检索结果-南通市图书馆

目的:应用生物信息学方法分析治疗缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的作用机制。方法:通过GEO数据库获得治疗IS的潜在靶点,应用基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto gene and genome encyclopedia,KE... 详细信息

目的:应用生物信息学方法分析治疗缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的作用机制。方法:通过GEO数据库获得治疗IS的潜在靶点,应用基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto gene and genome encyclopedia,KEGG)信号通路富集分析获得靶点参与的信号通路、生物过程、分子功能,通过STRING在线数据库构建分析蛋白质之间的相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)网络,导入Cytoscape软件并构建网络,CytoHubba插件筛选出关键靶点。结果:通过数据库筛选获得差异基因156个,其中133个基因上调、23个基因下调,KEGG富集通路分析筛选出靶点参与趋化因子信号通路、NF-κB信号通路等37条信号通路,GO功能富集分析结果表明靶点参与了细胞对脂多糖的反应、白细胞趋化性等多个生物过程。最终确定关键靶点为趋化因子CXC配体8(C-X-C motif chemokine 8,CXCL8)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、CXCL2、白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、CXCL1、IL-1β、CC型趋化因子配体4(C-C motif chemokine 4,CCL4)、IL-1α、细胞间黏附分子1(intercellular adhesion molecule 1,ICAM1)、前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2),关键通路为趋化因子信号通路。结论:所筛选的关键基因可能成为诊断IS的标志物或潜在治疗靶点,并为该病的发病机制研究提供了新的理论依据。

关键词：基因表达综合数据库缺血性脑卒中生物信息分析趋化因子

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