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澳洲坚果MiMYB1基因克隆及生物信息学分析

澳洲坚果MiMYB1基因克隆及生物信息学分析

作     者:王文林 肖海艳 郑树芳 谭秋锦 覃振师 黄锡云 贺鹏 汤秀华 许鹏 王立丰 陈海生 

作者单位:广西南亚热带农业科学研究所 农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室/农业农村部儋州热带作物科学观测实验站/中国热带农业科学院橡胶研究所 

会议名称:《2019年全国热带作物学术年会》

会议日期:2019年

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 090102[农学-作物遗传育种] 

关 键 词:Macadamia Integrifolia MiMYB1 gene cloning Bioinformatics analysis 

摘      要:【目的】克隆澳洲坚果MiMYB1基因,利用生物信息学对Mi MYB进行分析预测其结构和功能,为研究澳洲坚果R2R3-MYB家族转录因子成员在澳洲坚果产量形成中的作用机制提供理论参考。【方法】利用PCR技术从澳洲坚果品种桂热一号叶子中克隆MiMYB1基因,将其进行生物信息学分析预测。【结果】克隆获得的MiMYB1基因cDNA序列全长1205bp bp,开放阅读框(ORF)1059 bp,编码353个氨基酸。MiMYB1具有两个SANT保守结构域,属于R2R3-MYB家族,是无跨膜结构、无信号肽且定位细胞核的不稳定亲水蛋白。系统发育进化分析MiMYB1与荷花NnMYB39氨基酸序列亲缘关系最近,在拟南芥中,MiMYB1与AtMYB41亲缘关系最近,MiMYB1、AtMYB41、AtMYB74、AtMYB102聚类为S11亚族。【结论】克隆MiMYB1基因并分析其结构及功能,为深入阐明其在澳洲坚果的产量形成中的机制提供理论参考。

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