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植物MIo基因家族鉴定及系统进化分析

温州科技职业学院学报 2018年第2期10卷 19-26,56页

作者：陈伟哲史建磊温州科技职业学院浙江温州325006

为探究从低等到高等植物MIo基因结构及进化关系，本研究选取番茄、黄瓜、葡萄、拟南芥、水稻、玉米、江南卷柏，小立碗藓、绿藻等10个物种，运用生物信息学手段共鉴定出84个MIo基因。结果表明：绿藻MIo基因组明显比其他物种大，其次是... 详细信息

为探究从低等到高等植物MIo基因结构及进化关系，本研究选取番茄、黄瓜、葡萄、拟南芥、水稻、玉米、江南卷柏，小立碗藓、绿藻等10个物种，运用生物信息学手段共鉴定出84个MIo基因。结果表明：绿藻MIo基因组明显比其他物种大，其次是玉米，江南卷柏最小；绝大部分MIo含11-16个外显子；绿藻MIo编码蛋白和组成氨基酸明显比其他物种大，其次是小立碗藓，水稻和玉米较小；所有MIo编码蛋白理论等电点均大于6，属碱性蛋白；绝大部分MIo蛋白含7个跨膜结构；12个MIo蛋白具有N端信号肽和钙离子结合区；大部分MIo定位于细胞膜。系统聚类可将84个MIo基因分为6类（Ⅰ-Ⅵ），其中最大的一类为I类，含有24个成员；Ⅲ类和Ⅵ类最小，分别含4和5个成员。进一步分析发现，共有27对同源基因，包括15对旁源基因和12对直源基因。本文初步对10种植物MIo基因进行了鉴定分析，这为植物MIo基因功能挖掘及抗病育种奠定了良好基础。

关键词：植物 MIo 鉴定生物信息学系统进化

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蒲瓜品种温圆蒲1号的选育与栽培技术

浙江农业科学 2015年第5期56卷 659-661页

作者：陈先知王燕史建磊徐坚温州市农业科学研究院浙南作物遗传育种重点实验室浙江温州325006

温圆蒲1号是从苍南地方品种五月早蒲瓜变异单株经系统选育获得的一个品种。该品种植株蔓生,攀缘生长,植株生长势中等,叶呈心脏形,绿色。主侧蔓都能结瓜,以主蔓结瓜为主,主蔓一般6～7节开始结瓜,连续雌花数为6～7节,侧蔓从第1节开始,每... 详细信息

温圆蒲1号是从苍南地方品种五月早蒲瓜变异单株经系统选育获得的一个品种。该品种植株蔓生,攀缘生长,植株生长势中等,叶呈心脏形,绿色。主侧蔓都能结瓜,以主蔓结瓜为主,主蔓一般6～7节开始结瓜,连续雌花数为6～7节,侧蔓从第1节开始,每节均发生雌花。早熟,春季栽培从定植到采收约45 d。商品瓜葫芦形,瓜高约15 cm,单瓜重0 5～0 75 kg,瓜表皮绿色,光滑,肉质白色柔嫩,味甜,每100 g蒲瓜果肉中含Vc 6 656 mg,粗蛋白0 440 g,可溶性总糖2 25 g。一般667 m2^产量3 t以上,高产可达4 t。早春保护地栽培4月上中旬可上市,适宜长江流域作早春大棚栽培。

关键词：蒲瓜特征特性品质

黄瓜-酸黄瓜染色体片段导入系群体的构建及果实相关数量性状基因的定位

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中国农业科学 2012年第8期45卷 1558-1567页

作者：孟佳丽娄群峰周晓慧史建磊陈劲枫南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室

【目的】以栽培黄瓜(Cucumis sativus L.,2n=14)‘北京截头’为受体亲本,以野生酸黄瓜(*** Chakr,2n=24)为供体亲本,采用SSR标记辅助选择法构建黄瓜-酸黄瓜染色体片段导入系群体。初步定位控制黄瓜果实外形的数量性状基因。【方法】首... 详细信息

【目的】以栽培黄瓜(Cucumis sativus L.,2n=14)‘北京截头’为受体亲本,以野生酸黄瓜(*** Chakr,2n=24)为供体亲本,采用SSR标记辅助选择法构建黄瓜-酸黄瓜染色体片段导入系群体。初步定位控制黄瓜果实外形的数量性状基因。【方法】首先通过种间杂交-回交-自交获得大量的染色体片段导入系株系。然后选择均匀分布在黄瓜染色体组上的298对SSR标记对亲本进行多态性检测,使用检测出的亲本间差异引物对染色体片段导入系株系进行检测,筛选含有野生酸黄瓜染色体片段的植株。对该群体果实外形进行初步调查,利用t测验与轮回亲本比较,鉴定QTL。【结果】本研究构建了由50个株系组成的染色体片段导入系群体。在该群体中共检测到149个染色体导入片段,包含61个不同的导入片段,不同导入片段的总长度为259.95 cM,基因组覆盖率为45.37%。导入片段的长度在1.65—15.4 cM,平均长度为5.41 cM,分布于黄瓜的7条染色体上。利用该导入系群体初步定位了控制黄瓜果型的13个QTL。【结论】构建了一套以栽培黄瓜为背景,野生酸黄瓜为前景的染色体片段导入系群体,并利用该导入系初步定位了控制黄瓜果型的QTL,为开发利用野生酸黄瓜的优良基因提供了新的种质资源,也为今后定位黄瓜的数量性状遗传位点奠定了材料基础。

关键词：野生酸黄瓜染色体导入系分子标记辅助选择数量性状位点

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紫色辣椒夏季坐果率及其主要光合特性分析

园艺学报 2011年第1期38卷 77-86页

作者：隋益虎钱春桃陈劲枫史建磊胡能兵曹玉杰南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室南京210095 安徽科技学院生命科学学院安徽凤阳233100

夏季在塑料日光温室中采用人工蕾期授粉法,对18份紫色和21份绿色辣椒进行自交,并选择其中10份紫色和9份绿色材料做完全随机相互杂交,统计坐果率;选择叶片颜色具有代表性的5个品种,绿色品种7035、浓紫7033、中紫7037、略紫7034(叶脉为紫... 详细信息

夏季在塑料日光温室中采用人工蕾期授粉法,对18份紫色和21份绿色辣椒进行自交,并选择其中10份紫色和9份绿色材料做完全随机相互杂交,统计坐果率;选择叶片颜色具有代表性的5个品种,绿色品种7035、浓紫7033、中紫7037、略紫7034(叶脉为紫色)和略紫7039(叶脉为绿色),检测其叶片色素含量、主要光合过程指标和叶绿素荧光参数。结果表明:(1)紫色品种平均自交坐果率(72.19%)高于绿色品种(37.12%),紫色品种×绿色品种坐果率(55.99%)高于绿色品种×紫色品种和(21.60%)。(2)紫色品种叶片花青素(An)含量、叶绿素a、b比值(Chl.a/b)都显著高于绿色品种,但两者Chl.b含量无差异;多数紫色品种的Chl.a及类胡萝卜素(Car)含量高于绿色品种。(3)所有品种的蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)及Pn日变化趋势一致,紫色品种Pn达极大值时的光合有效辐射(PAR)、光补偿点(LCP)和光饱和点(LSP)以及一天中的高温时段实际Pn都显著地高于绿色品种,而表观量子效率(AQY)低于绿色品种。(4)绿色辣椒只在光系统Ⅱ(PSⅡ)的"反应中心水平"减轻过剩能量的伤害,紫色辣椒除此之外还在"天线水平"防止太阳能被原初反应过多吸收;与绿色品种相比,7033和7034所吸收(ABS/CS)、捕获(TRo/CS)和传递(ETo/CS)的能量总量较低,但同时耗散(DIo/CS)也低,而最大荧光(Fm)、最大光化学效率(Fv/Fm)、潜在光化学效率(Fv/Fo)和电子传递效率(ETo/TRo)等都很高。

关键词：紫色辣椒花青素坐果率光合作用叶绿素荧光

不同追肥水平对北美海蓬子生长和产量形成的影响

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南方农业学报 2014年第3期45卷 415-419页

作者：徐坚史建磊王燕曾国权陈先知王克磊温州科技职业学院浙江温州325006 浙江省海洋水产养殖研究所浙江温州325005

【目的】研究不同追肥水平下北美海蓬子的生长和产量形成情况，为其引种栽培提供一定理论指导。【方法】以北美海蓬子为试验材料，调查不同尿素∶复合肥（1∶1）追施水平（0、75、150、225、300 kg/ha）下的生物性状表现并进行统计分析... 详细信息

【目的】研究不同追肥水平下北美海蓬子的生长和产量形成情况，为其引种栽培提供一定理论指导。【方法】以北美海蓬子为试验材料，调查不同尿素∶复合肥（1∶1）追施水平（0、75、150、225、300 kg/ha）下的生物性状表现并进行统计分析。【结果】追肥水平对北美海蓬子生育影响显著，在0-225 kg/ha两者呈正相关，追肥量为225 kg/ha时嫩茎产量高达30000 kg/ha、种子产量近3000 kg/ha，追肥量为300 kg/ha时产量开始下降。225 kg/ha是北美海蓬子生长和产量形成的适宜追肥量，在株高、茎粗、分枝数、生物量（尤其是地上部分）等多个生物性状上表现优越。研究获得株高、分枝数、节间长、茎粗与追肥量的相关性拟合曲线：y=30.069＋1.845x-0.059x2、y=15.897＋0.377x＋0.019x2-0.001x3、y=1.997＋0.073x-0.003x2、y=0.300＋2.381＆#215;10-5x＋0.001x2-4.667＆#215;10-5x3，各曲线均达到显著水平。【结论】北美海蓬子株高、分枝数、节间长、茎粗与追肥量的相关性拟合曲线均达到显著水平，尿素与复合肥（1∶1）225 kg/ha追肥量最有利于北美海蓬子生长和产量形成。

关键词：北美海蓬子无机肥追肥量生物性状产量性状相关性

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浙南地区不同黄瓜品种比较试验

蔬菜 2015年第5期 8-10页

作者：王克磊朱隆静陈先知史建磊徐坚温州市农业科学研究院浙江温州325000 温州市设施蔬菜工程技术中心浙江温州325014

为筛选适宜浙南地区栽培的黄瓜新品种,引进了6个不同的黄瓜新品种,进行嫁接品种比较试验,结果表明:品种H24-915综合性状表现最好,果实的商品性状符合温州本地居民的消费习惯,且产量在品种比较试验中最高,折合667 m^2产量达3 153.31 kg。... 详细信息

为筛选适宜浙南地区栽培的黄瓜新品种,引进了6个不同的黄瓜新品种,进行嫁接品种比较试验,结果表明:品种H24-915综合性状表现最好,果实的商品性状符合温州本地居民的消费习惯,且产量在品种比较试验中最高,折合667 m^2产量达3 153.31 kg。H24-915在商品性状、产量等方面均有较大的优势,适宜在浙南地区进行进一步推广。

关键词：黄瓜嫁接品种

番茄WRKY转录因子比较鉴定及细菌胁迫响应

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福建农业学报 2023年第3期38卷 281-293页

作者：水德聚孙继熊自立徐焕文张圣美史建磊温州科技职业学院/浙南作物育种重点实验室浙江温州325006

【目的】深入了解番茄WRKY转录因子的组学特征及其生物胁迫响应。【方法】基于最新公共数据,利用生物信息学和比较基因组学方法对番茄WRKY进行系统鉴定,结合抗、感2个番茄自交系在青枯菌侵染前后的RNA-seq数据,挖掘青枯病抗性相关WRKY... 详细信息

【目的】深入了解番茄WRKY转录因子的组学特征及其生物胁迫响应。【方法】基于最新公共数据,利用生物信息学和比较基因组学方法对番茄WRKY进行系统鉴定,结合抗、感2个番茄自交系在青枯菌侵染前后的RNA-seq数据,挖掘青枯病抗性相关WRKY。【结果】85个番茄WRKY转录因子被鉴定,可分为Ⅰ、Ⅱa+b、Ⅱc、Ⅱd+e和Ⅲ等类别,Ⅱe基因最多。其中,9个基因七肽基序发生了单一氨基酸变异,WRKYGKK为优势突变型。这些WRKY主要分布在5号染色体,且具有端部和成簇分布现象,尤其是Ⅱe亚类。45.88%的番茄WRKY具有共线性。58.82%的番茄WRKY(主要是Ⅰ和Ⅱc类)与拟南芥和辣椒WRKY形成73对直系同源基因,其选择压力(Ka/Ks)均小于1。16个番茄WRKY(主要是Ⅱa+b和Ⅱc类)对几种生物胁迫反应强烈,且主要在根中表达。12个差异表达WRKY(主要是Ⅲ和Ⅱb类)被鉴定,其中Solyc03g095770.3(Ⅲ)与Solyc09g014990.4(Ⅰ)互作在番茄青枯病响应中发挥重要作用。【结论】综合鉴定了番茄WRKY转录因子,筛选到12个青枯病响应基因。

关键词：番茄 WRKY转录因子基因特征生物胁迫转录表达

不同植物Mlo基因全基因组鉴定及系统进化分析

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基因组学与应用生物学 2020年第8期39卷 3541-3553页

作者：史建磊万红建熊自立张海利马彦如苏世闻宰文珊温州科技职业学院温州市农业科学研究院浙南作物育种重点实验室温州325006 福建农林大学农学院福州350002 浙江省农业科学院蔬菜研究所杭州310021

Mlo作为一类广谱抗病因子,参与植物多种生物与非生物胁迫反应。为研究不同物种Mlo基因的基本特征及进化关系,选取已测序的29种代表性植物,利用生物信息学方法对其进行鉴定及系统进化分析。结果显示:共有198个植物Mlo基因被鉴定,各基因具... 详细信息

Mlo作为一类广谱抗病因子,参与植物多种生物与非生物胁迫反应。为研究不同物种Mlo基因的基本特征及进化关系,选取已测序的29种代表性植物,利用生物信息学方法对其进行鉴定及系统进化分析。结果显示:共有198个植物Mlo基因被鉴定,各基因具有11~14个外显子,编码400~600个氨基酸,翻译碱性疏水性稳定蛋白,部分Mlo含信号肽和钙调素结合区,绝大多数Mlo定位于细胞膜,含5~7个跨膜螺旋结构。基序分析发现,10个保守基序长21~50个氨基酸。染色体定位发现174个Mlo不均衡地散布于不同染色体或scaffold上,且主要位于两端,形成19个(24.1%)基因簇、5对(5.7%)串联重复和61对(36.2%)片段重复。系统聚类可将164个Mlo分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个区组,被子植物Mlo主要聚在ⅠA组,江南卷柏Mlo聚在ⅠA和ⅢB组,小立碗藓Mlo聚在ⅠB和ⅢA组,几乎所有藻类Mlo聚在Ⅱ组。同源性分析发现52.4%的Mlo以同源基因形式存在,包括25对直系同源基因和28对旁系同源基因,其Ka/Ks值为0.01~0.78,说明进化中主要受到纯化选择。研究表明植物Mlo基因家族较保守,具有成簇存在的特点,在进化过程中经重复扩张,形成了大量同源基因,同时也发生了不同程度的丢失,结果为相关基因分离及植物抗病育种应用提供了理论依据。

关键词： Mlo基因家族生物信息学基因重复系统聚类同源基因

黄瓜中导入野生酸黄瓜外源DNA片段的分子验证

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中国农业科学 2010年第22期43卷 4663-4670页

作者：史建磊陈劲枫娄群峰隋益虎吴志明张淑霞南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室

【目的】对栽培黄瓜(Cucumis sativus L.,2n=14)与野生酸黄瓜(Cucumis hystrix Chakr.,2n=24)经远缘杂交和多代回交、自交而来的渐渗系进行分子标记分析和表型鉴定,旨在为黄瓜导入酸黄瓜外源DNA片段提供相应依据。【方法】从分子标记分... 详细信息

【目的】对栽培黄瓜(Cucumis sativus L.,2n=14)与野生酸黄瓜(Cucumis hystrix Chakr.,2n=24)经远缘杂交和多代回交、自交而来的渐渗系进行分子标记分析和表型鉴定,旨在为黄瓜导入酸黄瓜外源DNA片段提供相应依据。【方法】从分子标记分析、DNA序列比对和农艺性状表现上对各渐渗系和双亲进行研究。【结果】渐渗系与栽培黄瓜存在13.2%的遗传多态性,包括供体特异带、缺失带和产生的新带。利用RAPD引物D-11和SSR引物06632在渐渗系中分别扩增出约310bp和150bp的酸黄瓜特异带,序列分析表明其与酸黄瓜相应DNA片段的相似性分别为92.93%和96.48%,碱基差异分别为41个和9个,包括碱基转换、颠换和缺失。表型鉴定发现其呈现出酸黄瓜的遗传特性。【结论】野生酸黄瓜DNA已渐渗进入栽培黄瓜基因组,同时发生了少量不同类型的变异。

关键词：黄瓜野生酸黄瓜渐渗系 DNA序列农艺性状