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流感病毒识别糖链受体分子机制的研究进展

生物化学与生物物理进展 2012年第7期39卷 605-612页

作者：钟耀刚秦棪楠孙士生陈闻天李铮西北大学生命科学学院功能糖组学实验室西安710069

近年来,由于流感病毒(influenza virus)不可预测的局部流行和有可能引发全球大流行,其一直是研究的热点课题之一.流感病毒表面糖蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)特异识别宿主细胞表面的糖链受体是流感病毒感染宿主、进而复制并继续传播的... 详细信息

近年来,由于流感病毒(influenza virus)不可预测的局部流行和有可能引发全球大流行,其一直是研究的热点课题之一.流感病毒表面糖蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)特异识别宿主细胞表面的糖链受体是流感病毒感染宿主、进而复制并继续传播的生物学基础.影响流感病毒宿主特异性的两个主要因素是HA自身的变化(包括基因突变、重组、糖基化位点数量和糖基化位置的变化)和宿主细胞表面糖链受体的变化(包括糖链受体的类型、分布和分子构象的改变)等.因此准确掌握这些信息有助于人们进一步加强对流感病毒的防控.本文主要从糖组学角度概述了流感病毒识别糖链受体的分子机制,重点介绍流感病毒宿主细胞表面糖链受体的研究进展.

关键词：流感病毒血凝素宿主糖链受体受体结合位点唾液酸

TGF-β1诱导下人肝星状细胞糖蛋白糖谱的研究

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TGF-β1诱导下人肝星状细胞糖蛋白糖谱的研究

作者：秦棪楠西北大学

学位级别：硕士

目的：许多疾病的发生伴随着相关糖蛋白糖基化的改变,糖蛋白糖链结构的多样性对其生理功能起着重要的作用。目前已证明多种癌症均有细胞内糖谱变化。肝纤维化作为一种普遍多发的疾病,如不能及时诊断和治疗可发展为肝硬化。肝星状细胞（H... 详细信息

目的：许多疾病的发生伴随着相关糖蛋白糖基化的改变,糖蛋白糖链结构的多样性对其生理功能起着重要的作用。目前已证明多种癌症均有细胞内糖谱变化。肝纤维化作为一种普遍多发的疾病,如不能及时诊断和治疗可发展为肝硬化。肝星状细胞（Hepatic Stellate Cells, HSCs）是肝脏合成细胞外基质（Extracellular Matrixc, ECM）的主要细胞。HSCs的活化与增殖是肝纤维化形成的中心环节。目前针对HSCs的研究多在基因层面,糖谱的研究很少涉及。因此本实验利用凝集素芯片对HSCs糖蛋白糖链进行规模化分析研究,比较“静态”HSCs和经转化生长因子β1 （transforming growth factorβ1, TGF-β1）诱导活化的HSCs的糖蛋白糖链表达差异,寻找肝纤维化相关糖蛋白糖链,分析糖基化蛋白与肝纤维化的关系,研究肝纤维化过程中蛋白糖基化修饰的改变,推测肝纤维化相关糖蛋白糖链的合成通路。方法：以LX-2细胞系为肝星状细胞系模型,采取终浓度为2ng／mL的TGF-β1诱导刺激LX-2细胞24h。半定量RT-PCR检测LX-2细胞系是否发生肝纤维化变化。提取对照组LX-2细胞和实验组LX-2细胞总蛋白,Cy3荧光标记,与凝集素芯片孵育,观察表达差异糖蛋白,分析糖蛋白糖链修饰变化,利用已公开相关基因芯片研究结果推测肝纤维化过程中糖链合成通路及其与糖基化修饰变化的关系。结论：通过半定量RT-PCR发现,TGF-β1和MMP-2基因在经转化生长因子β1（TGF-β1）诱导的LX-2细胞中高表达。证明TGF-β1诱导LX-2细胞系发生肝纤维化的细胞培养方法可行。应用凝集素芯片分析经TGF-β1诱导LX-2细胞系和“静态”LX-2细胞系糖蛋白糖链表达差异。得出以下初步结果：（1）肝纤维化的肝星状细胞中T抗原／Tn抗原糖链结构增加,T抗原或Tn抗原唾液酸化明显。（2）发生肝纤维化的肝星状细胞糖蛋白N-糖链分支结构增加显著,特别是Bisecting GlcNAc结构。（3）核心岩藻糖结构在纤维化肝星状细胞中主要以Fucosea-1,6GlcNAc（core fucose）结构存在,而且末端岩藻糖结构升高。（4）MAL-Ⅱ特异性识别的Sia2-3Galβ1-4Glc（NAc）结构主要存在于正常肝星状细胞,而SNA特异性识别的Sia2-6Galβ1-4Glc（NAc）主要存在于纤维化肝星状细胞。（5） GlcNAc、β1-4GlcNAc、Galβ-1,4GlcNAc结构在纤维化肝星状细胞中表达量升高,GalNAcβ-1,4GlcNAc结构则相对稳定。（6）ConA、LCA在纤维化肝星状细胞中信号增强,说明纤维化肝星状细胞中α-甘露糖结构增多。（7）根据WGA、PWM、STL、LEL、DSA显示结果分析,在纤维化肝星状细胞中GlcNAc及（GlcNAc）n （n=2,3）结构减少,（GlcNAc）n（≧3）结构增加。（8）根据PTL-Ⅱ、PTL-Ⅰ、BPL、VVA、SBA、SJA荧光信号强度分析,末端GalNAc和Gal结构增加,同时aGalNAc结构减少,Gal结构增多。本研究的技术路线图如下：

关键词：肝纤维化 N-糖链 O-糖链凝集素芯片肝星状细胞半定量RT-PCR TGF-β1 MMP-2

人肝星状细胞激活和抑制及其相关分子机制的研究进展

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中国细胞生物学学报 2011年第10期33卷 1127-1136页

作者：秦棪楠钟耀刚李铮西北大学生命科学学院功能糖组学实验室西安710069

肝纤维化是肝脏对一系列慢性刺激的损伤修复反应,以细胞外基质的过度沉积为主要特征。许多研究证明人肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSCs)的活化与增殖是肝纤维化形成的中心环节。因此,肝星状细胞激活机制及抑制活化途径的研究和... 详细信息

肝纤维化是肝脏对一系列慢性刺激的损伤修复反应,以细胞外基质的过度沉积为主要特征。许多研究证明人肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSCs)的活化与增殖是肝纤维化形成的中心环节。因此,肝星状细胞激活机制及抑制活化途径的研究和发现成为防治肝纤维化的关键。目前,国际上肝纤维化药物研发的思路之一是从肝纤维化发生的机制,即肝星状细胞激活机制中寻找分子靶点。近年来,对各种使肝星状细胞活化的信号通路及相关抑制机制的研究取得了一些进展,但由于肝星状细胞活化是多条信号通路相互协调的结果,其复杂性、未知性造成了阻断方式的特异性、多样性,使该研究还仅限于实验室阶段,要想应用于临床还需要大量实验证明。该文就最新发现的肝星状细胞激活和抑制及相关分子机制作一综述。

关键词：肝纤维化肝星状细胞激活抑制活化分子机制

秦岭鸡窝子地区藓类植物生态分布的DCA排序研究

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西北大学学报（自然科学版） 2012年第1期42卷 69-73页

作者：刘敏王玛丽卢元秦棪楠西北大学生命科学学院陕西西安710069

目的通过对鸡窝子地区藓类植物生态分布格局的调查研究,以探索藓类植物分布与森林类型的关系。方法在不同森林类型中设立15个样点,并统计样点中每种藓类植物的平均盖度,以此盖度为指标,应用除趋势对应分析(DCA)对秦岭鸡窝子地区不同森... 详细信息

目的通过对鸡窝子地区藓类植物生态分布格局的调查研究,以探索藓类植物分布与森林类型的关系。方法在不同森林类型中设立15个样点,并统计样点中每种藓类植物的平均盖度,以此盖度为指标,应用除趋势对应分析(DCA)对秦岭鸡窝子地区不同森林类型的藓类植物分布格局进行了研究分析。结果研究发现鸡窝子地区不同林型中藓类植物分布不同,阔叶林以尖叶提灯藓Mnium cuspidatum Hedw.,万年藓Climacium dendroides(Hedw.)*** Mohr.,狭叶小羽藓Haplocladium microphyllum(Hedw.)Broth,鼠尾藓Myuroclada maximowiczii(Borszoz.)Steere et Schof.为主,针叶林和针阔混交林以土生扭口藓Barbula vinealis Brid.,短月藓Brachymenium nepalenseHook.,中华木衣藓Drummondia sinensis ***.,褶叶青藓Brachythecium salebrosum(*** Mo-hr)B.S.G.,金灰藓Pylaisia polyantha(Hedw.)B.S.G.为主。结论藓类植物群落分布与森林类型密切相关,同时,气候环境对藓类植物的分布也有密切关系,该结论也将丰富秦岭地区藓类植物生态研究。

关键词：藓类植物鸡窝子地区 DCA排序分布格局

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外泌体在孤独症谱系障碍中的研究进展

中国儿童保健杂志 2022年第12期30卷 1345-1349页

作者：朱雨萱田雅宁潘珏秦棪楠西安交通大学医学部陕西西安710061

孤独症谱系障碍(ASD)是一类发病于儿童早期,以社会交往障碍和局限性重复行为为主要特征的广泛神经发育障碍性疾病。近几十年来,孤独症的患病率在全球范围内有明显的增长趋势并且缺乏特效治疗药,因此亟需灵敏度、特异度高的生物标志物和... 详细信息

孤独症谱系障碍(ASD)是一类发病于儿童早期,以社会交往障碍和局限性重复行为为主要特征的广泛神经发育障碍性疾病。近几十年来,孤独症的患病率在全球范围内有明显的增长趋势并且缺乏特效治疗药,因此亟需灵敏度、特异度高的生物标志物和特定的治疗方案。外泌体(exosomes)是一种能够被中枢神经系统大多数细胞类型释放的纳米级囊泡,其内含有的RNA、蛋白质、脂质等生物活性大分子参与多种神经细胞间物质交换和信息交流,在调节神经发育、分化、再生以及突触形成中发挥重要作用。随着分子生物学的发展和诊断技术的提高,外泌体以其采集方便、结构稳定、其内大分子不易降解、可通过血脑屏障等优势,逐渐成为ASD研究的热点。根据已有研究报道外泌体与ASD发生发展有关,并可能作为ASD诊断标志物的重要来源及新型药物治疗运载体。本文综述ASD外泌体研究进展,为ASD早期诊断、临床治疗和预后判断提供参考。

关键词：外泌体孤独症生物标志物

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过表达TIMP3对肝癌细胞生物功能的影响

中国细胞生物学学报 2023年第1期45卷 44-55页

作者：曹丽吴菲王晓霏秦棪楠西安交通大学基础医学院西安710061 西安交通大学第二附属医院西安710004 西安交通大学生物医学实验中心西安710061

组织金属蛋白酶抑制因子3(TIMP3)在肝癌中的具体作用机制尚不明确。该文探讨了TIMP3在肝癌细胞中的表达及其对细胞增殖、细胞凋亡、细胞周期的影响。通过q RT-PCR和Western blot检测肝癌细胞株(97H、97L和HUH7)和人正常肝细胞(LO2)中TI... 详细信息

组织金属蛋白酶抑制因子3(TIMP3)在肝癌中的具体作用机制尚不明确。该文探讨了TIMP3在肝癌细胞中的表达及其对细胞增殖、细胞凋亡、细胞周期的影响。通过q RT-PCR和Western blot检测肝癌细胞株(97H、97L和HUH7)和人正常肝细胞(LO2)中TIMP3的表达情况。将过表达TIMP3的质粒转染进97H和HUH7细胞,利用q RT-PCR和Western blot检测转染后细胞的TIMP3表达情况。通过MTT实验和活细胞工作站检测过表达TIMP3对肝癌细胞增殖的影响。此外,通过流式细胞术检测过表达TIMP3对肝癌细胞凋亡和细胞周期的影响,通过划痕实验检测表达TIMP3对肝癌细胞迁移的影响。最后,利用GESA软件进行基因富集分析以及Int Act数据库构建相互作用蛋白网络图对TIMP3相关生物学功能进行探索。研究结果表明,97H、97L和HUH7细胞中TIMP3的表达比LO2细胞中低。97H和HUH7细胞转染TIMP3质粒后RNA及蛋白水平明显升高,且过表达TIMP3可以促进细胞增殖,促进G1期向S期转化,抑制细胞凋亡,下调Bax的表达,上调Bcl-2、Bcl-xl的表达。总之,过表达TIMP3表达明显促进肝癌细胞增殖,抑制细胞凋亡,且TIMP3相关信号通路及存在相互作用蛋白密切参与肿瘤的进展,TIMP3可能是肝癌的潜在诊断标志物和治疗靶点。

关键词： TIMP3基因肝癌增殖凋亡转移基因富集分析

乙肝、肝纤维化/肝硬化及肝癌发展过程中蛋白质糖基化变化的研究

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乙肝、肝纤维化/肝硬化及肝癌发展过程中蛋白质糖基化变化的研究

中华医学会第十三次全国感染病学术会议

作者：李铮秦棪楠钟耀刚陈琳张华郭永红贾战生于汉杰吴昊翔西北大学生命科学学院功能糖组学实验室陕西省人民医院第四军医大学唐都医院感染病中心

目前研究表明在肝脏的炎症、纤维化/肝硬化、癌变的过程中蛋白质糖基化扮演着重要的角色。研究目的:利用糖组学技术全面系统地研究乙肝、肝纤维化/肝硬化、肝癌相关细胞、组织、血清和唾液的糖蛋白糖链谱,分析乙肝-肝纤维化/肝硬化-肝...

目前研究表明在肝脏的炎症、纤维化/肝硬化、癌变的过程中蛋白质糖基化扮演着重要的角色。研究目的:利用糖组学技术全面系统地研究乙肝、肝纤维化/肝硬化、肝癌相关细胞、组织、血清和唾液的糖蛋白糖链谱,分析乙肝-肝纤维化/肝硬化-肝癌发展过程中蛋白质糖基化的变化。方法凝集素芯片技术比较经TGF-β1诱导的肝星状细胞与静息态肝星状细胞糖蛋白糖链谱,凝集素组化验证并确定差异表达糖链在肝星状细胞中的变化和分布;比较来自同一肝癌患者的硬化组织、肝癌组织和癌旁组织

关键词：

来源： cnki会议评论

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外泌体糖基化在疾病诊断及治疗中的应用

生命的化学 2023年第6期43卷 821-830页

作者：吴祎凡李锐蒋锐宋昕烨杨帆刘静芸秦棪楠西安交通大学医学部西安710061 西安交通大学基础医学院细胞生物学与遗传学系西安710061

外泌体由脂质双分子层构成,内含多种生物分子,如蛋白质、核酸、糖类等,具有调节生命活动的作用,其蛋白质组分也可反映分泌细胞状态。糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰形式,糖基化蛋白对于维持细胞稳态、细胞间互作等生理功能具有重... 详细信息

外泌体由脂质双分子层构成,内含多种生物分子,如蛋白质、核酸、糖类等,具有调节生命活动的作用,其蛋白质组分也可反映分泌细胞状态。糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰形式,糖基化蛋白对于维持细胞稳态、细胞间互作等生理功能具有重要作用。近年来,有关于外泌体的研究大多关注外泌体核酸成分如miRNA、mRNA、lncRNA等的功能。外泌体膜蛋白也含有丰富的糖链,且具有重要的病理生理意义。本文着重介绍外泌体糖基化的结构、研究方法、在肿瘤等疾病中的分子功能以及在疾病诊断、治疗中的临床应用和前景。外泌体糖基化研究将随着技术的革新不断深入,有望成为多种疾病临床诊疗的重要手段。

关键词：外泌体糖基化疾病

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广义S变换下串联故障电弧的时频分析及识别研究

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电网技术 2024年第7期48卷 2995-3003页

作者：张蓬鹤秦译为宋如楠陈敢超中国电力科学研究院有限公司北京市海淀区100192

在当前用户侧负载日益复杂的情形下,故障电弧信号难以有效识别,阻碍了线路隐患监测及预警技术的发展。该文基于广义S变换进行了故障串联电弧的时频分析及识别研究。首先,比较了短时傅里叶变换、小波变换、广义S变换3种电弧时频特征提取... 详细信息

在当前用户侧负载日益复杂的情形下,故障电弧信号难以有效识别,阻碍了线路隐患监测及预警技术的发展。该文基于广义S变换进行了故障串联电弧的时频分析及识别研究。首先,比较了短时傅里叶变换、小波变换、广义S变换3种电弧时频特征提取方法的区别,阐明广义S变换在处理非线性负载高频特征方面的优势。然后,利用双曲高斯窗的广义S变换对负载信号进行时频特征提取,构建图像特征样本。最后,利用二维卷积神经网络对样本进行训练及分类,通过准确率、识别结果聚类进一步分析和验证识别算法的有效性。该文算法总体识别准确率在96.81%,涉及负载广泛,为后续电弧故障的监测识别研究提供参考。

关键词：故障电弧广义S变换双曲高斯窗函数时频域分析卷积神经网络

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