AF9与乙酰化组蛋白之间的相互作用机制
作者单位：吉林大学理论化学研究所
会议名称：《中国化学会第30届学术年会-第二十五分会：化学信息学与...》
会议日期：2016年
学科分类：081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070303[理学-有机化学] 0703[理学-化学]
摘 要：组蛋白乙酰化是一种调节基因的染色体表达的重要机制。我们通过分子动力学模拟(MD)方法来得到组蛋白乙酰化阅读框蛋白AF9 YEATS野生型和突变型的稳定结构,通过MM-PBSA方法分析野生型和突变型的结合细节以及结合自由能,从原子水平上的结构变化来研究乙酰化组蛋白识别的分子机制。研究结果揭示了在AF9和乙酰化组蛋白H3K9ac结合过程中发挥重要作用的关键残基,阐明了突变影响结合的两种机制:通过减弱AF9与H3K9ac之间的相互作用或通过活性位点构象的变化来阻止配体进入口袋。该项研究工作可以提供重要的信息来帮助理解蛋白AF9识别H3K9ac的机制以及两者之间的相互作用。