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牦牛基因组结构变异研究进展

中国草食动物科学 2024年

作者：刘瑞林徐东辉李瑞哲陈生梅马志杰农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室

基因组结构变异（Structural variation， SV）通常是指基因组内影响DNA序列方向或长度导致其发生变化的变异形式，包括缺失、插入、重复、易位和倒位。SV通过基因剂量效应和位置效应直接或间接影响基因的表达，进而导致物种发生表型变... 详细信息

基因组结构变异（Structural variation， SV）通常是指基因组内影响DNA序列方向或长度导致其发生变化的变异形式，包括缺失、插入、重复、易位和倒位。SV通过基因剂量效应和位置效应直接或间接影响基因的表达，进而导致物种发生表型变异。近十年来，随着全基因组重测序技术和高密度芯片技术的快速发展，牦牛基因组SV研究也取得重要进展。本文就基因组SV类型、形成机制和检测方法进行阐释，并将近10年来牦牛基因组SV的研究现状进行综述，以期为牦牛组学的深入研究、加快牦牛分子育种进程提供参考。

关键词：牦牛基因组结构变异

基于数据流的K-S变化检测的动态多目标规划算法

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长江大学学报（自然科学版） 2024年第1期21卷 109-116页

作者：张涛周晨杜锋陈芳刘瑞林长江大学信息与数学学院湖北荆州434023 荆楚理工学院数理学院湖北荆门448000

为了更加准确地判断环境是否发生变化并快速追踪动态多目标规划问题(dynamicmulti-objectiveoptimization problem,DMOP)当前时刻的Pareto前沿,提出了一种基于数据流的Kolmogorov-Smirnov(K-S)变化检测的动态多目标规划(DSK-SDMOP)算法。该算法以NSGA-Ⅱ为基础,通过数据流建立2个时刻的检验窗口,再利用K-S检验基于数据流的Pareto最优前沿是否发生变化,检测2个窗口的数据是否服从同一分布来判断环境是否发生变化,并就环境变化的剧烈程度实行相应的应答机制,以提高对环境的适应程度。利用基于数据流的K-S检测方法,对环境变化不会过于敏感,而且不用提前假设对应目标值的分布,易于操作。通过5个动态多目标规划标准测试函数对该算法进行测试,并和现有的2种算法进行对比分析,结果表明该算法处理动态多目标规划问题具有良好的性能。

关键词：动态多目标规划数据流 K-S检验 NSGA-Ⅱ

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基于线粒体全基因组的柴达木牛母系遗传多样性、群体结构及系统发育分析

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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2024年 1-12页

作者：魏旭东刘瑞林李瑞哲张卫忠王启辉赵海明郭卫兴许正全尕藏当周韩赟雷初朝马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海省格尔木市畜牧兽医站青海省格尔木市郭勒木德乡畜牧兽医站青海省格尔木市乌图美仁乡畜牧兽医站青海省都兰县宗加镇畜牧兽医站青海省乌兰县畜牧兽医站西北农林科技大学动物科技学院

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5... 详细信息

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5个北方黄牛品种(即蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛和安西牛)和2个国外培育品种(荷斯坦牛和日本和牛)的共129条线粒体全基因组相应序列进行综合分析,以揭示柴达木牛线粒体基因组遗传变异,明确其母系遗传多样性水平、群体遗传结构组成、母系遗传背景及与我国北方部分地方黄牛品种、国外培育品种间的遗传关系。【结果】(1)60头柴达木牛线粒体全基因组序列比对分析共发现346个多态位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点295个;根据序列间核苷酸变异共确定37种单倍型(H1～H37)。遗传多样性分析显示,柴达木牛线粒体基因组单倍型多样度为(0.981 0±0.006 0),核苷酸多样度为(0.003 3±0.000 2),提示其拥有丰富的母系遗传多样性。(2)系统发育分析表明,柴达木牛拥有普通牛和瘤牛2大母系支系,且以普通牛T支系为主,拥有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,提示柴达木牛拥有普通牛和瘤牛血统,有两个母系起源。(3)群体遗传分化分析表明,柴达木牛与蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛、日本和牛遗传分化程度均很弱,而与安西牛、荷斯坦牛达到中等遗传分化程度。(4)聚类分析显示,柴达木牛与蒙古牛聚类关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、安西牛、延边牛聚类关系相对较近,与日本和牛、荷斯坦牛聚类关系较远,其聚类结果与分化程度基本一致。【结论】柴达木牛拥有丰富的母系遗传多样性,由普通牛和瘤牛两个母系支系组成,含有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,推测其有2个母系起源。柴达木牛与蒙古牛亲缘关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、延边牛、安西牛遗传关系较近,而与日本和牛、荷斯坦牛遗传关系较远。

关键词：柴达木牛 mt DNA 母系起源群体结构

苯和环己烯分步制联环己烷过程催化剂设计及性能提升研究

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燃料化学学报（中英文） 2024年第9期52卷 1290-1298页

作者：刘瑞林王森孟繁春李卓杨慧敏赵世超覃勇张斌中国科学院山西煤炭化学研究所煤炭高效低碳利用全国重点实验室山西太原 030001 中国科学院大学北京10049

联环己烷是一种高储氢密度、低沸点储氢试剂.与联苯加氢相比,苯和环己烯烷基化制环己基苯再加氢是一种有望实现大规模制备联环己烷的途径.在成熟的烷基化技术基础上,需进一步开展高效环己基苯加氢催化剂的研发.本研究首先使用酸化的USY... 详细信息

联环己烷是一种高储氢密度、低沸点储氢试剂.与联苯加氢相比,苯和环己烯烷基化制环己基苯再加氢是一种有望实现大规模制备联环己烷的途径.在成熟的烷基化技术基础上,需进一步开展高效环己基苯加氢催化剂的研发.本研究首先使用酸化的USY分子筛催化苯和环己烯烷基化至环己基苯,获得100％转化率和产物选择性.进一步通过原子层沉积(ALD)在γ-Al2O3表面预先沉积不同厚度的TiO2膜后再负载铂颗粒制得Pt/TiO2/γ-Al2O3催化剂,研究TiO2膜提升催化剂环己基苯加氢性能机制.TEM、CO脉冲吸附、CO-DRIFTs、准原位XPS、H-D交换和H2-TPR表征显示,与Pt/γ-Al2O3相比,Pt/TiO2/γ-Al2O3催化剂不改变Pt颗粒的分散度,但能够形成新的Pt-TiO2相互作用,提高铂表面电子密度、平面活性位点比例和降低氢溢流能垒,提升环己烷基苯加氢性能.研究为进一步发展联环己烷有机液态储氢试剂提供理论支持.相关金属-载体相互作用调控策略可应用于其他芳香性分子高效加氢催化剂的研制.

关键词：有机液态储氢联环己烷加氢金属载体相互作用原子层沉积

来源：博看期刊评论

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从阴虚燥毒探析甘酸辛润法治疗干燥综合征

风湿病与关节炎 2024年第3期13卷 60-63页

作者：刘瑞林王济华李纪高杜明瑞周全河南中医药大学第一附属医院河南郑州450000

干燥综合征是一种系统性自身免疫性疾病,属中医学“燥痹”范畴,临床症状以口干眼干为主。中医学认为,阴虚是其主要病机,但对后续病机演变和治疗,各家的认识却各有不同。通过论述阴虚内热-燥热蕴毒的病机演变,将阴虚燥毒概括为本病发生... 详细信息

干燥综合征是一种系统性自身免疫性疾病,属中医学“燥痹”范畴,临床症状以口干眼干为主。中医学认为,阴虚是其主要病机,但对后续病机演变和治疗,各家的认识却各有不同。通过论述阴虚内热-燥热蕴毒的病机演变,将阴虚燥毒概括为本病发生、发展的关键,讨论甘酸化阴和辛以润之合用配伍指导临床用药治疗燥痹的合理性,为临床提供借鉴。

关键词：干燥综合征燥痹阴虚燥毒甘酸化阴辛以润之

凝血因子Ⅱ凝血酶受体在胃癌患者预后和免疫浸润中的临床意义

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凝血因子Ⅱ凝血酶受体在胃癌患者预后和免疫浸润中的临床意义

2024中国肿瘤标志物学术大会暨CACA整合肿瘤学高峰论坛暨第十七届肿瘤标志物青年科学家论坛暨中国肿瘤标志物产业创新大会

作者：张玉东周峰许紫鹏吴铭钰王艺超邵琳朱璨灿朱妍刘瑞林杨玲云

目的:探讨凝血因子Ⅱ凝血酶受体(F2R)表达在胃癌患者中的预后价值及其与免疫浸润的关系,探索其在影响胃癌发生、发展中的潜在生物学机制。方法:胃癌患者的临床病理信息和基因表达数据来源于癌症基因组图谱(TCGA)、UCSC Xena和GEO数据库... 详细信息

目的:探讨凝血因子Ⅱ凝血酶受体(F2R)表达在胃癌患者中的预后价值及其与免疫浸润的关系,探索其在影响胃癌发生、发展中的潜在生物学机制。方法:胃癌患者的临床病理信息和基因表达数据来源于癌症基因组图谱(TCGA)、UCSC Xena和GEO数据库等。采用Wilcoxon符号秩和检验、配对T检验分析临床特征与胃癌样本中F2R表达的相关性。构建Kaplan–Meier生存曲线和Cox回归模型来评估F2R对预后的影响,并构建包括相关列线图。利用UCSC的Xena平台的数据分析F2R基因表达和DNA甲基化之间的相关性,并采用MethSurv方法进行生存分析。使用TIMER2.0来评估F2R表达与肿瘤免疫细胞浸润丰富度的相关性等。对F2R共表达基因进行GO功能分析和KEGG通路分析,并通过TISIDB在线网站分析与F2R相互作用的药物。结果:F2R在胃癌样本中表达显著上调(P<0.001),与肿瘤组织学分级、临床分期相关;Cox回归的结果提示F2R是胃癌的独立预后因素(HR=2.004,95%CI:1.069～3.755,P<0.05)。生存分析的结果表明,F2R高表达组、F2R启动子区低甲基化组的患者总体生存率较低(P<0.05),预后差。免疫浸润的结果显示,F2R的表达与CD8+T细胞(r=0.367)、肿瘤相关的成纤维细胞(r=0.571)、巨噬细胞(r=0.564)、中性粒细胞(r=0.347)、树突状细胞(r=0.504)等呈正相关(P<0.05)。对于单细胞检测的数据集分析发现,F2R主要在成纤维细胞、CD8+T细胞、浆细胞和内皮细胞中表达。GO功能分析表明,F2R共表达基因的生物学过程主要涉及细胞粘附、对细胞迁移的调节、细胞外基质组织等;KEGG通路分析显示,F2R共表达基因主要富集在癌症通路、PI3K-Akt信号通路和MAPK信号通路等。多GSEA富集分析的结果显示,F2R基因高表达,会通过促进ECM受体相互作用、局灶粘附和癌症通路等影响胃癌的发生、发展。结论:F2R可能是一种独立的、潜在的胃癌预后生物标志物,与胃癌的免疫浸润相关,可作为免疫治疗靶点。

关键词： F2R 胃癌预后免疫浸润富集分析

来源： cnki会议评论

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天祝白牦牛全线粒体基因组母系遗传多样性

青海大学学报 2024年第2期42卷 28-34页

作者：曹萍徐宇辉刘瑞林陈生梅李瑞哲薛斌马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016

为从基因组水平上揭示天祝白牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和母系遗传背景,本研究利用基因组重测序技术,测定42头天祝白牦牛的全基因组序列,获取其线粒体基因组全序列,并从GenBank中下载1条已公布的天祝白牦牛线粒体基因组全序列... 详细信息

为从基因组水平上揭示天祝白牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和母系遗传背景,本研究利用基因组重测序技术,测定42头天祝白牦牛的全基因组序列,获取其线粒体基因组全序列,并从GenBank中下载1条已公布的天祝白牦牛线粒体基因组全序列,对共计43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列进行综合分析。结果表明:从43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列中共识别出971个变异位点,包括25个单一多态位点和946个简约信息位点;通过序列间核苷酸变异确定了20种单倍型,单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.907和0.013,表明天祝白牦牛拥有较为丰富的母系遗传多样性。与野牦牛及环湖、雪多、玉树、青海高原、帕米尔等牦牛品种相比,天祝白牦牛母系遗传多样性相对较低。利用美洲野牛作为参考外群进行系统发育分析,20种单倍型分布于5种单倍型组(A、B、C、E和G)中,归属于3个母系遗传支系(Mt-Ⅰ、Mt-Ⅱ和Mt-Ⅲ),以Mt-Ⅰ支系为主,推测其有3个母系起源。

关键词：天祝白牦牛线粒体基因组遗传多样性群体结构系统发育

废虾壳衍生多孔碳纳米酶的制备及用于比色检测自来水中过氧化氢

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分析试验室 2023年第7期42卷 957-963页

作者：杨沁宜刘瑞林徐州医科大学药学院徐州221004

以废虾壳为碳源,通过惰性气氛高温碳化法制得废虾壳衍生的多孔碳纳米酶,并将其作为一种类过氧化物模拟酶用于比色检测自来水中的H_(2)O_(2)。所制备的碳纳米酶呈无定型多孔结构,且催化活性类似天然辣根过氧化物酶。考察了反应体系中各... 详细信息

以废虾壳为碳源,通过惰性气氛高温碳化法制得废虾壳衍生的多孔碳纳米酶,并将其作为一种类过氧化物模拟酶用于比色检测自来水中的H_(2)O_(2)。所制备的碳纳米酶呈无定型多孔结构,且催化活性类似天然辣根过氧化物酶。考察了反应体系中各参数对类过氧化物酶催化活性的影响。在最优条件下,废虾壳衍生多孔碳纳米酶比色分析H_(2)O_(2)的线性范围为0~200μmol/L,线性相关系数R^(2)=0.9772,检出限为0.59μmol/L。建立的方法可用于快速分析自来水中的H_(2)O_(2)。

关键词：多孔碳纳米酶类过氧化物模拟酶废虾壳衍生多孔碳比色检测过氧化氢

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城镇化对我国人身保险需求的影响研究

城镇化对我国人身保险需求的影响研究

作者：刘瑞林广东财经大学

学位级别：硕士

保险作为金融业三驾马车的重要组成部分的同时也成为了改革开放以来发展速度最快的行业之一,它是用于衡量本国社会文明程度、政府治理能力以及经济发达程度是否已经达到了新高度的一个重要指标。改革开放数十年来,各行各业都得到了较大... 详细信息

保险作为金融业三驾马车的重要组成部分的同时也成为了改革开放以来发展速度最快的行业之一,它是用于衡量本国社会文明程度、政府治理能力以及经济发达程度是否已经达到了新高度的一个重要指标。改革开放数十年来,各行各业都得到了较大的发展,保险业亦随着这股春风蒸蒸日上。我国保险业务包括了人身保险业务以及财产保险业务,近年以来,我国人身保险规模得益于行业的高速发展也在迅速地拓展自身的规模。同时,我国城镇化推进工作也取得了较为满意的成绩。为了探究城镇化推进过程中是否能够显著影响人身保险的需求,分析如何在城镇化的进程中保持人身保险市场规模乃至保险行业规模的持续稳定增长,设计出在社会主义新时代下满足广大消费者的需求以及令消费者满意的人身保险产品显得意义重大,本文基于已有的理论知识和依靠获得各省市的相关数据进行数据分析以便于能够较为全面以及稳健的得出研究结果。首先,以城镇化理论和人身保险的相关理论为基础,描述了随着城镇化程度的提升,通过居民财富增加、农民生活方式改变、居民保险意识提升等方面促进人身保险需求。然后,使用2011-2020年各省市面板数据从城镇化率对人身保险发展的影响进行实证分析。最后,本文基于实证分析的结果分别从城镇化均衡发展、保险公司应该加强产品创新满足城镇化进程中产生的新需求、关注农村商业保险潜在市场、产业结构升级、提高民众保险意识等方面提出建议。

关键词：人身保险城镇化人身保险密度