我国分离的10株狂犬病病毒P和M蛋白基因序列分析
作者单位:武汉生物制品研究所
会议名称:《2011中国生物制品年会暨第十一次全国生物制品学术研讨会》
会议日期:2011年
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
摘 要:目的:探讨我国狂犬病病毒P、M蛋白基因序列、结构特点及变异情况等遗传学特征。方法:用RT-PCR方法从分离的10株狂犬病病毒中获得目的基因片段,测定核苷酸序列后,利用生物信息学软件分析核苷酸、氨基酸序列及其相关的功能位点并构建P、M蛋白基因的系统发育树。结果:10株病毒P和M基因核苷酸序列同源性分别为85.9%~99.4%和89.5%~99.5%,推导出的氨基酸同源性分别为92.3%~100%和96.0%~99.5%。在核苷酸及氨基酸水平上,10株病毒与我国分离的街毒株HN10及CTN疫苗株的P、M基因同源性均明显高于国外其他疫苗株、标准攻击毒CVS株相应的同源性。系统发育分析表明,10株病毒与我国湖南街毒株、CTN疫苗株进化关系最近,而与研究中选取的其他毒株进化关系较远。氨基酸对位分析表明,与其他基因1型毒株相比,本研究中10株狂犬病病毒的P、M基因出现多处变异,但很少在功能区发生变异。结论:分离的10株病毒属基因1型狂犬病病毒,与我国分离的街毒株及CTN疫苗株关系较近,其中P、M基因的功能区基本上均未发生变异。