赛葵黄脉病毒及其伴随卫星影响本氏烟内源基因表达分析
作者单位：西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室
会议名称：《绿色生态可持续发展与植物保护——中国植物保护学会第十二...》
会议日期：2017年
学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学]
基 金：西南大学基本科研业务费“创新团队”专项(XDJK2017A006)
关 键 词：赛葵黄脉病毒 表达谱 Gene Onlogy KEGG pathway
摘 要：赛葵黄脉病毒（Malvastrumyellow vein virus,MaYVV）是菜豆金色花叶病毒属（Begomovirus）且伴随β卫星分子MaYVB的单组份双生病毒,在我国云南、四川等地区的赛葵上广泛发生。该病毒在本氏烟上造成曲叶和黄脉症状,为明确MaYVV及其卫星MaYVB侵染本氏烟后寄主内源基因的表达情况,本研究以MaYVV及其卫星MaYVB侵染性克隆接种本氏烟21天后叶片为材料,构建了本氏烟基因表达谱（委托北京诺禾致源生物信息科技有限公司）,并运用Gene Onlogy（GO）数据库、KEGG pathway数据库对差异表达基因的功能和可能参与的分子调控途径进行了分析与预测。差异表达基因筛选以padj0.05为标准,分析结果得出,处理组总共有5条基因差异表达,其中有2条040 327基因表达上调、2 713条基因表达下调。对差异表达基因进行GO功能富集分析可知,这些差异表达基因显著富集到136个term,分布在分子功能、生物过程和细胞组分三大类中。其中,生物过程有75个,主要包括:有机物代谢（合成）过程、初级代谢产物、氮化合物代谢过程、酰胺生物合成过程、肽代谢（合成）过程、羧酸代谢过程、tRNA代谢过程等;细胞组分有25个,主要包括:光系统II析氧复合体、转录因子TFIID复合物、转录因子复合体等;分子功能部分有36个,主要包括:连接酶活性、细胞骨架蛋白结合、蛋白复合体结合等,对差异基因KEGG通路富集分析可知,这些差异表达基因主要富集在核糖体、卟啉与叶绿素代谢、氨酰tRNA生物合成等3个通路中。以上结果为进一步了解赛葵黄脉病毒与寄主的互作机理奠定基础。