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植物microRNA对重金属胁迫响应的调控

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生物化学与生物物理进展 2011年第12期38卷 1106-1110页

作者：丁艳菲朱诚王珊珊刘海丽浙江大学生命科学学院浙江大学植物生理学与生物化学国家重点实验室杭州310029 中国计量学院生命科学学院杭州310018

镉是重要的重金属污染物,它严重影响植物生长,并危害人体健康.植物的重金属耐受机理很复杂,需从多个角度阐述.但参与重金属应答的调节性基因研究较少,重金属响应调控网络并不清楚.

关键词：重金属污染物 microRNA 植物生长调控网络胁迫响应人体健康性基因

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miRNA在植物种子发育过程中的作用

遗传 2015年第6期37卷 554-560页

作者：龚淑敏丁艳菲朱诚中国计量学院生命科学学院浙江省海洋食品品质及危害物控制技术重点实验室杭州310018

MicroRNA(miRNA)是一类小分子非编码RNA,通过降解靶基因途径在转录后水平调控基因表达,参与植物生长、发育以及逆境胁迫应答等多种细胞代谢活动。种子是植物生长的基础要素,是农业生产的重要资料。与种子发育相关的miRNA已在多种植物中... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类小分子非编码RNA,通过降解靶基因途径在转录后水平调控基因表达,参与植物生长、发育以及逆境胁迫应答等多种细胞代谢活动。种子是植物生长的基础要素,是农业生产的重要资料。与种子发育相关的miRNA已在多种植物中得到鉴定。文章综述了参与植物种子发育过程的miRNA及其在种子发育中的具体调控机制,旨在为利用miRNA提高种子遗传特性提供研究思路。

关键词：种子 miRNA 发育调控机制植物

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肝硬化门静脉血栓形成相关危险因素研究

肝硬化门静脉血栓形成相关危险因素研究

作者：丁艳菲山东大学

学位级别：硕士

研究目的探讨肝硬化患者形成门静脉血栓的相关危险因素,为临床诊疗评估、早期干预提供思路。研究方法回顾性分析2012.1～2016.12在山东大学齐鲁医院住院治疗的18-80岁肝硬化患者(1670例),所有符合条件患者经超声或计算机断层扫描(CT)或... 详细信息

研究目的探讨肝硬化患者形成门静脉血栓的相关危险因素,为临床诊疗评估、早期干预提供思路。研究方法回顾性分析2012.1～2016.12在山东大学齐鲁医院住院治疗的18-80岁肝硬化患者(1670例),所有符合条件患者经超声或计算机断层扫描(CT)或磁共振成像(MRI)等影像学检查明确血栓诊断及分布部位。将其中肝硬化发生PVT者纳入PVT组(217例);随机选择同期住院的肝硬化未发生PVT者纳入非PVT组(250例)。收集记录以下数据资料:①一般资料:性别、年龄、病因、Child-pugh分级;②实验室指标:血红蛋白(Hb)、血小板(PLT);总胆红素(TBil)、白蛋白(ALB)、肌酐(Cr);D-二聚体、国际标准化比值(INR)、凝血酶原时间(PT)、纤维蛋白原(FIB);③影像学检查:血栓部位分布;④临床表现及并发症:腹泻、腹水、食管静脉曲张程度、肝性脑病(HE)、自发性细菌性腹膜炎(SBP);⑤手术史:脾切除、部分脾栓塞(PSE)、内镜下治疗(套扎术、组织胶注射治疗)、其他腹腔手术;⑥药物应用史:心得安、止血药物。数据处理:采用SPSS 19.0软件对影响肝硬化PVT形成的相关危险因素进行统计学分析。单因素分析采用X检验;多因素分析采用非条件Logistic逐步向前分析法,采用最大偏似然估计似然比检验模型进行假设检验。P0.05)。两组肝硬化病因均以乙型病毒性肝炎为主、肝功能分级均以Child-Pugh B和C级为主,差异无统计学意义(P>0.05)。2.单因素分析:两组在ALB、Cr、PT、INR、FIB、PLT、肝性脑病、自发性细菌性腹膜炎、腹泻、腹水、部分脾栓塞、其他腹腔手术、内镜下治疗(套扎术、组织胶注射治疗)方面差异均无统计学意义(P>0.05);两组在D-二聚体、Hb、TBiL、重度食管静脉曲张、脾切除手术、止血药物及心得安使用方面差异有统计学意义(P<0.05)。3.多因素分析:结合临床或相关文献、单因素分析结果(P<0.05)以及回归模型稳健的角度,我们将D-二聚体、Hb、TBiL、食管静脉曲张、部分脾栓塞史、脾切除史、心得安、止血药等8个因素进行多因素Logistic回归分析,结果发现重度食管静脉曲张(OR=6.918,P=0.018)、脾切除手术(OR=4.281,P=0.007)、D-二聚体升高(OR=5.007,P<0.001)为肝硬化PVT形成的独立危险因素。研究结论本研究认为止血药物、心得安、D-二聚体升高、重度食管静脉曲张、脾切除术均可能与肝硬化PVT的形成有关,其中重度食管静脉曲张、脾切除术、D-二聚体升高为肝硬化PVT形成的独立危险因素。

关键词：肝硬化静脉血栓形成门静脉危险因素

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类受体蛋白激酶与植物非生物胁迫应答

中国生物化学与分子生物学报 2014年第3期30卷 241-247页

作者：曹玉婷丁艳菲朱诚中国计量学院生命科学学院杭州310018

类受体蛋白激酶(receptor-like protein kinase,RLK)是植物信号转导网络中的重要成员,参与介导生长、发育以及逆境胁迫应答等多种细胞代谢过程.在植物细胞中已发现和克隆了富含亮氨酸重复区型(LRR)、凝集素型(lectin-like)和细胞壁相联... 详细信息

类受体蛋白激酶(receptor-like protein kinase,RLK)是植物信号转导网络中的重要成员,参与介导生长、发育以及逆境胁迫应答等多种细胞代谢过程.在植物细胞中已发现和克隆了富含亮氨酸重复区型(LRR)、凝集素型(lectin-like)和细胞壁相联型(WAK)等不同的RLK亚家族.这些RLK能够感受多种发育和外界环境胁迫信号,并在植物对非生物胁迫的响应过程中发挥重要的调控作用.本文结合当今国内外研究进展,简述植物RLK的典型结构域特征,详细介绍多种RLK在植物逆境信号识别与转导中发挥的作用,同时对RLK在非生物胁迫应答中的具体作用机制进行了探讨.

关键词：非生物胁迫类受体蛋白激酶信号传导调控

裂殖酵母Pap1应答H_2O_2氧化胁迫的机制

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中国生物化学与分子生物学报 2008年第5期24卷 398-402页

作者：丁艳菲张荃山东师范大学生命科学学院逆境植物重点实验室济南250014

转录因子Pap1是裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)应答H2O2氧化胁迫反应中的关键调控因子.高浓度的H2O2激活蛋白激酶Sty1途径清除过量的H2O2,使H2O2降至较低浓度再活化Pap1;低浓度的则直接氧化活化Pap1,导致Pap1快速向细胞核内运输... 详细信息

转录因子Pap1是裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)应答H2O2氧化胁迫反应中的关键调控因子.高浓度的H2O2激活蛋白激酶Sty1途径清除过量的H2O2,使H2O2降至较低浓度再活化Pap1;低浓度的则直接氧化活化Pap1,导致Pap1快速向细胞核内运输从而激活Pap1相关基因的表达.本文综述了裂殖酵母中转录因子Pap1在不同浓度H2O2胁迫下的激活途径,以及蛋白激酶Sty1对Pap1激活的重要作用.

关键词： H2O2 氧化胁迫转录因子Pap1 蛋白激酶Sty1

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miRNA在植物重金属胁迫应答中的作用

植物生理学报 2014年第5期50卷 599-604页

作者：张林丁艳菲王熠朱诚中国计量学院生命科学学院杭州310018

microRNA （miRNA）是一种新型的长度为20~24 nt的非编码RNA,通过对靶基因的表达调节进而参与调控植物体的多种生理代谢活动。重金属是一类重要的环境污染物,严重危害植物的生长发育,甚至导致植物死亡。植物在长期的进化过程中形成了抵... 详细信息

microRNA （miRNA）是一种新型的长度为20~24 nt的非编码RNA,通过对靶基因的表达调节进而参与调控植物体的多种生理代谢活动。重金属是一类重要的环境污染物,严重危害植物的生长发育,甚至导致植物死亡。植物在长期的进化过程中形成了抵御重金属胁迫的多种机制,如miRNA对特定基因转录后水平的调控就在逆境胁迫应答中发挥重要作用。本文综述了植物中参与重金属胁迫应答miRNA的种类及作用机制,为揭示重金属胁迫条件下基因表达调控机制,以及利用基因工程手段改良植物对重金属的耐受性提供了线索和依据。

关键词：重金属胁迫调节机制植物

石斛属植物DNA条形码鉴定及铁皮石斛产地分析

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中国食品学报 2023年第12期23卷 238-246页

作者：鄢珊珊沈斌国赵海莹丁艳菲朱诚中国计量大学生命科学学院、浙江省特色农产品品质及危害物控制技术重点实验室杭州310018 浙江凤凰源生物科技股份有限公司浙江台州318056 中国计量大学材料与化学学院杭州310018

为建立石斛属植物适合的DNA条形码以及利用条形码鉴定铁皮石斛产地,对鼓槌石斛、报春石斛、金钗石斛、铁皮石斛4种石斛以及杭州、霍山、云南和温州4个产地的铁皮石斛的66份样品的ITS2和psbA-trnH序列进行扩增、测序及序列分析。比较石... 详细信息

为建立石斛属植物适合的DNA条形码以及利用条形码鉴定铁皮石斛产地,对鼓槌石斛、报春石斛、金钗石斛、铁皮石斛4种石斛以及杭州、霍山、云南和温州4个产地的铁皮石斛的66份样品的ITS2和psbA-trnH序列进行扩增、测序及序列分析。比较石斛属植物种内、种间的变异,基于K2P距离分析Barcoding Gap,构建NJ系统发育树。结果表明,ITS2序列种内遗传变异(0~0.005)小于种间遗传变异(0.070~0.228),NJ进化树也能准确区分4种石斛;而psbA-trnH序列未形成Barcoding Gap,NJ进化树未能区分报春石斛和金钗石斛,psbA-trnH序列在鉴定石斛属植物时可作为补充序列。ITS2序列和psbA-trnH序列在4种产地铁皮石斛中存在多个变异位点,可鉴别铁皮石斛产地。

关键词：石斛属铁皮石斛 DNA条形码鉴定

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microRNA在植物生长发育中的作用

核农学报 2013年第7期27卷 904-912页

作者：刘海丽丁艳菲潘家荣江琼王光钺朱诚中国计量学院生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室浙江杭州310018 中国水稻研究所浙江杭州310006 杭州市实验外国语学校浙江杭州310018

microRNA(miRNA)是一类长度约为21-27核苷酸的小分子非编码RNA,广泛存在于真核生物中。它在转录后水平负调控靶基因的表达,因而在植物生长发育过程中发挥重要作用。miRNA的靶基因通常是调控植物生长发育和信号转导通路中的转录因子,表明... 详细信息

microRNA(miRNA)是一类长度约为21-27核苷酸的小分子非编码RNA,广泛存在于真核生物中。它在转录后水平负调控靶基因的表达,因而在植物生长发育过程中发挥重要作用。miRNA的靶基因通常是调控植物生长发育和信号转导通路中的转录因子,表明miRNA处于基因表达调控网络的核心位置。本文综述近年来miRNA在植物生长发育方面的调控作用,探讨在各植物器官中发挥主要作用的miRNA以及有关miRNA的长途运输作用方式。

关键词： microRNA 靶基因转录因子发育调控

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miR398在植物逆境胁迫应答中的作用

遗传 2010年第2期32卷 129-134页

作者：丁艳菲王光钺傅亚萍朱诚浙江大学生命科学学院杭州310029 浙江林学院林业与生物技术学院临安311300 中国水稻研究所杭州310006

MicroRNA(miRNA)是一类新型的调控基因表达的小分子RNA,它作为基因表达的负调控因子,在转录后水平调节靶基因的表达。miRNA参与调控植物的生长发育,并在多种非生物与生物胁迫响应中发挥重要作用。miR398是第一个被报道的受氧化胁迫负调... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类新型的调控基因表达的小分子RNA,它作为基因表达的负调控因子,在转录后水平调节靶基因的表达。miRNA参与调控植物的生长发育,并在多种非生物与生物胁迫响应中发挥重要作用。miR398是第一个被报道的受氧化胁迫负调控的miRNA。它通过负调控其靶基因Cu/Zn过氧化物歧化酶(Cu/Zn-superoxide dismutase,CSD)的表达,在多种逆境胁迫响应中扮演重要角色,如调节铜代谢平衡,应答重金属、蔗糖、臭氧等非生物胁迫,以及参与应答生物胁迫等。文章综述了miR398在多种逆境胁迫响应中重要的调节作用及miR398自身的转录调控。

关键词： miR398 非生物胁迫生物胁迫基因表达调控胁迫应答