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核酸四碱基体的量子化学计算方法比较

Chinese Journal of Structural Chemistry 2001年第4期20卷 313-318页

作者：刘世熙栗旸曹槐谢小光刘次全中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室昆明650223 云南省卫生防疫站昆明650022 云南大学现代生物学研究中心昆明650091

对9种四碱基体进行了6种半经验方法和HF/STO-3G的计算，结果表明PM3方法对四碱基体体系的计算比较适宜，其结果与从头算结果接近，而且大大缩短了计算时间。计算还说明，四碱基体极有可能是通过碱基对形成。由稳定能的顺序看，除已报道... 详细信息

对9种四碱基体进行了6种半经验方法和HF/STO-3G的计算，结果表明PM3方法对四碱基体体系的计算比较适宜，其结果与从头算结果接近，而且大大缩短了计算时间。计算还说明，四碱基体极有可能是通过碱基对形成。由稳定能的顺序看，除已报道的3种四碱基体G4、G·C·G·C和U4外，一种新的G·C·G·C四碱基体也有稳定存在的可能。

关键词：量子化学计算四碱基体核酸结构

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DNAB→Z构象转换的扭转角变化特征

Chinese Journal of Structural Chemistry 1999年第6期18卷 410-413页

作者：曹槐刘世熙谢小光云南大学现代生物学研究中心昆明650091

选择鸟嘌呤脱氧单核苷酸（Ｇ）作为模型，在一定范围内改变确定ＤＮＡ分子构象的８个扭转角，对Ｂ→Ｚ转换过程中的不同构象进行量子化学计算。通过能量分析，可将转换中扭转角的作用分为三类：从Ｂ型到Ｚ型，随扭转角γ的变化，势能... 详细信息

选择鸟嘌呤脱氧单核苷酸（Ｇ）作为模型，在一定范围内改变确定ＤＮＡ分子构象的８个扭转角，对Ｂ→Ｚ转换过程中的不同构象进行量子化学计算。通过能量分析，可将转换中扭转角的作用分为三类：从Ｂ型到Ｚ型，随扭转角γ的变化，势能曲线呈现两个能垒，与８个扭转角同时变化一致，说明γ是最重要的。α角和δ角的变化使能量升高对Ｚ构象的形成有显著影响，而β、ε、χ、ν０、ν４的变化使能量基本保持不变对新构象的生成影响不大。

关键词： DNA B-Z转换扭转角构象转换

七种不同抗冷性植物甘油-3-磷酸转酰酶m RNA二级结构研究

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云南植物研究 2002年第4期24卷 463-470页

作者：柳维波曹槐刘世熙刘次全云南大学现代生物学研究中心云南昆明650091

对南瓜、豌豆、黄瓜、拟南芥菜、红花、菠菜、黑子南瓜等 7种不同抗冷性植物甘油- 3-磷酸酰基转移酶的mRNA序列作了三核苷酸碱基模式分析 ,并用Zuker方法对其mRNA序列的翻译区进行了二级结构分析 ,统计出发夹、内环、膨胀环、三分支环... 详细信息

对南瓜、豌豆、黄瓜、拟南芥菜、红花、菠菜、黑子南瓜等 7种不同抗冷性植物甘油- 3-磷酸酰基转移酶的mRNA序列作了三核苷酸碱基模式分析 ,并用Zuker方法对其mRNA序列的翻译区进行了二级结构分析 ,统计出发夹、内环、膨胀环、三分支环、四分支环等二级结构的基本结构单元数 ,通过对编码脯氨酸的密码子在mRNA二级结构中的分布位置的研究 ,发现这些密码子主要是分布在茎的末端、环的根部、膨胀环或分支环上 ,占到了序列中所有编码脯氨酸的密码子总数的 6 9%到 97%的比例 ,这与我们在研究其他物种的mRNA二级结构时的发现是一致的。

关键词：抗冷性植物甘油-3-磷酸转酰酶 mRNA 二级结构 GPAT酶脯氨酸

六聚同多酸阴离子M_6O_(19)^(n-)(M=Mo,W,n=2;M=Nb,Ta,n=8)电子结构和化学性质的密度泛函理论研究

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化学学报 2004年第17期62卷 1579-1584页

作者：刘世熙岳斌谭德军赵栋许静玉金松林范康年贺鹤勇复旦大学化学系

采用B3LYP方法在LanL2DZ水平上计算了六聚同多阴离子 (M6On-19,M =Mo和W ,n =2 ;M =Nb和Ta ,n =8)的电子结构 ,分析了它们的前线轨道、分子静电势 (MEP) .计算结果表明 ,Nb6O8-19和Ta6O8-19是电子给体 ,而Mo6O2 -19和W6O2 -19则是电子受... 详细信息

采用B3LYP方法在LanL2DZ水平上计算了六聚同多阴离子 (M6On-19,M =Mo和W ,n =2 ;M =Nb和Ta ,n =8)的电子结构 ,分析了它们的前线轨道、分子静电势 (MEP) .计算结果表明 ,Nb6O8-19和Ta6O8-19是电子给体 ,而Mo6O2 -19和W6O2 -19则是电子受体。

关键词：六聚同多酸阴离子电子结构化学性质密度泛函前线轨道分子静电势

质谱中反偶电子规则并含双电荷离子的两类联苯化合物的裂解机理

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高等学校化学学报 2018年第3期39卷 435-446页

作者：王毅张苹吴生秀孙媛媛赵彤刘世熙西安瑞联新材料股份有限公司西安710077 云南大学化学科学与工程学院昆明650091

利用气相色谱-质谱法分别对含C≡C桥键、CF_2O桥键及双CF_2O桥键的联苯类化合物进行分析,在各个化合物的谱图中均存在显著的奇电子自由基离子峰(反偶电子规则)和双电荷碎片离子峰.根据所得实验结果,归纳以上化合物中奇电子离子的生成途... 详细信息

利用气相色谱-质谱法分别对含C≡C桥键、CF_2O桥键及双CF_2O桥键的联苯类化合物进行分析,在各个化合物的谱图中均存在显著的奇电子自由基离子峰(反偶电子规则)和双电荷碎片离子峰.根据所得实验结果,归纳以上化合物中奇电子离子的生成途径分别为:(1)游离基中心诱导苄基C_(sp^3)—C_(sp^3)键均裂后再经另一苄基C_(sp^3)—C_(sp^3)键均裂,即α-σ裂解;(2)电荷中心静电诱导C_(sp^3)—O_(sp^3)键异裂后再经苄基C_(sp^3)—C_(sp^3)键或C_(sp^3)—O_(sp^3)键均裂,即i-σ裂解.推测引起σ键裂解的机制是由内转换引起的.双电荷离子的生成受2个相互独立官能团上既含游离基又含电荷的活化反应中心共同诱导控制裂解得到,生成途径分别为:(1)2个相互独立的游离基中心分别诱导苄基C_(sp^3)—C_(sp^3)键双均裂得到,即αα双重控制裂解反应;(2)独立的游离基中心诱导C_(sp^3)—C_(sp^3)均裂及另一电荷中心静电诱导C_(sp^3)—O_(sp^3)键异裂得到,即iα双重控制裂解反应;(3)2个相互独立的电荷中心分别静电诱导C_(sp^3)—O_(sp^3)键双异裂,即ii双重控制裂解反应.采用密度泛函理论(DFT)方法对具有代表性的化合物的裂解途径进行了初步计算,结果与前述裂解机制一致.

关键词：气相色谱-质谱联用偶电子规则双电荷离子液晶化合物裂解机理

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冠心病患者血清中若干指标的化学计量学分析

化学通报 1998年第8期 26-28页

作者：宋仲容张晓林杨丽霞刘世熙曹槐云南大学现代生物学研究中心

冠心病患者血清中若干指标的化学计量学分析宋仲容张晓林ａ杨丽霞ｂ刘世熙曹槐＊（云南大学现代生物学研究中心昆明６５００９１）宋仲容女，３９岁，副教授，研究方向为无机与分析化学，现在重庆高等师范专科学校化学系。＊联系人男，... 详细信息

冠心病患者血清中若干指标的化学计量学分析宋仲容张晓林ａ杨丽霞ｂ刘世熙曹槐＊（云南大学现代生物学研究中心昆明６５００９１）宋仲容女，３９岁，副教授，研究方向为无机与分析化学，现在重庆高等师范专科学校化学系。＊联系人男，４７岁，教授，研究方向为生物物理化...

关键词：动脉粥样硬化血清指标冠心病临床检验

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不同硬件环境下量子化学软件的测试比较

化学通报 2000年第4期63卷 55-59页

作者：刘世熙王朝杰曹槐叶松云南大学现代生物学研究中心昆明650091 云南大学化学系昆明650091

计算机技术的飞速发展使得量子化学计算方法、水平和运算速度等方面有了很大的提高,同时也不断推出新的量子化学软件,诸多软件中,Gaussian和Gamess-US一直处于领先地位,是量子化学工作者的主要研究工具,研究这两种软件的计算速度具有比... 详细信息

计算机技术的飞速发展使得量子化学计算方法、水平和运算速度等方面有了很大的提高,同时也不断推出新的量子化学软件,诸多软件中,Gaussian和Gamess-US一直处于领先地位,是量子化学工作者的主要研究工具,研究这两种软件的计算速度具有比较强的代表性.针对国内使用微机进行量子化学研究有一定普遍性,我们以单分子计算和过渡态计算为例,对不同硬件产品作了大量测试工作,目的在于给广大的量子化学工作者购机时提供一些参考.

关键词：量子化学软件计算机应用量子化学计算

主成分分析方法在核酸碱基量子化学计算数据处理中的应用

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化学研究与应用 2002年第3期14卷 293-295页

作者：刘世熙曹槐栗 谢小光刘次全中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室云南大学现代生物学研究中心云南昆明650091 云南省卫生防疫站

The quantum calculations on five nucleic acid bases,A,G,C,U,and T,were performed by six semiempirical methods,ab initio Hartree Fork method with twenty different basis sets,and ab initio MP2 method with three different basis *** with experimental geometry parameters,two steps of principal component analysis(PCA) were processed on a large amount of data obtained from *** to the results of the PCAs,some important geometric parameters of the bases were selected out to represent all of the parameters to discuss the problem related to geometric structure.

关键词：主成分分析方法核酸量子化学数据处理碱基半经验方法从头算化学计量学结构

微波消解、流动注射-氢化物发生原子荧光光谱法测定三七中硒含量

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光谱实验室 2002年第2期19卷 209-212页

作者：栗晹刘世熙曹槐云南省卫生防疫站昆明市东寺街158号650022 云南大学现代生物学研究中心昆明市翠湖北路2号650091

用微波消解、流动注射 -氢化物发生原子荧光光谱法测定三七中硒 ,通过实验选择最优化的测定条件 ,方法的检出限为 0 .30 μg· L-1,相对标准偏差为 1.2 % ,线性范围为 0 - 10 0 μg· L-1,相关系数为0 .9999,回收率为 96 .7%— 10 0 .7%

关键词：微波消解流动注射氢化物发生原子荧光光谱法硒三七中药分析测定