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一种预测药物活性的神经元计算新方法

化学学报 2001年第7期59卷 1145-1149页

作者：程翼宇陈慰浙刘平浙江大学化学工程与生物工程学系浙江大学医学系

提出一种基于全变异算子遗传算法(MGA)的神经元计算新方法,用于辨识复杂药物构效关系.在MGA中,表达变量的各基因使用不同的变异概率,以便提高局部搜索效率.通过将随机初始化技术与局部搜索策略相结合,该算法能在有限时间内得到满意解.使... 详细信息

提出一种基于全变异算子遗传算法(MGA)的神经元计算新方法,用于辨识复杂药物构效关系.在MGA中,表达变量的各基因使用不同的变异概率,以便提高局部搜索效率.通过将随机初始化技术与局部搜索策略相结合,该算法能在有限时间内得到满意解.使用74个抑制还原酶的嘧啶类化合物所组成的数据集作为构效关系神经元计算的典型对象,用来考核MGA法在预测药效活性计算中的有效性.交叉验证及活性预测试验表明,用MGA法建立的构效关系模型的预测能力优于其他方法.

关键词：药物化学定量构效关系遗传算法神经元计算药物活性预测药物分子设计

一种基于最小二乘支持向量机算法的近红外光谱判别分析方法

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分析化学 2006年第4期34卷 561-564页

作者：虞科程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310027 浙江大学药物信息学研究所

将最小二乘支持向量机(LSSVM)用于近红外(NIR)光谱分析,建立一种新型的NIR光谱快速鉴别方法。以丹参药材道地性鉴别为例,对其NIR漫反射光谱进行主成分分析后,运用LSSVM法建立NIR光谱非线性分类模型,对丹参药材道地性进行快速鉴别。将本... 详细信息

将最小二乘支持向量机(LSSVM)用于近红外(NIR)光谱分析,建立一种新型的NIR光谱快速鉴别方法。以丹参药材道地性鉴别为例,对其NIR漫反射光谱进行主成分分析后,运用LSSVM法建立NIR光谱非线性分类模型,对丹参药材道地性进行快速鉴别。将本方法与经典SVM和BP神经网络法相比较,结果表明,本法判别准确率高,计算时间少,可推广应用于中药等天然产物质量快速鉴别。

关键词：最小二乘支持向量机近红外光谱药材道地性判别分析丹参

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基于逐步条件相关性分析的因果关系发现方法

模式识别与人工智能 2002年第4期15卷 478-483页

作者：董雁适程翼宇潘云鹤浙江大学计算机系杭州310027 浙江大学化学工程与生物工程学系杭州310027

从数据中发现与一个变量有直接因果关系的其它变量是一种非常有价值的技术.本文针对回归分析中的逐步回归算法和贝叶斯网络学习中的SGS算法、PC算法应用于变量选择的不足,提出了一种新的因果关系发现算法STEPCARD,并将其与STEPWISE算法... 详细信息

从数据中发现与一个变量有直接因果关系的其它变量是一种非常有价值的技术.本文针对回归分析中的逐步回归算法和贝叶斯网络学习中的SGS算法、PC算法应用于变量选择的不足,提出了一种新的因果关系发现算法STEPCARD,并将其与STEPWISE算法和SGS算法进行了实验比较分析.实验表明,STEPCARD算法能够和SGS算法一样从初始自变量集合中找出与因变量有因果相邻关系的变量,而STEPWISE算法只能找出与因变量显著相关的变量,其次,当初始自变量集合较大,而最后输出的自变量集合较小时,STEPCARD算法的计算量比SGS算法的计算量小得多.而且,当初始自变量个数接近或大于事例个数时,SGS算法将无法应用,而STEPCARD算法依然可以得到可信的结果.

关键词：逐步条件相关性分析因果关系变量选择回归分析贝叶斯网络学习算法数据集数据分析

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近红外漫反射光谱法快速无损鉴别阿胶真伪

光谱学与光谱分析 2006年第1期26卷 60-62页

作者：瞿海斌杨海雷程翼宇浙江大学药物信息学研究所浙江杭州310027

采用近红外光谱漫反射光谱技术和模式识别技术快速鉴别阿胶真伪。收集来源不同的阿胶(真品8个,伪品6个),采集其近红外漫反射光谱,使用多重散射校正和小波变换对光谱进行预处理后,分别应用相似度匹配和马氏距离方法建立质量鉴别模型。相... 详细信息

采用近红外光谱漫反射光谱技术和模式识别技术快速鉴别阿胶真伪。收集来源不同的阿胶(真品8个,伪品6个),采集其近红外漫反射光谱,使用多重散射校正和小波变换对光谱进行预处理后,分别应用相似度匹配和马氏距离方法建立质量鉴别模型。相似度法使用真品谱图作为标准谱图,用样品谱图与标准谱图的相似度值来鉴别阿胶质量;对阿胶样品进行重复扫描得到28张谱图,随机分为3组后应用马氏距离法建立交叉验证鉴别模型。两种模式识别方法均能准确无误的鉴别阿胶真伪,表明近红外光谱和模式识别技术结合可快速、准确、客观地进行阿胶质量鉴别,可推广到其他中成药的质量鉴别。

关键词：近红外光谱阿胶真伪鉴别模式识别

一种测定MDR肿瘤细胞内外阿霉素浓度的方法

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化学学报 2004年第12期62卷 1162-1165,MJ05页

作者：张洪妍沈朋栾连军程翼宇浙江大学药学院药物信息学研究所浙江大学医学院附属第一医院杭州310027

研究提出K5 62 /A细胞内外阿霉素浓度的反相高效液相色谱 -荧光测定法 .细胞内阿霉素浓度测定采用LichrospherC18色谱柱 ,甲醇 0 0 1%醋酸 ( 5 0∶5 0 ,V/V)流动相 ,流速 1 0mL/min ,柱温 3 5℃ ;细胞外阿霉素浓度测定采用Lichrospher... 详细信息

研究提出K5 62 /A细胞内外阿霉素浓度的反相高效液相色谱 -荧光测定法 .细胞内阿霉素浓度测定采用LichrospherC18色谱柱 ,甲醇 0 0 1%醋酸 ( 5 0∶5 0 ,V/V)流动相 ,流速 1 0mL/min ,柱温 3 5℃ ;细胞外阿霉素浓度测定采用LichrospherC18色谱柱 ,甲醇 0 0 1%醋酸 ( 5 5∶45 ,V/V)流动相 ,流速 0 8mL/min ,柱温 3 5℃ .荧光检测器波长λex=495nm ,λem=5 60nm ,均以盐酸柔红霉素为内标 .研究结果表明 ,该方法简单、准确、线性范围宽、检测限低 ,精确度和回收率良好 ,可用于多药耐药肿瘤细胞内外阿霉素浓度的动态变化规律研究 .

关键词：液相色谱分析阿霉素多药耐药机制肿瘤细胞 K562/A细胞化疗抗癌药物

预测毛细管区带电泳有效淌度的支持向量回归建模方法

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分析化学 2004年第9期32卷 1151-1155页

作者：康宇飞瞿海斌沈朋程翼宇杭州310003 浙江大学医学院附属第一医院浙江大学药物信息学研究所浙江大学药物信息学研究所杭州310027

提出预测毛细管电泳迁移行为的支持向量回归建模方法。以核苷为实际研究对象 ,利用正交试验获得的数据 ,结合二标记物技术 ,用支持向量回归算法建立毛细管区带电泳的柱温、电压、缓冲液浓度和pH值与 3种核苷的有效淌度之间的相关模型。... 详细信息

提出预测毛细管电泳迁移行为的支持向量回归建模方法。以核苷为实际研究对象 ,利用正交试验获得的数据 ,结合二标记物技术 ,用支持向量回归算法建立毛细管区带电泳的柱温、电压、缓冲液浓度和pH值与 3种核苷的有效淌度之间的相关模型。将其与偏最小二乘回归和人工神经网络方法相比较 ,结果表明所建模型的预测准确性优于后两者 ,适宜用于毛细管电泳迁移行为的预测。

关键词：支持向量回归有效淌度毛细管区带电泳标记物技术核苷

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红外光谱分析数据特征指纹的可视化表达方法

分析化学 2002年第12期30卷 1426-1430页

作者：程翼宇余杰吴永江浙江大学制药工程研究所浙江大学制药工程研究所杭州310027

提出一类红外光谱分析数据特征指纹的可视化表达方法。该方法采用基于贝叶斯准则的多元统计方法对原始数据进行投影变换 ,再以二维灰度图对变换后数据进行可视化表征 ,形成基于计算机图像的虚拟化学指纹图谱。将其用于鉴别 3种不同产地... 详细信息

提出一类红外光谱分析数据特征指纹的可视化表达方法。该方法采用基于贝叶斯准则的多元统计方法对原始数据进行投影变换 ,再以二维灰度图对变换后数据进行可视化表征 ,形成基于计算机图像的虚拟化学指纹图谱。将其用于鉴别 3种不同产地中药当归样品的结果表明 ,它能有效提取红外光谱分析数据的特征指纹 ,实现以虚拟指纹图谱对药材产地的分类鉴别 ,从而为辨识复杂化学物质体系提供了新的技术手段

关键词：红外光谱分析数据可视化中药材鉴别虚拟指纹图谱

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中药色谱指纹图谱的小波变换及分形表达方法

分析化学 2003年第7期31卷 774-778页

作者：陈闽军吴永江程翼宇浙江大学药物信息学研究所浙江大学药物信息学研究所杭州310027

提出一种基于小波变换的色谱指纹图谱分形表达方法。该法运用小波变换将色谱谱线分解至不同分辨尺度 ,然后计算各尺度分量的分形维数 ,用色谱的小波基分形参量替代色谱指纹图谱的采样值。仿真实验结果表明 ,色谱小波基分形参量对谱峰保... 详细信息

提出一种基于小波变换的色谱指纹图谱分形表达方法。该法运用小波变换将色谱谱线分解至不同分辨尺度 ,然后计算各尺度分量的分形维数 ,用色谱的小波基分形参量替代色谱指纹图谱的采样值。仿真实验结果表明 ,色谱小波基分形参量对谱峰保留时间漂移具有较好的抗干扰能力。以当归和川芎两种中药材的品种及道地性鉴别分类问题为实例 ,比较研究色谱采样值与小波基分形参量 ,k 近邻法的交叉验证计算结果表明 ,小波基分形参量的分类效果优于色谱采样值。

关键词：色谱指纹图谱中药质量分析小波变换分形维数

基于小波理论的化学谱图数据自适应滤波方法研究

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高等学校化学学报 1999年第3期20卷 378-382页

作者：董雁适程翼宇浙江大学化工学院

运用小波理论，利用噪声与真实信号小波变换极大模性态之间的显著差异，提出了一类新的化学谱图数据自适应滤波算法，从根本上突破了现有算法均依据信噪频率特性进行滤波的传统模式．经大量色谱谱图数据处理试验证明，这种算法具有无需... 详细信息

运用小波理论，利用噪声与真实信号小波变换极大模性态之间的显著差异，提出了一类新的化学谱图数据自适应滤波算法，从根本上突破了现有算法均依据信噪频率特性进行滤波的传统模式．经大量色谱谱图数据处理试验证明，这种算法具有无需设置初始参数，消除人为误差因素对分析计算结果的影响，信噪分离性能好及峰位和峰高保持不变等一系列优点，其鲁棒性。

关键词：仪器分析小波理论信号处理自适应滤波滤波