单细胞转录组解析口腔白斑细胞多样性及病损内异质性
作者单位：四川大学华西口腔医院口腔疾病研究国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心口腔黏膜病国家临床重点专科中国医学科学院口腔黏膜癌变与防治创新单元
会议名称：《中华口腔医学会第十三次全国口腔粘膜病学暨第十一次全国口腔中西医结合学术大会》
会议日期：2021年
学科分类：1003[医学-口腔医学] 100302[医学-口腔临床医学] 10[医学]
关 键 词：口腔白斑 口腔潜在恶性疾患 病损内异质性 单细胞测序 精准医学
摘 要：目的:探索口腔白斑病是否存在病损内异质性,在细胞级水平揭示其异质性特征,绘制口腔白斑病细胞图谱,为口腔白斑病的基础研究提供理论框架,为口腔白斑病患者的精准诊断和有效管理提供理论依据。方法:对一块巨大白斑病损的3处区域行组织活检,完善病理学检查的同时,采用酶及机械消化法将3块活检组织制备成单细胞悬液,磁珠筛选活细胞,10X Chromium微流控技术进行细胞捕获和文库构建,Illumina平台测序,Cellranger进行数据预处理,采用Seurat、GSVA、clusterProfiler、Monocle2及ggplot2包等对数据进行分析及图像化处理。结果:从口腔白斑组织内获取了27,611个细胞,确认了10种主要细胞谱系,成功构建了口腔白斑病的疾病细胞图谱。我们发现不同活检样本的上皮、基质、免疫细胞的部分亚型类群存在较大的状态和功能差异。尽管组织病理学提示无恶性转化的形态学特征,我们仍发现其中一块组织样本中的细胞分子表达呈现明显的促癌表征,临床病理追踪证实了这一发现。结论:口腔白斑存在病损内异质性,是由多种细胞亚群的状态及功能差异协同驱动所致。病损内异质性对病理分级为基础的疾病转归预测系统带来巨大挑战,因此对巨大白斑病损的多部位活检十分必要。此外,我们的数据再次提示组织病理形态学相对细胞分子功能学改变的滞后性,口腔白斑病的细胞分子分型更符合精准医学的需求。