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黑粉菌亚门进化基因组学

黑粉菌亚门进化基因组学

作     者:王启明 章小灵 李宽 Teun Boekhout Dominik Begerow 白逢彦 

作者单位:中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室 CBS-KNAW Fungal Biodiversity CentreYeast Division Ruhr-Universit?t Bochum 

会议名称:《中国菌物学会2016年学术年会》

会议日期:2016年

学科分类:0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 

基  金:国家自然科学基金No.31570016 

关 键 词:黑粉菌 基因组 进化 

摘      要:黑粉菌亚门内的类群具有多样的生活方式和生态位点,在人类活动和生态系统中担当着重要的角色:如植物寄生菌能够造成小麦、玉米、大麦和甘蔗等重要经济作物的病害,动物寄生菌能造成动物及人类浅度或深度的感染,有些无性型类群可以用作植物病害的生物防治剂。该亚门内大部分物种与寄主植物和动物协同进化,而且还会在不同尺度上进行寄主的跨越和转移,具有重要的科学研究价值。本研究将对该亚门内4个纲、10个目和28个科内的代表性的属种进行系统性的全基因组的测定和分析。截至目前为止,已经完成了分布在黑粉菌亚门10个目的 30个种的基因组草图。初步分析表明黑粉菌亚门物种的基因组大小在9-34M之间。分泌性效应因子的初步预测结果显示Moniliela属的分泌性蛋白数目明显比植物病原菌少,并且没有发现该属模式种与***同源的交配型基因。由于该属其大部分种的基因组还未测定,所以不清楚是否是整个属的种都缺失了交配型基因。我们还发现Golubevia pallescens有两个紧连的信息素受体Pra基因,多拷贝Pra基因除了在伞菌纲内的某些类群中发现外,在其它担子菌的类群中还没有发现。根据现有数据的初步分析,我们已经发现了一些有意思的现象,随着更多物种的测序和深入的分析将会彻底阐明黑粉菌遗传多样性及其适应进化机制。

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