双分子DNA i-motif的折叠与解折叠动力学
作者单位：中国工程物理研究院材料研究所 清华大学 中国科学院大学
会议名称：《中国化学会第30届学术年会-第二十四分会：超分子组装与软物质材料》
会议日期：2016年
学科分类：081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070303[理学-有机化学] 0703[理学-化学]
关 键 词：双分子 DNA i-motif 停流-圆二色谱 动力学
摘 要：利用停流-圆二色谱,本文研究了两种应用广泛的双分子DNA i-motif的折叠与解折叠动力学(序列3C:5’-CCC TAA CCC-3’和序列4C:5’-CCC CTA ACC CC-3’)。研究发现双分子i-moitf的折叠速率远小于单分子i-motif,并且3C序列形成双分子i-motif的pH值范围明显窄于4C序列。双分子i-motif的解折叠过程具有pH依赖性,且在H 8时其速度在百毫秒级别。通过建模分析,发现在3C序列形成的双分子i-motif解折叠过程中,1个质子的被中和是唯一的限速步骤;而4C形成的双分子i-motif则是2个质子协同被中和是唯一的限速步骤。研究结果将有助于理解双分子DNA i-motif的组装过程,并进一步指导基于DNA i-motif的分子机器与纳米材料的设计和构建。