷甲基化长链非编码RNA核丰富转录本1 胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1 生物信息学

基于m6A相关长链非编码RNA鉴定克罗恩病的潜在诊断生物标志物

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医学信息 2024年第1期37卷 10-15页

作者：黄晓东黄衔梁靖华李昂刘琦凯钟秀清肖剑伟深圳市中医肛肠医院<福田>外三科深圳市福田区风湿病专科医院风湿免疫科

目的探索克罗恩病（CD）m6A相关的长链非编码RNA(LncRNA)及其与患者临床性状的相关性。方法通过GEO数据库获取CD芯片数据，获取m6A相关的甲基化酶的表达量，通过差异分析筛选LncRNA。分析与m6A甲基化酶共表达的LncRNA，探索LncRNA与C... 详细信息

目的探索克罗恩病（CD）m6A相关的长链非编码RNA(LncRNA)及其与患者临床性状的相关性。方法通过GEO数据库获取CD芯片数据，获取m6A相关的甲基化酶的表达量，通过差异分析筛选LncRNA。分析与m6A甲基化酶共表达的LncRNA，探索LncRNA与CD患者病情活动的相关性并绘制ROC曲线，对LncRNA共表达的m RNA进行GO富集分析及KEGG信号通路分析。结果共筛选出CD中m6A相关的LncRNA 7个，3个LncRNA与8个m6A甲基化酶存在相关性。其中，LncRNAGSEC与病情活动指标CDEIS呈正相关。m6A甲基化位点预测提示GSEC存在多个高甲基化位点；ROC曲线下面积为0.805。GO富集分析显示其富集于蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性、Toll样受体结合等功能。KEGG信号通路分析显示其富集于NF-κB信号通路、炎症性肠病等通路。结论 GSEC可能是CD潜在的诊断及治疗靶点。

关键词：克罗恩病 m6A LncRNA GSEC

基于机器学习构建类风湿关节炎合并骨质疏松患者临床预测模型

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江苏大学学报(医学版) 2024年

作者：卢小平蔡旭陈新鹏洪易炜肖剑伟深圳市福田区风湿病专科医院风湿免疫科

目的:开发一种有效且简单的工具,用于评估类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者发生骨质疏松症(osteoporosis,OP)的风险,以便提早进行干预,改善患者的预后和生活质量。方法:通过回顾性研究,选取2018年1月至2023年6月期间我院RA患... 详细信息

目的:开发一种有效且简单的工具,用于评估类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者发生骨质疏松症(osteoporosis,OP)的风险,以便提早进行干预,改善患者的预后和生活质量。方法:通过回顾性研究,选取2018年1月至2023年6月期间我院RA患者53例及RA合并OP患者44例。收集24个预测因子,采用Lasso、Boruta和SVM-REF算法筛选关键预测因子,并使用多变量Logistic回归建立预测模型。进一步通过KNN及Lightgbm算法对模型进行验证。结果:筛选出4个关键预测因子:白介素4(IL-4)、总甲状腺素(TT4)、抗环瓜氨酸肽抗体(Anti-CCP)和年龄。建立的临床预测模型C指数为0.82,ROC曲线下面积为0.821,临床决策曲线结果显示,在不损害其他患者利益的情况下,当阈值概率为0.02～0.90时临床净获益水平最高,显示模型具有良好的预测能力。机器学习验证模型显示,KNN及Lightgbm结果,ROC曲线下面积分别为0.973和0.973,PR曲线下面积分别为0.974和0.969。混淆矩阵结果显示,KNN预测模型敏感度为0.951,特异度为0.911,准确率为0.928,F1值为0.918;Lightgbm预测模型敏感度为0.913,特异度为0.961,准确率为0.9,8,F1值为0.933。结论:本研究成功构建了一种针对RA合并OP的临床预测模型,发现年龄、Anti-CCP、TT4是高危因素,而IL-4是保护因素。

关键词：类风湿关节炎骨质疏松机器学习 Boruta SVM-REF 临床预测模型

基于生物光学模型的水面薄油膜厚度的高光谱遥感反演实验研究

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光谱学与光谱分析 2012年第1期32卷 183-187页

作者：肖剑伟田庆久南京大学国际地球系统科学研究所江苏南京210093

研究水表薄油膜厚度与其反射率光谱之间的变化规律,对于分析海洋油膜污染和油气勘探的遥感探测机理具有十分重要的意义。建立了水面薄油膜厚度的生物光学模型,并介绍了单波段和双波段比值简化算法反演薄油膜厚度信息的方法。通过对原油... 详细信息

研究水表薄油膜厚度与其反射率光谱之间的变化规律,对于分析海洋油膜污染和油气勘探的遥感探测机理具有十分重要的意义。建立了水面薄油膜厚度的生物光学模型,并介绍了单波段和双波段比值简化算法反演薄油膜厚度信息的方法。通过对原油样品进行油膜厚度定量反演,研究了遥感反射率随水表油膜厚度的变化规律。研究发现,可见光到近红外波段(450～800nm)反射率对油膜厚度变化最为敏感,有很高的负相关关系,并且随着油膜厚度的增加呈负指数形态下降。对于浅水环境较混浊的水体,ETM1/ETM3双波段比值模型可以较好的消除线性天空散射光的影响,克服单波段反演模型在不同水质背景下反演效果不稳定的特点,其反演结果的复相关系数R2可以达到0.98,是水表薄油膜厚度遥感探测的较好波段选择。

关键词：薄油膜厚度高光谱反射率生物光学模型

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内蒙古乌兰浩特市苏呼河地区苏中组地质特征

西部资源 2023年第2期 9-11页

作者：柳永正肖剑伟内蒙古自治区岩浆活动成矿与找矿重点实验室内蒙古自治区地质调查研究院内蒙古呼和浩特010020

苏中组岩石组合以灰色结晶灰岩、蜂窝状灰岩为主,夹少量青灰色板岩,形成于浅海环境。上部灰岩中发现新种古杯化石:Robustocyathus cf. proskurjakovi(普罗斯库尔雅柯夫强壮古杯),Ethmophyllum hinganensis Guo(兴安筛孔古杯),Ethmophyll... 详细信息

苏中组岩石组合以灰色结晶灰岩、蜂窝状灰岩为主,夹少量青灰色板岩,形成于浅海环境。上部灰岩中发现新种古杯化石:Robustocyathus cf. proskurjakovi(普罗斯库尔雅柯夫强壮古杯),Ethmophyllum hinganensis Guo(兴安筛孔古杯),Ethmophyllum simplex Guo(简单筛孔古杯),形成时代为早寒武世。该组是大兴安岭中段古生代最底部层位,对研究东北地区地质发展史有着重要意义。

关键词：苏中组古杯化石早寒武世苏呼河内蒙古

内蒙古科尔沁右翼前旗木头营子一带额尔格图片岩地质特征

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西部资源 2023年第1期 20-23页

作者：柳永正肖剑伟内蒙古自治区岩浆活动成矿与找矿重点实验室内蒙古自治区地质调查研究院内蒙古呼和浩特010020

额尔格图片岩是1∶5万区域地质调查命名的一个非正式填图单位,岩石组合以绿帘阳起片岩、斜长角闪片岩、斜长黑云母片岩等为主,夹长石石英片岩、深灰色角闪斜长变粒岩,属绿片岩—角闪岩相变质,原岩为中基性火山岩—沉积岩建造。在含绿帘... 详细信息

额尔格图片岩是1∶5万区域地质调查命名的一个非正式填图单位,岩石组合以绿帘阳起片岩、斜长角闪片岩、斜长黑云母片岩等为主,夹长石石英片岩、深灰色角闪斜长变粒岩,属绿片岩—角闪岩相变质,原岩为中基性火山岩—沉积岩建造。在含绿帘阳起片岩中获得LA-MC-ICP-MS锆石U-Pb年龄2170±24Ma,认为该年龄是绿帘阳起片岩之原岩形成时代,结合区域上已有的年龄数据,确定额尔格图片岩归属于古元古代。

关键词：额尔格图片岩古元古代锆石U-Pb年龄木头营子科尔沁右翼前旗

内蒙古满都拉地区蛇绿混杂岩碎屑锆石U-Pb年龄及其对区域构造演化的约束

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地质通报 2023年第2期42卷 223-238页

作者：许立权肖剑伟张玉清呼日乐张婷婷马嘉骏内蒙古自治区岩浆活动成矿与找矿重点实验室/内蒙古自治区地质调查院内蒙古呼和浩特010020

对满都拉地区蛇绿混杂岩的基质碎屑岩进行了锆石U-Pb年龄及Lu-Hf同位素研究。岩屑杂砂岩(D18003RZ1)锆石多具岩浆成因特征,U-Pb年龄分布于272~2302 Ma之间,有282 Ma和442.8 Ma两个峰值年龄;431~456 Ma锆石的^(176)Hf/^(177)Hf值为0.2826... 详细信息

对满都拉地区蛇绿混杂岩的基质碎屑岩进行了锆石U-Pb年龄及Lu-Hf同位素研究。岩屑杂砂岩(D18003RZ1)锆石多具岩浆成因特征,U-Pb年龄分布于272~2302 Ma之间,有282 Ma和442.8 Ma两个峰值年龄;431~456 Ma锆石的^(176)Hf/^(177)Hf值为0.282661~0.282797,ε_(Hf)(t)值为6.4~10.7,T_(DM2)介于801~1155 Ma之间;272~286 Ma锆石的^(176)Hf/^(177)Hf值为0.282554~0.282768,ε_(Hf)(t)值介于-1.5~5.9之间,T_(DM2)介于1069~1575 Ma之间。含粉砂绢云母硅质板岩(DC01TW1)锆石年龄分布在260~2185 Ma之间,其锆石有岩浆成因,也有变质成因,主要峰值年龄为270 Ma,次为1600 Ma和1850 Ma;263~293 Ma锆石的^(176)Hf/^(177)Hf值为0.282434~0.282805,ε_(Hf)(t)值为-6.0~7.1,T_(DM2)介于930~1894 Ma之间。杂砂岩以古生代碎屑锆石为主,少量古中元古代锆石,反映其物源以兴蒙造山带为主,而绢云母硅质板岩以晚古生代和古中元古代为主,反映其物源可能以兴蒙造山带和华北陆块并重。结合2种岩性的岩石组成、锆石年龄分布及物源分析,杂砂岩可能形成时代略早,且靠近岛弧,而绢云母硅质板岩形成时代稍晚,其环境更靠近陆块。满都拉地区这套碎屑岩的形成时代可能为晚二叠世,且可能不晚于256 Ma,形成于俯冲向碰撞转变的构造背景,进一步限定内蒙古中部的古亚洲洋在晚二叠世依然存在,其演化可能一直延续到晚二叠世末。

关键词：内蒙古满都拉地区蛇绿混杂岩碎屑锆石U-Pb年龄 Lu-Hf同位素地质调查工程

甲氨蝶呤、来氟米特联合运用于类风湿关节炎治疗中的效果分析

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2023年第3期 69-72页

作者：张明影谢秀娟蔡旭肖剑伟深圳市福田区慢性病防治院广东深圳518048

探索类风湿关节炎患者采取联合用药方案(甲氨蝶呤+来氟米特)的临床价值。方法研究工作从2021年6月开展,将2022年8月作为研究的结束时间。在上述研究时间段内选择72例患者作为观察分析主体,所选患者均诊断为类风湿关节炎。引导患者接受... 详细信息

探索类风湿关节炎患者采取联合用药方案(甲氨蝶呤+来氟米特)的临床价值。方法研究工作从2021年6月开展,将2022年8月作为研究的结束时间。在上述研究时间段内选择72例患者作为观察分析主体,所选患者均诊断为类风湿关节炎。引导患者接受随机抽签,分别在对照组和观察组纳入36例。对照组治疗药物是甲氨蝶呤,观察组治疗药物是甲氨蝶呤+来氟米特。比较两组用药价值。结果观察组综合疗效优于对照组,P<0.05。结论将甲氨蝶呤作为单一用药治疗类风湿关节炎患者的整体效果不够满意,同时联合来氟米特治疗能够进一步提高临床效果,使患者临床症状得到更好的改善,联合用药未明显增加不良反应,安全性良好,可作为治疗方案予以普及推广。

关键词：类风湿关节炎甲氨蝶呤来氟米特临床疗效血沉

免疫吸附联合糖皮质激素、免疫抑制剂治疗以高球蛋白血症性紫癜为主要表现的干燥综合征一例

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中国麻风皮肤病杂志 2023年第8期39卷 608-610页

作者：韩畅戴莉萍田红军陈新鹏肖剑伟深圳市福田区风湿病专科医院风湿科广东深圳518040

患者,女,44岁。反复全身斑疹10年,加重1个月。既往经糖皮质激素、中药、维生素等治疗未见好转。唇腺组织病理活检见5个淋巴聚集灶,结合抗核抗体等相关检查诊断为干燥综合征、高球蛋白血症性紫癜、肾小管酸中毒I型可能,给予免疫吸附联合... 详细信息

患者,女,44岁。反复全身斑疹10年,加重1个月。既往经糖皮质激素、中药、维生素等治疗未见好转。唇腺组织病理活检见5个淋巴聚集灶,结合抗核抗体等相关检查诊断为干燥综合征、高球蛋白血症性紫癜、肾小管酸中毒I型可能,给予免疫吸附联合糖皮质激素、免疫抑制剂治疗后病情好转。

关键词：免疫吸附干燥综合征高球蛋白血症性紫癜