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水稻矮秆基因d62（t）的精细定位

水稻矮秆基因d62（t）的精细定位

作者：樊叶杨浙江大学

学位级别：硕士

本研究所用矮秆突变体来自于本实验室在组织培养过程中获得的粳稻品种中花11号的转基因株系。矮秆表型在T代才出现，T代的表型分离，表明矮秆表型可能源于单隐性突变．矮化植株的表型与矮秆突变体dwarf-1相似：茎短而壮;叶片颜色深绿、... 详细信息

本研究所用矮秆突变体来自于本实验室在组织培养过程中获得的粳稻品种中花11号的转基因株系。矮秆表型在T代才出现，T代的表型分离，表明矮秆表型可能源于单隐性突变．矮化植株的表型与矮秆突变体dwarf-1相似：茎短而壮;叶片颜色深绿、宽而短，不卷曲或扭曲，而且叶尖有发枯的现象。我们将这个基因暂命名为d62(t)。为了克隆d62(t)，我们利用正常表型的杂合株系(在这个位点上是D/d基因型)与籼稻品种Kasalath杂交，获得有表型分离的TCF群体，然后进行分子定位。初步定位显示第1染色体短臂上的两个SSR标记RM5302和RM1与d62(t)紧密连锁。用868个F突变体个体进一步精细定位，发现d62(t)与C62003和RM6451共分离。通过与已公布的高精度遗传图谱和粳稻品种日本晴的全基因组序列的比较(http://***/)，发现该区域的重组频率比较小，且RM1和C62003所处的区域存在倒置现象。激素处理研究结果表明，突变体对GA及BR均不敏感，说明d62(t)可能并不参与GA及BR的合成途径，而有可能参与激素信号传导途径。从表型、精细定位结果与激素处理结果的比较来看，d62(t)与位于定位区间两端的两个矮秆基因d2和d18不等位。

关键词：水稻矮秆基因精细定位

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籼稻稻米碾磨与外观品质性状的QTL定位

遗传 2012年第12期34卷 1591-1598页

作者：梅德勇朱玉君樊叶杨中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室杭州310006

文章利用籼籼交组合特青/IRBB衍生的重组自交系群体,在2个环境下对稻米碾磨品质和外观品质进行QTL定位。共计检测到控制稻米碾磨品质的QTL 12个和控制外观品质的QTL 18个,包括糙米率8个、精米率2个、整精米率2个、粒长7个、粒宽5个和长... 详细信息

文章利用籼籼交组合特青/IRBB衍生的重组自交系群体,在2个环境下对稻米碾磨品质和外观品质进行QTL定位。共计检测到控制稻米碾磨品质的QTL 12个和控制外观品质的QTL 18个,包括糙米率8个、精米率2个、整精米率2个、粒长7个、粒宽5个和长宽比6个,这些QTL分布于除第4和12染色体外的其他10条染色体上。其中,第3染色体涵盖粒形基因GS3的区域对粒长、长宽比、糙米率和整精米率具有较大效应,其献率分别为56.71%、42.23%、10.05%和4.91%;第5染色体涵盖粒宽基因GW5的区域对粒宽、长宽比、糙米率和精米率具有较大效应,表型变异贡献率分别为59.51%、36.68%、19.51%和4.56%。此外,第6染色体涵盖直链淀粉含量基因Wx的区域对糙米率和精米率具有较小效应。GS3和GW5对糙米率和粒形具有重要作用。

关键词：碾磨品质粒形数量性状座位籼稻

水稻千粒重QTL qtgw1基因的精细定位

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核农学报 2014年第2期28卷 217-223页

作者：林文春余守武阮关海樊叶杨谢建坤江西师范大学生命科学学院江西南昌330022 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所浙江农科种业有限公司浙江杭州310021 中国水稻研究所国家水稻改良中心浙江杭州310006

粒重是水稻产量性状的主要构成因子及影响稻米品质的重要因素之一。本研究针对第1染色体上对千粒重具有重要作用的QTL进行精细定位。利用从珍汕97/密阳46重组自交系高代群体中挑选出在第1染色体短臂RM151-RM10404、RM151-RM10425和RM134... 详细信息

粒重是水稻产量性状的主要构成因子及影响稻米品质的重要因素之一。本研究针对第1染色体上对千粒重具有重要作用的QTL进行精细定位。利用从珍汕97/密阳46重组自交系高代群体中挑选出在第1染色体短臂RM151-RM10404、RM151-RM10425和RM1344-RM5359区间呈杂合而背景基本纯合的5个剩余杂合体(Residual Heterozygous Line,RHL),衍生5个F2:3群体(RHL群体),对千粒重QTL进一步分析,在RM151-RM1344区间检测到控制千粒重的QTL qtgw1,其增效等位基因均来自母本珍汕97。应用SSR标记检测,从其中一个RHL衍生群体中筛选到分离区间为RM151-RM3746,RM151-RM10402和RM10381-RM10425的4个单株,衍生4个F2群体(FF群体),利用该群体将QTL qtgw1定位在RM10376-RM10404之间。从其中一个F2群体筛选到分离区间为RM10381-RM10402,RM10390-RM10425和RM1344-RM10425的3个单株,衍生3个F2群体(L群体),根据3个L群体QTL分析结果,将千粒重QTL qtgw1定位在RM10381-RM10404,物理距离约246.6 kb。

关键词：水稻数量性状座位千粒重精细定位 qtgw1

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水稻第1染色体千粒重QTL的遗传分解

科学通报 2008年第12期53卷 1389-1394页

作者：余守武杨长登樊叶杨庄杰云李西明中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室国家水稻改良中心杭州310006

千粒重是提高水稻增产潜力和改良稻米品质的重要因素之一．本研究在千粒重QTLqTGWT1-1初定位的基础上，利用分别在第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合而背景纯合的2个水稻剩余杂合体（residual heterozygous line，RHL... 详细信息

千粒重是提高水稻增产潜力和改良稻米品质的重要因素之一．本研究在千粒重QTLqTGWT1-1初定位的基础上，利用分别在第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合而背景纯合的2个水稻剩余杂合体（residual heterozygous line，RHL），衍生两个F6群体．对千粒重QTL进一步分析，在初定位的QTLqTGWT1-1所在区间检测到两个效应大小相近、方向一致的紧密连锁QTLGw1-1和Gw1-2．应用SSR标记检测，从其中一个RHL衍生群体中筛选到杂合区间分别为RM151-RM10404，RM10381～RM243。RM10435～RM259和RM10398～RM5359的4个单株．应用SSR标记进一步检测4套F2群体，从每套F2群体中分别筛选到母本珍汕97B和父本密阳46纯合型材料各10株，自交获得4套近等基因系材料并考察其千粒重．利用交迭重组染色体片段代换系分析法，将千粒重QTLGw1—1和Gw1-2分别界定于392．9kb的RM10376～RM10398区间和308．5kb的RM10404-RM1344区间，增效等位基因均来自母本珍汕97B，两个QTL之间表现为积加作用．这两个QTL的遗传分解为其克隆及水稻产量和品质的分子育种奠定基础．

关键词：水稻第1染色体短臂剩余杂合体近等基因系 QTL 千粒重

应用二种定位法比较不同世代水稻产量性状QTL的检测结果

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Acta Genetica Sinica 2001年第5期28卷 458-464页

作者：庄杰云樊叶杨吴建利夏英武郑康乐中国水稻研究所国家水稻改良中心浙江大学核农业科学研究所杭州310029

应用珍汕９７Ｂ／密阳４６的Ｆ２和重组自交系（ＲＩＬ）群体，建立ＲＦＬＰ连锁图，检测控制稻谷产量及其５个构成因子的ＱＴＬ。结果表明，具有较大加性效应者，能同时在Ｆ２和ＲＩＬ群体中检测到。而且，在重组自交系群体中，发现设... 详细信息

应用珍汕９７Ｂ／密阳４６的Ｆ２和重组自交系（ＲＩＬ）群体，建立ＲＦＬＰ连锁图，检测控制稻谷产量及其５个构成因子的ＱＴＬ。结果表明，具有较大加性效应者，能同时在Ｆ２和ＲＩＬ群体中检测到。而且，在重组自交系群体中，发现设重复的表型鉴定与基于单株的表型鉴定，对效应较高的ＱＴＬ的检测影响不大。

关键词：数量性状基因加性效应 RFLP标记水稻产量性状

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一种水稻微效QTL精细定位和克隆新途径

中国水稻科学 2021年第4期35卷 407-414页

作者：朱玉君左紫薇张振华樊叶杨中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室/国家水稻改良中心杭州 310006

水稻重要农艺性状一般由少数主效QTL和大量微效QTL共同控制.水稻主效QTL克隆已取得显著进展,而微效QTL由于遗传作用弱,表型鉴定易受测量误差影响,克隆进展缓慢,但微效QTL在水稻重要农艺性状调控中的作用不容忽视.本文介绍了一种水稻微效... 详细信息

水稻重要农艺性状一般由少数主效QTL和大量微效QTL共同控制.水稻主效QTL克隆已取得显著进展,而微效QTL由于遗传作用弱,表型鉴定易受测量误差影响,克隆进展缓慢,但微效QTL在水稻重要农艺性状调控中的作用不容忽视.本文介绍了一种水稻微效QTL精细定位和克隆的新途径.该途径包含2个阶段:1)应用剩余杂合体构建近等基因系群体进行目标QTL的精细定位;2)应用基因编辑技术创制候选基因突变体验证基因功能.应用该策略笔者所在团队在水稻第1染色体长臂精细定位了6个微效粒重和粒型QTL,并成功克隆首个微效粒重QTL.该技术可在方法上为水稻QTL克隆及新种质创制提供更多选择.

关键词：水稻粒型微效QTL 图位克隆

来源：评论

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分子标记辅助选择在水稻育种中的应用

核农学报 2012年第5期26卷 756-761页

作者：朱玉君樊叶杨黄得润庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室浙江杭州310006

分子标记辅助选择与传统育种技术相结合,可提高育种效率,缩短育种周期。本文介绍了分子标记辅助选择在水稻育种上取得的主要进展,并讨论了该技术在实际应用中存在的问题和对策。

关键词：分子标记辅助选择病虫害抗性米质性状产量性状基因聚合

水稻硅含量QTL qHUS6.1的精细定位

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科学通报 2010年第23期55卷 2302-2306页

作者：龚俊义吴季荣王凯樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室杭州310006

硅是水稻的有益元素之一.针对位于水稻第6染色体短臂的谷壳硅含量QTLqHUS6.1,从前期建立的剩余杂合体衍生群体自交后代中,经目标区间的13个SSR标记检测,挑选出杂合区间彼此交迭的3个剩余杂合体,构建了3套近等基因系.在田间种植条件下,... 详细信息

硅是水稻的有益元素之一.针对位于水稻第6染色体短臂的谷壳硅含量QTLqHUS6.1,从前期建立的剩余杂合体衍生群体自交后代中,经目标区间的13个SSR标记检测,挑选出杂合区间彼此交迭的3个剩余杂合体,构建了3套近等基因系.在田间种植条件下,测量成熟后水稻谷壳、剑叶和茎秆的硅含量.表型分布和方差分析结果都显示,异质区间为RM19410~RM5815的近等基因系具有显著的基因型效应,而异质区间为RM4923~RM19410和RM19417~RM204的近等基因系未呈显著变异.经比较,将qHUS6.1定位在RM19410和RM19417之间约64.2kb,含9个候选基因的区域内,该QTL作用较强且同时控制水稻谷壳、剑叶和茎秆硅含量,增效等位基因来自父本密阳46,总体上呈加性遗传.本研究为qHUS6.1的克隆奠定了基础,并为QTL精细定位材料的构建和应用提供了新思路.

关键词：水稻硅含量 QTL 精细定位剩余杂合体近等基因系

水稻第1染色体短臂粒长和粒宽QTL的精细定位

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中国水稻科学 2008年第5期22卷 465-471页

作者：余守武樊叶杨杨长登李西明中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室/国家水稻改良中心浙江杭州310006

以第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合、背景基本纯合的2个水稻剩余杂合体(RHL)衍生两个F6群体,将控制水稻粒长和粒宽的2个粒形QTL(qGL-1和qGW-1)定位于RM3746-RM243区间内。在此基础上,应用SSR标记检测,从其中1个群体... 详细信息

以第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合、背景基本纯合的2个水稻剩余杂合体(RHL)衍生两个F6群体,将控制水稻粒长和粒宽的2个粒形QTL(qGL-1和qGW-1)定位于RM3746-RM243区间内。在此基础上,应用SSR标记检测,从其中1个群体中筛选到杂合区间分别为RM151-RM10404、RM10398-RM5359、RM10435-RM259和RM10381-RM243的4个单株,应用SSR标记进一步检测4套F2群体,从每套F2群体中分别筛选到母本珍汕97B和父本密阳46纯合型材料各10株,自交获得4套近等基因系材料并考查其粒长和粒宽。利用交迭重组染色体片段代换系分析法,将控制粒长和粒宽的QTL(qGL-1和qGW-1)界定于437.5kb的RM10390-RM1344区间和392.9kb的RM10376-RM10398区间,增效等位基因均来自母本珍汕97B,表明qGL-1和qGW-1是紧密连锁的不同座位。

关键词：粒形剩余杂合体近等基因系数量性状座位水稻精细定位