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微生物宏蛋白质组从样品处理、数据采集到数据分析

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色谱 2024年第7期42卷 658-668页

作者：吴恩慧乔亮复旦大学化学系上海200433

微生物与人体疾病、健康密切相关,如何理解微生物群落的组成及其发挥的功能是一大亟需研究的问题。近年来,宏蛋白质组学已经成为研究微生物组成与功能的重要技术手段。然而,由于微生物群落样本的复杂性与高度异质性,样品处理、质谱数据... 详细信息

微生物与人体疾病、健康密切相关,如何理解微生物群落的组成及其发挥的功能是一大亟需研究的问题。近年来,宏蛋白质组学已经成为研究微生物组成与功能的重要技术手段。然而,由于微生物群落样本的复杂性与高度异质性,样品处理、质谱数据采集与数据分析成为宏蛋白质组目前面临的三大挑战。在宏蛋白质组分析中往往需要针对不同类型的样品进行前处理优化,采取不同的微生物分离富集、提取和裂解方案。与单一物种蛋白质组相类似,宏蛋白质组学中的质谱数据采集模式有数据依赖性采集(data-dependent acquisition,DDA)模式和数据非依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)模式。DIA数据采集模式可以完整地采集样品的肽段信息,具有很强的发展潜力。但是由于宏蛋白质组样品的复杂性,其DIA数据解析已成为阻碍宏蛋白质组深度覆盖的一大难题。在数据解析方面,最重要的步骤在于蛋白质序列数据库的构建。数据库的大小和完整性不仅对鉴定数量有很大影响,还会影响物种和功能水平上的分析。目前宏蛋白质组数据库构建的金标准是基于宏基因组的蛋白质序列数据库。同时,基于迭代搜库的公共数据库过滤方法也已被证明具有很强的实用价值。从具体的数据解析策略角度,以肽段为中心的DIA数据解析方法占据了绝对的主流。随着深度学习和人工智能的发展,其会极大地推动宏蛋白质组数据解析的准确度、覆盖度与分析速度。在下游生物信息学分析方面,近年来开发了一系列注释工具,可以在蛋白水平、肽段水平、基因水平上进行物种注释来获得微生物群落组成。与其他组学方法相比,微生物群落的功能分析是宏蛋白质组学的一个独特特征。宏蛋白质组已经成为微生物群落多组学分析中的重要组成部分,并且仍在覆盖深度、检测灵敏度、数据解析完整度等方面具有很大的发展潜力。

关键词：宏蛋白质组学样品前处理数据库数据分析策略

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互联网使用与性别工资差异分析

合作经济与科技 2021年第16期 138-140页

作者：吴恩喆华南农业大学广东广州

互联网缩小就业鸿沟,带来数字红利,为避免性别工资差异继续扩大带来可能。本文基于CGSS2017数据,利用OLS模型分析互联网使用与性别收入差距的影响关系,并对性别工资差异进行Oaxaca-Blinder分解,最后对样本进行异质性分析。研究发现:互... 详细信息

互联网缩小就业鸿沟,带来数字红利,为避免性别工资差异继续扩大带来可能。本文基于CGSS2017数据,利用OLS模型分析互联网使用与性别收入差距的影响关系,并对性别工资差异进行Oaxaca-Blinder分解,最后对样本进行异质性分析。研究发现:互联网使用对于收入水平具有显著正向作用,且对性别工资差异的贡献度为-4.34%,即互联网使用能够缩小性别工资差异;在缩小收入差距方面,互联网使用在不同学历群体中均有作用,但在高学历群体中效果较为明显。

关键词：互联网使用性别工资差异 Oaxaca-Blinder分解

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清代跪叩礼与抱见礼的分流与演变

北京社会科学 2024年第6期 31-42页

作者：吴恩荣肇庆学院旅游与历史文化学院、西江流域中外文化交流研究中心

金国建立后,满洲跪叩礼与抱见礼皆呈发展与壮大之势。崇德称帝后,跪叩礼得到飞跃性发展,形成男女有别的等差性跪叩礼仪模式,并在顺治入关后继承明朝礼制时替换明朝礼仪中的拜礼,在国家礼制中全面铺展。抱见礼在金国时期发展出一定的等级... 详细信息

金国建立后,满洲跪叩礼与抱见礼皆呈发展与壮大之势。崇德称帝后,跪叩礼得到飞跃性发展,形成男女有别的等差性跪叩礼仪模式,并在顺治入关后继承明朝礼制时替换明朝礼仪中的拜礼,在国家礼制中全面铺展。抱见礼在金国时期发展出一定的等级性,并与跪叩礼组合使用,二者一度有合流态势。崇德后,抱见礼不仅没有得到发展与推广,反而呈现收缩之势,与跪叩礼发生分流,入关后这种趋势愈发清晰,在清中后期的国家礼制中更是接近消亡。两种满洲代表性礼仪出现不同的发展趋势,主要在于跪叩礼具有强烈的尊卑属性且适用场景广泛,而抱见礼相对平等、友爱且仅适用于相见场景,所以是否适应帝制政体下彰显皇权与等级性的礼制需求,成为决定二者在清代不同走向的根本原因。

关键词：清代礼仪满洲跪叩礼抱见礼皇权

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渔业滋养史前沿海社群:井头山海洋动物遗存研究

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中国科学：地球科学 2024年第5期54卷 1602-1618页

作者：吴恩东孙国平张颖 School of Culture History and LanguageAustralian National UniversityCanberra 2600Australia 浙江省文物考古研究所杭州310012 国家文物局考古研究中心北京100013

本文聚焦中国浙江井头山贝丘遗址(8300~7800cal a BP)丰富的海洋软体动物和鱼类遗存,综合性探究了中国长江下游和东南沿海史前先民的渔业经济、社群发展、古环境及其互动关系,并尝试探索中国新石器时代早期沿海聚落的兴衰变化与相关原因... 详细信息

本文聚焦中国浙江井头山贝丘遗址(8300~7800cal a BP)丰富的海洋软体动物和鱼类遗存,综合性探究了中国长江下游和东南沿海史前先民的渔业经济、社群发展、古环境及其互动关系,并尝试探索中国新石器时代早期沿海聚落的兴衰变化与相关原因.该研究基于海洋动物生态学和生物属性,采用动物考古学标准研究方法并结合碳十四测年,开展了采样、鉴定、测量和定量统计研究.研究结果显示,井头山遗址至少有11类贝类遗存和14类鱼类遗存.先民可能居于背山面海的海岸环境,以沿岸和近海开发模式的采集、渔捞与狩猎经济为主,并在该遗址出现了低水平的稻作农业.海岸环境变化可能是导致井头山先民被迫放弃该聚落的原因之一.本研究为讨论中国新石器时代距今8000年前后东部沿海地区对海洋资源的利用及社群发展与环境变化关系提供了新认识.

关键词：新石器时代海洋生物遗存渔业经济古环境社群发展

空间能源生产:新能源时代城市空间低碳转型新路径——基于光伏能源生产与城市空间互动融合视角

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城市规划 2024年第4期48卷 59-70页

作者：王乙喆东南大学建筑学院

新能源革命正深刻改变人类的能源结构,将对城市发展产生深刻影响,塑造全新的未来城乡人居环境图景。在“旧能源”向“新能源”变革进程中,城市正从能源“消费者”开始具备能源“生产者”职能,将推动低碳导向下的城市空间与能源互动模式... 详细信息

新能源革命正深刻改变人类的能源结构,将对城市发展产生深刻影响,塑造全新的未来城乡人居环境图景。在“旧能源”向“新能源”变革进程中,城市正从能源“消费者”开始具备能源“生产者”职能,将推动低碳导向下的城市空间与能源互动模式从“减少化石能源消耗”转为“增加新能源生产”。本研究基于光伏能源生产特征,提出空间能源生产的概念,明确了城市空间能源生产体系特征,构建了面向空间能源生产的宏观城市空间发展评估模型和微观城市空间开发利用模型。研究认为,能源生产空间构成比例、能源生产空间产能效率和能源生产空间规模门槛是影响城市空间能源生产的关键问题。为了推动空间能源生产,研究建议:(1)应推动城市空间传统功能产权与能源生产空间产权“两权并设”;(2)应建立面向城市全域空间的阳光资源协调机制;(3)应建立空间能源生产导向的城市空间布局与形态设计。

关键词：空间能源生产新能源光伏低碳城市空间转型

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基于动态嵌入特征的鲁棒半监督视频目标分割

北京航空航天大学学报 2024年

作者：陈亚当赵翊冰吴恩华中国科学院软件研究所南京信息工程大学计算机学院南京信息工程大学数字取证教育部研究中心

针对半监督视频目标分割方法存在推理时内存占用不断增加以及仅依赖低级像素特征训练困难的问题，提出了一种基于动态嵌入特征和辅助损失函数的半监督视频目标分割方法。使用一种动态嵌入特征，建立一个恒定大小的记忆库。通过时空聚合... 详细信息

针对半监督视频目标分割方法存在推理时内存占用不断增加以及仅依赖低级像素特征训练困难的问题，提出了一种基于动态嵌入特征和辅助损失函数的半监督视频目标分割方法。使用一种动态嵌入特征，建立一个恒定大小的记忆库。通过时空聚合方法，利用历史信息生成和更新动态嵌入特征。同时使用内存更新感应器来自适应控制记忆库的更新间隔，适应不同视频的运动模式。使用一种辅助损失函数以在高级语义特征层面上给网络提供辅助指导，并通过在多重特征层面多方面指导，提高模型精度和训练效率。针对视频前背景中相似目标误匹配的问题，设计了一种空间约束模块，以利用视频的时间连续性特性，更好捕获前一帧掩码信息和当前帧之间的关联。实验结果表明，本方法在DAVIS 2017验证集上达到了84.5 J&F的精度，在YouTube-VOS 2019验证集达到了82.4 J&F的精度。

关键词：视频目标分割时空记忆网络时空约束内存更新感应动态嵌入特征

21世纪好莱坞歌舞片中的“假定性”与影像“在场”

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当代电影 2024年第2期 158-165页

作者：孙汝喆中国传媒大学戏剧影视学院

鉴于与音乐、舞蹈相结合的体裁形式,好莱坞歌舞片被赋予了鲜明的假定表意特征。此种表意形式虽与戏剧“假定性”颇有关联,但如今已于歌舞片语境中完成蜕变,衍化为区隔于戏剧的独特“假定性”表达。21世纪好莱坞歌舞片尤为强调了此一形态... 详细信息

鉴于与音乐、舞蹈相结合的体裁形式,好莱坞歌舞片被赋予了鲜明的假定表意特征。此种表意形式虽与戏剧“假定性”颇有关联,但如今已于歌舞片语境中完成蜕变,衍化为区隔于戏剧的独特“假定性”表达。21世纪好莱坞歌舞片尤为强调了此一形态,影像符号性及视像表意功能的放大为影片提供了多维度的表意途径,也为观众提供了多角度解读窗口。透过视觉画面,高度假定的“幻觉式”表达于观众心理层面构建着影像内容与情感的“在场”,为影片烙下了“好莱坞”式的印记。但当下仍需对好莱坞歌舞片所依赖的高度“假定性”及其幻觉式表达客观分析,并对此进一步辩证探讨。

关键词：好莱坞歌舞片假定性视觉画面戏剧电影

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行政处罚与行政罚的关系之解

法学家 2024年第2期 14-27,191,192页

作者：王明喆南京师范大学法学院南京师范大学中国法治现代化研究院

行政处罚是我国实定法和学理上的重要概念,它与德日行政法上的行政罚概念并不相同。行政罚概念在德国最先由戈尔德施密特提出,经美浓部达吉等人介绍传入日本,并对我国民国时期行政法学产生重要影响。新中国建立后,行政罚概念被行政处罚... 详细信息

行政处罚是我国实定法和学理上的重要概念,它与德日行政法上的行政罚概念并不相同。行政罚概念在德国最先由戈尔德施密特提出,经美浓部达吉等人介绍传入日本,并对我国民国时期行政法学产生重要影响。新中国建立后,行政罚概念被行政处罚取代,二者虽仅有一字之差,但内涵并不相同。行政罚是指对违反行政义务的行为科处的法律制裁,其“行政性”体现在处罚对象的违反行政性。行政处罚是行政机关对社会危害性较小的不法行为科处的法律制裁,其“行政性”体现在处罚主体与处罚程序的行政性。我国的行政处罚概念是受到苏联法学影响的产物。在德日法上,真正与我国行政处罚类似的,不是传统意义上的行政罚,而是目前德国法上以《违反秩序法》为核心建构起的德国版“行政处罚”制度。厘清行政处罚与行政罚的区别,有助于理解我国行政处罚的概念,探究行政违法行为与犯罪的区别,有益于比较法研究的精细化。

关键词：行政处罚行政罚行政犯违反行政义务

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行政法上企业强制合规的反思与调整

浙江学刊 2024年第2期 99-109页

作者：王明喆南京师范大学法学院南京210023 中国法治现代化研究院

行政法上的强制合规是指法律给相关企业设定建立合规管理体系的义务,并对拒不履行合规管理义务的企业作出行政处罚的制度。强制合规与传统行政执法均采“命令—服从”模式,都是通过设定义务和科处处罚的方式迫使行为人遵守法律法规。企... 详细信息

行政法上的强制合规是指法律给相关企业设定建立合规管理体系的义务,并对拒不履行合规管理义务的企业作出行政处罚的制度。强制合规与传统行政执法均采“命令—服从”模式,都是通过设定义务和科处处罚的方式迫使行为人遵守法律法规。企业合规的本意是通过不予处罚、减免处罚等方式为企业降低风险,同时通过企业的自我规制减轻行政机关负担。但强制合规为企业设定了新的义务、增加了新的风险,同时将行政机关重新推到前台,为其增加新的监管职责。因此,强制合规并不可取,强制合规应当向正向激励型合规转变。行政法上的合规制度应当坚持企业自我规制的基本理念,在辅助性原则和合作性原则的指引下,尊重企业的自主选择权和主导地位。同时,应当完善对合规企业的正向激励措施,通过不予处罚、减免处罚或者给予奖励等激励措施诱导企业依法合规生产经营。

关键词：企业合规强制合规自我规制正向激励