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薄壳山核桃全基因组LBD基因家族的生物信息学分析

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浙江农林大学学报 2021年第3期38卷 464-475页

作者：黄元城郭文磊王正加浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

【目的】研究薄壳山核桃Carya illinoensis LBD基因家族结构特征、进化模式和在胚发育过程中的表达模式。【方法】运用生物信息学手段鉴定薄壳山核桃LBD基因,分析该基因结构特征、系统发生学关系、显花植物中的进化历史和在胚发育过程中... 详细信息

【目的】研究薄壳山核桃Carya illinoensis LBD基因家族结构特征、进化模式和在胚发育过程中的表达模式。【方法】运用生物信息学手段鉴定薄壳山核桃LBD基因,分析该基因结构特征、系统发生学关系、显花植物中的进化历史和在胚发育过程中3个关键阶段的表达模式。【结果】薄壳山核桃全基因组中一共鉴定到52个候选LBD基因。根据基因结构、系统发生学最大似然树和Motif分析可分为3类:GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ。多序列比对分析中,52个LBD基因LOB结构域中鉴定出3个重要的结构:CX2CX6CX3C锌指结构、高度保守的甘氨酸GAS结构和亮氨酸拉链(zipper-like)结构,并且在3类内都分别发生了特异性的的变异或者缺失。根据代表性显花植物LBD基因家族的系统发生学分析,从变异程度看GroupⅠ和GroupⅡ相对较为保守,而GroupⅢ内的所有LBD基因共享1支较长的分支,它们已发生了较大的变异,可能已经分化出新的功能。表达分析结果显示:LBD基因家族参与调控胚发育过程,通常控制子叶的发育和形态建成。薄壳山核桃LBD基因中又有在整个胚发育过程中都高表达的一簇基因,这些基因可能在胚发育过程中发挥了更加重要的作用。【结论】薄壳山核桃全基因组中共获得LBD基因52个,共可分为3个亚家族,不同的亚家族具有不同的基因结构、蛋白质结构、进化模式和表达模式,转录组表达分析显示:不同亚家族之间在胚发育不同阶段具有差异性表达,它们共同参与调控薄壳山核桃胚发育过程。

关键词：薄壳山核桃 LBD 转录因子系统进化基因功能

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安徽天堂寨大别山山核桃群落的初步研究

广西植物 2004年第2期24卷 97-101页

作者：郭传友黄坚钦王正加方炎明南京林业大学森林资源与环境学院江苏南京210037 浙江林学院生命科学系浙江临安311300

对安徽天堂寨山区大别山山核桃群落进行了初步研究 ,据统计 ,在 1 0块样地中 ,共存在维管植物1 2 8种 (含变种 ) ,隶属于 95属 ,5 2科。其中 ,种子植物 47科 ,88属 ,1 1 9种 ,可分为 1 1种地理分布类型 ,各类热带成分占 2 6.5 0 % ;各... 详细信息

对安徽天堂寨山区大别山山核桃群落进行了初步研究 ,据统计 ,在 1 0块样地中 ,共存在维管植物1 2 8种 (含变种 ) ,隶属于 95属 ,5 2科。其中 ,种子植物 47科 ,88属 ,1 1 9种 ,可分为 1 1种地理分布类型 ,各类热带成分占 2 6.5 0 % ;各类温带成分占 71 .0 8% ,植物区系具有北亚热带向暖温带的过渡性质。大别山山核桃 (Caryadabieshanensis)在群落中起着建群作用 ,优势明显 ,其重要值平均达 1 89.47。大别山山核桃群落的物种多样性指数较高 ,且分布较均匀 ,其Simpson指数D、Shannon Wiener指数H和群落均匀度R均值分别为 8.8786、 3 .5 73 5和 0 .740 1 ,是一种稳定的群落类型。

关键词：安徽省天堂寨山区大别山山核桃群落植物区系胡桃科

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与植物花发育相关的miRNA研究进展

分子植物育种 2015年第5期13卷 1177-1184页

作者：孙志超黄坚钦王正加浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地杭州311300

植物花器官的形成是物种得以延续的基础。研究表明,植物的花发育过程不仅受外部环境影响,同时也受内在基因调控,其中microRNA(miRNA)分子在基因调控过程中起到重要的作用。本文通过介绍模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及一些木本... 详细信息

植物花器官的形成是物种得以延续的基础。研究表明,植物的花发育过程不仅受外部环境影响,同时也受内在基因调控,其中microRNA(miRNA)分子在基因调控过程中起到重要的作用。本文通过介绍模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及一些木本植物关于miRNA方面的最新研究进展,综述这种非编码小RNA分子在调控植物花期、花器官与花育性上的作用,指出目前在miRNA研究上存在的问题,并对miRNA在花器官发育中的深入研究做出展望。

关键词：植物 microRNA 花发育

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提高大树移植成活率的技术措施

浙江林学院学报 2001年第4期18卷 438-440页

作者：钟泰林俞建军石柏林王正加浙江林学院产业后勤总公司浙江临安311300 浙江省杭州市萧山区市政园林公用事业管理处浙江杭州311200 浙江林学院资源与环境系浙江临安311300

大树 (胸径 1 0cm以上 )移植已广泛应用于现代园林绿化中 ,其成活的关键是在移植过程中维持树体水分和养分代谢平衡。 98株大树移植实验结果表明 :在移植过程中采用软材包装法 ,选用ABT 1号和ABT 3号生长剂处理树体伤口与根部 ,并协调... 详细信息

大树 (胸径 1 0cm以上 )移植已广泛应用于现代园林绿化中 ,其成活的关键是在移植过程中维持树体水分和养分代谢平衡。 98株大树移植实验结果表明 :在移植过程中采用软材包装法 ,选用ABT 1号和ABT 3号生长剂处理树体伤口与根部 ,并协调好挖吊运植各个环节 ,有助于树木在移植和养护过程中损伤的快速复原 ,保持树木的水分平衡 ,使其平均成活率提高到 90 8%以上。表 2参

关键词：大树移植成活率 ABT生长剂水分代谢平衡

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薄壳山核桃果实假果皮的光合特性

林业科学 2019年第10期55卷 10-18页

作者：张韵刘涛张涛谢乐添黄坚钦王正加胡渊渊浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室杭州311300 杭州市原种场杭州311115

【目的】通过研究薄壳山核桃不同发育时期果实的外观形态和光合特性参数,并结合DCMU[3-(3,4-二氯苯基)-1,1-二甲基脲]抑制果实光合作用对其果实干质量的影响,探讨薄壳山核桃果实假果皮光合作用对果实干物质积累的重要贡献,为充分挖掘薄... 详细信息

【目的】通过研究薄壳山核桃不同发育时期果实的外观形态和光合特性参数,并结合DCMU[3-(3,4-二氯苯基)-1,1-二甲基脲]抑制果实光合作用对其果实干质量的影响,探讨薄壳山核桃果实假果皮光合作用对果实干物质积累的重要贡献,为充分挖掘薄壳山核桃假果皮光合增产潜力和优势,进一步提高产量的技术途径提供参考。【方法】以薄壳山核桃果实为研究对象,在果实发育的关键时期授粉后80和120天测定果实的干/鲜质量、表面积、气体交换参数、叶绿素荧光参数及假果皮叶绿素(Chl)含量、RuBPC(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶)和PEPC(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶)活性的变化,并从7月15日(相当于75DAP)开始用DCMU对果实光合作用进行抑制处理,每周处理1次,直至9月12日果实收获时,分析DCMU处理对果实果长/果横径、果仁干/鲜质量和含油率的影响作用。【结果】1)从授粉后80~120天,薄壳山核桃果实鲜质量、干质量和表面积分别增加了579.33%、447.74%和227.39%(P0.05);3)薄壳山核桃果实假果皮叶绿素含量显著降低63.15%(P0.05);4)PAR=1801μmol·m^-2 s^-1时,薄壳山核桃果实假果皮最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(Y(Ⅱ))、光化学猝灭系数(qP)和电子传递速率(ETR)未发生显著变化(P>0.05);5)DCMU处理薄壳山核桃后,其果实果长和果横径分别减少5.07%和4.56%(P<0.05),果仁干质量和鲜质量分别减少12.29%和14.97%(P<0.05),含油率减少2.48%(P<0.05)。【结论】随果实发育进程,薄壳山核桃果实假果皮光合能力明显降低。从授粉后80~120天,果实假果皮叶绿素含量、RuBPC酶和PEPC酶活性明显降低是P g显著下降的原因;而叶绿素荧光参数未发生显著变化,表明果实发育期间其假果皮光合机构稳定。DCMU处理后果实大小以及果实品质明显下降,薄壳山核桃果实光合作用对其果实干物质积累具有重要的作用。

关键词：果实发育薄壳山核桃假果皮光合特性干物质积累

磷饥饿胁迫下两种山核桃叶肉与根尖细胞的超微结构特征

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电子显微学报 2022年第3期41卷 283-292页

作者：沈欣雨徐舰航王正加浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地浙江杭州311300

目的:解析在磷饥饿胁迫下叶肉和根尖在亚细胞层面的超微结构变化特征。方法:以半年生山核桃和薄壳山核桃幼苗为试材,采用水培方法进行磷胁迫对比处理,用透射和扫描电镜观察叶肉和根尖细胞的超微结构。结果:相比对照组,缺磷处理下,两种... 详细信息

目的:解析在磷饥饿胁迫下叶肉和根尖在亚细胞层面的超微结构变化特征。方法:以半年生山核桃和薄壳山核桃幼苗为试材,采用水培方法进行磷胁迫对比处理,用透射和扫描电镜观察叶肉和根尖细胞的超微结构。结果:相比对照组,缺磷处理下,两种山核桃属植物叶肉细胞中均出现内含物增加,核质电子密度升高,常染色质与异染色质相间分布更均匀,淀粉粒膨大、叶绿体肿胀,线粒体拟核区扩大,嗜锇颗粒、蛋白-脂类复合体球、磷酸钙颗粒物质基本不可见;气孔均关闭,蜡质分泌增多。其中,山核桃叶绿体基粒片层紊乱,线粒体明显减少,多泡体结构增加,根尖细胞降解严重,而薄壳山核桃类囊体仍垛叠规则,根尖细胞完整、仅内部细胞器发生变化。结论:两种山核桃属植物在缺磷条件下的亚细胞超微结构变化相似,但薄壳山核桃亚细胞超微结构表现更稳定,表明其在缺磷胁迫下的适应能力与抗性更强。

关键词：山核桃薄壳山核桃磷饥饿胁迫超微结构

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山核桃基因组DNA提取及RAPD引物筛选

安徽农业大学学报 2005年第1期32卷 72-76页

作者：王正加黄坚钦郭传友梁锦锋北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 浙江林学院生命科学学院临安311300 南京林业大学森林资源与环境学院南京210037

分别用SDS法、CTAB法、简易CTAB法及高盐低pH法提取山核桃干叶的基因组DNA并进行了检测比较。结果显示,SDS法更适合于山核桃基因组DNA的提取;对 600条 10碱基的随机引物进行了初筛和复筛,结果筛选出了 20条扩增多态性强、稳定性好的引物... 详细信息

分别用SDS法、CTAB法、简易CTAB法及高盐低pH法提取山核桃干叶的基因组DNA并进行了检测比较。结果显示,SDS法更适合于山核桃基因组DNA的提取;对 600条 10碱基的随机引物进行了初筛和复筛,结果筛选出了 20条扩增多态性强、稳定性好的引物,作为全部基因组的扩增引物。

关键词：山核桃 DNA提 RAPD引物筛选

37个新引进的薄壳山核桃品种遗传多样性SSR分析

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安徽农业大学学报 2013年第1期40卷 42-46页

作者：施娟娟叶生月俞世群王正加浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安311300 浙江省桐庐县林业技术推广站桐庐311500

对37个新引进的薄壳山核桃品种生物学性状进行分析,采用已开发的薄壳山核桃引物和山核桃引物,通过SSR(simple sequence repeat)技术对这37个品种进行遗传多样性分析。结果表明,引进的37个品种遗传多样性不明显,筛选获得的14对SSR引物共... 详细信息

对37个新引进的薄壳山核桃品种生物学性状进行分析,采用已开发的薄壳山核桃引物和山核桃引物,通过SSR(simple sequence repeat)技术对这37个品种进行遗传多样性分析。结果表明,引进的37个品种遗传多样性不明显,筛选获得的14对SSR引物共扩增出112个等位基因位点,平均每对引物获得8个等位基因位点,最多是20个,最少是3个,多态性最高为100%;通过Ntsys2.10软件对37个薄壳山核桃品种进行聚类分析,得出遗传相似系数为0.607～0.955,平均0.781,Eliott和Schley关系最近,Van Daman与Disirable,Van Daman和Eliott,Barton与Owens,Owens与Stuat,Disirable与Dependable间的遗传关系最远。这表明美国薄壳山核桃品种间遗传多样性较低。

关键词：薄壳山核桃 SSR 遗传多样性

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26种冬青属植物遗传多样性分析

西北植物学报 2011年第3期31卷 504-510页

作者：章建红高云振张斌王正加浙江省宁波市农业科学研究院林业研究所浙江宁波315040 浙江省三门县林业特产局浙江三门317111 海盐县农业经济局林特花卉站浙江海盐314300 浙江农林大学浙江临安311300

以26种冬青属植物种质资源为研究材料,利用RAPD和AFLP技术对基因组DNA进行扩增,以研究其物种间遗传多样性以及亲缘关系.结果表明:在RAPD分析中,从400条10个碱基的寡核苷酸引物中筛选出反应稳定、扩增性强、重复性好的引物20个,共扩增出... 详细信息

以26种冬青属植物种质资源为研究材料,利用RAPD和AFLP技术对基因组DNA进行扩增,以研究其物种间遗传多样性以及亲缘关系.结果表明:在RAPD分析中,从400条10个碱基的寡核苷酸引物中筛选出反应稳定、扩增性强、重复性好的引物20个,共扩增出312条多态性条带,多态率为95.41%;聚类分析显示26种冬青属植物间,布利奥特夫人枸骨叶冬青和黄果在AFLP分析中,10对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段,共扩增出350条谱带,其中336条具有多态性,占95.96%.综合RAPD和AFLP聚类结果,枸骨、无刺枸骨和日拉斯纳尔逊枸骨的亲缘关系较近,钝齿冬青、金宝石钝齿冬青和龟甲冬青三者的亲缘关系较近,可为冬青属植物的杂交育种与种质创新提供理论依据.

关键词：冬青属 RAPD AFLP 遗传多样性