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水稻第1染色体千粒重QTL的遗传分解

科学通报 2008年第12期53卷 1389-1394页

作者：余守武杨长登樊叶杨庄杰云李西明中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室国家水稻改良中心杭州310006

千粒重是提高水稻增产潜力和改良稻米品质的重要因素之一．本研究在千粒重QTLqTGWT1-1初定位的基础上，利用分别在第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合而背景纯合的2个水稻剩余杂合体（residual heterozygous line，RHL... 详细信息

千粒重是提高水稻增产潜力和改良稻米品质的重要因素之一．本研究在千粒重QTLqTGWT1-1初定位的基础上，利用分别在第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合而背景纯合的2个水稻剩余杂合体（residual heterozygous line，RHL），衍生两个F6群体．对千粒重QTL进一步分析，在初定位的QTLqTGWT1-1所在区间检测到两个效应大小相近、方向一致的紧密连锁QTLGw1-1和Gw1-2．应用SSR标记检测，从其中一个RHL衍生群体中筛选到杂合区间分别为RM151-RM10404，RM10381～RM243。RM10435～RM259和RM10398～RM5359的4个单株．应用SSR标记进一步检测4套F2群体，从每套F2群体中分别筛选到母本珍汕97B和父本密阳46纯合型材料各10株，自交获得4套近等基因系材料并考察其千粒重．利用交迭重组染色体片段代换系分析法，将千粒重QTLGw1—1和Gw1-2分别界定于392．9kb的RM10376～RM10398区间和308．5kb的RM10404-RM1344区间，增效等位基因均来自母本珍汕97B，两个QTL之间表现为积加作用．这两个QTL的遗传分解为其克隆及水稻产量和品质的分子育种奠定基础．

关键词：水稻第1染色体短臂剩余杂合体近等基因系 QTL 千粒重

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基于.net框架的水稻分子育种信息平台

杂交水稻 2008年第2期23卷 73-75页

作者：鄂志国庄杰云王磊中国水稻研究所浙江杭州310006

为实现水稻分子生物学数据的共享,采用动态web数据库的策略和浏览器/服务器(B/S)体系结构,构建了基于.net框架运行于Internet之上的水稻分子育种信息平台,对国内外水稻分子生物学研究中产生的数据进行收集、整理和信息共享。

关键词：水稻分子生物学信息平台数据库

水稻抽穗期QTL及其与产量性状遗传控制的关系

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中国水稻科学 2012年第2期26卷 235-245页

作者：郭梁张振华庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室浙江杭州310006

产量和抽穗期是评价水稻品种应用价值的基本性状。水稻QTL分析已经历了从初定位到基因克隆的发展过程,并以抽穗期和产量性状最受重视。总结了亚洲栽培稻抽穗期QTL的基因组分布,分析了这些QTL与产量性状遗传控制的关系,为进一步筛选和鉴... 详细信息

产量和抽穗期是评价水稻品种应用价值的基本性状。水稻QTL分析已经历了从初定位到基因克隆的发展过程,并以抽穗期和产量性状最受重视。总结了亚洲栽培稻抽穗期QTL的基因组分布,分析了这些QTL与产量性状遗传控制的关系,为进一步筛选和鉴定具有较高育种应用潜力的水稻抽穗期QTL和产量性状QTL提供参考。

关键词：水稻抽穗期产量性状数量性状基因座基因

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分子标记辅助选择在水稻育种中的应用

核农学报 2012年第5期26卷 756-761页

作者：朱玉君樊叶杨黄得润庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室浙江杭州310006

分子标记辅助选择与传统育种技术相结合,可提高育种效率,缩短育种周期。本文介绍了分子标记辅助选择在水稻育种上取得的主要进展,并讨论了该技术在实际应用中存在的问题和对策。

关键词：分子标记辅助选择病虫害抗性米质性状产量性状基因聚合

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水稻叶片性状和根系活力的QTL定位

Acta Genetica Sinica 2003年第12期30卷 1133-1139页

作者：沈波庄杰云张克勤夏奇清盛晨霞郑康乐中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室杭州310006 杭州师范学院生命科学系杭州310012

应用由 2 4 7个株系组成的珍汕 97B 密阳 4 6重组自交系 (RIL)群体及其分子标记连锁图谱 ,检测控制剑叶倒二叶、倒三叶的 5个形态性状和控制根系伤流量性状的数量性状座位 (QTL)。在 9个标记区间检测到控制叶片形态性状的 2 4个QTL ,LO... 详细信息

应用由 2 4 7个株系组成的珍汕 97B 密阳 4 6重组自交系 (RIL)群体及其分子标记连锁图谱 ,检测控制剑叶倒二叶、倒三叶的 5个形态性状和控制根系伤流量性状的数量性状座位 (QTL)。在 9个标记区间检测到控制叶片形态性状的 2 4个QTL ,LOD值为 2 9～ 11 8,单个QTL的表型变异贡献率为 4 0 %～ 32 5 % ;分别检测到 5 6对和 4对控制叶片形态和根系活力的上位性互作 ,绝大多数互作发生在 2个不表现加性效应的座位之间。与该群体产量性状QTL的研究结果相比较。

关键词：水稻数量性状座位叶片性状根系伤流量

应用二种定位法比较不同世代水稻产量性状QTL的检测结果

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Acta Genetica Sinica 2001年第5期28卷 458-464页

作者：庄杰云樊叶杨吴建利夏英武郑康乐中国水稻研究所国家水稻改良中心浙江大学核农业科学研究所杭州310029

应用珍汕９７Ｂ／密阳４６的Ｆ２和重组自交系（ＲＩＬ）群体，建立ＲＦＬＰ连锁图，检测控制稻谷产量及其５个构成因子的ＱＴＬ。结果表明，具有较大加性效应者，能同时在Ｆ２和ＲＩＬ群体中检测到。而且，在重组自交系群体中，发现设... 详细信息

应用珍汕９７Ｂ／密阳４６的Ｆ２和重组自交系（ＲＩＬ）群体，建立ＲＦＬＰ连锁图，检测控制稻谷产量及其５个构成因子的ＱＴＬ。结果表明，具有较大加性效应者，能同时在Ｆ２和ＲＩＬ群体中检测到。而且，在重组自交系群体中，发现设重复的表型鉴定与基于单株的表型鉴定，对效应较高的ＱＴＬ的检测影响不大。

关键词：数量性状基因加性效应 RFLP标记水稻产量性状

水稻硅含量QTL qHUS6.1的精细定位

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科学通报 2010年第23期55卷 2302-2306页

作者：龚俊义吴季荣王凯樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室杭州310006

硅是水稻的有益元素之一.针对位于水稻第6染色体短臂的谷壳硅含量QTLqHUS6.1,从前期建立的剩余杂合体衍生群体自交后代中,经目标区间的13个SSR标记检测,挑选出杂合区间彼此交迭的3个剩余杂合体,构建了3套近等基因系.在田间种植条件下,... 详细信息

硅是水稻的有益元素之一.针对位于水稻第6染色体短臂的谷壳硅含量QTLqHUS6.1,从前期建立的剩余杂合体衍生群体自交后代中,经目标区间的13个SSR标记检测,挑选出杂合区间彼此交迭的3个剩余杂合体,构建了3套近等基因系.在田间种植条件下,测量成熟后水稻谷壳、剑叶和茎秆的硅含量.表型分布和方差分析结果都显示,异质区间为RM19410~RM5815的近等基因系具有显著的基因型效应,而异质区间为RM4923~RM19410和RM19417~RM204的近等基因系未呈显著变异.经比较,将qHUS6.1定位在RM19410和RM19417之间约64.2kb,含9个候选基因的区域内,该QTL作用较强且同时控制水稻谷壳、剑叶和茎秆硅含量,增效等位基因来自父本密阳46,总体上呈加性遗传.本研究为qHUS6.1的克隆奠定了基础,并为QTL精细定位材料的构建和应用提供了新思路.

关键词：水稻硅含量 QTL 精细定位剩余杂合体近等基因系

水稻CMS-DA育性恢复基因定位及其互作分析

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Acta Genetica Sinica 2002年第7期29卷 616-621页

作者：谢建坤庄杰云樊叶杨屠国庆夏英武郑康乐中国水稻研究所国家水稻改良中心浙江大学原子核农业科学研究所杭州310029

在由 2 10个测交组合组成的协青早A (协青早B 密阳 4 6 )F6 群体中 ,构建了由 12 9个RFLP、SSLP组成的连锁遗传图谱。应用QTL分析方法 ,对水稻矮败型胞质雄性不育育性恢复基因进行了定位。检测到一个主效基因和 3个效应较小的QTL(qRf 1... 详细信息

在由 2 10个测交组合组成的协青早A (协青早B 密阳 4 6 )F6 群体中 ,构建了由 12 9个RFLP、SSLP组成的连锁遗传图谱。应用QTL分析方法 ,对水稻矮败型胞质雄性不育育性恢复基因进行了定位。检测到一个主效基因和 3个效应较小的QTL(qRf 1、qRf 10 1、qRf 5 ) 。

关键词：细胞质雄性不育育性恢复基因定位水稻

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排除主效作用下水稻产量性状QTL的检测

核农学报 2011年第5期25卷 857-862页

作者：钟娟刘文强吴建利贺浩华庄杰云江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室江西南昌330045 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室/国家水稻改良中心浙江杭州310006 湖南省农业科学院水稻研究所湖南长沙410125

本研究旨在排除主效QTL效应的基础上检测控制水稻产量性状的微效QTL。前期应用中156/谷梅2号重组自交系(RIL)群体在第7染色体RM2-RM214区间上检测到控制抽穗期和产量性状的主效QTL,本研究挑选在此区间呈谷梅2号基因型的两个株系,配组衍... 详细信息

本研究旨在排除主效QTL效应的基础上检测控制水稻产量性状的微效QTL。前期应用中156/谷梅2号重组自交系(RIL)群体在第7染色体RM2-RM214区间上检测到控制抽穗期和产量性状的主效QTL,本研究挑选在此区间呈谷梅2号基因型的两个株系,配组衍生新的RIL群体,检测控制水稻产量性状的QTL。共检测到25个产量性状QTL,其中,8个QTL前期在中156/谷梅2号RIL群体亦呈显著作用,加性效应方向与前期一致;6个QTL位于其中2个共有区间中,但呈显著的性状从原来的单个性状增加到4个性状;11个QTL所处的区间,前期均未检测到产量性状QTL。前期检测到QTL中有2个在本研究中未检测到,其中1个在RM2-RM214区间为谷梅2号背景下不发挥作用,另一个在前期研究中对表型方差的贡献率仅为0.55%。两个群体QTL检测结果的比较结果表明,排除主效QTL可极大地提高微效QTL得到检测的几率。

关键词：水稻数量性状座位重组自交系产量性状