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江汉平原黑杨湿心材细菌微生物群落结构解析

华中农业大学学报 2024年第4期43卷 221-229页

作者：周靖钰黄国伟张亚东祁高富张新叶华中农业大学生命科学技术学院武汉430070 湖北省林业科学研究院武汉430079

为探究细菌微生物群落在杨树湿心材发病过程中的作用,以江汉平原6年生华石2号黑杨湿心材和正常材为研究对象,采用高通量测序对16S rRNA基因V5―V7区进行测序,对测序列结果进行信息学分析,利用主成分分析、α多样性指数分析和微生物网络... 详细信息

为探究细菌微生物群落在杨树湿心材发病过程中的作用,以江汉平原6年生华石2号黑杨湿心材和正常材为研究对象,采用高通量测序对16S rRNA基因V5―V7区进行测序,对测序列结果进行信息学分析,利用主成分分析、α多样性指数分析和微生物网络分析技术等方法,探究6年生黑杨湿心材和正常材细菌微生物群落结构和组成差异。结果表明:6年生华石2号黑杨湿心材和正常材细菌微生物群落属水平上,劳尔氏菌属和拟杆菌属的细菌丰度最高,拟杆菌属、多形单胞菌属和氢孢菌属在湿心材中占比显著高于正常材(P<0.05)。微生物群落功能分析显示,劳尔氏菌属多为植物病原菌,在湿心材中广泛存在。α多样性指数分析表明,湿心材群落多样性和物种分布均匀度高于正常材,物种总数低于正常材。共现网络研究表明,黑杨正常材细菌微生物之间存在较多的竞争和拮抗作用,群落较不稳定,湿心材细菌间存在更多的协同和互生关系,微生物群落较稳定。关键微生物分析表明,6年生黑杨湿心材中关键细菌微生物是Aquabacterium、WCHB1-32等,6年生黑杨正常材中关键细菌微生物是Pleomorphomonas、Dysgonomonas,这些关键微生物在稳定湿心材微生物网络结构中发挥着重要作用。以上结果表明,黑杨湿心材形成受多方面因素的影响,是由微生物群落共同作用产生的结果。

关键词：黑杨湿心材高通量测序细菌微生物群落

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依据表型性状对紫薇遗传多样性的评价

东北林业大学学报 2024年第3期52卷 16-20,27页

作者：王芝懿李振芳彭婵陈英张新叶湖北省林业科学研究院武汉430075 南京林业大学

紫薇(Lagerstroemia indica)是夏季重要观赏花卉,对187份紫薇种质资源的13个表型性状进行统计分析,结果显示:9个数量性状的遗传多样性指数由大到小排序为花序长(S2)、着花数(S1)、花序宽(S3)、叶宽(S7)、叶长(S6)、花径(S5)、当年生梢... 详细信息

紫薇(Lagerstroemia indica)是夏季重要观赏花卉,对187份紫薇种质资源的13个表型性状进行统计分析,结果显示:9个数量性状的遗传多样性指数由大到小排序为花序长(S2)、着花数(S1)、花序宽(S3)、叶宽(S7)、叶长(S6)、花径(S5)、当年生梢节间数(S9)、当年生梢长(S8)、花瓣数(S4),各性状的平均遗传多样性指数为1.84,平均变异系数为23.97%;4个质量性状的遗传多样性指数由大到小排序为花色(S13)、象甲虫害(S12)、白粉病(S11)、花香味(S10),表明紫薇遗传多样性丰富。9个数量性状间有24对性状存在显著或者极显著相关性,主成分分析显示前3个主成分累计贡献率达74.687%。

关键词：紫薇表型性状遗传多样性

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紫薇种质资源在武汉地区的物候期特征分析

中国农学通报 2024年第13期40卷 96-101页

作者：王芝懿李振芳彭婵陈英张新叶湖北省林业科学研究院武汉430075 南京林业大学南京210037

对187份紫薇材料进行萌芽、展叶、开花、落叶等物候性状调查,分析其物候规律,进行综合分析评价,为紫薇种质资源物候性状评价提供理论依据及数据支持。研究结果表明,12个物候期变异系数为8.55%~52.01%,变异程度由大到小为叶芽萌动期>落... 详细信息

对187份紫薇材料进行萌芽、展叶、开花、落叶等物候性状调查,分析其物候规律,进行综合分析评价,为紫薇种质资源物候性状评价提供理论依据及数据支持。研究结果表明,12个物候期变异系数为8.55%~52.01%,变异程度由大到小为叶芽萌动期>落叶始期>展叶开始期>落叶盛期>现蕾期>落叶末期>展叶盛期>开花始期>开花盛期>开花末期>幼果出现期>果实成熟期。各物候期间有42对物候呈现极显著正相关,6对物候呈显著相关,其余18对物候无显著相关性。主成分分析中前3个主成分贡献率分别为36.320%、23.282%和17.704%,累计贡献率达到77.305%。紫薇各物候期间差异大,相关性较显著,主成分分析中前3个主成分具有一定的代表性,可为该地区紫薇种质的开发、培育、保护和评价提供科学依据。

关键词：紫薇物候遗传多样性相关性分析主成分分析

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自然干旱后不同系号杨树湿心材的特征

东北林业大学学报 2024年第1期52卷 110-114,127页

作者：黄国伟黄秦军张新叶马林江陈慧玲樊孝萍龙开莲湖北省林业科学研究院武汉430075 中国林业科学研究院林业研究所湖北省林科院石首杨树研究所

以2017年造林材料为对象,比较不同系号杨树湿心材在大旱前和大旱后的变化差异。结果表明:干旱前和干旱后所有系号杨树的湿心材长度比例均呈显著正态分布。所有系号均存在湿心材现象,且整体上湿心材比较严重。杨树径生长由于干旱受到了... 详细信息

以2017年造林材料为对象,比较不同系号杨树湿心材在大旱前和大旱后的变化差异。结果表明:干旱前和干旱后所有系号杨树的湿心材长度比例均呈显著正态分布。所有系号均存在湿心材现象,且整体上湿心材比较严重。杨树径生长由于干旱受到了严重抑制,但随着直径的增加及干旱的影响,湿心材长度比例继续增大,木芯含水率略有下降,干旱会减轻湿心材的危害。不同材料湿心材的pH差异不显著,均为弱碱性,江汉平原主栽的4个品种插干造林生长速度有一定优势,但湿心材相比带根造林更为严重一些。对连续2 a的湿心材特征进行相关分析,发现湿心材主要特征之间存在极显著正相关。

关键词：大旱杨树湿心材长度比例含水率

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基于SSR标记的紫薇分子鉴定及遗传分析

安徽农业大学学报 2024年第3期51卷 397-403页

作者：杨姝琦杨彦伶彭婵张新叶李振芳湖北省林业科学研究院武汉430075

以紫薇品种Lagerstroemia‘Dynamite'(G2)、鄂薇1号(E1)、鄂薇4号(E4)以及W9互为亲本的杂交子代共40个优良单株为试材,利用14对在种内亲本间具有多态性的SSR引物对子代进行真杂种的鉴定,并利用Gene Marker、Popgene、Cervus和NTSYS等软... 详细信息

以紫薇品种Lagerstroemia‘Dynamite'(G2)、鄂薇1号(E1)、鄂薇4号(E4)以及W9互为亲本的杂交子代共40个优良单株为试材,利用14对在种内亲本间具有多态性的SSR引物对子代进行真杂种的鉴定,并利用Gene Marker、Popgene、Cervus和NTSYS等软件对紫薇亲本和子代进行遗传多样性、聚类分析、AMOVA分析和主成分分析。结果表明:(1)有38个单株被鉴定为真杂种,杂种率为95%。(2)14对引物的多态信息指数(PIC)平均值为0.5402,属于高度多态水平,群体平均等位基因数(Na)为4.5个,平均期望杂合度(He)以及Nei′s基因遗传多样性指数(H)分别为2.602 2和0.594 7,平均Shannon′s信息指数为1.107 9。(3)来源于湖北野生紫薇品种E1单独聚在一个分支;而来源于美国紫薇品种的E4、W9和G2聚在一个大的分支上,另外一个个体23有别于3个亲本G2、E4和W9,单独一个分支;群体M2的5个个体,与24(M4)和32(M5)聚在一起,总体形成了3个大的组群。其中大部分个体都与其亲本聚在同一分支,但也有部分个体单独聚成一分支,这也说明部分杂交子代发生了遗传变异,体现出较丰富的遗传多样性。(4)AMOVA分析和主成分分析都表明了不同样本个体内产生了丰富的遗传变异。综上所述,筛选出的SSR标记可以有效地鉴定紫薇种内杂种以及反映紫薇种内的遗传多样性,因此该研究为紫薇品种的分子鉴定提供科学依据,同时也为后期种质资源收集、构建核心种质以及创制种内新品种奠定了理论基础。

关键词：紫薇 SSR分子标记真杂种鉴定遗传多样性种质资源

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浸泡时长及GA_(3)对砂生槐种子萌发的影响

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湖北林业科技 2024年第1期53卷 18-22页

作者：汪文涛李振芳仁增康珠杜超群张新叶西藏山南市林业和草原局山南856000 湖北省国有林场工作站武汉430079 湖北省林业科学研究院武汉430075

以砂生槐种子为材料,利用清水、300 mg·L^(-1)和600 mg·L^(-1)GA_(3)浸泡种子2 d、4 d和8 d,探讨不同处理对砂生槐种子萌发特性的影响。结果表明,随着浸泡时间的延长,砂生槐种子的发芽率有所提高,而且4~8 d的300 mg·L^(-1)GA_(3)浸... 详细信息

以砂生槐种子为材料,利用清水、300 mg·L^(-1)和600 mg·L^(-1)GA_(3)浸泡种子2 d、4 d和8 d,探讨不同处理对砂生槐种子萌发特性的影响。结果表明,随着浸泡时间的延长,砂生槐种子的发芽率有所提高,而且4~8 d的300 mg·L^(-1)GA_(3)浸种可显著提高砂生槐种子的发芽率,相比清水浸泡发芽率提高10%~15%。对于发芽势,清水、300 mg·L^(-1)及600 mg·L^(-1)3种处理在浸泡2 d和8 d后只有一个发芽势高峰,而浸泡4 d后有两个发芽势高峰。同时,方差分析结果表明,发芽率在9种不同处理间呈极显著差异,腐烂率呈显著差异,但硬实率在不同处理间没有显著差异。

关键词：砂生槐种子萌发浸泡时长 GA_(3)

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基于荧光SSR标记的紫薇遗传多样性分析

南京林业大学学报（自然科学版） 2023年第2期47卷 61-69页

作者：王芝懿李振芳彭婵陈英张新叶南京林业大学林学院江苏南京210037 湖北省林业科学研究院湖北武汉430075

【目的】以收集的239份紫薇属(Lagerstroemia)种质和1份黄薇属(Heimia)种质为材料,开展种质种间特征分析和紫薇种内资源的遗传多样性分析,为进一步优化紫薇种质资源收集保存及合理利用提供科学依据。【方法】基于16对荧光引物鉴定样品... 详细信息

【目的】以收集的239份紫薇属(Lagerstroemia)种质和1份黄薇属(Heimia)种质为材料,开展种质种间特征分析和紫薇种内资源的遗传多样性分析,为进一步优化紫薇种质资源收集保存及合理利用提供科学依据。【方法】基于16对荧光引物鉴定样品基因型,利用GeneMarker软件进行基因型数据的读取;对239份紫薇属种质和1份黄薇属种质进行特征位点分析;并利用Popgene、Cervus、NTSYS和GenAlEx软件对227份紫薇种质进行遗传多样性参数估算、聚类分析和主成分分析。【结果】紫薇(***)种内的特征位点信息最为丰富,其中15个引物所体现出的特征位点信息中,紫薇都有其独特的位点区别于其他6个种,而在福建紫薇(***)、川黔紫薇(***)和尾叶紫薇(***)中也有部分特异的特征位点是紫薇中没有的;16对紫薇SSR荧光引物共检测出143个等位基因,平均每个位点有8.938个等位基因,平均有效等位基因数(Ne)为3.600,Shannon’s信息指数(I)均值为1.459,观测杂合度(Ho)均值为0.577,期望杂合度(He)均值为0.687,Nei’s基因遗传多样性指数(H)均值为0.685,平均多态信息指数(PIC)为0.648,表明参试紫薇种质资源遗传多样性比较丰富;聚类结果显示参试紫薇种质分为10个组群,其中美国引进紫薇种质、湖北野生紫薇种质相对独立聚集成不同组群;主坐标分析显示这10个组群大致可分为3个区域,其中湖北的野生紫薇种质、美国引进种质分别相对聚集在一起。【结论】利用SSR标记可以有效地反映出紫薇种质资源间的遗传多样性,可为进一步优化紫薇种质资源收集保存、构建核心种质及创制新品种、合理开发利用提供科学依据。

关键词：紫薇遗传多样性 SSR 聚类分析

基于SSR标记的紫薇核心种质构建及取样策略对比

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分子植物育种 2022年

作者：王芝懿李振芳彭婵陈英张新叶南京林业大学林学院湖北省林业科学研究院

本研究利用简单重复序列标记(simple sequence repeats， SSR)技术对213份紫薇(Lagerstroemia indica)种质资源进行PCR扩增，通过Popgene软件分析产物数据，进行遗传多样性分析，通过5种不同的方法构建紫薇核心种质，并通过主坐标分析及...

本研究利用简单重复序列标记(simple sequence repeats， SSR)技术对213份紫薇(Lagerstroemia indica)种质资源进行PCR扩增，通过Popgene软件分析产物数据，进行遗传多样性分析，通过5种不同的方法构建紫薇核心种质，并通过主坐标分析及T检验分析证明核心种质的代表性。最终通过M策略法，抽取了25份(11.74%)紫薇种质初步构建了原始紫薇的核心种质，其有效等位基因(Ne)、Shannon’s信息指数(I)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei’s基因遗传多样性指数(H)值分别为4.274、1.658、0.568、0.760、0.745，均高于原始种质，保留率分别高达119.52%、113.87%、99.47%、110.95%、108.92%，说明所选核心种质具有更丰富的遗传多样性。M策略法在基于SSR分子标记构建紫薇核心种质中可行，该方法抽取的种质资源具有代表性、遗传多样性丰富。

关键词：

不同楸树品种根段及枝干萌条内源激素质量分数及扦插生根率

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东北林业大学学报 2023年第9期51卷 28-33页

作者：李振芳张亚东陈慧玲张新叶樊孝萍湖北省林业科学研究院武汉430075 湖北省林科院石首杨树研究所

以3个楸树品种的1年生根段萌条和枝干萌条为材料,对其进行内源激素质量分数测定和扦插生根率统计。结果表明:楸树3个品种根段萌条的生根率皆高于枝干萌条,且不同品种间,根段萌条和枝干萌条的生根率都存在极显著差异,3个品种的生根率从... 详细信息

以3个楸树品种的1年生根段萌条和枝干萌条为材料,对其进行内源激素质量分数测定和扦插生根率统计。结果表明:楸树3个品种根段萌条的生根率皆高于枝干萌条,且不同品种间,根段萌条和枝干萌条的生根率都存在极显著差异,3个品种的生根率从大到小依次为楚楸1号、洛楸1号、金丝楸;除了洛楸1号的茉莉酸和金丝楸的DL-二氢玉米素、赤霉素3的质量分数在根段萌条低于其枝干萌条外,其余激素在不同品种根段萌条中的质量分数皆高于对应枝干萌条;不同部位萌条内源激素质量分数的差异随品种不同而不同,洛楸1号有4种激素在两个不同部位萌条中存在显著差异,楚楸1号有1种存在显著差异,而金丝楸中所有激素都差异不显著;不同品种相同部位萌条中内源激素间差异分析结果表明,除脱落酸外,根段萌条中其他内源激素质量分数间的差异均大于枝干萌条;根段萌条各因素间整体相关性及显著性强于枝干萌条各因素间,反式玉米素、DL-二氢玉米素与生根率存在显著相关性。

关键词：楸树根段萌条枝干萌条内源激素生根率