检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

相容溶质四氢嘧啶的微生物合成研究进展

生物工程学报 2022年第3期38卷 868-881页

作者：张鑫舒志万李永臻邢江娃王嵘沈国平朱德锐青海大学医学院基础医学研究中心青海西宁810016

四氢嘧啶(ectoine)作为一种氨基酸的衍生物,是嗜盐微生物胞内重要的天然次级代谢物,具有保护细胞和稳定生物大分子的功能,可广泛应用于药物制备佐剂、器官移植与保存、皮肤创伤修复与新型化妆品研发等生物医学领域。由于四氢嘧啶的医用... 详细信息

四氢嘧啶(ectoine)作为一种氨基酸的衍生物,是嗜盐微生物胞内重要的天然次级代谢物,具有保护细胞和稳定生物大分子的功能,可广泛应用于药物制备佐剂、器官移植与保存、皮肤创伤修复与新型化妆品研发等生物医学领域。由于四氢嘧啶的医用价值和商业市场需求,文中从野生菌株的筛选与诱变育种、构建基因工程菌株与系统代谢整合工程菌株、四氢嘧啶的优化发酵与生产工艺以及抽提纯化工艺等方面,系统论述了四氢嘧啶高效积聚和过量化生产研究策略,并展望多组学、计算生物学及“细胞工厂”等技术在后续四氢嘧啶高效生产上的应用前景。

关键词：四氢嘧啶紫外诱变基因工程系统代谢分批发酵

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

青藏高原小柴旦盐湖微生物群落结构及多样性

水生态学杂志 2017年第5期38卷 55-64页

作者：刘静张欣沈国平封希媛龙启福朱德锐青海大学医学院基础医学研究中心西宁810016 北京工业大学计算机学院北京100022 青海民族大学西宁810016

通过探究小柴旦盐湖微生物群落结构与多样性,为盐湖微生物资源的开发利用和生态保护提供重要的理论参考依据。利用Illumina Mi Seq测序平台对小柴旦盐湖细菌和古菌的16S rRNA基因(V3~V5区)进行高通量测序,获得细菌和古菌的物种注释OTU(O... 详细信息

通过探究小柴旦盐湖微生物群落结构与多样性,为盐湖微生物资源的开发利用和生态保护提供重要的理论参考依据。利用Illumina Mi Seq测序平台对小柴旦盐湖细菌和古菌的16S rRNA基因(V3~V5区)进行高通量测序,获得细菌和古菌的物种注释OTU(Operational Taxonomic Units)数目分别为870和410,其中分类地位明确的细菌有18门、24纲、135属,古菌2门、4纲、22属。细菌优势类群依次是厚壁菌门(Firmicutes,34.05%)、变形菌门(Proteobacteria,32.91%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.01%)和蓝细菌门(Cyanobacteria,8.46%);优势种群依次是芽孢杆菌属(Bacillus,21.53%)、Chloroplast-norank(6.65%)和海杆菌属(Marinobacter,4.05%)。古菌的优势类群和优势种群主要是未确定分类地位的沃斯古菌门(Woesearchaeota DHVEG-6,80.84%),相关的系统分类学尚需深入研究。小柴旦盐湖微生物的种群结构复杂、类群丰富,细菌Shannon多样性指数(4.77±0.45)显著高于古菌(2.79±0.45),且存在大量的新种资源。

关键词：小柴旦盐湖高通量测序微生物多样性种群结构聚类分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

青海湖嗜盐微生物系统发育与种群多样性

生物多样性 2012年第4期20卷 495-504页

作者：朱德锐刘建韩睿沈国平杨芳龙启福刘德立华中师范大学生命科学院湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室武汉430079 青海大学医学院西宁810016 青海大学农林科学院西宁810016

青海湖是我国境内最大的内陆咸水湖泊,水体中嗜盐微生物的生存现状尚不明确。本研究利用OSM培养基(Oesterhelt-Stoeckenius medium),从湖域生境水样中富集和分离获得嗜盐微生物35株,以中度嗜盐菌为主,约占62.9%(22株);轻度嗜盐菌次之,约... 详细信息

青海湖是我国境内最大的内陆咸水湖泊,水体中嗜盐微生物的生存现状尚不明确。本研究利用OSM培养基(Oesterhelt-Stoeckenius medium),从湖域生境水样中富集和分离获得嗜盐微生物35株,以中度嗜盐菌为主,约占62.9%(22株);轻度嗜盐菌次之,约占22.9%(8株);耐盐菌与非嗜盐菌分别占11.4%(4株)和2.9%(1株)。根据16SrDNA序列的系统发育分析表明,γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)菌株最多,约占68.6%(24株);芽孢杆菌纲次之,约占17.1%(6株);放线菌纲、α-变形菌纲(α-Proteobacteria,1株)和散囊菌亚纲(Eurotiomycetidae,1株)的类群相对较少。这些嗜盐菌属于14个属,其中以海洋螺菌目盐单胞菌属(Halomonas)为优势种群,共计10株;其次为海单胞菌属(Marinomonas),共4株。中度嗜盐菌盐单胞菌属应为青海湖嗜盐菌的优势种群,可能因为相对偏低的盐度环境,为其长期进化和适应性生存提供了必要条件。

关键词：青海湖嗜盐微生物系统发育种群多样性 16SrDNA

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

呋喃丹多克隆抗体的制备与初步应用

环境科学研究 2008年第3期21卷 175-179页

作者：贲亚琍朱德锐胡芹芹李娜熊丽刘德立华中师范大学生命科学学院

以呋喃丹为原料,在强碱性（pH〉12）下水解生成呋喃酚,与对硝基苯氯甲酸酯和6-氨基己酸反应,合成呋喃丹半抗原,即6-[[（2,3-二氢-2,2-二甲基-7-苯并呋喃基氧）羰基]氨基]己酸（BFNH）.通过活性酯法将半抗原与载体BSA偶联制备的呋喃丹人... 详细信息

以呋喃丹为原料,在强碱性（pH〉12）下水解生成呋喃酚,与对硝基苯氯甲酸酯和6-氨基己酸反应,合成呋喃丹半抗原,即6-[[（2,3-二氢-2,2-二甲基-7-苯并呋喃基氧）羰基]氨基]己酸（BFNH）.通过活性酯法将半抗原与载体BSA偶联制备的呋喃丹人工免疫抗原免疫家兔获得了抗呋喃丹多克隆抗体,免疫抗原BFNH-BSA和包被抗原BFNH-OVA的结合比分别为18∶1和5∶1.采用辛酸-硫酸铵二步沉淀法纯化兔Ⅱ抗体,抗体最高效价为5.12×10^6,重、轻链分子量分别约为55和22 ku.通过间接竞争ELISA鉴定抗体质量,测得在10^-7～0.01 mg/mL范围内,抑制率与标准农药浓度的线性关系显著,呋喃丹残留最低检测限为10^-7mg/mL,与5种结构相似的氨基甲酸酯类的交叉反应率低于10%.并初步应用于果蔬样品呋喃丹残留的快速检测.

关键词：呋喃丹多克隆抗体 ELISA 应用检测

Ectoine高产菌株Halomonas ***26的鉴定及紫外诱变选育

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物学杂志 2020年第4期37卷 31-35页

作者：田磊张芳沈国平高翔龙启福朱德锐青海大学医学院基础医学研究中心西宁810016

通过紫外线诱变小柴旦盐湖盐单胞菌菌株Halomonas ***26,以获得高产Ectoine的突变株,为工程生产Ectoine提供优良的发酵菌源。采用形态学观察、生理生化试验及16S rRNA基因测序分析明确菌株的分类地位。紫外诱变筛选Ectoine产量超过原始... 详细信息

通过紫外线诱变小柴旦盐湖盐单胞菌菌株Halomonas ***26,以获得高产Ectoine的突变株,为工程生产Ectoine提供优良的发酵菌源。采用形态学观察、生理生化试验及16S rRNA基因测序分析明确菌株的分类地位。紫外诱变筛选Ectoine产量超过原始菌株2倍以上的正向突变菌株,HPLC测定胞内Ectoine产量,并对突变株进行连续培养,研究Ectoine的产量稳定性。实验结果显示:原始菌株XH26(Ectoine优化产量456.82 mg/L±15.72 mg/L,CDW 0.71 g/g±0.04 g/g),经9轮紫外循环诱变处理后(50 s为最佳诱变时间),获得7株高产Ectoine突变菌,Ectoine产量均大幅提高(约200%)。其中,积聚量最大的菌株HU09-32,产量可达1351.09 mg/L±17.69 mg/L(增幅290%),将7株突变菌连续培养40 d(接种2 d/次),胞内Ectoine产量稳定,生长特性、增殖速度与积聚量明显优于原始菌株XH26,具有很好的发酵生产和工业应用潜力。

关键词：盐单胞菌 Ectoine 紫外诱变积聚量突变育种

青藏高原克鲁克-托素湖湿地系统微生物多样性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

地球与环境 2017年第4期45卷 399-407页

作者：龙启福封希媛刘静张欣沈国平朱德锐青海大学医学院基础医学研究中心西宁810016 青海民族大学计算机系西宁810007 北京工业大学计算机学院北京100022

克鲁克湖(Keluke Lake)和托素湖(Tuosu Lake)是青藏高原重要的湿地和水禽自然保护区,其水体微生物的多样性有待研究。利用Illumina测序平台进行16S rRNA基因(V3-V4区)高通量测序,并分析两湖水体微生物的群落结构和多样性。结果表明淡水... 详细信息

克鲁克湖(Keluke Lake)和托素湖(Tuosu Lake)是青藏高原重要的湿地和水禽自然保护区,其水体微生物的多样性有待研究。利用Illumina测序平台进行16S rRNA基因(V3-V4区)高通量测序,并分析两湖水体微生物的群落结构和多样性。结果表明淡水克鲁克湖和咸水托素湖的物种注释OTU数目分别为331和148,获得克鲁克湖的已知细菌种类为16门34纲66属;托素湖为9门19纲54属。克鲁克湖的微生物优势类群以变形菌门(Proteobacteria)为主,次为蓝菌门(Cyanobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其优势种群是未确定种属的蓝细菌、弓形杆菌属(Arcobacter)和盐单胞菌属(Halomonas)。托素湖的优势类群以变形菌门为主,次为厚壁菌门(Firmicutes),优势种群是盐单胞菌属。克鲁克湖的微生物物种丰富度、多样性和分布均匀度均显著高于咸水托素湖,但托素湖的物种优势度明显高于克鲁克湖。两湖优势微生物的属群分布与环境因子存在明显的正相关,此为高原湿地生态系统的环境监测与保护提供参考依据。

关键词：青藏高原克鲁克湖托素湖高通量测序微生物多样性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

微生物学报 2022年第3期62卷 1083-1098页

作者：张鑫王智博缪增强邢江娃王嵘李永臻朱德锐沈国平青海大学医学院基础医学研究中心青海西宁810016

【目的】探究盐适应条件下坎帕尼亚盐单胞菌(Halomonas campaniensis)的差异基因表达水平,挖掘四氢嘧啶(ectoine)合成代谢相关联的差异基因。【方法】设置无盐组NS (0 mol/L NaCl)、中盐组MS (1.5 mol/L NaCl)和高盐组HS (2.5 mol/L NaC... 详细信息

【目的】探究盐适应条件下坎帕尼亚盐单胞菌(Halomonas campaniensis)的差异基因表达水平,挖掘四氢嘧啶(ectoine)合成代谢相关联的差异基因。【方法】设置无盐组NS (0 mol/L NaCl)、中盐组MS (1.5 mol/L NaCl)和高盐组HS (2.5 mol/L NaCl),培养H. campaniensis XH26菌株,利用IlluminaHiSeq测序进行转录组学分析,筛选四氢嘧啶合成代谢关联的差异基因,并进行qRT-PCR验证。【结果】菌株XH26胞内四氢嘧啶的积累量与盐度变化密切相关,1.5mol/LNaCl时积聚量最大为419.2mg/L。转录组测序(n=3/组)能定位到基因组测序序列的数量统计为87.24%–95.87%,共注释操纵子748个(涉及2 182个基因),转录起始-终止位点941个,预测新转录本456个,上调基因385个和下调基因326个(涉及245个KEGG通路)。组间NSvsMS分析表明,合成基因ectABC和lysC表达上调以促进四氢嘧啶生成,关联基因gltB、gltD、davT、hisD、alh-9、betA、acnB、pckA以及gadA表达上调,参与四氢嘧啶合成关联通路的上游调控。比较组MSvsHS分析表明,基因ectA、acnB、pckA、gadA和gdhA表达下调致使四氢嘧啶产量减少。qRT-PCR验证结果与组学测序的表达趋势相一致。【结论】四氢嘧啶生物合成与Asp(或天冬氨酸半缩醛)、上游氨基酸代谢网络(Asn、Glu、Gln和His)以及三羧酸循环(琥珀酸、延胡索酸和草酰乙酸)密切相关,此为后续四氢嘧啶合成途径的优化和代谢通路的整合设计提供重要的参考依据。

关键词：坎帕尼亚盐单胞菌 Illumina HiSeq 四氢嘧啶盐适应转录组分析 qRT-PCR

西藏扎布耶盐碱湖细菌的多样性与分离菌株的生长特性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

微生物学通报 2023年第12期50卷 5286-5299页

作者：陶宇杰舒志万郭敏高翔王嵘沈国平韩睿朱德锐青海大学医学院基础医学研究中心青海西宁810016 青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室青海西宁810016

【背景】扎布耶湖位于青藏高原地区,是以水体中富含高浓度CO_(3)^(2−)、HCO_(3)^(−)和Na^(+)为显著特性的盐碱湖,因其地理位置高寒、高海拔,人迹罕至,涉及该盐湖微生物的研究相对较少。【目的】系统探究湖水中细菌多样性和菌种资源等,... 详细信息

【背景】扎布耶湖位于青藏高原地区,是以水体中富含高浓度CO_(3)^(2−)、HCO_(3)^(−)和Na^(+)为显著特性的盐碱湖,因其地理位置高寒、高海拔,人迹罕至,涉及该盐湖微生物的研究相对较少。【目的】系统探究湖水中细菌多样性和菌种资源等,发掘可利用的潜在菌种。【方法】采用Illumina测序16S rRNA基因V3−V4区分析扎布耶湖细菌的群落结构组成、物种多样性特征;采用纯培养筛选分离可培养细菌,明确分离菌株分类学地位、生长特性及产酸能力,同时测定分离菌株四氢嘧啶(ectoine)、吲哚乙酸(3-indoleacetic acid,IAA)和胞外聚合物(extracellular polymeric substances,EPS)的积聚量。【结果】Illumina测序明确分类地位的细菌有21门44纲86目583属,其中优势门类群是变形菌门(Proteobacteria,25.11%−67.60%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,4.84%−35.02%)和厚壁菌门(Firmicutes,1.24%−11.01%),优势属类群是克雷伯氏菌属(Klebsiella,0.01%−9.53%)、盐单胞菌属(Halomonas,0.54%−8.75%)、芽单胞菌属(Gemmatimonas,2.39%−6.00%)和腈基降解菌属(Nitriliruptor,1.27%−6.26%)。纯培养法筛选获得嗜盐碱菌38株,其中芽孢杆菌属(Bacillus)23株(60.53%)和盐单胞菌属(Halomonas)10株(26.32%),菌株均具有耐盐碱和产酸能力(19.80%−29.68%)。大多数菌株能积聚四氢嘧啶、IAA和EPS,产量范围分别为1.36−175.59、0.27−8.69和0.02−0.22 g/g。【结论】扎布耶湖细菌群落结构与其他地区盐碱湖相似,但存在大量未明确分类学地位的细菌,分离菌株多具有耐盐碱及产酸特性。此外,还发现4株高效生产四氢嘧啶、3株生产吲哚乙酸和3株生产胞外聚合物的潜力菌株,为扎布耶盐湖微生物资源的开发利用奠定了基础。

关键词：扎布耶湖细菌多样性高通量测序纯培养法次级代谢物

高盐盐湖可分离嗜盐耐盐菌的种群多样性及四氢嘧啶产量评价

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物技术通报 2022年第1期38卷 168-178页

作者：张田田李永臻沈国平王嵘朱德锐邢江娃青海大学医学院基础医学研究中心西宁810016

为了解柴达木盆地茶卡盐湖、柯柯盐湖和小柴旦盐湖等三大硫酸镁亚型高盐盐湖可分离嗜盐耐盐菌的种群多样性,采用RM中、高盐培养基筛选分离可培养的嗜盐菌和耐盐菌,扩增16S rRNA基因序列进行种属鉴定和环境因子典范对应分析(CCA),选取优... 详细信息

为了解柴达木盆地茶卡盐湖、柯柯盐湖和小柴旦盐湖等三大硫酸镁亚型高盐盐湖可分离嗜盐耐盐菌的种群多样性,采用RM中、高盐培养基筛选分离可培养的嗜盐菌和耐盐菌,扩增16S rRNA基因序列进行种属鉴定和环境因子典范对应分析(CCA),选取优势菌属构建系统发育树,并采用高效液相色谱法(HPLC)检测次级代谢产物四氢嘧啶(Ectoine)积聚量,筛选高产菌株。结果表明三大盐湖共分离获得嗜盐和耐盐菌113株,优势种属为Bacillus(42株)、Staphylococcus(30株)和Halomonas(26株),各丰度与盐湖类型相关;其中中度嗜盐菌居多,其次为耐盐菌和弱嗜盐菌。系统发育分析表明Bacillus属存在5个进化分支,由6个种组成,Halomonas属存在6个进化分支,由7个种组成。HPLC检测四氢嘧啶积聚量,获得具有高产四氢嘧啶潜力菌株7株。这些研究结果说明柴达木盆地硫酸镁亚型高盐盐湖可分离嗜盐耐盐菌的优势菌属以Bacillus、Staphylococcus和Halomonas为主,且多为中度嗜盐菌,其高产四氢嘧啶的潜力菌株可用于后续四氢嘧啶发酵应用研究。

关键词：柴达木盆地高盐盐湖可培养细菌种群多样性四氢嘧啶