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衢州不断擦亮绿色底色

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6种禾本科植物GEF基因家族鉴定与抗旱性分析

衢州日报

作者：林敏方远鹏

本报讯（记者林敏通讯员方远鹏） 4月17日，在全市关注森林工作座谈会上，命名了柯城区姜家山乡等6个乡镇为“浙江省森林城镇”并授牌。至此，全市共有81个乡镇成功创建省级森林城镇，实现全覆盖。“近年来，我市高度重视生态文明... 详细信息

本报讯（记者林敏通讯员方远鹏） 4月17日，在全市关注森林工作座谈会上，命名了柯城区姜家山乡等6个乡镇为“浙江省森林城镇”并授牌。至此，全市共有81个乡镇成功创建省级森林城镇，实现全覆盖。“近年来，我市高度重视生态文明建设，以扩大森林面积、提升森林质量、增......

关键词：林业局负责人集体林权制度改革国土绿化流转面积森林城镇森林资源保护

来源： cnki报纸评论

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cnki报纸

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山地农业生物学报 2024年第4期43卷 1-10页

作者：申晨方远鹏谢鑫贵州大学农学院农业微生物特色重点实验室贵州贵阳550025

小G蛋白介导的鸟嘌呤三核苷酸磷酸/鸟嘌呤二核苷酸磷酸(GTP/GDP)信号通路对于植物抗性十分重要,鸟嘌呤核苷酸交换因子(Guanine Nucleotide Exchange Factor, GEF)可对多种小G蛋白进行调节。植物基因组中包括BIG(Brefeldin A-inhibited G... 详细信息

小G蛋白介导的鸟嘌呤三核苷酸磷酸/鸟嘌呤二核苷酸磷酸(GTP/GDP)信号通路对于植物抗性十分重要,鸟嘌呤核苷酸交换因子(Guanine Nucleotide Exchange Factor, GEF)可对多种小G蛋白进行调节。植物基因组中包括BIG(Brefeldin A-inhibited Guanine Nucleotide Exchange Protein)和GBF(Golgi Brefeldin A-Resistant Guanine Nucleotide Exchange Factor)两类GEF基因,目前,这些GEF基因的系统性鉴定与表达分析尚不明确。因此,本研究采用基因家族鉴定的方法,对禾本科GEF基因家族进行比较分析。结果表明:从6种禾本科(水稻Oryza sativa、小麦Triticum aestivum、节节麦Sorghum bicolor、高粱Aegilops tauschii、谷子Setaria italica、玉米Zea mays)基因组中获得58个GEF基因,分布于45条不同的染色体上。系统发育分析表明,禾本科GEF基因家族包含5个亚家族(BIG1/4、BIG2/3、BIG5、GNL2、GNON),并且存在单拷贝以及基因选择性保留特性。共线性分析进一步确定禾本科GEF基因存在复杂的演化历程。干旱表达结果显示,GEF基因家族在不同禾本科植物、不同亚家族以及拷贝水平上均已产生抗旱性分化。本研究结果将为禾本科作物的抗旱基因筛选提供基础。

关键词：禾本科鸟嘌呤核苷酸交换因子基因家族表达分析

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科研融入口腔材料学教学的探索与实践

口腔颌面修复学杂志 2024年第4期25卷 305-309页

作者：马新扬崔晓明唐成芳左艳萍王丹杨方远鹏西安医学院口腔医学院西安710075

通过将科学研究与口腔材料学教学相结合,把学科前沿融入课程教学内容,结合新的教学大纲及培养目标优化授课方式,使用科学研究的创新思维引导学生进行课程学习和自主式实验课设计,改善了学生对口腔材料学的学习积极性和主动性,提高了学... 详细信息

通过将科学研究与口腔材料学教学相结合,把学科前沿融入课程教学内容,结合新的教学大纲及培养目标优化授课方式,使用科学研究的创新思维引导学生进行课程学习和自主式实验课设计,改善了学生对口腔材料学的学习积极性和主动性,提高了学生解决分析问题的能力,实现了创新型医学人才的培养目标。

关键词：口腔材料学科研融入创新型人才混合式教学

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口腔材料学教法改革的探索与思考

牙体牙髓牙周病学杂志 2024年第7期29卷 426-430页

作者：马新扬崔晓明李雪左艳萍唐成芳王丹杨方远鹏许晓茹西安医学院口腔医学院口腔修复学教研室陕西西安710075 西安医学院口腔医学院口腔正畸学教研室陕西西安710075

口腔材料学是口腔医学专业的一门基础课程,对培养学生的临床工作与科学研究能力发挥着重要的指导作用。由于课程具有多学科交叉性、基础原理复杂性、涉及材料广泛性等特点,使教学过程中存在学生学习兴趣低、知识掌握程度差等问题。本文... 详细信息

口腔材料学是口腔医学专业的一门基础课程,对培养学生的临床工作与科学研究能力发挥着重要的指导作用。由于课程具有多学科交叉性、基础原理复杂性、涉及材料广泛性等特点,使教学过程中存在学生学习兴趣低、知识掌握程度差等问题。本文通过实施医文融合的“贴心课堂”、线上教学的“前课堂”、线下教学的“动课堂”、科研融入实验教学的“自主课堂”等改革方法,改善了学生对口腔材料学的学习积极性和主动性,提高了学生解决分析问题的能力,实现了创新型医学人才的培养目标。

关键词：口腔材料学多元化改革医文融合科研融入创新型人才

番茄PLC基因家族鉴定及抗番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)防御反应分析

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核农学报 2023年第2期37卷 230-240页

作者：方远鹏韦建明李云洲贵州大学农学院植物病理教研室贵州贵阳550025

番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗ToBRFV防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶... 详细信息

番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗ToBRFV防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶C(PI-PLC)7个,非特异性磷脂酶C(NPC)3个,7个PI-PLC蛋白均具备3个核心结构域(PLC_X c、PLC_Y c、C2)和1个EF_hand-like结构域,3个NPC蛋白均只具有Phosphoesterase结构域。10个番茄PLC蛋白按照结构相似度可以划分为7个分支,分别为NPC1、NPC2、NPC6、PI-PLC2、PI-PLC3、PI-PLC4、PI-PLC6。另外,10个番茄PLC蛋白的二级结构占比类似,但三级结构存在明显差异。共线性分析结果显示,番茄PLC基因与水稻、拟南芥、雷蒙德式棉PLC基因间分别存在3、12、16对共线性关系。最后,通过转录组测序方法,检测了PLC基因家族在接种ToBRFV后的相对表达水平,结果显示,SlNPC1、SlNPC6、SlPLC4在ToBRFV接种的样本中表达水平较高,其他PLC基因则在ToBRFV接种后表达水平降低。本研究为番茄抗ToBRFV研究和育种奠定了技术与理论基础。

关键词：番茄 PLC基因家族生物信息学抗病毒 ToBRFV

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不同牙体高度箍结构前牙桩冠的三维有限元分析

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西安交通大学学报（医学版） 2008年第4期29卷 391-393,427页

作者：方远鹏白乐康朱勇杨炼西安医学院口腔医学系陕西西安710021 西安交通大学医学院附属口腔医院陕西西安710004 重庆医科大学附属二院口腔科重庆400010

目的探讨桩冠修复中不同余留牙体高度及箍结构形式的应力分布特点和箍效应的生物力学机制。方法模拟临床建立箍包绕不同牙体高度的上颌中切牙烤瓷核桩冠三维有限元模型,通过静态加载分析牙本质受力情况。结果牙本质应力分布呈现出从颈... 详细信息

目的探讨桩冠修复中不同余留牙体高度及箍结构形式的应力分布特点和箍效应的生物力学机制。方法模拟临床建立箍包绕不同牙体高度的上颌中切牙烤瓷核桩冠三维有限元模型,通过静态加载分析牙本质受力情况。结果牙本质应力分布呈现出从颈部向根尖部逐渐增高的趋势。牙体预备形成箍结构修复后能减小牙根各部位应力值,减小程度依包绕部位和高度而变,箍结构包绕1mm牙体高度能明显降低牙体颈部应力值,包绕2mm牙体时应力降低反而不明显。结论冠边缘包绕1mm牙体可产生明显的箍效应,而包绕2mm牙体修复时应根据牙体情况而定。

关键词：残根三维有限元箍结构应力

水稻OsHDAC15基因的克隆、表达分析及原核表达

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植物生理学报 2021年第3期57卷 558-568页

作者：杜巧丽方远鹏蒋君梅李向阳谢鑫贵州大学农学院农业微生物特色重点实验室贵阳550025 贵州大学绿色农药与农业生物工程教育部重点实验室贵阳550025

组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase, HDAC)在植物生长发育、器官构建、逆境胁迫及激素信号应答中发挥重要作用,并作为调节染色质结构和基因表达的关键表观遗传因素。其中HDAC15蛋白是HDAC家族中第Ⅱ亚族(HDA) a类成员,在植物应对非... 详细信息

组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase, HDAC)在植物生长发育、器官构建、逆境胁迫及激素信号应答中发挥重要作用,并作为调节染色质结构和基因表达的关键表观遗传因素。其中HDAC15蛋白是HDAC家族中第Ⅱ亚族(HDA) a类成员,在植物应对非生物胁迫、病原物侵染等方面具有重要作用。本研究克隆了一个水稻(Oryza sativa) HDAC15基因,该基因全长1 611 bp,编码536个氨基酸,含50个磷酸化激酶作用位点和一个Histdeacetyl结构域,亚细胞定位于细胞核。系统发育分析表明,该基因编码蛋白与短柄草(Brachypodium distachyon)蛋白同源性最高。互作预测分析表明, HDAC15基因可被多种miRNA作用,从而实现对HDAC15基因功能表达的调控。实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, RT-qPCR)分析表明, Os HDAC15基因的表达具有组织特异性;在40℃高温胁迫下, OsHDAC15的表达水平在较短时间内受到诱导表达;在干旱(300 mmol·L^(-1), D-mannitol)、盐胁迫(250 mmol·L^(-1), NaCl)和外源脱落酸(200μmol·L^(-1),abscisicacid, ABA)处理条件下,基因表达量均显著上调。OsHDAC15基因同时也受激素吲哚乙酸(10μmol·L^(-1), indole-3-acetic acid, IAA)和4℃低温的诱导表达,峰值出现相对滞后,但最高表达量为对照组的27倍。同时为获得HDAC15可溶性蛋白,将其转化到大肠杆菌(Escherichia coli) Rosetta (DE3)中进行原核表达,结果显示, HDAC15蛋白最佳诱导温度和IPTG (异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷)浓度分别为30℃和0.8mmol·L^(-1)。该研究为HDAC15基因参与水稻组蛋白修饰,及其在组蛋白去乙酰化中的作用研究提供了证据。

关键词：水稻 OsHDAC15 基因克隆表达分析

胰岛素样生长因子-1对骨质疏松大鼠种植体周围骨组织的影响

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中国老年学杂志 2017年第1期37卷 44-46页

作者：朱勇唐成芳王峰左艳萍方远鹏西安医学院口腔医学系陕西西安710021

目的研究胰岛素样生长因子(IGF)-1局部应用对骨质疏松(OP)状态下种植体骨结合效果的影响。方法采用4个月龄SD雌性大鼠行卵巢摘除术建立OP模型,并以未切除卵巢的大鼠作为对照(假手术组)。建模成功后,切除卵巢的大鼠随机分为IGF-1组,OP组... 详细信息

目的研究胰岛素样生长因子(IGF)-1局部应用对骨质疏松(OP)状态下种植体骨结合效果的影响。方法采用4个月龄SD雌性大鼠行卵巢摘除术建立OP模型,并以未切除卵巢的大鼠作为对照(假手术组)。建模成功后,切除卵巢的大鼠随机分为IGF-1组,OP组和雌二醇(E2)组,于右侧股骨远心端植入纯钛种植体,IGF-1组种植窝内局部应用含10μg重组人胰岛素样生长因子(rh IGF)-1的明胶海绵,其余各组种植窝内放入空白明胶海绵。E2组皮下注射给予苯甲酸E2。术后8 w分别处死动物取股骨,制作脱钙切片,形态计量学观察种植体周结合骨板宽度、骨小梁宽度和骨小梁面积百分比。结果 IGF-1组种植体周结合骨板厚度、骨小梁宽度和骨小梁面积百分比显著高于OP组,骨板结合宽度与E2组及假手术组无显著差异,骨小梁宽度和骨小梁面积百分比与E2组无差异但显著低于假手术组。结论 IGF-1局部应用可增加种植体周围骨板厚度,骨板外周骨小梁宽度和骨小梁面积/视野面积百分比,有助于改善OP状态下的骨结合。

关键词：胰岛素样生长因子骨质疏松种植骨

高粱TCP转录因子基因SbTCP14的克隆和表达分析

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植物生理学报 2021年第7期57卷 1573-1581页

作者：屈志广杜巧丽方远鹏蒋君梅谢鑫贵州大学农学院农业微生物特色重点实验室贵阳550025

为探究高粱(Sorghum bicolor)TCP转录因子SbTCP14的表达特征,以高粱‘BTx623’为材料,对其进行基因克隆、生物信息学分析、响应胁迫表达及蛋白原核表达研究。结果显示,高粱SbTCP14基因CDS全长为1185 bp,其蛋白分子量大小为40.09 kDa,编... 详细信息

为探究高粱(Sorghum bicolor)TCP转录因子SbTCP14的表达特征,以高粱‘BTx623’为材料,对其进行基因克隆、生物信息学分析、响应胁迫表达及蛋白原核表达研究。结果显示,高粱SbTCP14基因CDS全长为1185 bp,其蛋白分子量大小为40.09 kDa,编码394个氨基酸,亚细胞定位于细胞核,无跨膜区和信号肽。系统进化分析表明高粱SbTCP14与玉米ZmTCP14的亲缘关系最近。qRT-PCR分析表明,在250 mmol·L^(-1)NaCl和20%PEG6000处理下,SbTCP14基因表达量呈先升高后降低模式。在300 mmol·L^(-1)甘露醇处理下,SbTCP14基因表达量在24 h内无显著变化。经0.01 mmol·L^(-1)IAA和1 mmol·L^(-1) SA处理后,SbTCP14基因表达量呈先升后降趋势。原核表达结果显示,SbTCP14蛋白最佳表达菌株为大肠杆菌BL21(DE3)菌株,最佳诱导温度为25℃,最佳IPTG浓度为0.8 mmol·L^(-1)。Western blot结果验证原核表达的蛋白为SbTCP14。

关键词：高梁 SbTCP14 基因克隆生物信息学分析表达分析