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基于图网络的药物与靶标相互作用预测方法研究

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基于图网络的药物与靶标相互作用预测方法研究

作者：魏家濠贵州师范大学

学位级别：硕士

预测未知药物-靶标相互作用是药物发现和再利用的关键步骤。识别药物和蛋白质相互作用对药物再利用和药物发现具有重要意义。然而,探索具有复杂化学性质的药物与蛋白质之间的相互作用是一项具有挑战性的研究。因此,许多研究利用计算机... 详细信息

预测未知药物-靶标相互作用是药物发现和再利用的关键步骤。识别药物和蛋白质相互作用对药物再利用和药物发现具有重要意义。然而,探索具有复杂化学性质的药物与蛋白质之间的相互作用是一项具有挑战性的研究。因此,许多研究利用计算机技术设计相应的算法来解决生物学问题和预测未知药物-靶标相互作用。这使生物学家能够获得可靠的药物-蛋白对,减少了通过生化实验鉴定所需的时间和费用。如何准确预测药物与靶标之间潜在的相互作用,是一项颇具挑战的研究任务。单一数据源可能存在片面性,综合多种数据来源可以提供更全面准确的信息,为了获取药物和蛋白质的综合特征,我们整合多源药物数据与蛋白质数据。本文提出了基于自动编码器的特征融合算法(简称AENF),AENF将药物相关信息与靶标相关信息通过自动编码器进行有效融合。实验证明,AENF能够提升药物-靶标相互作用预测模型的输入数据质量,进而提高预测结果的准确性。另外,蛋白质和药物往往不是孤立存在,而是通过网络结构相互联系和影响。因此,为了研究图网络考虑节点间的拓扑关系,挖掘药物和蛋白质之间相互作用,本文考虑基于Guilt-by-assocition用图卷积神经网络做节点特征聚合(简称AGCN),预测药物和蛋白质相互作用。实验证明,AGCN能够得到更为精确的预测结果。先前的研究主要集中在评估节点之间的连接或孤立的网络拓扑结构的一致性。这种片面的方法可能严重阻碍DTI预测的准确性。因此,本文提出了一种名为TTGCN的新方法。它结合了异构图卷积神经网络和图注意网络来解决药物和蛋白质相互作用预测问题。TTGCN利用图注意力神经网络来学习节点之间的连通性,残差图卷积神经网络来学习原始特征空间和嵌入空间中两个节点之间都存在连接,这保证了原始特征空间和嵌入空间之间保持一致的拓扑结构。随后,我们将归纳矩阵补全应用于药物和蛋白质相互作用预测。实验证明TTGCN的性能优于诸多领先的药物和蛋白质相互作用预测方法。

关键词：药物-靶标相互作用自动编码器图卷积神经网络图注意力神经网络

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双目面结构光三重扫描测量系统温漂补偿方法

红外与激光工程 2024年第1期53卷 213-224页

作者：杨濠铭孙子杰孙岩标邾继贵天津大学精密测试技术及仪器全国重点实验室天津300072 北京卫星制造厂有限公司北京100094

双目面结构光三重扫描是在条纹投影双目视觉重建的基础上,追加左、右相机与投影仪构成的单目视觉系统重建点云,在反光和凹凸起伏等表面测量应用上具有更好的点云完整性优势。但由于环境温度变化影响,投影仪产生较大温度漂移,导致双目重... 详细信息

双目面结构光三重扫描是在条纹投影双目视觉重建的基础上,追加左、右相机与投影仪构成的单目视觉系统重建点云,在反光和凹凸起伏等表面测量应用上具有更好的点云完整性优势。但由于环境温度变化影响,投影仪产生较大温度漂移,导致双目重建点云与单目重建点云发生“分层”现象。为此,文中提出了一种基于正交条纹投影的三重扫描系统温漂在线补偿方法,通过投影仪投射正交条纹来构建双目重建点在投影仪图像中准确的映射关系,并基于双目重建点在投影仪图像中的重投影误差最小化目标函数来求解温漂补偿后的投影仪最优外参数。最后,以金属球和汽车零件作为被测对象进行实验验证,在不依靠标定板等先验信息及繁琐标定流程基础上,所提在线快速补偿方法可以使得双目点云与单目点云温漂量分别减小78.2%和94.3%,极大减轻了温度变化对于三重扫描点云数据拼接影响。

关键词：三重扫描投影仪正交条纹温漂补偿

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有机高频滤波器贱金属化技术研究

有机高频滤波器贱金属化技术研究

作者：张濠雯电子科技大学

学位级别：硕士

融合FEB的YOLOX遥感图像目标检测算法

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重庆邮电大学学报（自然科学版） 2024年第2期36卷 319-327页

作者：余翔庞志濠重庆邮电大学通信与信息工程学院重庆400065

针对遥感图像的复杂背景干扰大、目标尺度变化大以及小目标检测困难等导致检测精度降低的问题,提出一种增强YOLOX主干网络输出特征提取能力的检测算法。通过加入连续膨胀残差卷积和注意力机制,设计一种全新的提取主干网络输出特征增强块... 详细信息

针对遥感图像的复杂背景干扰大、目标尺度变化大以及小目标检测困难等导致检测精度降低的问题,提出一种增强YOLOX主干网络输出特征提取能力的检测算法。通过加入连续膨胀残差卷积和注意力机制,设计一种全新的提取主干网络输出特征增强块(feature enhance block,FEB),让连续膨胀残差卷积串联4个具有不同膨胀率的膨胀残差卷积,扩大算法的感受野,丰富上下文信息,同时减轻背景对检测的影响,有效加强算法对目标尺度变化大及小目标的检测能力,使用SA注意力机制抑制背景对算法检测的干扰,提高算法的检测精度。在RSOD数据集上的实验表明,FEB相较于其他同类型模块具有更好的特征提取能力。

关键词：机器视觉遥感图像目标检测 YOLOX

深度学习算法在识别鉴定陆地节肢动物中的应用

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生态学杂志 2024年

作者：庄晓濠张卫信刘胜杰中山大学生态学院河南大学环境与规划学院

陆地节肢动物是目前已知多样性最高的动物类群，对人类社会和自然生态系统发挥着重要的作用，但其多样性的调查过程一直面临着物种分类鉴定的巨大挑战。随着计算机视觉技术的发展，深度学习图像识别技术在动植物识别领域展现出了高效的... 详细信息

陆地节肢动物是目前已知多样性最高的动物类群，对人类社会和自然生态系统发挥着重要的作用，但其多样性的调查过程一直面临着物种分类鉴定的巨大挑战。随着计算机视觉技术的发展，深度学习图像识别技术在动植物识别领域展现出了高效的分类潜力，日趋成为动物分类的新方法。然而，深度学习算法技术在陆地节肢动物识别鉴定中的发展却远远滞后于植物和脊椎动物。本文在阐述陆地节肢动物多样性和生态功能的基础上，介绍了深度学习图像识别技术的基本原理、常用类型及影响识别正确率的主要因素；同时，归纳总结了深度学习识别技术在土壤节肢动物中的应用案例和存在问题，并基于此对其在节肢动物识别的未来研究重点作出展望，以期为计算机技术在陆地节肢动物，尤其是土壤节肢动物，实现快速、准确、优化的识别鉴定提供参考。

关键词：陆地节肢动物土壤动物图像识别深度学习

稀土离子掺杂红外微晶玻璃发光材料的研究进展

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硅酸盐学报 2024年第8期52卷 2527-2542页

作者：叶昇达陈健濠黄雄健董国平华南理工大学材料科学与工程学院发光材料与器件国家重点实验室广州510641 华南理工大学物理与光电学院广州510641

稀土离子掺杂微晶玻璃兼具晶体材料优异的光学特性和玻璃材料良好的物理化学特性,是一种极具发展前景的红外发光材料。本文从微晶玻璃的透过率出发,结合散射理论对其影响因素进行了简要分析,指出实现透明微晶玻璃的基本条件。分析归纳... 详细信息

稀土离子掺杂微晶玻璃兼具晶体材料优异的光学特性和玻璃材料良好的物理化学特性,是一种极具发展前景的红外发光材料。本文从微晶玻璃的透过率出发,结合散射理论对其影响因素进行了简要分析,指出实现透明微晶玻璃的基本条件。分析归纳了目前稀土离子掺杂红外微晶玻璃的现状和特性,包括氟氧硅酸盐、碲酸盐和锗酸盐微晶玻璃体系。介绍了稀土离子掺杂红外微晶玻璃的应用研究进展,最后对其发展状况进行总结及展望,为稀土离子掺杂红外微晶玻璃的研究提供思路和参考。

关键词：微晶玻璃红外氟氧硅酸盐碲酸盐锗酸盐

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中国家庭高端品消费的“挤出效应”

消费经济 2024年第4期40卷 30-45页

作者：周先波陈志濠陶颖中山大学岭南学院中山大学马克思主义学院

“十四五”规划强调“全面促进消费,顺应居民消费升级趋势”。高端品消费是居民消费升级的一种体现,对其特征的研究具有现实意义。本文利用中国家庭金融调查(CHFS)2011—2019年微观调查数据,研究高端品消费对家庭消费的影响效应。工具... 详细信息

“十四五”规划强调“全面促进消费,顺应居民消费升级趋势”。高端品消费是居民消费升级的一种体现,对其特征的研究具有现实意义。本文利用中国家庭金融调查(CHFS)2011—2019年微观调查数据,研究高端品消费对家庭消费的影响效应。工具变量估计表明,高端品消费对家庭消费具有显著的“挤出效应”,且对农村、西部省份、低消费地区、教育程度低等劣势群体家庭消费的“挤出效应”更强。虽然高端品消费对总消费有同期“挤出效应”,但往期高端品消费对本期的总消费具有“促进效应”。联立模型估计显示,高端品消费和家庭消费之间具有双向“挤出效应”。本文研究结论对促进消费高质量发展和消费升级、强化高端消费引领作用等具有政策启示。

关键词：高端消费品家庭消费升级消费结构高品质消费消费质量

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供需视角下托育教师胜任力模型构建研究

教师教育研究 2024年第1期36卷 56-63,121页

作者：邓林园邹盛濠张丽北京师范大学教育学部北京100875 北京师范大学继续教育与教师培训学院北京100875

我国0-3岁婴幼儿托育需求大,而托育教师队伍建设存在师资不足、体系混乱等问题,尚未形成供需适配的托育教师胜任力标准。因此,本研究采用半结构化访谈的方法对“供给侧”的10位托育服务相关从业人员和“需求侧”的10位0-3岁婴幼儿家长... 详细信息

我国0-3岁婴幼儿托育需求大,而托育教师队伍建设存在师资不足、体系混乱等问题,尚未形成供需适配的托育教师胜任力标准。因此,本研究采用半结构化访谈的方法对“供给侧”的10位托育服务相关从业人员和“需求侧”的10位0-3岁婴幼儿家长进行深入访谈,借助质性分析软件MAXQDA 20对访谈文本进行编码分析。最终,本研究通过对供需双方访谈资料的对比与整合分析,构建出一个科学、系统的托育教师胜任力模型。该模型遵循由外到内、层层深入的逻辑结构,统合形成个性品德、价值观念、专业知识与技能的三维胜任力模型,以期为我国托育教师的培养与发展提供参考框架,更好地促进托育教师的专业化发展,满足0-3岁婴幼儿身心发展需要。

关键词：托育教师胜任力供需对比访谈

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大坝变形极端梯度提升区间预测模型应用研究

水力发电学报 2024年

作者：陈羡濠胡昱王亚军朱学舟浙江海洋大学海洋工程装备学院清华大学水圈科学与水利工程全国重点实验室清华大学水利部水圈科学重点实验室清华大学水利水电工程系

大坝在运行期间，其原始监测数据呈现出复杂、多样且时变的特征，该情况导致了长期监测预警的有效性与准确性逐渐减弱，进而增加了工程失事的风险。因此，建立高效准确的变形监测模型对大坝安全评估具有重要意义。由于大坝系统固有的不... 详细信息

大坝在运行期间，其原始监测数据呈现出复杂、多样且时变的特征，该情况导致了长期监测预警的有效性与准确性逐渐减弱，进而增加了工程失事的风险。因此，建立高效准确的变形监测模型对大坝安全评估具有重要意义。由于大坝系统固有的不确定性，传统的确定性点预测面临无法规避的误差挑战，难以确定坝体变形主要影响因素且精度有待提高。本文提出了一种新的方法，采用极端梯度提升结合自举法构建预测区间，同时，通过弹性网络法进行位移影响因子集的特征提取，使用贝叶斯优化算法搜索最优模型参数。该模型通过自举法结合多个集成模型，有效估计了模型的偏差；通过训练组合模型得到残差，进一步估计了随机噪声的方差，最终实现了对大坝变形不确定性的量化。文章结合白鹤滩特高拱坝运行期坝体变形监测资料进行工程实例验证，通过对比采用单一模型的预测结果和实测结果，验证了本文提出的混合模型方法的高精度和良好鲁棒性，均方根误差仅为0.0112，模型准确率达到96%，效能提升较单一模型最高提高71%。

关键词：水利工程变形预测 XGBoost 区间分析贝叶斯优化