重庆市部分地区两种无性繁殖作物上的病毒发生情况调查
作者单位：植物病害生物学重庆市高校重点实验室西南大学植物保护学院 重庆市农业技术推广总站
会议名称：《中国植物保护学会2019年学术年会》
会议日期：2019年
学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治]
基 金：国家自然科学基金(31772127,31801706) 西南大学博士基金(swu118002) 中央高校基本科研业务费“创新团队”专项(XDJK2017A006)
关 键 词：马铃薯病毒 甘薯病毒 Illumina深度测序
摘 要：马铃薯和甘薯是重庆市广泛种植的两种重要的粮食作物,它们的共同点是均为无性繁殖,有利于病毒的积累。在前期的病毒病调查过程中从重庆武隆、巫溪、彭水采集表现花叶、植株畸形、矮化症状的马铃薯疑似病毒病田间样品,从合川采集表现明显花叶、斑驳、叶畸形的甘薯病叶。为明确上述样品中的病毒病原,本研究将上述样品制备混样,并采用近年来广泛应用于病毒高通量挖掘的小RNA深度测序技术进行病毒鉴定。Illumina深度测序及生物信息学分析结果显示,比对到马铃薯Y病毒N株系（Potato virus Y N strain,PVY～N）、马铃薯M病毒（Potato virus M,PVM）、马铃薯S病毒（Potato virus S,PVS）、马铃薯A病毒（Potato virus A,PVA）、甘薯羽扇斑驳病毒（Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV）、甘薯病毒C （Sweet potato virus C,SPVC）、甘薯杆状DNA病毒A（Sweet potato badnavirus A,SPBV-A）、甘薯杆状DNA病毒B （Sweet potato badnavirus B,SPBV-B）的reads数分别为82条、27条、5条、1条、15条、7条、2条、3条。为验证高通量测序结果并明确上述病毒在不同寄主中的存在情况,本研究分别提取所采集的各类田间样品RNA并反转录,根据上述病毒基因组保守序列设计引物进行PCR扩增并测序。结果显示,马铃薯病样中包含PVYN、PVM、PVS、PVA四种病毒,甘薯病样中包含SPFMV、SPVC、SPBV-A、SPBV-B四种病毒。本研究明确了从武隆、巫溪、合川、彭水、南川5区县田间所采集的马铃薯和甘薯这2种作物上存在的病毒病原,对于两种无性繁殖作物无毒种质的制备和检测具有参考价值,同时对于病毒病田间监测（如传毒介体）和防控也具有重要意义。