十个关键的基因标志物和它们参与的六种重要功能通路
会议名称：《2024年全国皮肤病防治学术年会》
会议日期：2024年
学科分类：1002[医学-临床医学] 100206[医学-皮肤病与性病学] 10[医学]
摘 要：目的:由于麻风病致残率高,缺乏有效的早期诊断和治疗方法,因此我们希望通过挖掘GEO表达谱数据,找到麻风病的关键致病基因以及它们参与的功能网络。方法:在这项研究中,我们对从GEO数据库(GSE84893、GSE74481、GSE17763、GSE16844和GSE443)中获得的麻风和正常样本进行了生物信息学分析。通过WGCNA分析,筛选出85个hub基因(GS0.7和MM0.8),通过DEG分析,筛选到82个上调基因和3个下调基因(|Log2FC|3和FDR0.05),然后将49个交叉基因视为关键基因,进行GO注释、KEGG通路和PPI分析,以确定其在麻风病发病机制中的生物学意义。结果:我们最终得到了一个基因-通路网络,表明ITK、CD48、IL2RG、CCR5、FGR、JAK3、STAT1、LCK、PTPRC、CXCR4可作为麻风的生物标志物,这些基因在6种免疫系统通路中发挥着重要作用,包括趋化因子信号通路(Chemokine signaling pathway)、Th1和Th2细胞分化通路(Th1and Th2 cell differentiation)、Th17细胞分化通路(Th17 cell differentiation)、T细胞受体信号通路(T cell receptor signaling pathway)、自然杀伤细胞介导的细胞毒性通路(Natural killer cell mediated cytotoxicity)和白细胞跨内皮迁移通(Leukocyte transendothelial migration)。结论:我们的研究最终确定了十个关键的基因标志物和它们参与的六种重要功能通路,这些标记和通路是麻风病病因的重要组成部分,这增强了我们对麻风病发病和发展的免疫分子机制的认识。