单细胞转录组测序揭示胶质母细胞瘤独特的免疫微环境
作者单位：天津医科大学总医院
会议名称：《2021年中国肿瘤标志物学术大会暨第十五届肿瘤标志物青年科学家论坛》
会议日期：2021年
学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
关 键 词：胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序 巨噬细胞极化 SPI1
摘 要：目的:作为发病率和死亡率极高的肿瘤,胶质母细胞瘤(GBM)一直是临床诊疗的重大难题。GBM中浸润的免疫细胞主要是肿瘤相关巨噬细胞(TAM),T细胞含量很少,因此其也被定义为冷肿瘤。到目前为止,关于TAM在GBM中激活状态的研究主要局限于单个肿瘤组织的RNA测序分析,尚无更加深入清晰的研究。方法:我们综合分析9个GBM样本共16201个细胞的单细胞转录组测序结果,使用特定标志基因确定TAM的来源和激活状态,进一步使用SCENIC方法分析关键调控子信息,并刻画不同GBM亚型的TAM特征,最后明确靶向TAM关键调控基因的潜在药物靶点。结果:TMEM119和MHC-Ⅱ可作为TAM细胞来源和激活状态的重要标志基因。在混合型GBM中,绝大多数浸润的TAM为骨髓来源的巨噬细胞,而在前神经元亚型GBM中,TAM主要由激活型小胶质细胞组成,经典亚型GBM中主要浸润的是抑制型小胶质细胞。研究进一步发现,SPI1是TAM的核心转录调控因子,在TAM成熟和极化过程中发挥重要作用,可作为GBM免疫治疗的潜在药物靶点。结论:我们在单细胞水平描绘了人类GBM免疫全景图,重新定义了GBM中的TAM激活类型,并发现SPI1有望作为GBM免疫治疗靶点。