非损伤技术分析中国野骆驼群体遗传结构及人口历史动态
作者单位：湖南农业大学植物保护学院 中国林业科学研究院森防森保所
会议名称：《“农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会》
会议日期：2017年
关 键 词：野骆驼 粪便 非损伤评估 人口历史动态 遗传结构
摘 要：野骆驼(Camelus ferus)是旧世界真驼属唯一的野生种,数量不足830峰,是比大熊猫还珍稀的极度濒危野生保护动物,它们仅存于蒙古国西南和我国西北的库姆塔格沙漠和塔克那玛干沙漠。我们借助5对骆驼科特异性微卫星引物,对来自塔克拉玛干沙漠(TK)、库姆塔格沙漠的阿尔金山北麓(AJ)、西湖湿地(XH)和小泉沟(XQG)4个野骆驼分布区的1028份野骆驼粪便样品的个体进行了识别,并对识别个体遗传多样性,群体遗传结构,群体人口历史动态进行了研究。结果显示:1)5对微卫星引物共扩增得到101个多态性基因片段,各位点平均等位基因数(Na)为14.65,各位点在全部样品中平均有效等位基因数(Ne)为8.03,各位点在全部样品平均观测杂合度(Ho)是0.37之间,各位点在全部样品中平均期望杂合度(He)是0.87,各位点在全部样品中固定指数是0.57。2)1028份粪便样品来自420峰野骆驼,Structure等生物学软件分析发现这420峰野骆驼分为两个群体:TK单独为一个群体(A),而AJ、XH和XQG为另一个群体(B)。地理群体遗传分化结果显示:TK与AJ、XQG、XH、3个群体分化最明显,与它们的遗传距离依次为0.359、0.416、0.517。而AJ、XQG及XH三个地理群体两两之间遗传距离较小,XH与AJ遗传距离最大为0.246;XH与XQG距离交次之,为0.139;而AJ与XQG遗传距离最小,仅为0.111方差。方差分析显示(AMOVA),差异的95%来自群体内和个体间,只有5%的差异来自群体间。3)野骆驼历史上曾经经历了两次人口紧缩,最近的一次人口紧缩在生在1000年左右。我们的研究结果将为极度濒危的野骆驼保护政策的制定与执行提供理论依据。